DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment cana and Cenpe

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001027247.1 Gene:cana / 3771934 FlyBaseID:FBgn0040233 Length:1931 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_063138291.1 Gene:Cenpe / 362044 RGDID:1307115 Length:2505 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2331 Identity:543/2331 - (23%)
Similarity:971/2331 - (41%) Gaps:605/2331 - (25%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     7 SSIQVCIKVRPC-----EPGLTS----------LWQVKEGRSIQLADSHAEPYVFDYVFDEGASN 56
            :::.||::|||.     |.|..|          ::|...|:|.|          ||.||....:.
  Rat     5 AAVAVCVRVRPLNSREEELGEASHIYWKTDKNAIYQSDGGKSFQ----------FDRVFHSNETT 59

  Fly    57 QEVFDRMAKHIVHACMQGSNGTIFAYGQTSSGKTYTMMGDEQNPGVMVLAAKEIFQQISSETERD 121
            :.|::.:|..|:.:.:||.||||||||||:||||:||||.|...||:..|..:|||:|....||:
  Rat    60 KNVYEEIAVPIISSAIQGYNGTIFAYGQTASGKTHTMMGSEDCLGVIPRAIHDIFQRIKKFPERE 124

  Fly   122 FLLRVGYIEIYNEKIYDLL--NKKNQDLKIHESGNGIVNV-NCKESIVTSEDDLLRQLYMGNKER 183
            |||||.|:|||||.|.|||  .:|.:.|.|.|..|..|.| :..|.:|.:.:..|:.|..|.|.|
  Rat   125 FLLRVSYMEIYNETITDLLCNTQKVKPLIIREDINRNVYVADLTEEVVYTAEMALKWLATGEKNR 189

  Fly   184 VVGETNMNERSSRSHAIFRIIIESRKSDHSDN--DTVKQSVLSLVDLAGSEQVDPADHAS----- 241
            ..|.|.||:||||||.|||:|:|||:...|.|  .::|.|.|:||||||||:........     
  Rat   190 HYGITKMNQRSSRSHTIFRMILESREKAESSNCDGSIKVSHLNLVDLAGSERAAQTGAEGMRLKE 254

  Fly   242 ------SLMIFRNLVKSLSESVDSKPNSFRDSKLPRIMLPSLGGNVLTSIICTITPSFVEESSST 300
                  :|:|...::|.||:.......::|||||.||:..|||||..|.|||||||:.::|:.:|
  Rat   255 GCYINRNLLILGQVIKKLSDGQVGGFINYRDSKLTRILQNSLGGNAKTRIICTITPASLDETLTT 319

  Fly   301 ISFGTCAKKIRCKPQVCKIDSETTMMRQLDRGISMLKDKLAKKKIKNESQLVLQELEGRI--KRD 363
            :.|.:.||.::..|.|.::.::..::::..|.|..||.:|.:...|..:|.:.::...::  ::|
  Rat   320 LQFASTAKYMKNTPYVNEVSNDEALLKRYRREIVDLKKQLEEVNTKTRAQEIEKDQLAQLLDEKD 384

  Fly   364 MLK-------------IVSSASL---DDYRLQKRRR-TWTLTASGSEGDAPVLALPEPEESRLPR 411
            :|:             :|:|:|:   .:..::|:|| ||..   |...|:..:     :|.::| 
  Rat   385 LLQKVQDEKIQNLKRMLVTSSSIALQQELEIKKKRRVTWCF---GKMKDSNYV-----KEFKIP- 440

  Fly   412 PSKLTNLPKPLFQRRGIAPKAKGICKTLKEKRLQTDNMDTMPGRAKQLGRETASRIPSVMMSKKY 476
                ||:.... ::..:.|..:.....|.|..|..:: :......:.|.....|...:::..:..
  Rat   441 ----TNITTRT-RKTSVTPLRENSLMKLGESALSWES-EVFDNTLEPLAEAEWSSATALLSEENL 499

  Fly   477 QESVPNCDAPQTEI----SALTASNQVAK------------ETIEKYEE---------QVKRLKE 516
            :..:.:.:.....:    ..|...|:..|            |.:|:.||         :|..||.
  Rat   500 ESELTSLNTQYNNLVLDYEQLRRENEDLKLKLKEKNELEEFEFLEQREEKDQELQLMHEVSNLKN 564

  Fly   517 TIERLEMENGKAVN-LGEQFETHKAKSKQMEE--------------ELLSSISEKDSTIVSLQQS 566
            .|:..|..|....| |..:.|..|.|..|::|              ..||..||....:....::
  Rat   565 LIKHAEEYNQDLENELSSKVELLKEKEDQIKELQRYIDAQKSETTKTDLSYSSEATEDLKQAMRT 629

  Fly   567 LEELSRDVLRNSKED--------QMRSMCPELESSCERICN------KCLE--------LERLLP 609
            |.:|....|...:|.        :::....||..||:::.|      :.||        ||:.|.
  Rat   630 LSDLDTVALDAKRESAFLRSENLELKERINELSDSCKQMENGIQMYQRQLEAKKQVQADLEKELQ 694

  Fly   610 LASASGLDSVACQFDQLRSEIAA--------TRMKLESMLSTF-SHASCEVSQKTT--------- 656
            ||           |.:: |:::|        :.::||..::.. ...:.||.:|.|         
  Rat   695 LA-----------FQEI-SKLSALVDGKGLLSNLELEKRITDLQKELNKEVEEKETLQKEVHLLS 747

  Fly   657 DCKRLSEQISTAHDDFGQLQEKYNNLKHKWSSQKLAIDTMQVD--YNTIQQKYLQLQ-------- 711
            :.|.|..::.|..   .:|.||         |::|.:.|.:.:  ::.:..|..::|        
  Rat   748 ELKSLPSEVETLR---RELHEK---------SEELCVITTEREKLFSEMAHKDSRIQGLLEEIGN 800

  Fly   712 --DEYRHLEL---RSDEQCQQLQDENSKL---QAEIGTLKERV-EEIHSELLEVPNPDTHPEDME 767
              |:....:|   .|||:||.|:..:.:|   |.|:....||| :|:..:..|:.......::|.
  Rat   801 TKDDLAASQLSQRSSDEECQALKSLHVELKHRQEEVLEESERVKQELSQKTQELAQKTAEGQEML 865

  Fly   768 LQNQELKKRLSKLQWEFDEIQLNYECLSNELMSTIQECDALREEHKQRTTNSDLESMKSS----- 827
            .|.:||:::|.:........:.....|:.:|..|::|..||.:|      .:||:.::.|     
  Rat   866 NQMEELREKLERRDSSLQSAEKEKNLLTEKLQQTLEEVRALTQE------KNDLKQLQESLQTER 924

  Fly   828 -GVGTECSDPENELDTDLLQQFTKLSKSIQQ-------------IELTDY--SGGRRLFIYNHAE 876
             .:.::..|..| ::.|..:|.....:|::|             .|::|:  ..||.   .:..|
  Rat   925 DQLRSDIQDTVN-MNIDTQEQLLNALESLKQHQETINMLKMKATEEMSDHLPIKGRE---GSSDE 985

  Fly   877 QDQSVPSL---KLCLEPAKYLEGDGKQHDASDSVFLKGFLKCQRFQIVKINQEQNLVKEEDRMRD 938
            .:|.:..:   .|..|.|..:.|.|:.|..::.         ||    ||:   :|::|..|::.
  Rat   986 VEQKLDGIDEENLLAESAHTVVGSGEDHGETEE---------QR----KID---SLLQENSRLQQ 1034

  Fly   939 IIFQLKQEVDGKKNLIEEEKEVINNLRAQITSLNQIETIKNQNAKTKILCEELQTKDTVQTANKQ 1003
            .:          :::|.|::::..:|:..|..     :::||. :.:||.:||:.:..:..   |
  Rat  1035 TL----------ESIIAEKEQLKMDLKENIEM-----SVENQE-ELRILRDELKRQQEIAA---Q 1080

  Fly  1004 ESQEVLTLKTSLAHLKSKVCELQKKLEKQSEDEKISELQSDIGEISECCLSMELKLADIVNWQAE 1068
            |...|......|:....::.|:::||::  :::|:.|.|..:..|.|....|:.|:.|:.|.|.|
  Rat  1081 EKDHVTEKSEELSRAHERLAEIEEKLKE--KNQKLQETQQQLVSIQEAMSEMQAKVTDLENLQNE 1143

  Fly  1069 ----------------------------------ELRPLDQLQES-----------GVELQHHST 1088
                                              |...|.:||||           ..|::....
  Rat  1144 FRNQALALERVETERLELAQKLHENYEKMESITKERNDLKELQESFEIEKKQLKEYAREMESAGL 1208

  Fly  1089 TAEESLNV--------------------------------------------------------- 1096
            ..:|.||:                                                         
  Rat  1209 QTKEQLNIAHANLKEYQEIIKELRGSISEKEAQASSTQDTGKTNPASQGETPVPREQELLPDAEE 1273

  Fly  1097 -----EK-----PIQE--QTERTLTTE-YERRIEQLEESLQRAQEELSILEKRKTD---ENKSLQ 1145
                 ||     |::|  :|..:|||| .|..|..|.:.|:.:|:|:|.|.|.::|   ..::||
  Rat  1274 ARASAEKGSELEPVEEHSRTAHSLTTEGIEMEILALTKKLEESQKEISCLTKERSDLRRTQEALQ 1338

  Fly  1146 LEYMAKIETS---------ENENRSKFRAYCLDLKETQKRYEE---QLQQTNEKLASVTTQCQVH 1198
            :| .|:::..         |.|........|  |||.:.:.:.   .|.|...:|:||..|.:|.
  Rat  1339 VE-CAQLKDDARRTLANHLETEEELSLARCC--LKEQENKIDSLIVSLSQKEAELSSVRVQLEVT 1400

  Fly  1199 LDVIKRSLQEKITQAE----KERNELAVRHKAELEKIRETLKEKESSYKE------KLRQAEEER 1253
            ...::|.:||...:.|    ||.:|:..: .:||:.||..|..|:|:.:.      :|.:..||.
  Rat  1401 TGELERKVQELCEKQEQLNIKETSEVQGK-MSELDHIRALLLTKDSALQSVESDRLRLNKQLEES 1464

  Fly  1254 DKEISRL----EVMRNTIAELHKTNSDREVELEGVKMEKCQLKKLYDKSMLELEQLQCTADQKSS 1314
            .:||..|    |.:|.....||   .:||.:.|.:|....:|::|.||   |.|.|         
  Rat  1465 QEEIKILIKEREELRRAQEALH---VEREQQQESIKEISTRLQELQDK---EYEYL--------- 1514

  Fly  1315 DLLPGSSNENIDDLQKKCDQYVQDLELLRGEKAELLSEIQKINGQHSNTIKKLEEIEAEMITLTT 1379
                                .::.|...:|.|.|.|:  |::..|.|:    ||::|.:.:.||.
  Rat  1515 --------------------VMKSLNETQGNKCEDLN--QQLEAQKSS----LEKVEMQNVNLTQ 1553

  Fly  1380 QKELERCEIAEKLETFKS--KEADIKEALHCAQLRLHAYDKLVCEYERLKGCLSDSNKLSENLQK 1442
            :       :.|.||..||  ||.|        :|| ...::|..:.::||..|.::  :::.|:|
  Rat  1554 R-------LNETLEEMKSVAKERD--------ELR-SVEERLTADRDQLKKSLEET--ITKGLEK 1600

  Fly  1443 KVERLHAEQLALQEGISGRDSEIKQLRSELKDAIDENKTVREAKVGLENSLKAVQENM------- 1500
            : |.|....:.|||    ....|.:||..:.|..||   :......||::...:..::       
  Rat  1601 E-EELRVAHMHLQE----HQETINELRKSVSDCTDE---IAHIHGDLEHTHAVIHGDLEHTHAVI 1657

  Fly  1501 --------SAQEGQFKQKIADIKGSVDELQIKLK-SLQEVRDHLESRNEELKRKLKDAQELQNMV 1556
                    :...|..:...|.|.|.::.....:. .|:.....|:::|:||:.|   ..:|.   
  Rat  1658 HGDLEHTHAVIHGDLEHTHAVIHGDLEHTHAVIHGDLEHTHAVLQTQNQELQEK---GHQLS--- 1716

  Fly  1557 DKERKLNSSLREDFDKLEQTKLDLE------EQLRAKKVEIDRRSKE-LGEVT------------ 1602
                ::.:.|||..|::||.|..||      |.:..:|:::.::..| |.|:|            
  Rat  1717 ----QVKADLRETMDQMEQLKEQLEAQNSTLESIEIEKLKLTQQLNENLKEMTLVAKENDDLKIM 1777

  Fly  1603 -----KDCENIRSDLEAQTNDFLKERETLNLTISDLRLHNEQLLETSKNYLSDITAANNLNLEMK 1662
                 ::.:.:|..|.......|:::|.|.:...||:.|.|.:.....:........:::|:|::
  Rat  1778 DEALREERDQLRESLRQTEASDLEKQEKLRIAHLDLKEHQETIERLMGSVAKRTEEVSDMNMELE 1842

  Fly  1663 K---NLHDLTKECKSLRSDLQ---SKEEYFQTQKQLLDE--TISNLKEENRKMEEKLSSGNKALK 1719
            :   .|.:..:|.|:  |:||   ||.|..:|:|||.::  .:|.::.||..:.:::....:.:|
  Rat  1843 RANTRLQEKVQELKA--SELQLLKSKVEAGETKKQLKEQGLALSKIEMENLNLAQQIHQNLEEMK 1905

  Fly  1720 EDCEKLRSTLESKELILQQNKQELEERLTVINEK----------NGKNALLDAQ------LKSNE 1768
             ...|.|..|:..|.||:..|.:|::.|.....|          .||..|...:      |:...
  Rat  1906 -SISKERDDLKRMEEILRMEKDQLKDSLREAKFKAHQNYEETVQYGKGLLCGGEQHCTGRLREKC 1969

  Fly  1769 TAFTSLRKAWIKQSLAIEAANKRSLEMEQKVDKRTREYEELRSTLKTR-EINFRSEKERMDGTIS 1832
            .....|.|.:.:.:...|..|:.||::|    |.|:..:||..|:||: .:.:...||     |.
  Rat  1970 LRIEKLLKRYSEMANDYECLNRFSLDLE----KETKTQKELSVTIKTKLSLPYTQTKE-----IE 2025

  Fly  1833 SLL--EDKRNLE-----EKLCTVTELLAKLKRELPAL----------HTQKVNGGDVSIE-LNSS 1879
            .||  ..:.::|     :||..|...:.::|.|....          ..:|.|...:.|: |:.:
  Rat  2026 KLLTANQRCSMEFHRILKKLKYVLSYITRIKEEQHEFINKFEMAFIQEVEKQNELQIKIQSLSQT 2090

  Fly  1880 NGSPTPAAVPATKKPLDCNSAECVPKKSSSLETAERKNRRMTAYDE------NRKQ 1929
            :..|:..:.....:.:|.:..|.:...|        :|..:|...|      |||:
  Rat  2091 SNIPSRDSQSKLSQEMDLHIEEILKDFS--------ENDFLTIKTEVKQVLSNRKE 2138

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
canaNP_001027247.1 Motor_domain 8..310 CDD:473979 138/332 (42%)
CCDC158 <505..>729 CDD:464943 63/302 (21%)
SMC_prok_B 622..1285 CDD:274008 177/867 (20%)
SMC_prok_B 1110..1875 CDD:274008 201/878 (23%)
CenpeXP_063138291.1 None

Return to query results.
Submit another query.