Protein Alignment Golgin245 and spo15

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_611787.2
• Gene: Golgin245 / 37702
• FlyBaseID: FBgn0034854
• Length: 1489
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_593009.1
• Gene: spo15 / 2541649
• PomBaseID: SPAC1F3.06C
• Length: 1957
• Species: Schizosaccharomyces pombe
• Alignment Length: 1796
• Identity: 378/1796 - (21%)
• Similarity: 684/1796 - (38%)
• Gaps: 509/1796 - (28%)

  Fly    29 AAVSSSSSTTPNSETNTS----------------NNENFFSITEEDTPQNSPYRIQ-KLPA---- 72
            :..||:...||.|.:|.|                |     |:|::....|...::: ||.|
pombe    93 STASSALPLTPRSPSNASWLLVRGGLLDSPILDIN-----SVTQKSNLLNELKQVRSKLAALEHE 152

  Fly    73 -------TSASALRGRSTQSLNGATSRTRKLSNSSMASDVSFRLPTYEAPAVYHLQSDLDETSSE 130
                   .|:|..:.::|.|:...||.          .|||:            .|..|....|.
pombe   153 NGILSLQLSSSNKKDKNTSSVTTLTSE----------EDVSY------------FQKKLTNMESN 195

  Fly   131 FDDSASTARLDVITKDQLYDAYKKSLDRYHKYRCRYTDLAKK---YKELERDSSKARSVLVETQ- 191
            |....|.|          ||..::.|....|       |.||   |::::.|.|..::.|.|.|
pombe   196 FSAKQSEA----------YDLSRQLLTVTEK-------LDKKEKDYEKIKEDVSSIKASLAEEQA 243

  Fly   192 -DKALRRISELREQ---------CTLEQQAKAHLEEALRVEMDDMSCKMQAYQTKLQLLGENPEN 246
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pombe   244 SNKSLRGEQERLEKLLVSSNKTVSTLRQ-----TENSLRAE-----CK--TLQEKLEKCAINEE- 295

  Fly   247 ITAALERSGQQLESEQLIDLEESIG--------KSPLSTNGSSGVSDLQRLLKERDEQLKSVTEK 303
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pombe   296 ------------DSKLLEELKHNVANYSDAIVHKDKLIEDLSTRISEFDNLKSERD-TLSIKNEK 347

  Fly   304 YEAV--------------RKQEEENVLLLAQTKQAIHTELELKDTEVRKLQEKLKQLESQRESHN 354
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pombe   348 LEKLLRNTIGSLKDSRTSNSQLEEEMVELKESNRTIHSQLTDAESKLSSFEQENKSLKGSIDEYQ 412

  Fly   355 NEVKEQFKKLQATKQEVDAKLMATEHLLNTLKESYAIKEQQVVTLEAQLEAIRVENEQKVKDLQK 419
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pombe   413 NNLSSKDKMVKQVSSQLEEARSSLAHATGKL---------------AEINSERDFQNKKIKDFEK 462

  Fly   420 QNEDRNTQASDSSEQLKKLQAAVQDAESQLLSKDQLLESLRSEQAAKEQ---------------- 468
            ..:|.....:.||.:||:..|.:.       .|||.|.:||.:  .|||
pombe   463 IEQDLRACLNSSSNELKEKSALID-------KKDQELNNLREQ--IKEQKKVSESTQSSLQSLQR 518

  Fly   469 -----QLKH------LKEQLGKLKQENEN------YLDKLRENKKSSDSQTNEAQDQQKKLQAAK 516
                 :.||      |.|..|:|:.|..|      .|..|...|:::.:..||..:.:..||...
pombe   519 DILNEKKKHEVYESQLNELKGELQTEISNSEHLSSQLSTLAAEKEAAVATNNELSESKNSLQTLC 583

  Fly   517 DEAESKLLAT-------EELLHSLRNDYKAQEEKVALLEDKLKTLSKENDVNVEKLHHINEQREA 574
            :..:.||..:       |:...||...:|...|....||:..:|::|:......||    :|.:.
pombe   584 NAFQEKLAKSVMQLKENEQNFSSLDTSFKKLNESHQELENNHQTITKQLKDTSSKL----QQLQL 644

  Fly   575 QSTDSQQKINELRAAKDEAEAKLLSTEHSLNALQAALSAKEEQAASLEQSLNALKTE---SEHSL 636
            :..:.:||.:.|....::...|||..|.|    ..:|..|:|...|||:::..||.:   ||.:|
pombe   645 ERANFEQKESTLSDENNDLRTKLLKLEES----NKSLIKKQEDVDSLEKNIQTLKEDLRKSEEAL 705

  Fly   637 QDLRLHNDQLLEIVQ----RH-----QQNDWEAQLARAREELAAIQSQRELHALELEKSLE---- 688
            :..:|....|.|::.    :|     |:||..:.|:.|:...|.:.|       ||.||.|
pombe   706 RFSKLEAKNLREVIDNLKGKHETLEAQRNDLHSSLSDAKNTNAILSS-------ELTKSSEDVKR 763

  Fly   689 --------------MERESVAALNSEKASQEEQHRLK-----------------------LEQLQ 716
                          |::...:.:||.::.....|.|:                       .|.|.
pombe   764 LTANVETLTQDSKAMKQSFTSLVNSYQSISNLYHELRDDHVNMQSQNNTLLESESKLKTDCENLT 828

  Fly   717 RE-------IQILQDQHANSESETVAALKGQLEALSQDLATSQASL------------------- 755
            ::       :|.|..:|.|.||: |:.||.....||.||...::||
pombe   829 QQNMTLIDNVQKLMHKHVNQESK-VSELKEVNGKLSLDLKNLRSSLNVAISDNDQILTQLAELSK 892

  Fly   756 ------------------LAKEKELKASGN-----KLNKIKKQHEQHQAKSSDQSARLEALQSEL 797
                              |..||:|..:.|     :|:|:..:.:..::||||...:|.|.|.|:
pombe   893 NYDSLEQESAQLNSGLKSLEAEKQLLHTENEELHIRLDKLTGKLKIEESKSSDLGKKLTARQEEI 957

  Fly   798 A----DRLSHSRQVESEKEELQARVTGILEEIGTMQAQMQQVQDSHSELEREKRKL--------- 849
            :    :.:|.|:.:.|.|.:|..    .|.:...::|.::.:::..||:|.|:..|
pombe   958 SNLKEENMSQSQAITSVKSKLDE----TLSKSSKLEADIEHLKNKVSEVEVERNALLASNERLMD 1018

  Fly   850 -----ESRIESLQQEQVDSSAQDERTSAKLEEIQSENTKL----AERNCLLEEQTN---HLESQL 902
                 ...|.|||.|.....|:::...:||..:.||...|    ::.|..||::||   ::|..:
pombe  1019 DLKNNGENIASLQTEIEKKRAENDDLQSKLSVVSSEYENLLLISSQTNKSLEDKTNQLKYIEKNV 1083

  Fly   903 QAKQDEIGKIQAKLQQVLDEHSKL--QNAQELMDHDHRTLQDKCDAYEKDKLLTKHTLDCLQSAS 965
            |...||..:...:|:::..::.||  :|||                 .||:||      .|:..|
pombe  1084 QKLLDEKDQRNVELEELTSKYGKLGEENAQ-----------------IKDELL------ALRKKS 1125

  Fly   966 EELHRVKANLDRELKEQDQQLSELRERQRE----QEQ----------QLKDQAERCAKLKAQNSE 1016
            ::.|.:.||...:|||:...|.:|...:.|    .||          :..|.|.|.:.:|...|:
pombe  1126 KKQHDLCANFVDDLKEKSDALEQLTNEKNELIVSLEQSNSNNEALVEERSDLANRLSDMKKSLSD 1190

  Fly  1017 SETQLQATISNL---REQLDAYK--------------QTEQGIQEKLQATNSSYTTQIATLEARW 1064
            |:..:....|:|   .::||..|              |....:.:.|:....|:.....:|....
pombe  1191 SDNVISVIRSDLVRVNDELDTLKKDKDSLSTQYSEVCQDRDDLLDSLKGCEESFNKYAVSLRELC 1255

  Fly  1065 SAANSDVERLHEANDALQL------EMEQLKIKHGQEREEVKESIAQKNRQVVELQEAMATRDRQ 1123
            :.:..||......:|....      |:.:|.:   ...|...::..|.|.:.:||...:.|.|.:
pombe  1256 TKSEIDVPVSEILDDNFVFNAGNFSELSRLTV---LSLENYLDAFNQVNFKKMELDNRLTTTDAE 1317

  Fly  1124 LQEKIEASEKLA-KFDEILIENEYLNKHTKQLEAE-LAESAELKEKLKSLQCELYVLQEKAEQHA 1186
            ..:.:...|||. :.|:.||:...|.|..|..|.. |.:.||:.|.:.|       |:|..|:..
pombe  1318 FTKVVADLEKLQHEHDDWLIQRGDLEKALKDSEKNFLRKEAEMTENIHS-------LEEGKEETK 1375

  Fly  1187 VQMAEKETQSATATAEVSELKKAIE-----------------------EQAVELTRQKEHASF-- 1226
            .::||..::........::||..::                       |:::...||||.:..
pombe  1376 KEIAELSSRLEDNQLATNKLKNQLDHLNQEIRLKEDVLKEKESLIISLEESLSNQRQKESSLLDA 1440

  Fly  1227 ----------VTEQSDAVQKDLLQAQQQLHDKQIELAMSRDEQALLQAEADGLRQEVICLKEHLS 1281
                      .:.::.::.:.:......|.||..|||.:.::...||.    |..|.:.|.|::
pombe  1441 KNELEHMLDDTSRKNSSLMEKIESINSSLDDKSFELASAVEKLGALQK----LHSESLSLMENI- 1500

  Fly  1282 PSTDSDSLRSLNERLQRE---LEDLKHKSAGAESNMQQEIEELQANNQQMAERINELETLRAG-- 1341
                ...|:...|::|.:   :::|.|:...:::|.:.::.:..:..:.::|.|.:|..|.|.
pombe  1501 ----KSQLQEAKEKIQVDESTIQELDHEITASKNNYEGKLNDKDSIIRDLSENIEQLNNLLAEEK 1561

  Fly  1342 --------------IQAQQLLASMA-PKNVQEAAAAGEKAELESKLKEIM---NEVQDVTNRNLF 1388
                          :|....||.:. .|:..|:.....|.:|.|..:|:.   ||...:|.|.|.
pombe  1562 SAVKRLSTEKESEILQFNSRLADLEYHKSQVESELGRSKLKLASTTEELQLAENERLSLTTRMLD 1626

  Fly  1389 LEQKCENFLILEQSNERLKLQNAKLSRQLDETLVSMQHSEAVPANTEFEYLRNIMFQYLTGNTNN 1453
            |:.:.::...::.|..    ::.:..|.|::::.|:|....:.:|| .|.|::::......|...
pombe  1627 LQNQVKDLSNIKDSLS----EDLRTLRSLEDSVASLQKECKIKSNT-VESLQDVLTSVQARNAEL 1686

  Fly  1454 ETLV-----KV---------ISAVLKFSPQQAQVALEKEHQ 1480
            |..|     |:         :|..||....|    ||::|:
pombe  1687 EDEVSRSVDKIRRRDDRCEHLSGKLKKLHSQ----LEEQHE 1723

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Golgin245	NP_611787.2	Smc	286..>856	CDD:440809	156/743 (21%)
		Smc	583..1247	CDD:440809	180/866 (21%)
		MIT_CorA-like	<1244..>1333	CDD:469776	19/91 (21%)
		Grip	1433..1477	CDD:197860	13/57 (23%)
spo15	NP_593009.1	PRK03918	<176..723	CDD:235175	143/643 (22%)
		SMC_prok_B	455..1236	CDD:274008	187/832 (22%)
		SMC_prok_B	887..>1650	CDD:274008	163/812 (20%)