DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG4554 and Utp20

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_611676.1 Gene:CG4554 / 37570 FlyBaseID:FBgn0034734 Length:2733 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001421474.1 Gene:Utp20 / 314713 RGDID:1560606 Length:2788 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2974 Identity:774/2974 - (26%)
Similarity:1373/2974 - (46%) Gaps:464/2974 - (15%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     9 KDTNTFRFKSFGDRVNEIDLRHLALYHIGHRNEELDEEENATYFQQTIQKWNVLNLSEEYNYFSK 73
            |..||:||.:|.:|:..:   ::.:.|...|....||:.. |||.:.:.||..|||:|.:..|.|
  Rat     9 KTENTYRFLTFAERLGNV---NIDIIHRIDRTASYDEDVE-TYFFEALLKWRELNLTEHFGKFYK 69

  Fly    74 ----RCRKIVTLPQLLHQKDFVVDLLLERLSTATNLSQQPLLELLYVLAKDLREEFYPYFQRVLD 134
                :|:   :..||::.::.:|..|...|....:.:.||||:|:..||:||:.:|||:|:....
  Rat    70 EVIDKCQ---SFNQLVYHQNEIVQSLKTHLQIRNSFAYQPLLDLVVQLARDLQTDFYPHFEDFFL 131

  Fly   135 RLICLLNTQDSEQLEWTLICLAHLFKTLKPYLKRNIGVVFNAILPLLDEQHYAEHVTNFAVECFA 199
            .:..:|.|||:|.|||....|::|:|.|...:.::|..:::....||  .|...|:.|||.|.|.
  Rat   132 TITSILETQDTELLEWAFTSLSYLYKYLWRLMVKDISKIYSLYSTLL--AHKKLHIRNFAAESFT 194

  Fly   200 YIARDVRDFPRFLTYVLKTVLREQVESVHGCGRLIYEILRGVNGQLHNSAAEIFAHVLEVLVNKD 264
            ::.|.|.| ...|..::...|.|..|.|.|.|:|::|:.:||....|:...:    .|::::.|.
  Rat   195 FLMRKVSD-KNALFNLMFLDLNEHPEKVEGVGQLLFEMCKGVRNMFHSCTGQ----ALKLILQKL 254

  Fly   265 SAHTKDQTE----LLGD------------IVEYSLGLLLNFLRSDQSNILWQKLCSAASSESVDE 313
            ...|:.:|:    |:|:            |.:..||:..:.|:..... |..|:..|..||:.|:
  Rat   255 GPVTETETQLPWILVGETLKNMAKSTVVYIHKEHLGVFFDCLQESLLE-LHNKVTKANCSENSDQ 318

  Fly   314 -QRVIDLMLPLVTHKDGRYVSELPLVVGTLLKLLDR---ELDPLQPLTTLVTSLLKAQHTQLSQL 374
             :|:::..|.:|.|..|..|::...:.|.||:.|..   .....:.|..:|::||..::..|.:.
  Rat   319 MRRLLETFLIVVKHGSGSKVAQPADICGVLLEALQTAHLSTSCRKTLLDVVSALLLVENVSLPEA 383

  Fly   375 DASRLLQKLL--SISRKQVTVYEDAILQLLDYSQFEILVLPNVIGYFEEQRQL-------RAREL 430
            .....::|:.  ...|:.:..:.:.:..:   .|||.|.||:.:.|.|....:       .|..:
  Rat   384 LIEETIEKVFESKFERRLILDFSEVMFAM---KQFEQLFLPSFLLYIENCFLMDDSVASDEALAI 445

  Fly   431 LARIVLHKRPLKVDGNSLAQWVAYPLQLKQKDTIKLVEQE-------------LLHLD------- 475
            ||:::|:|......|:...:  .|||...|:.....::|.             |.||.       
  Rat   446 LAKLILNKAAPPTAGSMAIE--RYPLVFSQQTVGSYLKQRKAESKRRKGQFPVLDHLSSIVQSPP 508

  Fly   476 ----LTKEEHLLLIILVPHLRGFNKQPLEQGLQSVIEKLI--CDNG------------------- 515
                .:..:....::::||||..:|:.....:...||.|.  .|.|                   
  Rat   509 NNDAASLSQSWAALVVLPHLRPLDKEKTISLVSCFIESLFLAVDRGSFGKGNLFVLCQAVNTLLS 573

  Fly   516 -KDFTQLLLLLQT----HALLKFNLPKSLRSSLNGYLIPELGKDIRALACLQVVLLQGPKNELST 575
             ::.::||.|:..    |.:|.|....|:....:.|              .|.:.|.|.|..||.
  Rat   574 LEESSELLHLVPVERVKHLVLTFPAEPSVLLLADVY--------------YQRLALCGCKGPLSE 624

  Fly   576 SD--ELLFGIGGLLSQPVSLYRRIAAHCLDVLNS--------------SSKPNPYSHFNAAACIE 624
            ..  ||...:...:|..||..|.:.   :.:||.              |.:.:.::....|..:.
  Rat   625 EALMELFPKLQANISTGVSKIRLLT---IRILNHFDIQLPVSMEDDGLSEQQSAFAILRQAELVP 686

  Fly   625 PTVHNYRELLLQLQQLEPASAQFKQFSQLPH--FKEHAVSLLLGLLYNNFKFVWAPVQQLLAAYV 687
            .||.:|||.||.|::|.....|    |.:|.  .:|..:..|||:||.||..:|.||.:|::::.
  Rat   687 ATVSDYREKLLHLRKLRHDVVQ----SAVPQGPLQEVPLRYLLGMLYINFSALWDPVIELISSHA 747

  Fly   688 KTMTVDEFWTLFKAKLVDTVACIDYKKEVTT-----LQVPYQRDYQSAALTMLLTLPG------E 741
            ..|...:||.:          |.::.::..:     ||...:.:......:...|..|      :
  Rat   748 HGMENKQFWNV----------CYEHLEKAASHAEKELQKDTRDEESEGGGSWEQTQEGDVGTLYQ 802

  Fly   742 QQLTLQ-------QALNYRQLLWQSVPKLGTLAEVKNADLVRLFLQFVDNEYRAQLEKSEHTWNV 799
            |||.|:       ...|:|.|||:::.|.....|.::.:|..|||:|::|||        :..::
  Rat   803 QQLALKTDCRERLDHTNFRFLLWKALAKFPERVEPRSRELSPLFLRFINNEY--------YPADL 859

  Fly   800 NEATAADI----------DVEE-----DDENENNETKPEPRGRQKRRTQNAHTKFILQTLQLKLA 849
            ..|...|:          :|||     :.|:...|..|.....||::|:.|..|.::..||:   
  Rat   860 QVAPTQDLRRKGRGAVSEEVEEEPAAGEGEDVEEEAAPTDEAPQKKKTRRAAAKQLIAHLQV--- 921

  Fly   850 CFVSQPNPKALHRQAEMHDFYLELLAGPNSQLQQLALDCLAAYKQPAALVQQKAQLSGLIDEEKF 914
             |....||:||:.::::::.||:||...:..:|::.|||:..|:.| .::..:..|..|:|:..|
  Rat   922 -FSKFSNPRALYLESKLYELYLQLLLHQDQAVQKITLDCIMTYRHP-HILPYRENLQRLLDDRSF 984

  Fly   915 KTTLSGFELSS----ITAQQRSELIPFMLRVLYGKMLTK---GVQKQLSAQLRKTLILRFLGQLE 972
            |..:..|.:|.    :.|..|::|.|.::|:|||:|..|   ..|.:.::..|.:::||||...:
  Rat   985 KEEIVHFNISEDNSVVKAAHRADLFPILMRILYGRMKHKTGSKTQGKSASGTRMSIVLRFLAGTQ 1049

  Fly   973 ESEIMDFLQMAFGRFSAYTDKPVDEVAKYARESYDPSAVIAAKQLQRIVNLLELIRKEFAGKLTS 1037
            ..||..||.:.......:.|.........|.|..|.|.|:...:...::|.||::.|..: .|.|
  Rat  1050 PEEIQFFLDLLSEPVKHFKDGDCCSAVIRAVEDLDVSKVLPVGRQHGVLNSLEIVLKNIS-HLIS 1113

  Fly  1038 DFQCYVLKLLLLVGSVAQEVINGEGKL----VAAYKNVKHSGLQTLVNYFGQLVDMEEL-WQEPQ 1097
            .:...:|::||.:.:....:::...|:    :...||::..|::.:.:.|   :|.|.. :...:
  Rat  1114 TYLPKILQILLCMTAAISHILDQREKIQLRFINPLKNLRRLGIKMVTDIF---LDWESYQFSAEE 1175

  Fly  1098 MNAICEVYLWPGIARLSQDSIHTPTPMLKLLLLWGGEPRFQKWLKKSAPA-DKLPIMHHLMALLL 1161
            ::|:....:||.|.||..:|.::|||:|||:.:|....|:...|.|..|. .:..|:.::.|:|.
  Rat  1176 IDAVFHGTVWPQICRLGSESQYSPTPLLKLISIWSRNARYFPLLAKQKPGHPECDILTNVFAVLS 1240

  Fly  1162 NEKAKPNVKRAILQVVEHLLESAATEEYGAEAL------------------------SIVHPHIP 1202
            .:.........|:.:|:.||.....|.  .||:                        .::.||:|
  Rat  1241 AKNLSGATASIIMDIVDDLLNLPDFEP--TEAVPSLPVTGCVYANVAENTEPVTVGGRLILPHVP 1303

  Fly  1203 TILQQLQ----NSWRHKKAGRQTLDKRELNILTLITSHVEEPDTCELLLQVLLPIFTKQSASAAP 1263
            .|||.|.    ::.:.||...:....:||.||:.|:..:::.:.|.||:.:|||...:  .:...
  Rat  1304 AILQYLSKNTISAEKVKKKKNRAQVSKELGILSKISKFMKDREQCSLLITLLLPFLLR--GNVPQ 1366

  Fly  1264 ETVVQLVTTLGNLLKRVSKPQNYLRQLAPLFEQVSALPARKLLCDL---LADMAKQLHKEAKQNP 1325
            :|.:.::.|:.|||:....|.::||.||.||..:....:|:|||.:   |:|....|        
  Rat  1367 DTELDILVTVQNLLQHCLDPSHFLRPLAKLFSVIKNKLSRQLLCTVFQSLSDCESGL-------- 1423

  Fly  1326 DISPIAASLREWVRIVLLLNAWDKRWLEQPDYDKRLEAL----SELKQLAEKKDKKIDLQLGVLV 1386
                      :::..::.|||:|||.|:..::|.|..|.    |.:|.:     :.:|:...|.|
  Rat  1424 ----------KYITDIVKLNAFDKRHLDDINFDVRFSAFQTITSHIKAM-----QTVDVDYLVAV 1473

  Fly  1387 VYNCFYMLR-NDSDLGMRVNI--GELLKPLLPLITLQLEVKEDLHFWLEDTVLPLLQRCMRDEKH 1448
            ::||||.:. .|..|....:|  ..::|.|..|...:.|.||.:|    .|:|..|::.::.:. 
  Rat  1474 MHNCFYNMEIGDMSLSDNASICLTSIIKRLAALNVTEKEYKEIIH----RTLLEKLRKGLKSQT- 1533

  Fly  1449 EHARSEAIGLLGELARQCPAAHEILKDLSPLTDKYDLEVDFFENMLHLQTQRHGRALQRLVN--I 1511
            |..:.:...:|..|.:..|...| .|||..||..:|.|:||||||.|:|..|..|||::|.|  :
  Rat  1534 ESVQHDYTLILSCLIQTFPNQLE-FKDLVQLTHYHDPEMDFFENMKHIQIHRRARALKKLANQLL 1597

  Fly  1512 SGGSWRTVPPCARTLTQFLLPLATRYLMSERHSGKHTLVDAAIEAVGVMSEFLPWTQYQAVLRYY 1576
            .|    .|...:::|..:::|.|...::.|:......:..||.|.:|.:...|.|..|...|:::
  Rat  1598 EG----QVMLSSKSLQNYIMPYAMAPILDEKMLKHENITIAATEVIGAICRHLTWPAYVYYLKHF 1658

  Fly  1577 LQKLRHVHSQQKQCVRVVVRILDAFHFDLTQAQTDLVSLAKLKEKLIEAVEAKE----PAEESDE 1637
            :..|:.....||..|.::|.:|:|||||....:..:.:: |.:|..:|..|..|    ..|:.||
  Rat  1659 IHVLQSGQINQKLAVSLLVIVLEAFHFDYKTLEEQMGNV-KNEENTVEMTELLEHEAMEVEDMDE 1722

  Fly  1638 VKAEE---------------DAEADEVPVKKEDD----QSDFIDFEEEDPNEPVVEQQRTQLLAP 1683
            .:.|:               :|.|.|....||.:    ...|:...:|       |.:||     
  Rat  1723 QEKEQASERLSDSKEPSGAPEAAASEGTAAKEPECISKSVSFLPRNKE-------ELERT----- 1775

  Fly  1684 NAAKKVMATITTVLLPTLNRSITEKTNYDTKHKVNRRRLSYEREEEEIQRVPIALAMVKLLQKLP 1748
              .|.:...||..:||.|::.:...|..:.:||:.:.::.   .:||:.|||:|.|||||::.||
  Rat  1776 --IKTIQGAITGDILPRLHKCLAAATKREEEHKLVKSKVV---NDEEVVRVPLAFAMVKLMRSLP 1835

  Fly  1749 LELLENSLPGIFMKVCTFLRSPLKSVRMLTRDILKKIMITLGGSYLGMLLEQLQSLLTRGFQVHV 1813
            .|::|.:||.|.:|||..|::..:.:|.:.|..|.|||..||..:|..:|::||:.|.||:||||
  Rat  1836 REVMEANLPSILLKVCVLLKNRAQEIRDIARSTLCKIMEDLGVHFLQYILKELQTTLVRGYQVHV 1900

  Fly  1814 LSVTLHGVLDALKSDLKPEHIENCLQNLLEVALNDIFGDVNAEKEVEKIVAHTPEAKPSAKSYLT 1878
            |:.|::.:|..|.|.|....:::|||.:.|:..:::||.:..||||::|::...||:.| |||.:
  Rat  1901 LTFTVYTLLQGLSSKLHVGELDSCLQIMTEIFNHELFGALAEEKEVKQILSKVMEARRS-KSYDS 1964

  Fly  1879 LNIAARHIRDNCLLDLLLPFKEHLARSHSRKVTQKIQECFAKIVGGLVENTHIARESLLIFIYGT 1943
            ..|..:.:....:..|:||.||.|..:.|.|:.:|:.|...:|:.||:.|..:..::||:..||.
  Rat  1965 YEILGKFVGKQQVTKLILPLKEILQNTTSLKLARKVHETLRRIIAGLIVNPDMTADALLLLSYGL 2029

  Fly  1944 MSESISDLLPGTKKRQLTEKEQALMKRTRP---------DCLILQPAPGRRSVATGNKQVKSNAQ 1999
            :||:    ||     .|||||:   |...|         .||:|...|    |..|.|.|.|. :
  Rat  2030 VSEN----LP-----LLTEKEK---KPAAPVPDARLPPQSCLLLPATP----VRGGAKAVVSK-K 2077

  Fly  2000 ANAHILVEFGLELLHFVLKRKKLTDLDYQ--PFLHPLLPLLKDSLSSNHARTTTYALKCYTAIWL 2062
            .|.|:.:|.||.|||..||..|:.....:  ..|.|.:.:|.:.|.:...:..|.||:|  .||:
  Rat  2078 TNMHVFIESGLRLLHLSLKTSKIKSSSERVLEMLDPFVSVLINCLGAQDVKVITGALQC--LIWV 2140

  Fly  2063 GEYELSDLNREALQPVVARMFQILKNFSTFGATRQEENAQLVRASFKAVVALLRKCEDYQLSNEQ 2127
            ..:.|..:..:|.| :...:|.:|||::..||.| .:|..||...||.|..:::|.:.:|::.:|
  Rat  2141 LRFPLPSIATKADQ-LTKHLFLLLKNYARLGAAR-GQNFHLVVNCFKCVTIVVKKVKSHQITEKQ 2203

  Fly  2128 IEQLLLHIEQELQEGECSSQTMVFTLLKALVGRKVDSRSLHDLMKRLGDLSIISSSDYVRDECRG 2192
            ::.||.:.|:::.  :.|.|...|.||||::.||:....:.|:|:::..|:|.:.|:..|.:||.
  Rat  2204 LQVLLAYAEEDIY--DTSRQATAFGLLKAILSRKLLVPEIDDVMRKVSKLAISAQSEPARVQCRQ 2266

  Fly  2193 ILLTYIMEYTLRQKVEQIVKFMSVQLCYSQTAGRQSAIQFMHSIINKFPQLMLVKQSEFLYLSLG 2257
            :.|.||::|.|.:|:...::||..||.|....||:|.::.:..:...|||.:|.......::.|.
  Rat  2267 VFLKYILDYPLGEKLRPNLEFMLAQLSYEHETGRESTLEMIAYLFETFPQGLLHDYCGMFFIPLC 2331

  Fly  2258 TRLVNDEDPSCRRSVAAALEALIGRLTKLERQPLLDLTLLFFTAPQSSQKPGVREMAAALLSRFV 2322
            ..::||:...|:|..:.|:::|:.::::.::..|..|...:|.|    :|...|::||.....||
  Rat  2332 LMMINDDSAMCKRMASMAVKSLLSKVSREKKDWLFALVTSWFEA----KKRLNRQLAALACGLFV 2392

  Fly  2323 EAEKAGFAERLPLVLPTLVNVLTLGHAEAGGRFVRAPGYLAAEVDESELHKKNKRKKFKTLPDED 2387
            |:|...|..||..:||.                      :..|:|.         :.||.:    
  Rat  2393 ESEGVDFERRLGTLLPV----------------------IEKEIDP---------ESFKDI---- 2422

  Fly  2388 LLLAGLDNESILEQQQRKADHQLIQLQYCLLKIFEHCGESLLNNPQLSDTVDDLAYGSQRLLNHD 2452
                      |.|.:::.||..|......:.|:.:.|  ::|:..:.|:|:..:.......|.|.
  Rat  2423 ----------IEETEEKAADRLLFGFLTLISKLIKEC--NILHFTKPSETLSKIWSHVHSHLRHP 2475

  Fly  2453 HNWVRCNAAKLLTHIVAHYDFAYIGQQLSGIKLEAGAKK------ALYFIYAQPAEDIKSLVLDL 2511
            |:||...||::...:.|......:.|:..|.|    |||      |:.|:.:...:.:||..|..
  Rat  2476 HSWVWLTAAQIFGLLFASCQPEELIQKWKGKK----AKKKTSDPVAVKFLTSDLDQKMKSFSLAS 2536

  Fly  2512 CAQVTPGETAQEMIDELSKILLFVGHM--LRDVPFSLKQEKNDD--------------------- 2553
            |.|:........:.:::.|.|||:..:  |.::....|||:..|                     
  Rat  2537 CHQLHSRFLDASLGEQVVKNLLFIAKVLYLLELDSENKQERLKDSEEQDTLGDALAREAAEEKAA 2601

  Fly  2554 ---------EEEREPVNKISLTWLIRNIRFLINKEVAKAPHDISIRTAMFTLIEALSTLLSVESV 2609
                     ||:.||....:|.|||:.:..:...|.|.:|.:...||.:|..:.|::..|.|:.|
  Rat  2602 ADGKTESSREEKEEPSKPATLMWLIQKLSRMAKLEAAYSPRNPLKRTCIFKFLGAVAVDLGVDRV 2666

  Fly  2610 TRLAPSLLQALVREMSEEDQNVDAELRQQALRVGSRLRKRIGAEVYDKLRNAVQTKLMARRAERR 2674
            ....|.::..|.||::......|..|:..:..:...|:|.:|.|.:.....:||.:...:||.|:
  Rat  2667 KPYLPVIIAPLFRELNSTYSEQDPVLKNLSQEIIELLKKLVGLESFSLAFASVQKQASEKRALRK 2731

  Fly  2675 KVVAQEKIHDPERAAKRKAGMQERKKAAKRLKAAVVRGKAPDIKQKLKK 2723
            |..|.|.:.:|:.|||:|....:.|..||:.|...:|   |..|.|.:|
  Rat  2732 KRKALEFVTNPDIAAKKKLKKHKNKSEAKKRKIEFLR---PGYKAKRQK 2777

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG4554NP_611676.1 DRIM 840..1446 CDD:462198 165/656 (25%)
FYDLN_acid <1606..1667 CDD:450301 15/83 (18%)
DUF6700 1723..1944 CDD:466565 83/220 (38%)
Utp20NP_001421474.1 DRIM 910..1533 CDD:462198 167/662 (25%)
DUF6700 1814..2030 CDD:466565 83/216 (38%)

Return to query results.
Submit another query.