Protein Alignment CngB and Elk

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_611607.2
• Gene: CngB / 37479
• FlyBaseID: FBgn0266346
• Length: 1040
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_477009.1
• Gene: Elk / 37047
• FlyBaseID: FBgn0011589
• Length: 1284
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 792
• Identity: 166/792 - (20%)
• Similarity: 306/792 - (38%)
• Gaps: 182/792 - (22%)

  Fly   337 AVDEPDTEM----NSDVDHRKPSSAGSLDSQGQQFLRDQVRHLVRRFTARANKVKSRIELPPTPS 397
            |..:.|||.    |.||      .||.  :.|::..|..:..|...:......||::::|    .
  Fly   182 AASDGDTEAGEGNNLDV------PAGC--NMGRRRSRAVLYQLSGHYKPEKGGVKTKLKL----G 234

  Fly   398 SSSTVSSPSPPP---TKSLHPSPQHKVRLVPAGQSPHRGRLFEADTPRSNVWLCSSLCGANNDER 459
            ::...|:.:|.|   |:|:     .|.||:    .||.| :|:      .:|
  Fly   235 NNFMHSTEAPFPEYKTQSI-----KKSRLI----LPHYG-VFK------GIW------------- 270

  Fly   460 TLDPQGKIYISWLCVVSLSFLYNAWVIPLRASF---PFQTKENTNIWLACDFCADIIYLLDVVFF 521
                      .|  |:.::..|.|.::|..|:|   ..|||       ..|...:.::::|::..
  Fly   271 ----------DW--VILVATFYVALMVPYNAAFAKADRQTK-------VSDVIVEALFIVDILLN 316

  Fly   522 KHRVMYLFEGFWVKNKNLTRKNYMRKLQFKLDLLALLPLELLY----FKLGTQAVWLRFPRFFKI 582
            ........:|..|.|......||:|. .|.|||||.||.:.||    :......:.|     .|:
  Fly   317 FRTTFVSRKGEVVSNSKQIAINYLRG-WFALDLLAALPFDHLYASDLYDGEDSHIHL-----VKL 375

  Fly   583 QSFWEVFRLLDRVIS-SPHFVRVAKTLTYMLYMI----HITAALYY--AYSDYQGLGQNR--WV- 637
            .....:.|||.::.. |.|   .|..||.:::..    |..|.::|  |..:|:...::.  |:
  Fly   376 TRLLRLARLLQKIDRYSQH---TAMILTLLMFSFTLAAHWLACIWYVIAVKEYEWFPESNIGWLQ 437

  Fly   638 -----------FSGKGHPYVRCFAFATKTATSIG-KNPKPERQGEYVFMTVAWLMGVFVFALLIG 690
                       .......|.....|...:.||:| .|.......|.||..:..|:|..:.|::.|
  Fly   438 LLAERKNASVAILTTAETYSTALYFTFTSLTSVGFGNVSANTTAEKVFTIIMMLIGALMHAVVFG 502

  Fly   691 QIRDIIST--ATRNKHE--YRQLEDETLEYMRRLNLSQEVQSRVKMWFQFTWEQQRTLDESNILD 751
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  Fly   503 NVTAIIQRMYSRRSLYESKWRDLKD----FVALHNMPKELKQRIEDYFQTSWSLSHGIDIYETLR 563

  Fly   752 ALPINLKTDIAISVHIQTLSKVQLFADCEEALLRDLVLKLRAVTFLPGDFVCRKGEVGREMYIVK 816
            ..|..|:.|:::.:|.:.| ::.:|....:..|:.|.|.::.....||:::..||:....:|.:.
  Fly   564 EFPEELRGDVSMHLHREIL-QLPIFEAASQGCLKLLSLHIKTNFCAPGEYLIHKGDALNYIYYLC 627

  Fly   817 LGQVQVMGGPSSDVVLATLTEGSVFG---EISLLGIN-----------GAD---RRTADVRSKGY 864
            .|.::|:   ..|:|:|.|.:|.:.|   .:.|:..:           |.|   |.::|:::..|
  Fly   628 NGSMEVI---KDDMVVAILGKGDLVGSDINVHLVATSNGQMTATTNSAGQDVVVRSSSDIKALTY 689

  Fly   865 SNLFVLSKSDLNEVIAYYPTAQAILKKRARQLMRKN-------------------AAREREEERE 910
            .:|..:....|.||:..||..|.......:..:..|                   :..|.:|.||
  Fly   690 CDLKCIHMGGLVEVLRLYPEYQQQFANDIQHDLTCNLREGYENQDSDIGPSFPLPSISEDDENRE 754

  Fly   911 RARSALQADVVIGNPKTPETAPKLLQTVIQALPFESPAVVLITRGSKRMRRKRQSVQMETIVEPK 975
            .|....:.:...|.  .|.:....|..:..: |..:....|:..||.|.:|..|..:
  Fly   755 EAEEGGKGEKENGG--GPPSGASPLHNISNS-PLHATRSPLLGMGSPRNQRLHQRGR-------- 808

  Fly   976 MEVTGAAETQDQKGLKTGRCSPDLLS-----SIQQELKS--KHKFINLTDSEKALISQ------- 1026
             .:....||..:.......||.|..|     .:::|..|  |...:...||:.:.:.|
  Fly   809 -SLITLRETNKRHRTLNAACSLDRGSFEEPEPLEEEQSSGGKRPSLERLDSQVSTLHQDVAQLSA 872

  Fly  1027 ---SANNSLEDM 1035
               :|.::|::|
  Fly   873 EVRNAISALQEM 884

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CngB	NP_611607.2	PLN03192	411..>891	CDD:215625	116/529 (22%)
		CAP_ED	775..889	CDD:237999	30/130 (23%)
Elk	NP_477009.1	PAS_9	40..133	CDD:463873
		PLN03192	270..>650	CDD:215625	94/428 (22%)
		cNMP	586..716	CDD:197516	30/132 (23%)