DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG9485 and aglb

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_726062.2 Gene:CG9485 / 37435 FlyBaseID:FBgn0034618 Length:1629 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_068073337.2 Gene:aglb / 553352 ZFINID:ZDB-GENE-050309-54 Length:1568 Species:Danio rerio


Alignment Length:1630 Identity:735/1630 - (45%)
Similarity:1015/1630 - (62%) Gaps:126/1630 - (7%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    53 LDSVAIRTVPSANANAMGNAGSAEIVSNQIIRRREMSTMGKETESHSIPISEGQDAEHILYRLKR 117
            |..||.||....:|......|..:..:..:.|       ||:|  ..:.:::.:..|..|:||::
Zfish     4 LSDVAARTAGDPDATFPVFKGHPKKSTASMFR-------GKQT--RVLLLNDMESMERTLFRLEQ 59

  Fly   118 GSKLSVHPDASLLGRKIVLYTNYPAEGQKFVRTEYRVLGWQLSNGKQITSVMHPEAHVVDTDIRS 182
            |.:|......:|.|:.:.::|||||..:|||.:.:|.|.|:..:|::           .|:|...
Zfish    60 GFELQFRLGPTLQGKSVHVHTNYPALYKKFVASSFRQLEWENPSGRE-----------DDSDKYC 113

  Fly   183 QVELNMSGTYHFYFRYLERPDTGCSGAD--GALYVQVEPTLHVGPPGAQKTIPLDSVRCQTVLAK 245
            :::|.::|:|.:||        ||....  |..|:.|:|.|.||  ..:|.:|||.:..||.|||
Zfish   114 KLDLEIAGSYQYYF--------GCGNEQKTGGGYIIVDPVLRVG--HERKILPLDCITVQTYLAK 168

  Fly   246 LLGPLDTWEPKLRVAKEAGYNVIHFTPIQELGGSRSCYSLRDQLKVNSHFAPQKGGKISFEDVEK 310
            .|||||.|..:|:||:|.|||:|||||:|:||.|:||||:.|||::|..|:| .|...::.||..
Zfish   169 CLGPLDEWLDRLKVARETGYNMIHFTPLQKLGMSKSCYSIADQLELNPDFSP-PGKNYTWMDVGN 232

  Fly   311 VIKKCRQEWGVASICDIVLNHTANESDWLLQHPDATYSCATCPYLRPAFLLDATFAQCGADIAEG 375
            :.:|.::||.:..|.|:|.||||..|.|:..||:..|:....|:|:||:|||.........||:|
Zfish   233 LTEKLKKEWNMICITDVVYNHTAANSKWIRLHPECGYNLVNSPHLKPAWLLDRALWHFSCAIADG 297

  Fly   376 SLEHVGVPAVIEQECHLEALKYQLHTSYMSKVNIHELYQCDVMKYVNEFMSQVRTREPPKNVANE 440
            .....|:|.:||.|.|:..||..|.|...:.:.:.|..|.:|.|.|.:|...::....|.....|
Zfish   298 KYSDGGLPPLIENEKHITILKGLLWTEVFTHLKLWEFLQVNVEKAVEQFRKVLQAGNKPVGPELE 362

  Fly   441 CRFQEIQLIQDPQYRRLASTINFELALEIFNAFHGDCFDEESRFRKCAETLRRHLDALNDRVRC- 504
            .: .::::|||.|:|||::|::.:||||:|    |...:......:|.:..::.|:.||  |.| 
Zfish   363 GK-PKLKVIQDSQFRRLSNTVDMQLALEMF----GRHTNGPKSIEECCDWFKKSLEELN--VECY 420

  Fly   505 -EVQGYINYAIDNVLAGVRYERVQGDGPRVKEISEKHSVFMVYFTHTGTQGKSLT-EIEADMYTK 567
             |:..:...|||.::..|.|||:...||::..:::.:.:.:.|||.   ..:.:| |.|:.:...
Zfish   421 KEMHSHHEKAIDCIVGTVCYERIAAHGPQLGPVTQTNPLVLRYFTF---PFEDMTMEQESQLMQD 482

  Fly   568 AGE--FFMAHNGWVMGYSDPLRDFAEEQPGRANVYLKRELISWGDSVKLRFGRRPEDSPYLWQHM 630
            ...  ..:|||||||| .||||:|||   ..:.|||:|||:.||||||||:|.:|||.||||.||
Zfish   483 PNNACHLLAHNGWVMG-DDPLRNFAE---AGSTVYLRRELVCWGDSVKLRYGDKPEDCPYLWAHM 543

  Fly   631 TEYVQTTARIFDGVRLDNCHSTPLHVAEYLLDAARKINPELYVVAELFTNSDYTDNVFVNRLGIT 695
            .:|.:.||:.|.|||||||||||||||||:|..||:..|:|||||||||.|:..||||:.|||||
Zfish   544 KKYTEITAKHFSGVRLDNCHSTPLHVAEYILAVARQHRPDLYVVAELFTGSEELDNVFMTRLGIT 608

  Fly   696 SLIREALSAWDSHEQGRLVYRYGGVPVGGFQANSSRHEATSVAHALFLDLTHDNPSPVEKRSVYD 760
            ||||||:||.||||:||||||:||.|||.|...:.|....|:|||:|||:||||..|::.||.||
Zfish   609 SLIREAMSAGDSHEEGRLVYRFGGEPVGSFIQPNLRPLEPSIAHAMFLDVTHDNECPIQVRSAYD 673

  Fly   761 LLPSAALVSMACCATGSNRGYDELVPHHIHVVDEERTYQEW--------GKGVDSKSGIMGAKRA 817
            .|||:|:|||||||:||.|||||||||.|.||.|||.|.:|        |:.|:..|||...|.|
Zfish   674 ALPSSAIVSMACCASGSTRGYDELVPHQISVVKEERLYPKWNPDALPSSGREVNLHSGITAGKLA 738

  Fly   818 LNLLHGQLAEEGFSQVYVDQMDPNVVAVTRHSPITHQSVILVAHTAFGYPSPNAGPTGIRPLRFE 882
            ||.||.:|||.||:||||||:|.:.||||||.|.|||||:.|..|||..|..:.....:.|:...
Zfish   739 LNKLHQELAENGFTQVYVDQLDEDTVAVTRHCPSTHQSVVTVCRTAFKDPKTHQFRESLAPMYIP 803

  Fly   883 GVLDEIILEASLTMQSDKPFDRPAPFKKDPNVINGFTQFQLNLQEHIPLAKSTVF-QTQAYSDGN 946
            |.::|:||||....:|.:      .:.||...|||...:.:.::|||.|.:|.:. |..|.:.|.
Zfish   804 GKIEEVILEARTVERSAE------SYVKDETFINGLPNYTVEIREHIQLKESQIVKQGDATTKGR 862

  Fly   947 N---TELNFANLRPGTVVAIRVSMHPGPR----------TSFDKLQK--------ISAALRIGSG 990
            :   .|:.|..|.||:|:|.|||:.|..:          :.|::|.|        ::..|:|   
Zfish   863 SEFVEEILFEKLTPGSVIAFRVSLDPNSQKMVGYLRTQLSQFNRLFKSGSLTDSNVAGILKI--- 924

  Fly   991 EEYSQLQAIVSKLDLVALSGALFSCDDEERDLGKGGTAYDIPNFGKIVYCGLQGFISLLTEISPK 1055
                .|:.::|||.|..|:..||.||.||::  .||..|:||::..:.|.|||||:|:|:||.||
Zfish   925 ----SLEFLISKLTLAELNVLLFRCDAEEQE--DGGGCYNIPSWMPLKYGGLQGFVSVLSEIRPK 983

  Fly  1056 NDLGHPLCNNLRDGNWMMDYISDRLTSYED-LKPLSAWFKATFEPLKNIPRYLIPCYFDAIVSGV 1119
            ||||||.|:|||.|||::||:|.||.:... |:.:..||||.|..||::||||:|||||||:.|.
Zfish   984 NDLGHPFCDNLRQGNWILDYVSTRLINKGGALREVGKWFKAVFSYLKHLPRYLVPCYFDAIIVGA 1048

  Fly  1120 YNVLINQVNELMPDFIKNGHSFPQSLALSTLQFLSVCKSANLPGFSPAL--------SPPKPPKQ 1176
            |...::.|...|..|:.||.:..:.|||.::|...|.:...||..||.|        |..|..:|
Zfish  1049 YATAVDAVFNQMSSFVLNGSTLVKQLALGSVQMCGVGRVPALPHLSPELEDVPVRVNSATKQEEQ 1113

  Fly  1177 -CVTLSAGLPHFSTGYMRCWGRDTFIALRGSMFLTGRYNEARFIIIGFGQTLRHGLIPNLLDSGS 1240
             ||:::|||||||||..|||||||||||||.|.||||:.|||.||:.|..|:|||||||||..|.
Zfish  1114 CCVSIAAGLPHFSTGIFRCWGRDTFIALRGLMLLTGRHLEARDIILAFAGTMRHGLIPNLLGQGV 1178

  Fly  1241 KPRFNCRDAIWWWMYCIKQYVEDAPKGAEILKDKVSRIFPYDDADAHAPG--AFDQLLFDVMQEA 1303
            ..|:|||||:|||:.||:.|....|.|.:||...|||::|.||::|.|.|  |.||.|:.::|||
Zfish  1179 AARYNCRDAVWWWLQCIQDYCTIVPSGTDILMCPVSRMYPTDDSEAQALGTVAHDQPLYVLIQEA 1243

  Fly  1304 LQVHFQGLQYRERNAGYEIDAHMVDQGFNNQIGIHPETGFVFGGNNFNCGTWMDKMGSSQKAGNK 1368
            :|.|.||:|:||||||.:||.:|..:|||.:..::||||||:|||.|||||||||||.|.||.||
Zfish  1244 MQRHMQGIQFRERNAGPQIDWNMQHEGFNVEAKVNPETGFVYGGNGFNCGTWMDKMGESDKAHNK 1308

  Fly  1369 GRPSTPRDGSAVELVGLQYAVLRFMQSLAEKEVIPYTGVE--RKGPSGEVTKWSYKEWADRIKNN 1431
            |.|:|||||||||:|||..:.:|::..:.|....||:.|:  |.|....:|   ||||..||:.|
Zfish  1309 GVPATPRDGSAVEIVGLSKSAVRWLMMMNETGHFPYSSVKIHRDGAEQLIT---YKEWNQRIQEN 1370

  Fly  1432 FDKYFFVSE------SETCSVANKKLIYKDSYGATQSWTDYQLRCNFPITLTVAPDLCNPQNAWR 1490
            |:::|:||:      .:...:.:||.|||||:||:..|.|||||.||.|.:.|||:|.:.|.||:
Zfish  1371 FERFFYVSDDPADPNEQRPDLVHKKCIYKDSHGASSPWCDYQLRPNFTIAMVVAPELFSVQRAWK 1435

  Fly  1491 ALERAKKYLLGPLGMKTMDPEDWNYRANYDNSNDSTDCTVAHGANYHQGPEWVWPIGFYLRARLI 1555
            |||..:..|||||||||:||:|..|...|||:.|:.|...|.|.||||||||:|.:|::|||:|.
Zfish  1436 ALEIVETKLLGPLGMKTLDPDDLVYCGVYDNALDNDDYNRAKGFNYHQGPEWIWLVGYFLRAKLY 1500

  Fly  1556 FAKKCGHLDETIAETWAILRAHLRELQT----SHWRGLPELTNDNGSYCGDSCRTQAWSVAAILE 1616
            |.:|.|  .|...::..:::..|..|.|    |.|:|||||||:||.||..||.|||||:|.:||
Zfish  1501 FGRKMG--QEKYNQSVYLVKNVLSRLHTHLERSPWKGLPELTNENGQYCPFSCETQAWSIATVLE 1563

  Fly  1617 VLYDL 1621
            .|:||
Zfish  1564 ALFDL 1568

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG9485NP_726062.2 RNA_pol_I_A49 <30..>76 CDD:462024 7/22 (32%)
glyc_debranch 112..1621 CDD:273673 721/1569 (46%)
aglbXP_068073337.2 None

Return to query results.
Submit another query.