DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG10505 and Cftr

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_611571.2 Gene:CG10505 / 37428 FlyBaseID:FBgn0034612 Length:1312 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_006236159.2 Gene:Cftr / 24255 RGDID:2332 Length:1665 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1510 Identity:406/1510 - (26%)
Similarity:699/1510 - (46%) Gaps:255/1510 - (16%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    12 ESNPFIKANIISKWLFLWMHSVFRKGRREELDASKLYEHLPSFDS-ESLTRNLQPHWEKE-SKKK 74
            :.:|..||:.|||..|.|...:.|||.|..|:.|.:|: .||.|| :.|:..|:..|::| :.||
  Rat   191 QKSPLEKASFISKLFFSWTTPILRKGYRHHLELSDIYQ-APSSDSADHLSEKLEREWDREQASKK 254

  Fly    75 NPSLMRLIFKVYGWQFVPVCILYSLLEMAIHSFQPLLLGGLISYFAYGQTTVTKESAYLYAMGIV 139
            .|.|:..:.:.:.|:||...:|..|.|:. .:.||:|||.:|:  :|......:.|..:| :||.
  Rat   255 KPQLIHALRRCFVWRFVFYGVLLYLGEVT-KAVQPVLLGRIIA--SYDPDNTEERSIAIY-LGIG 315

  Fly   140 LCSL--VTSLVFHPFMFYVFAVGTRVRLACAGLVYRKCLRASASSGEGLG-GQAISVMSIDLSQF 201
            ||.|  |.:|:.||.:|.:..:|.::|:|...|:|:|.|:.|:...:.:. ||.||::|.:|::|
  Rat   316 LCLLFIVRTLLLHPAIFGLHHIGMQMRIAMFSLIYKKTLKLSSRVLDKISIGQLISLLSNNLNKF 380

  Fly   202 DLTFYFFHDLWKGPVEACIFGYLMTRQVGWTSLIGIAFIVILIPLQAWAAKASASFGTRSAKHRD 266
            |......|.:|..|::..:...|:...:.:::..|:..:::|:..||...|....:..:.|...:
  Rat   381 DEGLALAHFIWIAPLQVVLLMGLLWDLLQFSAFCGLGLLIVLVIFQAILGKMMVKYRDKRAAKIN 445

  Fly   267 ARVKLMNEIIGAIQVIKMYAWEKSFGRLIAAVRQSEVKAIRGSMSIYAALQCTNMISK-ISLFLS 330
            .|:.:.:|:|..|..:|.|.||.:..::|.::|:.|:|..|.|..:..........|. ..:|||
  Rat   446 ERLVITSEVIDNIYSVKAYCWESAMEKIIESLREEELKMTRRSAYMRFFTSSAFFFSGFFVVFLS 510

  Fly   331 LVAYVYVGDLVTAKKVFILSSYYGLLNDSLLHYWPMAITTWAQTLVSARRVVEFL---------- 385
            ::.|..:..:| .:|:|...|:..:|..|:...:|.|:..|..:|...|::.:||          
  Rat   511 VLPYTVINGIV-LRKIFTTISFCIVLRMSVTRQFPTAVQIWYDSLGMIRKIQDFLQTQEYKVLEY 574

  Fly   386 ------LQVEKPT---EESCCRDNPGLELDAEKPKPAQSGRLHCVQSETKCLSFRKVSASWDKPS 441
                  |.:|..|   ||........::|:.:..| ..:|..|        |||..:....:   
  Rat   575 NLMFTGLVMENVTAFWEEGFQELLEKVQLNNDDRK-TSNGENH--------LSFSHLCLVGN--- 627

  Fly   442 IKQPRKPHIEGISFHINAGQFVGIVGNVGSGKSTLLHAILGEIELMQGRVEVHGRISYAAQQPWV 506
                  |.::.|:.:|..|:.:.|.|:.|:||::||..||||:|..:|.::..||:|:::|..|:
  Rat   628 ------PVLKNINLNIKKGEMLAITGSTGAGKTSLLMLILGELEASEGIIKHSGRVSFSSQISWI 686

  Fly   507 FQGSIRENILFVEQYEEKRYRAVVHACQLDRDLELLPRGDATVVGERGISLSGGQKARIALARAV 571
            ..|:|:|||:|...|:|.||::||.||||..|:......|.||:||.|::|||||:|||:|||||
  Rat   687 MPGTIKENIIFGVSYDEYRYKSVVKACQLQEDITKFAEQDNTVLGEGGVTLSGGQRARISLARAV 751

  Fly   572 YRQADIYLFDDPLAAVDAQVGKLLMDKCFHRLLDGKMRILVTHHVQLLKSVDQLLLLEGGKLTQQ 636
            |:.||:||.|.|...:|....:.:.:.|..:|:..|.|||||..::.||..|::|:|..|.....
  Rat   752 YKDADLYLLDSPFGYLDVLTEEQIFESCVCKLMASKTRILVTSKMEQLKKADKILILHEGSSYFY 816

  Fly   637 GSYEELKDV-------------------------------------------------------- 645
            |::.||:.:                                                        
  Rat   817 GTFSELQSLRPDFSSKLMGYDTFDQFTEERRSSILTETLRRFSVDDASTTWNKAKQSFRQTGEFG 881

  Fly   646 ------------------ITHHAALDLEAIEADKQQVKR-------------------------- 666
                              |.....|.:|. |:|..|.:|                          
  Rat   882 EKRKNSILSSFSSVKKISIVQKTPLSIEG-ESDDLQERRLSLVPDSEHGEAALPRSNMITAGPTF 945

  Fly   667 -------VLSQVDRTSKQLSKGEEKDPATI----------------------QDENGNAEQQLQ- 701
                   ||..:..|...:|...::..|:|                      ||...|..:::. 
  Rat   946 PGRRRQSVLDLMTFTPSSVSSSLQRTRASIRKISLAPRISLKEEDIYSRRLSQDSTLNITEEINE 1010

  Fly   702 ---------------GAVSYDTYKAYF---RALGAPFLVCLVLSMFVLARGCQAVMDIFISRWAT 748
                           ...:::||..||   |.|.|..:.|:::.:          :::..|.:..
  Rat  1011 EDLKECFFDDMVKIPTVTTWNTYLRYFTLHRGLFAVLIWCVLVFL----------VEVAASLFVL 1065

  Fly   749 W-----EEDRGYDSV----DDYEATRTKMVIWYTVLLLL-----TLALFLLRTFGFFFMCLRISL 799
            |     ..:.|.:..    ..|....|....:|...:.:     .|||.|.|........:..|.
  Rat  1066 WLLKNNPVNGGNNGTKIANTSYVVVITSSSFYYIFYIYVGVADTLLALSLFRGLPLVHTLITASK 1130

  Fly   800 TLHDQLYHGIIRAWMYFFNANPSGRVLNRFSSDIQNVDVNLPQAMMDSLQFLVDVV-AVLVIVAI 863
            .||.::.|.|:.|.|..||...:|.:|||||.||..:|..||..:.|.:|.|..|| |::|:.|:
  Rat  1131 ILHRKMLHSILHAPMSTFNKLKAGGILNRFSKDIAILDDFLPLTIFDFIQLLFIVVGAIIVVSAL 1195

  Fly   864 ANYWLL--IPAAIMVILLYFCRALYIGASRSLKRIESLTRSPIYSHTNQTFHGHSTIRSMDAMPQ 926
            ..|..|  :|...:.|||   ||.::..|:.||::||..||||::|...:..|..|:|:......
  Rat  1196 QPYIFLATVPGLAVFILL---RAYFLHTSQQLKQLESEGRSPIFTHLVTSLKGLWTLRAFRRQTY 1257

  Fly   927 LEQTFHGHQNTNSSALFLYVSANRAFSFWTDLICVIYILAVTF-SFLVINQSFYSGDVGLAITQS 990
            .|..||...|.:::..|:|::..|.|....|:|.|::.:.||| |.|...:.  .|..|:.:|.:
  Rat  1258 FETLFHKALNLHTANWFMYLATLRWFQMRIDMIFVLFFIVVTFISILTTGEG--EGTTGIILTLA 1320

  Fly   991 MTLVIMCQWGMRQTAEMENNMTSVERVLEYAQTPSEPPL-----------ESPKSVNLAAE---- 1040
            |.::...||.:..:.:.::.|.||.||.::....:|..:           :||.::.:..|    
  Rat  1321 MNIMSTLQWAVNSSIDTDSLMRSVSRVFKFIDIQTEESICTKIMKELHSEDSPNALVIKNEHVKK 1385

  Fly  1041 ---WPQAGHLRFQDLRMRYSPGDEDILRGLNFESQPMEKIGIVGRTGAGKSSIIQALFRLALNEG 1102
               ||..|.:..:||.::|......||..::|...|.:::|::||||:|||:::.|..|:...:|
  Rat  1386 CDTWPSGGEMVVKDLTVKYVDDGNAILENISFSISPGQRVGLLGRTGSGKSTLLSAFLRMLNIKG 1450

  Fly  1103 TIEIDGLDIGKLGLHDLRSRISIIPQDPVLFSGTLRFNLDPFDEKSDESLWSALDDVKLKKHVAS 1167
            .|:|||:....:.|.:.|....:|.|...:||||.|.||||..:..||.:|...|.|.||..:..
  Rat  1451 EIQIDGVSWNSMTLQEWRKAFGVITQKVFIFSGTFRQNLDPNGKWRDEEIWKVADQVGLKSVIEQ 1515

  Fly  1168 LEGGLSCRMQDGGSNFSMGQRQLVCLARAILRQNRVLVMDEATANVDTETDILIQETIQTKFAEC 1232
            ..|.|:..:.|||...|.|.:||:||||::|.:.:::::||.:||:|..|..:|:..::..||.|
  Rat  1516 FPGQLNFTLVDGGYVLSHGHKQLMCLARSVLSKAKIILLDEPSANLDPITYQVIRRVLRQAFAGC 1580

  Fly  1233 TVLTIAHRLHTVMDNDSVLVMDAGQIVEFGAPHKLLQRKDGALLKLVNQNDATTVKFLKRIASES 1297
            ||:...||:..::|....||::.|.:.::.:...||..|.      |.|...::.:.:|......
  Rat  1581 TVVLCEHRIEAMLDCQRFLVIEQGNVWQYESLQALLSEKS------VFQRALSSSEKMKLFHGRH 1639

  Fly  1298 YMRRNRRDSLTISEE 1312
            ..::..|..:|..:|
  Rat  1640 SSKQKPRTQITAVKE 1654

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG10505NP_611571.2 MRP_assoc_pro 15..1271 CDD:188098 399/1464 (27%)
CftrXP_006236159.2 None

Return to query results.
Submit another query.