DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG10505 and mrp-1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_611571.2 Gene:CG10505 / 37428 FlyBaseID:FBgn0034612 Length:1312 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_508122.2 Gene:mrp-1 / 180409 WormBaseID:WBGene00003407 Length:1534 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:1392 Identity:442/1392 - (31%)
Similarity:704/1392 - (50%) Gaps:176/1392 - (12%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    11 RESNPFIKANIISKWLFLWMHSVFRKGRREELDASKLYE---------HLPSF------DSESLT 60
            :.|.|...|:.:::..|.|...:...|.::.|:...|::         .:|||      :.|...
 Worm   204 KNSCPEYTASFLNQLTFQWFSGLAYLGNKKSLEKEDLWDLNERDKAENIIPSFIENLIPEVEGYR 268

  Fly    61 RNLQPHWEKESKKKNPSLMRLIFKVYGW---------------QFVPVCILYSLLEMAIHSFQPL 110
            |.::.:.|....|.:||::..|||.|.:               |||...:|..|:.......||:
 Worm   269 RKIKKNPEAAIPKNHPSILIPIFKTYKFTLLAGGCYKLMFDLLQFVAPELLRQLISFIEDKNQPM 333

  Fly   111 LLGGLISYFAYGQTTVTKESAYLYAMGIVLCSLVTSLVFHPFMFYVFAVGTRVRLACAGLVYRKC 175
            .:|..|                  |:.:.|.||:.|::.|.:...:|.:|..:|......||.|.
 Worm   334 WIGVSI------------------ALLMFLSSLLQSMILHQYFHEMFRLGMNIRSVLTSAVYTKT 380

  Fly   176 LRASASSGEG-LGGQAISVMSIDLSQFDLTFYFFHDLWKGPVEACIFGYLMTRQVGWTSLIGIAF 239
            |..|..:.:| ..|..:::||:|:.:......|....|..|::..:..|.:.:.:|.:.|.|...
 Worm   381 LNLSNEARKGKTTGAIVNLMSVDIQRIQDMTTFIMLFWSAPLQILLSLYFLWKLLGVSVLAGFVI 445

  Fly   240 IVILIPLQAWAAKASASFGTRSAKHRDARVKLMNEIIGAIQVIKMYAWEKSFGRLIAAVRQSEVK 304
            :::|||..::.:....:......|.:|.|:|:|:||:..::|:|:|:||||..:::..||:.|::
 Worm   446 LILLIPFNSFISVKMRNCQMEQMKFKDERIKMMSEILNGMKVLKLYSWEKSMEKMVLEVREKEIR 510

  Fly   305 AIRGSMSIYAAL----QCTNMISKISLFLSLVAYVYVGDLVTAKKVFILSSYYGLLNDSLLHYWP 365
            .::....:.||.    .|...:..:..|...|.:....:::|.:..|:..:.:.:|...|. .:.
 Worm   511 VLKKLSYLNAATTLSWACAPFLVAVLTFGLYVLWDPENNVLTPQITFVALALFNILRFPLA-VFA 574

  Fly   366 MAITTWAQTLVSARRVVEFLLQVEKPTEESCCRDNPGLELDAEKPKPAQSGRLHCVQSETKCLSF 430
            |..:...|...|..|:.||....|...:.|.                |..|....::.:..    
 Worm   575 MVFSQAVQCSASNTRLKEFFAAEEMSPQTSI----------------AYGGTDSAIKMDGG---- 619

  Fly   431 RKVSASWDKPSIKQPRKPHIEGISFHINAGQFVGIVGNVGSGKSTLLHAILGEIELMQGRVEVHG 495
               |.:|.  |.::.||.|  .|:|:|..||.|.|||.||||||:||||:|||:..:.|.|:|:|
 Worm   620 ---SFAWG--SKEEDRKLH--DITFNIKRGQLVAIVGRVGSGKSSLLHALLGEMNKLSGSVQVNG 677

  Fly   496 RISYAAQQPWVFQGSIRENILFVEQYEEKRYRAVVHACQLDRDLELLPRGDATVVGERGISLSGG 560
            .::|..|..|:...|:|.||||...|:.|.|:.|:..|.|.:|||.||..|.|.:||:||:||||
 Worm   678 SVAYVPQLAWIQNLSLRNNILFNRPYDAKLYQNVIENCALVQDLESLPAEDRTEIGEKGINLSGG 742

  Fly   561 QKARIALARAVYRQADIYLFDDPLAAVDAQVGKLLMDKCFHR---LLDGKMRILVTHHVQLLKSV 622
            ||.|::||||||:.|:|.|.||||:|||:.|||.:.:.....   .|..|.|:|:||.:..||..
 Worm   743 QKQRVSLARAVYQNAEIVLLDDPLSAVDSHVGKHIFENVISTATGCLGTKTRVLLTHGLTYLKHC 807

  Fly   623 DQLLLLEGGKLTQQGSYEEL--------------------------------KDVITHHAALDLE 655
            ||:::|:...:::.|:|:||                                |:|  :....||:
 Worm   808 DQVIVLKDETISEMGTYQELMNSNGAFSEFLEEFLLEESKHKGRSVSFGEDSKEV--NELLRDLD 870

  Fly   656 AIE-ADKQQVKRVLSQV-----DRTSKQLSKGEEKDPATIQDENGNAEQQ--LQGAVS------- 705
            .:. |.:|:::..:||.     |:.::.:..|..||..|.....|.:|::  |.||:|       
 Worm   871 QVSPAIRQRIQSQMSQEIEKTDDKNAEIIRNGLHKDEQTAHSSIGKSEEKESLLGAISPKEKTPE 935

  Fly   706 ---------------------YDTYKAYFRALGAPFLVCLVLSMFVLARGCQAVM-DIFISRWAT 748
                                 ::.|.:||||:|  ..:.||..:..:|.....|. :::::||:.
 Worm   936 PPKQTKTQLIEKEAVETGKVKFEVYMSYFRAIG--IKIALVFFLVYVASSMLGVFSNLYLARWSD 998

  Fly   749 WEEDRGYDSVDDYEATRTKMVIWYTVL----LLLTLALFLLRTFGFFFMCLRISLTLHDQLYHGI 809
            ..::...........|:.::.| |.||    .....|..::...|  .:|  .|..||..|...|
 Worm   999 DAKEIALSGNGSSSETQIRLGI-YAVLGMGQATSVCAASIIMALG--MVC--ASRLLHATLLENI 1058

  Fly   810 IRAWMYFFNANPSGRVLNRFSSDIQNVDVNLPQAMMDSLQFLVDVVAVLVIVAIANYWLLIPAAI 874
            :|:.|.||:..|.||:||||..||..:|..||..:|..:..:|..|.:..:...|......|..|
 Worm  1059 MRSPMAFFDVTPLGRILNRFGKDIDVIDYRLPSCIMTFVGAIVQAVTIFAVPIYATPLSSFPITI 1123

  Fly   875 MVILLYFCRALYIGASRSLKRIESLTRSPIYSHTNQTFHGHSTIRSMDAMPQLEQTFHGHQNTNS 939
            ::|..||....|:..||.|||:||.:|||||||..::..|.|:||:...:.:..:......:.|.
 Worm  1124 VLIGYYFLLRFYVSTSRQLKRLESASRSPIYSHFQESIQGASSIRAYGVVDKFIRESQHRVDENL 1188

  Fly   940 SALFLYVSANRAFSFWTDLICVIYILAVTFSFLVINQS--FYSGDVGLAITQSMTLVIMCQWGMR 1002
            :..:..:.|||..:...:::..:.:|:...:.:....|  ..:|.|||:::.::.:.....|.:|
 Worm  1189 ATYYPSIVANRWLAVRLEMVGNLIVLSSAGAAVYFRDSPGLSAGLVGLSVSYALNITQTLNWAVR 1253

  Fly  1003 QTAEMENNMTSVERVLEYAQTPSEPPLESPKSVNLAAE-WPQAGHLRFQDLRMRYSPGDEDILRG 1066
            .|:|:|.|:.:|||:.||..||:    |...|.:||.: ||:.|.:..::..:||.||.:.:|.|
 Worm  1254 MTSELETNIVAVERINEYTITPT----EGNNSQSLAPKSWPENGEISIKNFSVRYRPGLDLVLHG 1314

  Fly  1067 LNFESQPMEKIGIVGRTGAGKSSIIQALFR-LALNEGTIEIDGLDIGKLGLHDLRSRISIIPQDP 1130
            :.....|.|||||||||||||||:..|||| :..:.|.|||||.:|..|.|..||||::|:||||
 Worm  1315 VTAHISPCEKIGIVGRTGAGKSSLTLALFRIIEADGGCIEIDGTNIADLLLEQLRSRLTIVPQDP 1379

  Fly  1131 VLFSGTLRFNLDPFDEKSDESLWSALDDVKLKKHVASLEGGLSCRMQDGGSNFSMGQRQLVCLAR 1195
            ||||||:|.|||||...||:.:|.||.:..|...|.||:.||...:.:||.|.|:|||||:||||
 Worm  1380 VLFSGTMRMNLDPFFAFSDDQIWEALRNAHLDSFVKSLQEGLHHHISEGGENLSVGQRQLICLAR 1444

  Fly  1196 AILRQNRVLVMDEATANVDTETDILIQETIQTKFAECTVLTIAHRLHTVMDNDSVLVMDAGQIVE 1260
            |:||:.:|||:|||.|.||.|||.|:|:||:.:|.:||||||||||:||||:|.:||:|.|.:.|
 Worm  1445 ALLRKTKVLVLDEAAAAVDVETDSLLQKTIREQFKDCTVLTIAHRLNTVMDSDRLLVLDKGCVAE 1509

  Fly  1261 FGAPHKLLQRKDGALLKLVNQNDATTV 1287
            |..|.|||...||....:.  .||..|
 Worm  1510 FDTPKKLLSNPDGIFYSMA--KDANVV 1534

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG10505NP_611571.2 MRP_assoc_pro 15..1271 CDD:188098 436/1370 (32%)
mrp-1NP_508122.2 MRP_assoc_pro 23..1531 CDD:188098 439/1387 (32%)

Return to query results.
Submit another query.