DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG10505 and Abcc4

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_611571.2 Gene:CG10505 / 37428 FlyBaseID:FBgn0034612 Length:1312 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038948894.1 Gene:Abcc4 / 170924 RGDID:620266 Length:1382 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1380 Identity:524/1380 - (37%)
Similarity:795/1380 - (57%) Gaps:122/1380 - (8%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    14 NPFIKANIISKWLFLWMHSVFRKGRREELDASKLYEHLPSFDSESLTRNLQPHWEKE---SKK-- 73
            ||...||:.|:..|.|::.:|:.|.:..|:...::..||...|:.|...||.:|:||   :||  
  Rat    11 NPLQDANLCSRLFFWWLNPLFKAGHKRRLEEDDMFSVLPEDRSKHLGEELQGYWDKEVLRAKKDA 75

  Fly    74 KNPSLMRLIFKVYGWQFVPVCILYSLLEMAIHSFQPLLLGGLISYFAY--GQTTVTKESAYLYAM 136
            :.|||.:.|.|.| |:...:..:::|:|......||:.||.:|.||..  ...:....:||.||.
  Rat    76 RKPSLTKAIVKCY-WKSYLILGIFTLIEETTRVVQPIFLGKIIDYFEKYDSDDSAALHTAYGYAA 139

  Fly   137 GIVLCSLVTSLVFHPFMFYVFAVGTRVRLACAGLVYRKCLRASASS-GEGLGGQAISVMSIDLSQ 200
            .:.||:|:.:::.|.:.::|...|.|:|:|...::|||.||.|.|: |:...||.::::|.|:::
  Rat   140 VLSLCTLILAILHHLYFYHVQCAGMRIRVAMCHMIYRKALRLSNSAMGKTTTGQIVNLLSNDVNK 204

  Fly   201 FDLTFYFFHDLWKGPVEACIFGYLMTRQVGWTSLIGIAFIVILIPLQAWAAKASASFGTRSAKHR 265
            ||....|.|.||.||::|.....|:..::|.:.|.|:|.:|||:|||:...|..:|..:::|...
  Rat   205 FDQVTIFLHFLWAGPLQAIGVTILLWVEIGISCLAGLAILVILLPLQSCIGKLFSSLRSKTAAFT 269

  Fly   266 DARVKLMNEIIGAIQVIKMYAWEKSFGRLIAAVRQSEVKAIRGSMSIYAALQCTNMIS-----KI 325
            |||::.|||:|..:::||||||||||..||..:|:.|:..|.||    :.|:..||.|     |:
  Rat   270 DARIRTMNEVITGMRIIKMYAWEKSFADLITNLRKKEISKILGS----SYLRGMNMASFFIANKV 330

  Fly   326 SLFLSLVAYVYVGDLVTAKKVFILSSYYGLLNDSLLHYWPMAITTWAQTLVSARRVVEFLLQVEK 390
            .||::...||.:|:.:||..||:..:.||.:..::..::|.||...::.:||.||:..|||..|.
  Rat   331 ILFVTFTTYVLLGNKITASHVFVAMTLYGAVRLTVTLFFPSAIERVSEAVVSVRRIKNFLLLDEL 395

  Fly   391 PTEESCCRDNPGLELDAEKPKPAQSGRLHCVQSETKCLSFRKVSASWDKPSIKQPRKPHIEGISF 455
            |            |..|::|...::           .:..:..:|.|||..    ..|.::|:||
  Rat   396 P------------ERKAQEPSDGKA-----------IVHVQDFTAFWDKAL----DTPTLQGLSF 433

  Fly   456 HINAGQFVGIVGNVGSGKSTLLHAILGEIELMQGRVEVHGRISYAAQQPWVFQGSIRENILFVEQ 520
            ....|:.:.:||.||:|||:||.|:|||:....|.|.|||||:|.:||||||.|::|.||||..:
  Rat   434 TARPGELLAVVGPVGAGKSSLLSAVLGELPPTSGLVSVHGRIAYVSQQPWVFSGTVRSNILFGRK 498

  Fly   521 YEEKRYRAVVHACQLDRDLELLPRGDATVVGERGISLSGGQKARIALARAVYRQADIYLFDDPLA 585
            ||::||..|:.||.|.:||:||..||.||:|:||.:||||||||:.||||||:.|||||.||||:
  Rat   499 YEKERYEKVIKACALKKDLQLLEDGDLTVIGDRGATLSGGQKARVNLARAVYQDADIYLLDDPLS 563

  Fly   586 AVDAQVGKLLMDKCFHRLLDGKMRILVTHHVQLLKSVDQLLLLEGGKLTQQGSYEE-LKDVITHH 649
            ||||:|||.|...|..:.|..|:.|||||.:|.||:...:|:|:.|::.|:|:|.| ||..:...
  Rat   564 AVDAEVGKHLFQLCICQTLHEKITILVTHQLQYLKAASHILILKDGEMVQKGTYTEFLKSGVDFG 628

  Fly   650 AALDLEAIEADKQQV-------KRVLSQVDRTSKQLSKGEEKD--PATIQDENGNA----EQQLQ 701
            :.|..|..||:...|       .|..|:....|:|.|:...||  |.....||..|    |.:.:
  Rat   629 SLLKKENEEAEPSPVPGTPTLRNRTFSEASIWSQQSSRPSLKDGVPDAQDAENTQAAQPEESRSE 693

  Fly   702 GAVSYDTYKAYFRALGAPFLVCLVLSMFVLARGCQAVMDIFISRWATWEEDRGYDSVDDYEATRT 766
            |.:.:..||.||.|..:.|.:..::.:.::.:....:.|.::|.||..:.........:...|.|
  Rat   694 GRIGFKAYKNYFSAGASWFFIIFLVLLNLMGQVFYVLQDWWLSHWANRQGALNDTKNANGNVTGT 758

  Fly   767 KMVIW----YTVLLLLTLALFLLRTFGFFFMCLRISLTLHDQLYHGIIRAWMYFFNANP------ 821
            ..:.|    ||.|..:|:...:.|:...|::.:..|.|||::::..|::|.:.||:.||      
  Rat   759 LDLSWYLGIYTGLTAVTVLFGIARSLLVFYVLVNASQTLHNRMFESILKAPVLFFDRNPIELTQL 823

  Fly   822 ---------------------------------------------------SGRVLNRFSSDIQN 835
                                                               .||:|||||.||.:
  Rat   824 EVFRVVDGALDSHRHLSHPHPWPQNGSLQASVTSVTGSDVIRFPEVLLLALPGRILNRFSKDIGH 888

  Fly   836 VDVNLPQAMMDSLQFLVDVVAVLVIVAIANYWLLIPAAIMVILLYFCRALYIGASRSLKRIESLT 900
            :|..||...:|.:|.|:.||:|:.:.|....|:|||...:.|:....|..::..||.:||:||.|
  Rat   889 MDDLLPLTFLDFIQTLLLVVSVIAVAAAVIPWILIPLVPLSIIFVVLRRYFLETSRDVKRLESTT 953

  Fly   901 RSPIYSHTNQTFHGHSTIRSMDAMPQLEQTFHGHQNTNSSALFLYVSANRAFSFWTDLICVIYIL 965
            |||::||.:.:..|..|||:..|..:.::.|..||:.:|.|.||:::.:|.|:...|.||.::::
  Rat   954 RSPVFSHLSSSLQGLWTIRAYKAEERCQELFDAHQDLHSEAWFLFLTTSRWFAVRLDAICAVFVI 1018

  Fly   966 AVTFSFLVINQSFYSGDVGLAITQSMTLVIMCQWGMRQTAEMENNMTSVERVLEYAQTPSEPPLE 1030
            .|.|..||:.::..:|.||||::.|:||:.|.||.:||:||:||.|.|||||:||.....|.|.|
  Rat  1019 VVAFGSLVLAKTLDAGQVGLALSYSLTLMGMFQWSVRQSAEVENMMISVERVIEYTDLEKEAPWE 1083

  Fly  1031 SPKSVNLAAEWPQAGHLRFQDLRMRYSPGDEDILRGLNFESQPMEKIGIVGRTGAGKSSIIQALF 1095
            ..|  .....||..|.:.|.::...||.....:|:.|....:..||:||||||||||||:|.|||
  Rat  1084 CRK--RPPPGWPHEGVIVFDNVNFTYSLDGPLVLKHLTALIKSREKVGIVGRTGAGKSSLISALF 1146

  Fly  1096 RLALNEGTIEIDGLDIGKLGLHDLRSRISIIPQDPVLFSGTLRFNLDPFDEKSDESLWSALDDVK 1160
            ||:..||.|.||.:...::||||||.::|||||:||||:||:|.|||||:|.|||.||.||::|:
  Rat  1147 RLSEPEGKIWIDKILTTEIGLHDLRKKMSIIPQEPVLFTGTMRKNLDPFNEHSDEELWKALEEVQ 1211

  Fly  1161 LKKHVASLEGGLSCRMQDGGSNFSMGQRQLVCLARAILRQNRVLVMDEATANVDTETDILIQETI 1225
            ||:.:..|.|.:...:.:.|||||:|||||||||||||::||:|::||||||||..||.|||:.|
  Rat  1212 LKEAIEDLPGKMDTELAESGSNFSVGQRQLVCLARAILKKNRILIIDEATANVDPRTDELIQQKI 1276

  Fly  1226 QTKFAECTVLTIAHRLHTVMDNDSVLVMDAGQIVEFGAPHKLLQRKDGALLKLVNQNDATTVKFL 1290
            :.|||:||||||||||:|::|:|.::|:|:|::.|:..|:.|||..:....|:|.|........|
  Rat  1277 REKFAQCTVLTIAHRLNTIIDSDKIMVLDSGRLREYDEPYVLLQNPESLFYKMVQQLGKGEAAAL 1341

  Fly  1291 KRIASESYMRRNRRD 1305
            ...|.:.|.|||..|
  Rat  1342 TETAKQVYFRRNYPD 1356

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG10505NP_611571.2 MRP_assoc_pro 15..1271 CDD:188098 513/1343 (38%)
Abcc4XP_038948894.1 MRP_assoc_pro 6..1334 CDD:188098 517/1356 (38%)

Return to query results.
Submit another query.