DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG10505 and Abcc5

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_611571.2 Gene:CG10505 / 37428 FlyBaseID:FBgn0034612 Length:1312 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_446376.2 Gene:Abcc5 / 116721 RGDID:70913 Length:1436 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1364 Identity:432/1364 - (31%)
Similarity:720/1364 - (52%) Gaps:151/1364 - (11%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    11 RESNPFIKANIISKWLFLWM----HSVFRKGR--REELDASKLYEHLPSFDSESLTRNLQPHWEK 69
            :..:|...|.:.|...|.|:    ..|.:||.  .|::.....||     .|:...|.|:..|::
  Rat    96 KHQHPVDNAGLFSYMTFSWLSPLAQVVHKKGELLMEDVWPLSKYE-----SSDVNCRRLERLWQE 155

  Fly    70 ESKKKNP---SLMRLIFKVYGWQFVPVCILYSLL-----EMAIHSFQPLLLGGLISYFAYGQTTV 126
            |..:..|   ||.|::     |.|....::.|::     ::|..|....::..|:.|      |.
  Rat   156 ELNEVGPDAASLRRVV-----WIFCRTRLILSIVCLMITQLAGFSGPAFVVKHLLEY------TQ 209

  Fly   127 TKESAYLYAMGIVLCSLVTSLVFHPFMFYVFAV----GTRVRLACAGLVYRKCLRASASSGEGLG 187
            ..||...|::.:||..|:|.:|....:...:|:    |.|:|.|...:.::|.|:......:.| 
  Rat   210 ATESNLQYSLLLVLGLLLTEVVRSWSLALTWALNYRTGVRLRGAVLTMAFKKILKLKNIKEKSL- 273

  Fly   188 GQAISVMSIDLSQFDLTFYFFHDLWKGPVEA---CIFGYLMTRQVGWTSLIGIAFIVILIPLQAW 249
            |:.|::.|.|..:..........|..|||.|   .|:..::   :|.|..:|.|..::..|...:
  Rat   274 GELINICSNDGQRMFEAAAVGSLLAGGPVVAILGMIYNVII---LGPTGFLGSAVFILFYPAMMF 335

  Fly   250 AAKASASFGTRSAKHRDARVKLMNEIIGAIQVIKMYAWEKSFGRLIAAVRQSEVKAIRGS---MS 311
            .::.:|.|..:.....|.||:.|||::..|:.||||||.|:|.:.:..:|:.|.:.:..:   .|
  Rat   336 VSRLTAYFRRKCVAATDDRVQKMNEVLTYIKFIKMYAWVKAFSQCVQKIREEERRILEKAGYFQS 400

  Fly   312 IYAALQCTNMISKISLFLSLVAYVYVGDLVTAKKVFILSSYYGLLNDSLLHYWPMAITTWAQTLV 376
            |...:  ..::..|:..::...::.:|..:||.:.|.:.:.:..:..: |...|.::.:.::..|
  Rat   401 ITVGV--APIVVVIASVVTFSVHMTLGFDLTAAQAFTVVTVFNSMTFA-LKVTPFSVKSLSEASV 462

  Fly   377 SARRVVEFLLQVE------KP-----------------TEESCCRDNPGLELDAEKPKPAQSGRL 418
            :..|.....|..|      ||                 :..|..:.:|.|....:|.|.|..|: 
  Rat   463 AVDRFKSLFLMEEVHMIKNKPASPHIKIEMKNATLAWDSSHSSTQSSPKLTPKVKKDKRAPKGK- 526

  Fly   419 HCVQSETKCLSFRKVSA------------SWDKPSIKQPRKPHIE-----------GISFHINAG 460
               :.:::.|...:..|            |.::||.::.....|.           .|...|..|
  Rat   527 ---KEKSRQLQHTEHQAVLAEQKGHLLLDSDERPSPEEEEGKQIHAGSMRLQRTLYNIDLEIEEG 588

  Fly   461 QFVGIVGNVGSGKSTLLHAILGEIELMQGRVEVHGRISYAAQQPWVFQGSIRENILFVEQYEEKR 525
            :.|||.|:|||||::|:.||||::.|::|.:.|.|..:|.|||.|:...::|:||||.::::|:|
  Rat   589 KLVGICGSVGSGKTSLISAILGQMTLLEGSIAVSGTFAYVAQQAWILNATLRDNILFGKEFDEER 653

  Fly   526 YRAVVHACQLDRDLELLPRGDATVVGERGISLSGGQKARIALARAVYRQADIYLFDDPLAAVDAQ 590
            |.:|:::|.|..||.:||..|.|.:||||.:|||||:.||:||||:|....||:.||||:|:||.
  Rat   654 YNSVLNSCCLRPDLAILPNSDLTEIGERGANLSGGQRQRISLARALYSDRSIYILDDPLSALDAH 718

  Fly   591 VGKLLMDKCFHRLLDGKMRILVTHHVQLLKSVDQLLLLEGGKLTQQGSYEELKDVITHHAALDLE 655
            ||..:.:....:.|..|..:.|||.:|.|...|:::.::.|.:|::|::|||.::...:|.:...
  Rat   719 VGNHIFNSAIRKRLKSKTVLFVTHQLQYLVDCDEVIFMKEGCITERGTHEELMNLNGDYATIFNN 783

  Fly   656 AIEADKQQVKRVLSQVDRTSKQLSKGEEKDPATIQDENG---------NAEQQLQGAVSYDTYKA 711
            .:..:...|: :.|:.:.:..|.|:.:...|.:::.|..         ..|::.||:|.:..|..
  Rat   784 LLLGETPPVE-INSKKEASGSQKSQDKGPKPGSVKKEKAVKSEEGQLVQVEEKGQGSVPWSVYWV 847

  Fly   712 YFRALGAPFLVCLVLSMFVLARGCQAVMDIFISRWATWEEDRGYDSVDDYEATRTKM-------- 768
            |.:|.|.|....:::.:|:|..|..|....::|.|.  ::..|..:|  :|..|:.:        
  Rat   848 YIQAAGGPLAFLVIMVLFMLNVGSTAFSTWWLSYWI--KQGSGNSTV--FEGNRSSVSDSMRDNP 908

  Fly   769 -VIWYTVLLLLTLALFL----LRTFGFFFMCLRISLTLHDQLYHGIIRAWMYFFNANPSGRVLNR 828
             :.:|..:..|::|:.|    :|...|....||.|..|||:|:..|:|:.|.||:..|:||:|||
  Rat   909 FLQYYASIYALSMAVMLILKAIRGVVFVKGTLRASSRLHDELFRRILRSPMKFFDTTPTGRILNR 973

  Fly   829 FSSDIQNVDVNLP-QAMMDSLQFLVDVVAVLVIVA-IANY--WLLI---PAAIMVILLYFCRALY 886
            ||.|:..|||.|| ||.|    |:.:|:.|...|. ||..  |.|:   |..|:..:|:....:.
  Rat   974 FSKDMDEVDVRLPFQAEM----FIQNVILVFFCVGMIAGVFPWFLVAVGPLLILFSVLHIVSRVL 1034

  Fly   887 IGASRSLKRIESLTRSPIYSHTNQTFHGHSTIRSMDAMPQLEQTFHGHQ---NTNSSALFLYVSA 948
            |   |.|||::::|:||..||...:..|.:||.   |..:.::..|.:|   :.|.:..||:..|
  Rat  1035 I---RELKRLDNITQSPFLSHITSSIQGLATIH---AYNKRQEFLHRYQELLDDNQAPFFLFTCA 1093

  Fly   949 NRAFSFWTDLICVIYILAVTFSFLVINQSFYSGDVGLAITQSMTLVIMCQWGMRQTAEMENNMTS 1013
            .|..:...|||.:..|.......::::....|...||||:.::.|..:.|:.:|..:|.|...||
  Rat  1094 MRWLAVRLDLISIALITTTGLMIVLMHGQIPSAYAGLAISYAVQLTGLFQFTVRLASETEARFTS 1158

  Fly  1014 VERVLEYAQTPSEPPLESPKSVNLAA---EWPQAGHLRFQDLRMRYSPGDEDILRGLNFESQPME 1075
            |||:..|.:|.|   ||:|..:...|   :|||.|.:.|::..|||......:|:.::|..:|.|
  Rat  1159 VERINHYIKTLS---LEAPARIKNKAPPHDWPQEGEITFENAEMRYRENLPLVLKKVSFTIKPKE 1220

  Fly  1076 KIGIVGRTGAGKSSIIQALFRLA-LNEGTIEIDGLDIGKLGLHDLRSRISIIPQDPVLFSGTLRF 1139
            |||||||||:||||:..|||||. |:.|.|:|||:.|..:||.||||:::||||:|||||||:|.
  Rat  1221 KIGIVGRTGSGKSSLGMALFRLVELSGGCIKIDGVRISDIGLADLRSKLAIIPQEPVLFSGTVRS 1285

  Fly  1140 NLDPFDEKSDESLWSALDDVKLKKHVASLEGGLSCRMQDGGSNFSMGQRQLVCLARAILRQNRVL 1204
            |||||::.::|.:|.||:...:|:.:|.|...|...:.:.|.|||:|:|||:|:|||:||..::|
  Rat  1286 NLDPFNQYTEEQIWDALERTHMKECIAQLPLKLESEVMENGDNFSVGERQLLCIARALLRHCKIL 1350

  Fly  1205 VMDEATANVDTETDILIQETIQTKFAECTVLTIAHRLHTVMDNDSVLVMDAGQIVEFGAPHKLL 1268
            ::|||||.:|||||:||||||:..||:||:||||||||||:.:|.::|:..||:|||..|..||
  Rat  1351 ILDEATAAMDTETDLLIQETIREAFADCTMLTIAHRLHTVLGSDRIMVLAQGQVVEFDTPSVLL 1414

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG10505NP_611571.2 MRP_assoc_pro 15..1271 CDD:188098 432/1360 (32%)
Abcc5NP_446376.2 PLN03130 100..1424 CDD:215595 432/1360 (32%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 499..569 13/73 (18%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 795..822 5/26 (19%)

Return to query results.
Submit another query.