Protein Alignment CG8908 and abca12

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_611464.3
• Gene: CG8908 / 37293
• FlyBaseID: FBgn0034493
• Length: 1626
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_031748843.1
• Gene: abca12 / 101731410
• XenbaseID: XB-GENE-6041943
• Length: 7516
• Species: Xenopus tropicalis
• Alignment Length: 1856
• Identity: 443/1856 - (23%)
• Similarity: 779/1856 - (41%)
• Gaps: 434/1856 - (23%)

  Fly    30 SNTLTSVIIIVGPIVVFLVYAATALFREPQEETSV----KYPPV-----NITTKVPYIYYSPENL 85
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 Frog  5811 NNTINSALNIINLL-----------------NTNINNIQQFQPIATVINNLLSCMTYNRIQPMNS 5858

  Fly    86 V--LAAVIEDVVHDLKAVGSKAFASASELNKALIGKDTYGYVGIEFDDSFSDINELP--INVTVG 146
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 Frog  5859 VEEMQAKAVELQNNNKLFAAVAFDLPSE---------TTGQSKASFN--------LPKQIKYTIS 5906

  Fly   147 LRFPLHLRKN--PKMVW---DNTSILKHSKMDVDYYQVEGFLVVQAKLSEALIRAK-NEAVVLPE 205
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 Frog  5907 MEPVLSEDTNIIRKSYWTPVPASSLNKYSR---------GFVYLQENIDRAIIEMQTNKSVA--N 5960

  Fly   206 VILQHYPDVAEVDRLDNRVALGGVLFLPVTISAAYL------AQMIVMERRDHLRDMLELMGVRA 264
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 Frog  5961 VGLQYQSVPFPCYKRDRFLASMGYT-LPIALMITWVLFISAFVKKIVHEKEMRLHEYMRMMGVNS 6024

  Fly   265 WIYWLSWFL--VAFLLLSIPTVFMVLLLKWRYFSLSDSSLVLFFL-LVYNLEVLTSAFMISSFFS 326
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 Frog  6025 SSHFCAWFIESASFLLITVS--ILVLLLKFGQILPSSNGFILFLLFLDYSLTIIAMSYLISVFFH 6087

  Fly   327 DTVGVQVAIVIVHLIGCLPWRLL-LMGYVPTLPRTIFVCLFLNSSLAMGLQQFIKSENLRLGLHW 390
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 Frog  6088 NTNVAGLSGSLIYIITFFPFIVIATKSSVLSFSAKTLLCIFSPTALSNAIQYVVYYEEQSVGIQW 6152

  Fly   391 TYLFERTDWDEFVHLGPIL-LFMLFGCLLRILVL-AYMEQLRSYQNR-----------KWYFPVQ 442
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 Frog  6153 SNMY----------ISPLLGDSMTFGWLCWLLFIDAMIYFLVGFYIRMVFPGKYGIPAPWYFPFQ 6207

  Fly   443 PSFWCR-------------------------WNRRPRSDDF-DVEGQE-----TGIRGHPLIVRA 476
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 Frog  6208 MSFWLKCCGLESLRPTKSSGLTFTNIMADNIYHKKGAENDLCSLNEQEPNDLTVGVSLH------ 6266

  Fly   477 RNIEKVFNEWIAVKDLNLNFYQDEITVFLGHNDSGKSTILMLLAGFLRPSAGEITINGYDLATNQ 541
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 Frog  6267 -GLTKVFQSKTAVNNLNLNFYEGHITALLGHNGAGKTTTLSMLTGLFGASSGTIYVYGDDIRTNL 6330

  Fly   542 RKARQSMCICPQPNVLFEKVNARWHLQFYCRLKG--LNRQEASAETDKYLEIGRLQDFANTKVKN 604
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 Frog  6331 DRARSNMGVCMQYDVHFDHLTTKEHLLLYGSIKAPHWTRAHLHIEVKRNLKDTGLYNHRHKPVKA 6395

  Fly   605 LPSGIKRMLMLCCNLCGNSKILLLDEPGTSMDPAMRSNMWDLLRRERKGRCIIMATHNMNEAEVV 669
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 Frog  6396 LSGGMKRKLSICIALIGGSKVVILDEPTTGVDPCSRRSIWEVISKQKKDKTIILSTHHLDEAEVL 6460

  Fly   670 ADQIVVLCDAQVIGYGTTGFLTQIAGTGSSYLLICTK-------MDTCIVAEVTNFLQIRFPDIK 727
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 Frog  6461 SDRIAFLEQGGLKCCGTPLYLKQKFGSG--YHLTLTKKFPNRENQEECDVELVTDLIKSHIPEAC 6523

  Fly   728 LHNEFSIYVTYELPTKYVQ---QYAALFLELEEALGELNLAEISVCAPTLGSVFLQM------GE 783
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 Frog  6524 LKEDVGGELVYLLPSFNAEISGAYLSLLQALDSRMNDLHIGCYGISDTTIEEVFLKLTDNLDEDE 6588

  Fly   784 EMRQSWNRISSFDLLSSPS-------PMLSLLNLLPTFEVREDD---------GRVKCCNQWRAI 832
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 Frog  6589 QDAMAWS--STKTVVPIPNEENLHVQDELSLTNY--RFTDRDDQPLTNEEKLTGVSLLLKKIMAI 6649

  Fly   833 VEKKRLFTLRHQKFYCMIIATPIIICLL----------IISFSIFIFLVD--------------H 873
            ..|:...:.|:.|.....:..|::..::          .:||...:...|              :
 Frog  6650 FIKRFHNSRRNWKGLISQVLLPVLFVVIAMGLGSLSSSAVSFPELLLTPDLYGTSSQSVAFGLYN 6714

  Fly   874 HLSELLVTDLSIYPKAVFVIDSPAEGNRFERHYMANVIGQG--------------GTVRSTSGTP 924
            ..|..||:.::.:|.    ||:......      :|.:.|.              |:...::|.|
 Frog  6715 ESSSNLVSAMNSFPG----IDNSCLNQN------SNCLSQNGLGLWTSDNQSLSYGSCNCSTGAP 6769

  Fly   925 IDDYLLA-------------------EMESDQVKVQHTFL----AGATF-------------DSN 953
            :.|...|                   .|||..:.....|:    .|.:|             ..|
 Frog  6770 VCDASSAAPPHRRTFSEQMLYNVSGYNMESYLLTTNLQFIQKRYGGWSFGIPWVSSKLETLVPQN 6834

  Fly   954 ANSIIA--WSNNKLKHG-----SALSMGLVYAAI-GQELAKLDIRIVNKPYQDTVQQAVRGLIYA 1010
            .|..|:  |.||...|.     ::.|..|:...: ..|..:..|.:.:||...||.|....:...
 Frog  6835 PNMTISKVWFNNDGPHSLPAFINSFSNFLLRTNLPSNESDQYSISVASKPLSGTVIQTSTTVTLV 6899

  Fly  1011 STIEFAVLVFHYLVLGTAIFAVLPIVERRSKVQHQQFSSGMSRSTYWLSHLSWDYCFYIAMILPL 1075
            :|: .|:.|.....:.||.||...:.|..|..:..|..:|:..:.||:::..:|...|   ::|:
 Frog  6900 NTL-IALCVLAGYSITTASFATYVVKEHHSGAKRLQHIAGVGETCYWVTNFIYDSIIY---LIPV 6960

  Fly  1076 -IVVAGITIGSVLPVI----------VQLLAFGFSAISFTYLLCLMSNDFGKMFSIILYINM-IG 1128
             :.:|.|.|.. ||..          :..:.|||:..|:.|||.......|..|...:.||: ||
 Frog  6961 SLSLATIAIFK-LPAFYDYPNLGAMSLLFILFGFATFSWMYLLAGTFKSPGNAFITYVSINLFIG 7024

  Fly  1129 V-------LALFIH-PKSP---------QTRYAVIESVLLVHPHYSLCCGMYEAIRMSTFSLKQL 1176
            :       :..|:: .:||         || |.|:..|..:.|.:  |.| |..|.:|.....|:
 Frog  7025 INTIISTSVVYFLYVQRSPSDSDYQSLNQT-YTVLTDVFKIFPQF--CFG-YGMIMLSQQQALQM 7085

  Fly  1177 PYLIFSGAAYLTIV---VFAW------------------VPRRLNYVFKSIRNEKIYPSY----- 1215
            ...|:.|.:...|.   :..|                  :...:.:.|||........||
 Frog  7086 QSAIYGGTSTTNIFSMDILGWMLSAMAIQGAFCFLLRLLINDGIIFSFKSFVKRNCMKSYLVVTK 7150

  Fly  1216 -KDEDKEVDKMRRRLAYLTTAHYAFFPLI-LKNLSKRY----GSFVAVRSLTLDLNPFECVGLLG 1274
             .:||::|...|.|:    .:..|...|: |:.|:|.|    .:.|||.::||.:...||.||||
 Frog  7151 NPEEDEDVRAERERV----DSGQADPDLLQLQGLTKVYHHVGKNMVAVNNMTLSIPAGECFGLLG 7211

  Fly  1275 RNGSGKSSIFRMIVGMESITVGSIHIK----------GYSLKTRPKDASRHVGFCPRELMLLSFM 1329
            .||:||::.|:|:.|..:.:.|:|.::          |::     .|.|. .|:||:|..|...:
 Frog  7212 VNGAGKTTTFKMLTGDVAPSKGNIQVRNNAGNLENVLGFN-----TDWSA-FGYCPQEDALDELL 7270

  Fly  1330 TGKDALRFCCLINGIRREYIKSLVASLAECFELVPHMNKRISTYSNGTKRKLMIAMGTLA-PSLM 1393
            ||::.|.|...::||..:.||::..||.:..:||.:.::..:.||.||:|||..|:..:. ||::
 Frog  7271 TGEEHLYFYARLHGIPEKKIKAVSFSLLQKLQLVQYKDRTTAAYSCGTRRKLSTALALIGRPSIL 7335

  Fly  1394 CLDEPTAGVDMHAKYEIWSILDGIRQGGRSILLTTHNLEECEFLCTNVGIMDHGSLLCYGSLSRL 1458
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 Frog  7336 LLDEPSSGMDPKTKRHLWKIISEEVKEKCAVVLTSHSMEECEALCTRLAIMVKGKFQCIGSLQHI 7400

  Fly  1459 KHRFNMGIFVKVKMGTRAEMDDERDNWMQITMMPPNDSEMGSTVGARRMMLAHLLRHHNPPVEPV 1523
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 Frog  7401 KSRFGSGFTVKMHL---------KDSSVNV-----------------EALTSFMCRHF------- 7432

  Fly  1524 KKSRTSRAQPDTTNSELNMRKDYEALLQELEEVFKKDHPYSTVSEKYSYRGMITFCIPRGQIKWS 1588
                     |:|                     :.||..::          |:.:.:|......:
 Frog  7433 ---------PNT---------------------YLKDQHFT----------MVEYHVPVTAGGVA 7457

  Fly  1589 AIFEYMENLKDEMQILYYSVSHTTFQDVFMKFVRKQ 1624
            .||:.:|..|.::.|:::|||.||..:||:.|.:.|
 Frog  7458 GIFDLLEANKSDLDIIHFSVSQTTLDEVFINFAQSQ 7493

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG8908	NP_611464.3	rim_protein	<124..1626	CDD:130324	424/1751 (24%)
abca12	XP_031748843.1	rim_protein	4..>82	CDD:130324
		rim_protein	5675..7493	CDD:130324	442/1854 (24%)