DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG15099 and Dop1a

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001261081.1 Gene:CG15099 / 37176 FlyBaseID:FBgn0034400 Length:2683 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_017451594.1 Gene:Dop1a / 315864 RGDID:1305534 Length:2479 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2872 Identity:895/2872 - (31%)
Similarity:1377/2872 - (47%) Gaps:691/2872 - (24%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     9 EEQKLMAEAKYRTYMTNIDKALRNFEYSSEWADLISALGKLSKAISSNTQYQVIPRRLKIAKRLA 73
            ||.:|::::|||.|:..|||||:||||||||||||||||||:|.:.:|.:|||:|::|.|.||||
  Rat     4 EELELLSDSKYRNYVAAIDKALKNFEYSSEWADLISALGKLNKVLQNNAKYQVVPKKLTIGKRLA 68

  Fly    74 QCMHPALPSGVHLKALETYSVIFSKTGPERLATE-FIYSAGLFPLLGYAAMNVRPALLAIYETYF 137
            ||:|||||.|||.||||||.:||...||:|||.: |:||:||||||..|||:|:|.||::||.|:
  Rat    69 QCLHPALPGGVHRKALETYEIIFKIIGPKRLAKDLFLYSSGLFPLLANAAMSVKPTLLSLYEIYY 133

  Fly   138 VPLGDKLRPALSGFLNGVLPGYDCGLDHFERISALLKQVCNAVNPMHFYTVLWESVANNAAIRLP 202
            :|||..|:|.|.|.|.|:|||.:.|.:::||.:.||::|..||....||:.||.|:..:.|:|||
  Rat   134 LPLGKTLKPGLQGLLTGILPGLEEGSEYYERTNTLLEKVAAAVEQSAFYSALWGSLLTSPAVRLP 198

  Fly   203 AITYLLEHFNKRLDMQEQIYIMGHNREIMMSALCVCLNDSLILVQRNTLEFLLLGFPMHTVLLSE 267
            .|||:|.|.|::|.|::|:||:|.:.|:|:.|:...:.||.:||||:||:.:|..||.|....:.
  Rat   199 GITYVLAHLNRKLSMEDQLYIIGSDIELMVEAVSTSVQDSSVLVQRSTLDLILFCFPFHMSQATR 263

  Fly   268 DDLVKLVTNGLNTILRRDMSLNRRLFSWLLGSEVAKNSPTYDTLSLDTSNAPLEEEPEPYFVKHS 332
            .|::::::..|:.:|||||||||||::||||.:  .|.......|...||.  ||....||...|
  Rat   264 PDMIRILSAALHVVLRRDMSLNRRLYAWLLGFD--NNGAIIGPRSTRHSNP--EEHATYYFTTFS 324

  Fly   333 RHILIKALITTLRLS---LECAPM-DLKPYRIMLSLLDKAEIGSAVLDYVLHDIIRAMY------ 387
            :.:|::|::..|:::   .|...| ||||:||::|||||.|:|..:|:.||.::.|.:|      
  Rat   325 KELLVQAMVGILQVNGFGEESTLMQDLKPFRILISLLDKPELGPVILEDVLIEVFRTLYSQCKAE 389

  Fly   388 ---------------ISS------GNAEALKSANLLFATFDPAYIWSYMTNMFEKACQQANSMQE 431
                           :||      ..||.:|:|||||.:|:|.|:|.|:...||:.|::....: 
  Rat   390 LDLQMEPPFSKDRAQLSSKLRENKKTAELIKTANLLFNSFEPYYMWDYIARWFEECCRRTLHAR- 453

  Fly   432 KSQAGETSGKYACDVGSGDPC------VLEICVLTEFLLETVSL----------EMYTETTRVYL 480
                        .:||.||..      :...|.|.:|||:.|||          |.|.|....:|
  Rat   454 ------------LEVGPGDSSDASEFQLTTFCSLVDFLLDIVSLPTRSMRVLCQETYIEIQTEHL 506

  Fly   481 PKVFLAITQLLSLHMDHISSNEITASLKLCMKIVSRVQPMITSPIKLNKLIEQSGGSSS------ 539
            |::.|.:...|:.|:..:..:|:|.||:||.||:|:|||.:.| .....:::...|.:|      
  Rat   507 PQLLLRMISALTSHLQTLRLSELTDSLRLCSKILSKVQPPLLS-AGTGGVVQFPSGQNSAVKEWE 570

  Fly   540 DEKITMNSASDAGKTEAGAQGNSLEKSKSDSRLNQFAENTLHSADPNDEELIHRSASNQSVGRQS 604
            |:|:  :|.|....||....|.:...|:|..  :.|.|...:.|:                    
  Rat   571 DKKV--SSVSMENPTEVFEDGENPPSSRSSE--SGFTEFIQYQAE-------------------- 611

  Fly   605 PNKKKAKSISRLSELDKDISASDTGQQSSSDLDTPRSIKKLKAKAKVPFIRSPKKQRPKDMVLIQ 669
                      |..:||::::...|                    |.:|.                
  Rat   612 ----------RTDDLDRELNGQGT--------------------ATIPI---------------- 630

  Fly   670 SNTSAEVSDGPS--AEEPKSAPPDQTPQFQLDEESRATQQRGFSILEKCIRQYEIFFEVYLSRKL 732
            .:||:|.....:  :||....||....|.......:|.|:   :.::.|:...:.|....:...:
  Rat   631 GSTSSETETASTVGSEETVIQPPSTLTQGAAGRTGKAVQK---TAMQCCLEYVQQFLSRLIHLYI 692

  Fly   733 LHIESEPKECSVKVQLQRTTSTIHTSNLFMAEQVLDHECPVRESQIERLFNLLRVDIVPRSKQLQ 797
            ||.:|.|          :.::..|.|:|               |:|:|                 
  Rat   693 LHSDSFP----------QASAADHQSDL---------------SRIQR----------------- 715

  Fly   798 RLLNRSLPLPASASELSSDSEAQEEKQQSLLIDGQTQRSVQQLAELQLSPSLRGAVKLAATLLVE 862
                       ..|:...||:. :.|::::    .|.::         |.....|...|..|.:|
  Rat   716 -----------DTSKWDRDSQG-DAKERNI----HTPKT---------SKEYLSAFLAACQLFLE 755

  Fly   863 MSTFP------NCNKHVVLDKNEPEL-----PNWLKVLCLVACFAQSDKELQVASITTLFDLISL 916
            .|:||      |.......:|.:.:.     |.||:.| :.||...||..:|..:::.:.||:.|
  Rat   756 CSSFPVYIAEGNHTSESHSEKPDTDCEHAHPPQWLQTL-MSACSQASDFSVQSVAVSLVMDLVGL 819

  Fly   917 LRS------------QIEHTTSP--GVTFVVMLPLLKFGHVSYMEQHTRVFQLVSSILWDYLGTA 967
            .:|            :.....||  |...||:.|.|..|::.|:.:.|..|:.|:..|||.||..
  Rat   820 TQSVAMVTGENINSMEPAQPLSPNQGRVAVVIRPPLTQGNLRYIAEKTEFFKHVALTLWDQLGDG 884

  Fly   968 GIDPAQIAA-LLHQLHSCL-ESGLVETVIGNRMQSQHLLQMQSQSRSDLGKAAIRNFQMERLAEA 1030
            .....|.:. |.:|||:.: .|.:.|.|:     ||.|                           
  Rat   885 TPQHHQKSVELFYQLHNLVPSSSICEDVV-----SQQL--------------------------- 917

  Fly  1031 QLLCPTESTERLR-ESQARSFKKFELLWHLGRD-----KQTARGFEKTLLKVLDTL-ALPHYMSE 1088
                 |...:::| |:.||    |.:||||.||     ...||.|:::|..:||:| :|..  |.
  Rat   918 -----THKDKKVRMEAHAR----FAVLWHLTRDLHVNKSSFARSFDRSLFIMLDSLTSLDG--ST 971

  Fly  1089 RTFVTNWLQASLLRGDLARLTKPLYKILLSASSKRVGIVHMQQLYRESETEVTPAFERDVYAISS 1153
            .:....||...|.|.|:||:.:||..:||...::||.:..:|.....|:|...|..|.|.:.:.:
  Rat   972 SSVGQAWLNQVLQRHDIARVLEPLLLLLLHPKTQRVSVQRVQAERYWSKTSCYPGEENDKHFMQN 1036

  Fly  1154 -EQGNVKYHHMETSSGNKKKSPIRNFPKKIFGVTLSGGKANKVSNFVSDK-STVATCSEATQDMN 1216
             ...||...|:..|.|:::| |:.....:.|.:|:         |.:||: |.::|.||      
  Rat  1037 FTCNNVSQVHLIASKGSREK-PLTMDEIENFSLTV---------NPLSDRLSLLSTSSE------ 1085

  Fly  1217 TIGLIINPLENANDFDDETDLEEPRIEIPHKETPLEQKLASAMDESEQPSQEQPANQPDNSLQYD 1281
            ||.:::      :|||           :|.::..:.|...|...:|..                 
  Rat  1086 TIPMVV------SDFD-----------LPDQQMEILQSSDSGCSQSSA----------------- 1116

  Fly  1282 QDITDHSDSSDFESDSELRETSIEKEDSITVSSSAGVSDDVKRFVGD--CESVTDALTQHEKIKS 1344
                  .|:..:|.|.|  ..|..::..:..:||.  .|||::.|.|  |:.|            
  Rat  1117 ------GDNFSYEVDPE--NVSAHEDSHLAKASSP--DDDVQQVVFDLICKVV------------ 1159

  Fly  1345 RKTYRLTREKTPGENSLNSLEQKDHDSISELQADALPADEYFREDKKLGKR------------KK 1397
                             :.||.:.....|||:.::||...   .|..|||.            :.
  Rat  1160 -----------------SGLEAESASVTSELEIESLPPKS---SDFDLGKEATKTEDQAPQHSQH 1204

  Fly  1398 VLTSGEKKRL---------SC----ISKTSTDSNISGSHVEQPEQEEETEPGTESTINVEDKRRN 1449
            ||.|.:..|.         .|    ||:.|:...|||:          .:..|:|:::.|.|.|.
  Rat  1205 VLLSDDSPRFLSVSTEEGCECLANGISRNSSSPCISGT----------AQTLTDSSVSSETKSRQ 1259

  Fly  1450 LSLETSKLQPDMQKTL------------EKGKQ-----NVEILRQNNAAAAAAAA---------- 1487
            .|  .|.:|...::.|            |.|||     .|::.|:.:.....||:          
  Rat  1260 RS--HSSIQFSFKEKLSEKISEKETIVKESGKQPGAKPKVKLARKKDEDKKKAASEKLKQTNVFF 1322

  Fly  1488 ----------AAAEEQIS-VRSSMKSTVSLTDA---AHLYHNHLLIYLAIYDTRQTLYALQTLRN 1538
                      :..|.:|| :.|.|.|..|....   .|..:.|:|:||.:||:.:||||...:::
  Rat  1323 SDGLDLENWYSCGEGEISEIESDMGSPGSRKSPNFNIHPLYQHVLLYLQLYDSSRTLYAFSAIKS 1387

  Fly  1539 IICCDKRTFLCLSITTSFSSA------SLKQLLVRHRKSISGKGFDGSVG-NSEYAQGYRGCMQL 1596
            |:..:...|:....|||.::|      .|:.||.|||.|:.||.|...:. :|.:  .:|..|.:
  Rat  1388 ILKSNPVAFVNAISTTSVNNAYTPQLSLLQNLLARHRISVMGKDFYSHIPVDSNH--NFRSSMYI 1450

  Fly  1597 ELLVTLCLFYARGYFQKESLDAQRQSPTLQDIVNNRRIQLESIELLTLICSELIEIVKGMGRGLA 1661
            |:|::|||:|.|.::      ......|.||::.||.:|:.|||:|||:.:||.::::...:|..
  Rat  1451 EILISLCLYYMRSHY------PTHVKVTTQDLIGNRNMQMMSIEILTLLFTELAKVIESSAKGFP 1509

  Fly  1662 NYIADLLARAKLQKVMLHCLNSSVCSY------GLKGN----TNSGSYAEQVLSFNDPQDDQLHA 1716
            ::|:|:|::.|:|||:||||.||:.|.      ...|.    ...|...:.:::|::.:.|  :.
  Rat  1510 SFISDMLSKCKVQKVILHCLLSSIFSVQKWHSEKTAGKNMVAVEEGFSEDSLINFSEDEFD--NG 1572

  Fly  1717 DCFQLQLLRLLLAVIRLEHEVHQLRQDTPPAAGED----SAGNASPTRLAEGATANVKYLPNCLI 1777
            ...|.||||:|..:|.|||.|..:.:::  .||.|    ...:.||.:    ...:::||....|
  Rat  1573 STLQSQLLRVLQRLIVLEHRVMTIPEES--EAGFDFVVSDLEHVSPHQ----PMTSLQYLHAQPI 1631

  Fly  1778 SQQPMFLAAVLGALQQERLRHLHRNWTDLVTSSLNCFSFGSLTNIVISVVHQLCSNLDRISKM-- 1840
            :.|.|||.||:.||.|.....:|..|..|:||:|. :....|..:|:||..|||.|||.:.:.  
  Rat  1632 TCQGMFLCAVIRALHQHCACKMHPQWIGLITSTLP-YMGKVLQRVVVSVTLQLCRNLDNLIQQYK 1695

  Fly  1841 ---GLPQQRH------FPPDYVVSQLEALTILCHYCLLDNTQQTALSHLFNQAYPQTSSSAQSSS 1896
               ||...|.      .|||.:::.||.:|.:.||||||.|.|   .|                 
  Rat  1696 YETGLSDSRPLWVASIIPPDMILTLLEGITAIIHYCLLDPTTQ---YH----------------- 1740

  Fly  1897 TGQLLNSIVHSFLSASESSTSAPAPRNPQLQAARNAVLSHLPRIMSSVAAIWD-------SE--- 1951
              |||.::                 ....|..||:.:||.|..|||||..:|.       ||   
  Rat  1741 --QLLVNV-----------------DQKHLVEARSGILSILHMIMSSVTLLWSILHQADASEKMG 1786

  Fly  1952 -----------LGQLRPVRQQLLEFLSPVSLHHGSNFLAAVAVTWQQRGIATNMNGLSIAEQFQR 2005
                       ||..:.:|||:||.|.|:|::||.:|:||:|..|         ||....:...|
  Rat  1787 LAASASVTTINLGATKNLRQQILELLGPISMNHGVHFMAAIAFVW---------NGRRQNKTPSR 1842

  Fly  2006 NSVLQAC-PAQLSLVSLVSSIRVMPMDSFVMTLHHVVRSPPPIHRPPAQLSIEVSALELFYFYMK 2069
            ..|:.|. ..||.||.||.||.||..::.:.|:..|::.||.|.:....||:||..|:.||.|::
  Rat  1843 TKVIPAASEEQLLLVELVRSISVMRAETVIQTVKEVLKQPPAIAKDKKHLSLEVCMLQFFYAYIQ 1907

  Fly  2070 SAPAPQLADAWSSLLALIRDGLNLTPPA--QFALLMLLNEFVQRCPQMPFQDKKEVRELHDVTSR 2132
            ..|.|.|.|:|:|||.|::|.:.|:.||  ||.:|.:||||:.:.|.:  ::||:.|:|.|||.:
  Rat  1908 RIPVPNLVDSWASLLVLLKDSIQLSLPAPGQFLILGVLNEFIMKNPSL--ENKKDQRDLQDVTHK 1970

  Fly  2133 LVDSLSSVAGSCLEQTTWLRRNLAVKEDTDGLAKDNSVGGGGLQQ-------------------Y 2178
            :||::.::|||.|||||||||||.||.....:     |.|..|:.                   |
  Rat  1971 IVDAIGAIAGSSLEQTTWLRRNLEVKPSPKIM-----VDGTNLESDVEDMLSPAMETSNITPSVY 2030

  Fly  2179 SLQAQSVLAAILSNLLDVAYGSQEKDKVVNIVTPLLYNITPYLKNHTARNVPFFYACSALLASLS 2243
            |:.|.::|:.:|::|||:.:.|.||::|:.::..:::.:.|||:||:|.|.|.:.||..||:|||
  Rat  2031 SVHALTLLSEVLAHLLDMVFYSDEKERVIPLLVNIMHYVVPYLRNHSAHNAPSYRACVQLLSSLS 2095

  Fly  2244 GYQYTRKAWRKDMLDLLLDNAFFQMHLSCLPFWRMIMDSLMTYDNTTFRELMTRVSLSQAGSLNI 2308
            ||||||:||:|:..||.:|.:||||..||:..||.|||:|||:|.||||:|||||:::|:.|||:
  Rat  2096 GYQYTRRAWKKEAFDLFMDPSFFQMDASCVSHWRAIMDNLMTHDKTTFRDLMTRVAVAQSSSLNL 2160

  Fly  2309 FTSRDQEYEQRAMLLKRLAFVIYCSEFDQHNKYMPDIQEQLANSLRLVPMGPSVQAAVFLCFRVL 2373
            |.:||.|.||||||||||||.|:.||.||:.||:|||||:|..|||| |..|::.:.|||.||||
  Rat  2161 FANRDVELEQRAMLLKRLAFAIFSSEIDQYQKYLPDIQERLVESLRL-PQVPTLHSQVFLFFRVL 2224

  Fly  2374 LLRMSPDHVTSLWPIIIAEMVQVFLQMEQELKSESEERNQQLRLPSGIDVSWSAASGASNGYNSQ 2438
            ||||||.|:|||||.:|.|:|||||.|||||.::.:.........:|::.:::..:|.|..||| 
  Rat  2225 LLRMSPQHLTSLWPTMITELVQVFLLMEQELTADEDISRTSGPSAAGLETTYTGGNGFSTSYNS- 2288

  Fly  2439 TPMQHWRSVQLEACKLLELGCVLPATKLPHFQMYRWAFVGTEFD----------VHEEEVCLPNG 2493
               |.|.::.|.|||.|:|...||:..||.||||||||:....|          :|:.|      
  Rat  2289 ---QRWLNLYLSACKFLDLALALPSENLPQFQMYRWAFIPEASDDSGLEVRRQGIHQRE------ 2344

  Fly  2494 SLENLATLPSALYVPHVRRVARLM--------DMKYTSQSPILQRPSN--------------RHL 2536
                        :.|:|.|:|:|:        |.|......:.:...|              .||
  Rat  2345 ------------FKPYVVRLAKLLRKRAKDEEDFKILEGLEMAKHQKNPEEDGSARTLGWEPGHL 2397

  Fly  2537 MLHFQQLQSLQELYAFFTTLG--------------------ISCPQPRNFADTENDVA---NCLK 2578
            :|....::::::|..||..|.                    .|...|......||..|   ...:
  Rat  2398 LLTLCTMRNMEQLLPFFNVLSQVFNSKVTSRCGGHSGSPILYSNSFPSKDMKLENHKAFSSKARQ 2462

  Fly  2579 EIEEVLANDFLE 2590
            :|||::..||||
  Rat  2463 KIEEMIEKDFLE 2474

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG15099NP_001261081.1 Dopey_N 17..301 CDD:461183 154/284 (54%)
Dopey_N <2200..2477 CDD:471021 150/276 (54%)
Dop1aXP_017451594.1 Dopey_N 11..294 CDD:461183 152/282 (54%)
Dopey_N <2088..2324 CDD:471021 136/240 (57%)

Return to query results.
Submit another query.