DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment JAG2 and Jag2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_002217.3 Gene:JAG2 / 3714 HGNCID:6189 Length:1238 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001401828.1 Gene:Jag2 / 29147 RGDID:2938 Length:1247 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1247 Identity:1126/1247 - (90%)
Similarity:1161/1247 - (93%) Gaps:9/1247 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MRAQGRGRLPRRLLLLLALWVQAARPMGYFELQLSALRNVNGELLSGACCDGDGRTTRAGGCGHD 65
            |||:|.|||||||||||.|.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
  Rat     1 MRARGWGRLPRRLLLLLVLCVQATRPMGYFELQLSALRNVNGELLSGACCDGDGRTTRAGGCGRD 65

Human    66 ECDTYVRVCLKEYQAKVTPTGPCSYGHGATPVLGGNSFYLPPAGAAGDRARARARAGGDQDPGLV 130
            ||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||:|.||.||||||
  Rat    66 ECDTYVRVCLKEYQAKVTPTGPCSYGYGATPVLGGNSFYLPPAGAAGDRARARSRTGGHQDPGLV 130

Human   131 VIPFQFAWPRSFTLIVEAWDWDNDTTPNEELLIERVSHAGMINPEDRWKSLHFSGHVAHLELQIR 195
            |||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 VIPFQFAWPRSFTLIVEAWDWDNDTTPDEELLIERVSHAGMINPEDRWKSLHFSGHVAHLELQIR 195

Human   196 VRCDENYYSATCNKFCRPRNDFFGHYTCDQYGNKACMDGWMGKECKEAVCKQGCNLLHGGCTVPG 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 VRCDENYYSATCNKFCRPRNDFFGHYTCDQYGNKACMDGWMGKECKEAVCKQGCNLLHGGCTVPG 260

Human   261 ECRCSYGWQGRFCDECVPYPGCVHGSCVEPWQCNCETNWGGLLCDKDLNYCGSHHPCTNGGTCIN 325
            ||||||||||:||||||||||||||||||||.|:|||||||||||||||||||||||.|||||||
  Rat   261 ECRCSYGWQGKFCDECVPYPGCVHGSCVEPWHCDCETNWGGLLCDKDLNYCGSHHPCVNGGTCIN 325

Human   326 AEPDQYRCTCPDGYSGRNCEKAEHACTSNPCANGGSCHEVPSGFECHCPSGWSGPTCALDIDECA 390
            ||||||.|.|||||.|:|||:|||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 AEPDQYLCACPDGYLGKNCERAEHACASNPCANGGSCHEVLSGFECHCPSGWSGPTCALDIDECA 390

Human   391 SNPCAAGGTCVDQVDGFECICPEQWVGATCQLDANECEGKPCLNAFSCKNLIGGYYCDCIPGWKG 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||
  Rat   391 SNPCAAGGTCVDQVDGFECICPEQWVGATCQLDANECEGKPCLNAFSCKNLIGGYYCDCLPGWKG 455

Human   456 INCHINVNDCRGQCQHGGTCKDLVNGYQCVCPRGFGGRHCELERDECASSPCHSGGLCEDLADGF 520
            .|||||:|||.||||||||||||||||||||||||||||||||..:||||||..||:||||.|||
  Rat   456 ANCHININDCHGQCQHGGTCKDLVNGYQCVCPRGFGGRHCELEYYKCASSPCRRGGICEDLVDGF 520

Human   521 HCHCPQGFSGPLCEVDVDLCEPSPCRNGARCYNLEGDYYCACPDDFGGKNCSVPREPCPGGACRV 585
            .||||:|.||||||||||||||:||.|||||||||.|||||||:||||||||||||.||||||||
  Rat   521 RCHCPRGLSGPLCEVDVDLCEPNPCLNGARCYNLEDDYYCACPEDFGGKNCSVPRETCPGGACRV 585

Human   586 IDGCGSDAGPGMPGTAASGVCGPHGRCVSQPGGNFSCICDSGFTGTYCHENIDDCLGQPCRNGGT 650
            |||||.:||....|.|.||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||:|||||||||
  Rat   586 IDGCGFEAGSRAHGAAPSGVCGPHGHCVSLPGGNFSCICDSGFTGTYCHENIDDCMGQPCRNGGT 650

Human   651 CIDEVDAFRCFCPSGWEGELCDTNPNDCLPDPCHSRGRCYDLVNDFYCACDDGWKGKTCHSREFQ 715
            ||||||:|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
  Rat   651 CIDEVDSFRCFCPSGWEGELCDINPNDCLPDPCHSRGRCYDLVNDFYCVCDDGWKGKTCHSREFQ 715

Human   716 CDAYTCSNGGTCYDSGDTFRCACPPGWKGSTCAVAKNSSCLPNPCVNGGTCVGSGASFSCICRDG 780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.:||||||:||||||||||||||.|||||||||
  Rat   716 CDAYTCSNGGTCYDSGDTFRCACPPGWKGSTCTIAKNSSCVPNPCVNGGTCVGSGDSFSCICRDG 780

Human   781 WEGRTCTHNTNDCNPLPCYNGGICVDGVNWFRCECAPGFAGPDCRINIDECQSSPCAYGATCVDE 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   781 WEGRTCTHNTNDCNPLPCYNGGICVDGVNWFRCECAPGFAGPDCRINIDECQSSPCAYGATCVDE 845

Human   846 INGYRCSCPPGRAGPRCQEVIGFGRSCWSRGTPFPHGSSWVEDCNSCRCLDGRRDCSKVWCGWKP 910
            ||||||||||||:|||||||:.|.|.|||||..|||||||||||||||||||.||||||||||||
  Rat   846 INGYRCSCPPGRSGPRCQEVVIFTRPCWSRGVSFPHGSSWVEDCNSCRCLDGHRDCSKVWCGWKP 910

Human   911 CLLAGQPEALSAQCPLGQRCLEKAPGQCLRPPCEAWGECGAEE--PPSTPCLPRSGHLDNNCARL 973
            |||:.||.|||||||.||:|.|||.||||:||||.||||.||:  |||||||||:.|||||||||
  Rat   911 CLLSPQPSALSAQCPPGQQCREKAMGQCLQPPCENWGECTAEDPLPPSTPCLPRTTHLDNNCARL 975

Human   974 TLHFNRDHVPQGTTVGAICSGIRSLPATRAVARDRLLVLLCDRASSGASAVEVAVSFSPARDLPD 1038
            |||||||.|||||||||||||||:||||||.||||||:|||||||||||||||||||||||||||
  Rat   976 TLHFNRDQVPQGTTVGAICSGIRALPATRAAARDRLLLLLCDRASSGASAVEVAVSFSPARDLPD 1040

Human  1039 SSLIQGAAHAIVAAITQRGNSSLLLAVTEVKVETVVTGGSSTGLLVPVLCGAFSVLWLACVVLCV 1103
            |||||..|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||..||||||||||:||
  Rat  1041 SSLIQSTAHAIVAAITQRGNSSLLLAVTEVKVETVVMGGSSTGLLVPVLCSVFSVLWLACVVICV 1105

Human  1104 WWTRKRRKERERSRLPREESANNQWAPLNPIRNPIERP-------GGHKDVLYQCKNFTPPPRRA 1161
            |||||||||||||||||:||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||
  Rat  1106 WWTRKRRKERERSRLPRDESANNQWAPLNPIRNPIERPGSSGLGTGGHKDVLYQCKNFTPPPRRA 1170

Human  1162 DEALPGPAGHAAVREDEEDEDLGRGEEDSLEAEKFLSHKFTKDPGRSPGRPAHWASGPKVDNRAV 1226
            .|||||||.|.|..||||||:|.||:.||.||||||||||||||..|.||||.||.|||||||||
  Rat  1171 GEALPGPASHGAGGEDEEDEELSRGDGDSPEAEKFLSHKFTKDPSCSLGRPACWAPGPKVDNRAV 1235

Human  1227 RSINEARYAGKE 1238
            ||..:.|.||:|
  Rat  1236 RSTKDVRCAGRE 1247

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
JAG2NP_002217.3 MNNL 28..196 CDD:462222 161/167 (96%)
DSL 178..240 CDD:128366 61/61 (100%)
EGF_CA 307..345 CDD:238011 32/37 (86%)
EGF 351..381 CDD:394967 27/29 (93%)
EGF_CA 385..421 CDD:238011 35/35 (100%)
EGF_CA 423..458 CDD:238011 32/34 (94%)
EGF_CA 461..496 CDD:238011 32/34 (94%)
EGF_CA 500..534 CDD:238011 24/33 (73%)
EGF_CA 536..571 CDD:238011 30/34 (88%)
EGF_CA 636..671 CDD:238011 32/34 (94%)
EGF_CA 676..709 CDD:238011 31/32 (97%)
EGF 716..746 CDD:394967 29/29 (100%)
EGF_CA 757..787 CDD:238011 28/29 (97%)
EGF_CA 789..824 CDD:238011 34/34 (100%)
EGF_CA 827..863 CDD:238011 34/35 (97%)
VWC_out 872..943 CDD:214565 59/70 (84%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1114..1139 23/24 (96%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1156..1238 61/81 (75%)
Jag2NP_001401828.1 MNNL 28..196 CDD:462222 161/167 (96%)
DSL 178..240 CDD:128366 61/61 (100%)
EGF_CA 307..345 CDD:238011 32/37 (86%)
EGF 351..381 CDD:394967 27/29 (93%)
EGF_CA 385..421 CDD:238011 35/35 (100%)
EGF_CA 423..458 CDD:238011 32/34 (94%)
EGF_CA 461..496 CDD:238011 32/34 (94%)
EGF_CA 502..534 CDD:238011 24/31 (77%)
EGF_CA 536..571 CDD:238011 30/34 (88%)
EGF_CA 636..671 CDD:238011 32/34 (94%)
EGF_CA 676..709 CDD:238011 31/32 (97%)
EGF 716..746 CDD:394967 29/29 (100%)
EGF_CA 757..787 CDD:238011 28/29 (97%)
EGF_CA <797..824 CDD:238011 26/26 (100%)
EGF_CA 827..863 CDD:238011 34/35 (97%)
VWC_out 872..943 CDD:214565 59/70 (84%)

Return to query results.
Submit another query.