Protein Alignment GEFmeso and vav3b

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_788403.2
• Gene: GEFmeso / 37134
• FlyBaseID: FBgn0050115
• Length: 1549
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_073774357.1
• Gene: vav3b / 559145
• ZFINID: ZDB-GENE-070912-251
• Length: 851
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 756
• Identity: 135/756 - (17%)
• Similarity: 280/756 - (37%)
• Gaps: 180/756 - (23%)

  Fly   460 ESLDRLTDIKPKFAARLSELARLNNRPLS-SSSICSTSSSSSSGSDQLLNGKLMATSYLASVESL 523
            |:.| |.|:: .|...:..|::|:..|:: .|.|.|..:..|:.::.:         |:...:.:
Zfish    95 EAFD-LFDVR-DFGKVIDTLSKLSYTPVAQQSGIRSFPTEESTENEDI---------YIHLADLI 148

  Fly   524 AESENELGDQHHPPAMSVLE-----------------------KTC--LEIVDSERSFVEDLGQV 563
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Zfish   149 DE---ELEEDVYDPVYGDIEGGEVYEDLMRTEAAVSQAAEVDIRSCCLLEIKQTEAKYTETLETI 210

  Fly   564 IKGYLQDWKERACLRVDELQILFANIEEIYEFNSMLLQRLIN--TGRDPGRIARCFIDLRDGFDV 626
            .|.::....:  .:...::..:|.||.::.:.:..|:..:.:  ..::...:.:.||..:|...:
Zfish   211 EKYFMIPLMK--FIPATDIDKVFINIPDLVKVHKGLMGEIQDCVQNKNAENLHQIFITYKDRLLL 273

  Fly   627 YTTYCTSYPEAISLLTKLLQATHTYSL-LASTQKLLQH-RLPLGSYLLKPVQRILKYHLLLDSLR 689
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Zfish   274 YGKYCSHVESAISLLDFICKEKEGVRLKLEECSKRANNGKFTLRDLLVVPMQRVLKYPLLLQELV 338

  Fly   690 KH-------CDVKEVVEAHVIMRQVAHNIDQVKRKQEQQSRVKELSGILDGWLGPELTVLGELRQ 747
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Zfish   339 KYTNDGPEKSNLRIALDA---MRDLAQYVNEVKRDVETLREIDQYQRSIEN-LNQSLLSYGRPKG 399

  Fly   748 EGLL-----MEQHNKQRLVLLFATMLIITKQKEDGRLQFKTYISQNNLMLSEHLPGEP----TSF 803
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Zfish   400 DGEVRLVSNLDKRRQDRHIFLFDAAVIICKRRGD-NYEMKEVIDLSHFKITNNLADKDCRKWSSG 463

  Fly   804 YVIPFDEPRHQIKLTARNRDQKRIW-------------------TQHIKGVMLEKLDIPMRAKEL 849
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Zfish   464 FYLTHQQGQSGFEFLFKTKELKKKWLDQFEMAISNIRPENATFNSHHFRMHTFERATTCSSCRML 528

  Fly   850 VYQLGNEEDRTPDRSTWKWSLHSGSNSTPTYLERRNACRRSEIRQRNSKFKRKTVANSSSFDSFN 914
            :..:.|:....|         ..|:.:....|.:...|.|:....:  |.:|||...
Zfish   529 LRGIFNQGYLCP---------KCGNGAHKGCLGKLGVCGRTGAAVQ--KPQRKTTPR-------- 574

  Fly   915 ESLEQEEESISQ----------AKPSKPLARNNSLDDTALQKLAA---AMRYRKRDAAVKEETKT 966
               :||:..:.:          :||....|.|..:.| .::.:.|   :..::.:....:|....
Zfish   575 ---KQEDPGLPKMLVIRDYFGVSKPQGGQALNAQIGD-VIEVVYADPHSSWWQGKILTTQETGFF 635

  Fly   967 PVKEPCKCDQDAKQDERIEPCSCILRDQRSRSAKSQSPVFSYKALKERSKSVPRIGGFSLDEEAE 1031
            |             .:.::||.|:.|            ...|       .|.|...|......||
Zfish   636 P-------------SDAVKPCPCVPR------------TVDY-------SSQPWFAGPMERHHAE 668

  Fly  1032 REREQDEDSAASLRGSKPDLSERKTKGKGFFEVKQYNHKTMPKKIANLKKQRSSTTKSCSRFYMD 1096
            .|..:.|:|...:|       .|..:.:.:....:||:        ::|..:..|.:.|  ||:
Zfish   669 SELMERENSTYLVR-------YRSRESREYAISIKYNN--------DVKHLKVLTKEGC--FYI- 715

  Fly  1097 LSEFDSSSSTVLKITESTEELRPDGEIELAQEAATLDESTQ 1137
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Zfish   716 -----AESRTFKNVLGLVEYYK---QHSLKEGFRTLDTTLQ 748

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
GEFmeso	NP_788403.2	RhoGEF	548..712	CDD:459876	41/174 (24%)
		PH_PLEKHG1_G2_G3	694..839	CDD:270063	26/172 (15%)
vav3b	XP_073774357.1	None