Protein Alignment GEFmeso and arhgef4

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_788403.2
• Gene: GEFmeso / 37134
• FlyBaseID: FBgn0050115
• Length: 1549
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_009296712.1
• Gene: arhgef4 / 559017
• ZFINID: ZDB-GENE-070912-575
• Length: 3088
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 888
• Identity: 205/888 - (23%)
• Similarity: 338/888 - (38%)
• Gaps: 182/888 - (20%)

  Fly     5 SDSDTSERWEDFFGSSTE------LAPSLLGIYDTLTNSFAAGGVAAAPTATSHESKASSSGDST 63
            ||||.:.  .|.|.||.|      ..|::|.:.:.:           :||.|  .|.:......|
Zfish  2199 SDSDQAS--VDGFESSVEDRSLSPAHPTVLALSNQM-----------SPTWT--RSLSCFETTDT 2248

  Fly    64 PKRSNSNCSSSSSTGSSTGSCSSVPTSDDQSASYTLASSSTHLGHQEPPAPLVVAGLRDEPDGAQ 128
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Zfish  2249 PTRPMSPKPHSPGLGWTQRRSFRYP-------SRSVASSLCLLGQ-----GVSTDGLLDPPQ--R 2299

  Fly   129 LSRLVQRRSQESQIHGSSSS--IASSGSSRRGSNIRILSPNVHRIITHSDIQPVEAVSAEALKQH 191
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Zfish  2300 PTSLKPRTTQLTTAHSFDSEYLLEDSSSDNQSQN---------------SLNSASLISKTEHVQH 2349

  Fly   192 QQQSQRSPTQGRYIKTGHSGTPPAAGSAPKLKLSHIPLSKITG-KLSTQSGSELVSTFD-SSNEY 254
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Zfish  2350 ITEAERRPQENACVLRVKSRDPGTA--APR------PMSDLYGWTMSLQGTRELALDLERKTNAH 2406

  Fly   255 LNSVAFAAFEKSKPQDEDRTPTNKSVPGTPFHFDGHPFQGRKLTLPRYDSQQSIKLIEMEQLAAT 319
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Zfish  2407 QRSCSYETL-----TDVDN------------------IRKKKLS-----KQQSLRQI------ST 2437

  Fly   320 SAQLLHAKPATPGTPATPT--PSATKAKEFVCSEPLSPVDIVDTINFDLVAQHMERLTLADP--- 379
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Zfish  2438 STSERHEKLRARLSLTSPEQFPSVPLKDHFFSQS--TPVGL-DYLGWAHRASFSE-TNLSAPEKE 2498

  Fly   380 --GDLDPRAELIEAVNKTLVNKPLVRSSSAACASTICSSPLLTYARTKSLGAKASTLGGGVPIKL 442
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Zfish  2499 AHGQVAPLALVI-------TDGP---QDKSGLADEVGSEDDL-YNEFRSSSNRFGHPGGG----- 2547

  Fly   443 PTAEQLA--ELEEANKLSAESL-DRLT--DIKPKF-AARLSELARLNNRPLSSSSICSTSSSSSS 501
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Zfish  2548 --GEQLAINELISDGSVCAEALWDHVTMDDQELGFKAGDVIEVVDATNKEWWWGRVLDSEGWFPA 2610

  Fly   502 GSDQL-LNGKLMATSYLASVESLAES-ENELGDQHHP--PAMSVLEKTCL-EIVDSERSFVEDLG 561
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Zfish  2611 SFVRLRVNQDEPMEEYLAHLDGASEGCGASMGGPLGPGLPCKEQMRANVINEIMSTERDYIKHLK 2675

  Fly   562 QVIKGYLQDWKERACLRVDE-LQILFANIEEIYEFNSMLLQRLIN--TGRDP--GRIARCFIDLR 621
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Zfish  2676 DICEGYIKQCRKRTDMFTEEQLRTIFGNIDELYRFQKKFLKALEKKFNKEHPHLSEIGSCFLEQQ 2740

  Fly   622 DGFDVYTTYCTSYPEAISLLTKLLQATHTYSLLASTQKLLQHR--LPLGSYLLKPVQRILKYHLL 684
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Zfish  2741 TNFQIYSEYCNNHPNACVQLSKLMK-IKKYVFFFEACRLLQKMIDISLDGFLLTPVQKICKYPLQ 2804

  Fly   685 LDSLRK-----HCDVKEVVEAHVIMRQVAHNIDQVKRKQEQQSRVKELSGILDGWLGP------- 737
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Zfish  2805 LAELLKYTNPQHRDYKDVEAALNAMKNVARLINERKRRLENIDKIAQWQSSIEDWEGEDVLSRSS 2869

  Fly   738 ------ELTVLGELRQEGLLMEQHNKQRLVLLFATMLIITKQKEDGR--LQFKTYISQNNLMLSE 794
                  :||.:.:.:.:|       :||:..||...|:..|:....|  |.:|..:..:.:.:.:
Zfish  2870 DLIFSGDLTKISQPQAKG-------QQRMFFLFDHQLVFCKKDLLRRDILYYKGRLDMDEMEVVD 2927

  Fly   795 HLPGEPTSFYV---------IPFDEPRHQIKLTARNRDQKRIW 828
            ...|:...|.|         .|..|..|  .|.|:..:||:.|
Zfish  2928 VEDGKDKDFNVSVKNALKLCSPGGEEVH--LLCAKKPEQKQRW 2968

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
GEFmeso	NP_788403.2	RhoGEF	548..712	CDD:459876	56/175 (32%)
		PH_PLEKHG1_G2_G3	694..839	CDD:270063	35/159 (22%)
arhgef4	XP_009296712.1	SKG6	<354..>498	CDD:462564
		PAT1	428..>696	CDD:401645
		PTZ00341	<536..>645	CDD:173534
		SH3_ASEF	2546..2617	CDD:212906	19/77 (25%)
		RhoGEF	2659..2838	CDD:214619	57/179 (32%)
		PH_Collybistin_ASEF	2843..2982	CDD:269931	26/135 (19%)