Protein Alignment GEFmeso and arhgef4

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_788403.2
• Gene: GEFmeso / 37134
• FlyBaseID: FBgn0050115
• Length: 1549
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_004917856.1
• Gene: arhgef4 / 100487089
• XenbaseID: XB-GENE-960463
• Length: 1808
• Species: Xenopus tropicalis
• Alignment Length: 1118
• Identity: 226/1118 - (20%)
• Similarity: 380/1118 - (33%)
• Gaps: 361/1118 - (32%)

  Fly     2 DIESDSDTSERWEDFFGSSTELAPSLLGIYDTLTNSFA----------------------AGGVA 44
            ||:||...||..:|  ....||..|...|.:...|...                      ...:|
 Frog   692 DIKSDVKASESQKD--SKIAELKDSRTEIKEEPNNKIKRMNIKNSDIFKKYLSVKTPVPNGSQLA 754

  Fly    45 AAPTA--------TSHES---------KASSSG-----DSTPKR---SNSNCSSSSSTGSSTGSC 84
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 Frog   755 AKPTGETSDFSDEDSYESSFLYNRSMRKASGSGRIDLDNFTRLRCGVAPSNTNDKSDNGQSQG-F 818

  Fly    85 SSVPTSDDQSASYTLASSSTHLGHQEPPAPLVVAGL-----RDEPDGAQLSRLVQRRSQESQ--I 142
            |..||.:.::.| ...:.|..|..:...|....:.:     .|:...||.|....|..::..  :
 Frog   819 SKPPTENCETKS-ERNTESKRLKERLMWAHKSFSSMFDFKNNDKDSAAQSSEGTPREEKKKSRPL 882

  Fly   143 HGSSSSIASSGSSRRGS--NIRILSPNVHRIITHSD---------------IQPVEAVSAEALK- 189
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 Frog   883 QSSWKTLRNSKNKDKDSFKRLSVLNLSAHIINTNMPRGASKENGNEHLPPILDPIKQPSSMEIKP 947

  Fly   190 ----QHQQQSQRSPTQGRYIKTGHSGTPPAAGSAPKLKLSHIPLSKITGKLSTQSGSELVSTFDS 250
                ....:|...|.:.   |..|.                        |.|.::...|.:|.|
 Frog   948 CMTTDTNTESDLEPLEA---KENHK------------------------KWSLENDDSLQTTCD- 984

  Fly   251 SNEYLNSVAFAAFEKSKPQDEDRTP---------TNKSV------PGTPFHFDGHP-FQGRKLTL 299
                 :|..|:.|:.::....::.|         :|..:      |.:|..|...| ||.|.|
 Frog   985 -----DSAFFSQFDSNESHSLNKQPSITTLFNPFSNSEINPMPCRPMSPKPFSQWPSFQRRGL-- 1042

  Fly   300 PRYDSQQSIKLIEMEQLAATSAQLLHAKPATPGTPATP-----------TPSATKAKEFVCSEPL 353
                        ...:::|||...|.......|.|.:|           |..:::..:...|...
 Frog  1043 ------------HNSRISATSMTSLANSSTVDGCPDSPETAVKTWGGYLTDRSSQKDDSSASSQS 1095

  Fly   354 SP--------VDIV------DTINFDLVAQHMERLTL---ADPGDLDPRAEL-IEAVNKTLV--- 397
            .|        :||:      ..:...::....||..|   ..|.||.....| |...::||.
 Frog  1096 KPSLNTASSVMDILRDEDSRQLVPSSILKMQRERNALLYKKRPTDLTASQYLPINTESRTLTLPQ 1160

  Fly   398 ------------NKPLVRSSSAACASTICSSPLLTYART------KSLGA--------KASTLGG 436
                        .:|.....|.:|.:      |..|.|.      ||:.|        |||.
 Frog  1161 MASMGHKRDSEPTRPKALFKSLSCDN------LWVYERNQERKLDKSIDAGDLMRNQSKASM--- 1216

  Fly   437 GVPIKLPTAEQLAELEEANKLSAESLDRLTDIKPKF--AARLSELARLNNRPLSSSSICSTSSSS 499
            .|.|..|      |:..:..:...|..|.|..:...  ..|.:.|:..|:...:..|:.....|.
 Frog  1217 SVSIGPP------EIFRSFPMKVHSFSRSTPSRLDLVGCVRRTSLSVFNDGSTNRPSLFDDLGSD 1275

  Fly   500 S--------------SGSDQLLNGKLMATSYLASVESLAE----SENELGDQHHPPAMSVLE--- 543
            .              .|.:||...:|::...:...|:|.:    .:.|||.:    |.||:|
 Frog  1276 EDFYEELHVSGHRFVGGGEQLAINELISDGSVVYAEALWDHVTMDDEELGFK----AGSVIEVMD 1336

  Fly   544 ---------------------------------KTCL---------------------------- 547
                                             :.|.
 Frog  1337 ATNKEWWWGRILDSEGWFPASFVRLRVNQDEPMEDCATKAGDKEQDSRNVPRRNGFGQNNKDQMR 1401

  Fly   548 -----EIVDSERSFVEDLGQVIKGYLQDWKER-ACLRVDELQILFANIEEIYEFNSMLLQRL--- 603
                 ||:::|:.:::.|..:.:||::..::| .....|:|..:|.||||||:|....|:.|
 Frog  1402 TNVINEILNTEKHYIKHLKDICEGYIKQCRKRDDMFTEDQLWTIFGNIEEIYKFQKKFLKTLEKR 1466

  Fly   604 INTGRDP---GRIARCFIDLRDGFDVYTTYCTSYPEA---ISLLTKLLQATHTYSLLASTQKLLQ 662
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 Frog  1467 IN--KDSPHLSEIGSCFLEYQTDFQIYSEYCNNHPNACTELSKLTKVKKYVHFFETCRLLQKMID 1529

  Fly   663 HRLPLGSYLLKPVQRILKYHLLLDSLRK-----HCDVKEVVEAHVIMRQVAHNIDQVKRKQEQQS 722
              :.|..:||.|||:|.||.|.|..|.|     |.|...|..|...|:.||..|::.||:.|...
 Frog  1530 --ISLDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTNSQHRDYTNVEAALDAMKNVARLINERKRRLENID 1592

  Fly   723 RVKELSGILDGWLGP-------------ELTVLGELRQEGLLMEQHNKQRLVLLFATMLIITKQK 774
            ::......::.|.|.             |||.:..|:.:|       :||:..||...::..|:.
 Frog  1593 KIAHWQSSIEDWEGEDILARSSELIHSGELTKISHLQPKG-------QQRIFFLFDHQIVFCKKD 1650

  Fly   775 EDGR--LQFKTYISQNNLMLSEHLPGEPTSFYVIPFDEPRHQIKLT-------ARNRDQKRIWTQ 830
            ...|  |.:|..|..:::.:.....|:...|.:...:..:.|.|::       |:..:.|:.|.|
 Frog  1651 LLRRDILYYKGKIDMDDMEVLNVEDGKDKDFNITVKNAFKLQGKVSEEIHLFLAKKPEHKQRWLQ 1715

  Fly   831 HI----KGVMLEK 839
            ..    |.|:|:|
 Frog  1716 AFEEERKQVLLDK 1728

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
GEFmeso	NP_788403.2	RhoGEF	548..712	CDD:459876	58/178 (33%)
		PH_PLEKHG1_G2_G3	694..839	CDD:270063	36/170 (21%)
arhgef4	XP_004917856.1	SH3_ASEF	1291..1363	CDD:212906	13/75 (17%)
		RhoGEF	1404..1583	CDD:214619	59/182 (32%)
		PH_Collybistin_ASEF	1588..1727	CDD:269931	27/145 (19%)