Protein Alignment GEFmeso and vav3

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_788403.2
• Gene: GEFmeso / 37134
• FlyBaseID: FBgn0050115
• Length: 1549
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_073797007.1
• Gene: vav3 / 100333179
• -ID: -
• Length: 860
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 554
• Identity: 105/554 - (18%)
• Similarity: 222/554 - (40%)
• Gaps: 112/554 - (20%)

  Fly   460 ESLDRLTDIKPKFAARLSELARLNNRPLSSSSICSTSSSSSSGSDQLLNGKLMATSYLASV--ES 522
            |:.| |.|:: .|...:..|::|::..::..:......:..|..|:.:      .::|..:  |:
Zfish    98 EAFD-LFDVR-DFGKVMDTLSKLSHTHIAQQTGIRPFPTEESVEDEDI------YNHLEDLIDEN 154

  Fly   523 LAESENELGD---------------------QHHPPAMSVLEKTCL-EIVDSERSFVEDLGQVIK 565
            ..|.|.:|.|                     |....|.:.:...|| ||..:|..:.|.|..:.|
Zfish   155 GVEDEEDLYDCVYDDDEGGEVYEDLMKVELVQPQKQAETDIRSCCLMEIKQTEEKYTETLDSIEK 219

  Fly   566 GYLQDWKERACLRVDELQILFANIEEIYEFNSMLLQRLINT--GRDPGRIARCFIDLRDGFDVYT 628
            .:::...:  .|...|::.:|.||.::.:.::.||:.:.::  ..:...:.:.||..::...:|.
Zfish   220 FFMKPLGQ--SLSSVEIEKVFINIPDLVKVHTSLLREVQDSVLMHNATNLYQIFIKYKERLVLYG 282

  Fly   629 TYCTSYPEAISLLTKLLQATHTYSLLASTQKLLQHRLPLGSYLLK-----PVQRILKYHLLLDSL 688
            .||:....||:.|..:.:....   :....:|...|...|.:.|:     |:||:|||||||..|
Zfish   283 KYCSQVESAIACLDDICKNRED---VRQMLELCSKRANNGKFTLRDLLVVPMQRVLKYHLLLQEL 344

  Fly   689 RKH-------CDVKEVVEAHVIMRQVAHNIDQVKRK-------QEQQSRVKELSGILDGWLGPEL 739
            .||       .::::.::|   |:.:|..:::|||.       .:.|..::.|:..|..:..|:
Zfish   345 VKHTHDATDKTNLRQALDA---MKDLAQYVNEVKRDIETLRDIDQYQKSIENLNQSLRNYGRPK- 405

  Fly   740 TVLGELRQEGLLMEQHNKQ-RLVLLFATMLIITKQKEDGRLQFKTYISQNNLMLSEHLPGEPTS- 802
               |:.......:::..|| |.:.||.:.:|:.|::.| ..:.|..|..::..::.:    |||
Zfish   406 ---GDSEVRVASVDKRAKQDRHIFLFDSAVIVCKRRGD-NYEMKEVIDLHSFKITNN----PTSE 462

  Fly   803 ---------FYVIPFDEPRHQIKLTARNRDQKRIWTQHIKGVMLEKLDIPMRAKELVYQLGNEED 858
                     || :..::.::..:...:.::.|:.|.:.. |:.|..:
Zfish   463 KENRKWCHGFY-LTHNQGQNGFEFFFKTKELKKKWQEQF-GMALSNI------------------ 507

  Fly   859 RTPDRSTWKWSLHSGSNSTPTYLERRNACRRSEIRQRNSKFKRKTVANSSSFDSFNESLEQEEES 923
             .|:  :.|.:.|.....|   .|...:|...|:..| ..|.:....:.....:..|.|.:.|..
Zfish   508 -CPE--SGKCNFHEFRMHT---FETTTSCSSCEMLLR-GVFYQGYRCSKCGAGAHKECLGRVEVC 565

  Fly   924 ISQAKPSK----PLARNNSLDDTALQKLAAAMRY 953
            :..:..|:    .:.:..|..|..|.|:.....|
Zfish   566 VKSSAASRSAESQIGKTTSRGDKDLPKMLVICNY 599

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
GEFmeso	NP_788403.2	RhoGEF	548..712	CDD:459876	41/177 (23%)
		PH_PLEKHG1_G2_G3	694..839	CDD:270063	30/162 (19%)
vav3	XP_073797007.1	None