Protein Alignment CG30116 and ttc41

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_725799.1
• Gene: CG30116 / 37126
• FlyBaseID: FBgn0028496
• Length: 1922
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001429318.1
• Gene: ttc41 / 101885759
• ZFINID: ZDB-GENE-110914-190
• Length: 1166
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1156
• Identity: 222/1156 - (19%)
• Similarity: 384/1156 - (33%)
• Gaps: 417/1156 - (36%)

  Fly    49 ELVGPELQS----LYDDRQIELEFVDMH---------------FGTGDLEVHQLERDPYLIHDYL 94
            |:..|.||.    :.||.|.:|.::..:               |...||:..:.:||.  .:::.
Zfish     9 EVDSPSLQPYLCYVPDDLQEDLFYLKYNIFSHLDALCQTRGTCFRPMDLQRSKQDRDD--ANNHK 71

  Fly    95 HEIDTCHAHTK--------SVFFMVLVGDGIGRQLLPTKIDEDIFSA------------------ 133
            ::.|......|        |.||:.|:|...| |.||     ||.|.
Zfish    72 NDSDLFDQQLKISLDLVDRSSFFICLLGHSYG-QCLP-----DIESCSSSEVVRKLNIAASSGYP 130

  Fly   134 -VLADQ-QTSADHEAMLVK-----------WYERDASQTQRQLKQDYRLMNVDAWLAESQRMQSF 185
             ||.|: :|.:..|..:.|           :|.:|.:....:...|....:.|.    |:.|..|
Zfish   131 WVLEDEYRTCSLTELEITKAAFIDNHRLCFFYFKDYTPQDTEDDDDDDDNDDDG----SEEMSIF 191

  Fly   186 LEQAFQSLLQGSGASGRSPDFMERVQLLRRTQIEREVSQAMALTSEKILAVFRERAAQCSKGDVE 250
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Zfish   192 LDM----------LSKQSQRERQRLRDLKR----RIINHCLP------VRFFRNQ--------YE 228

  Fly   251 AAERLRKIKDELTMNLSTDNHTTLVVPGSAASEAIDPDNEDHESYLSKFKNKVTDKLRLLIEAHI 315
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Zfish   229 LGEMIRKDWEEVISKISKDSKHLI----SGWQDSF--DLHSHKSY-----------SRALCNWFV 276

  Fly   316 TNDP--DVIKGRKKTVQEIFH--EHATHLRILREHTDSDALVESRVPQQLRQNLMANFRNGSRHA 376
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Zfish   277 PSVPATETLNAFDKFLHPVTHNAKYETHAK------NPGALFNSDL-------------NDSEKS 322

  Fly   377 PYFLCGADGSGKSA-----------------ILCHLYGQVGSWFGSTRVHRVIRFAKATPRSAYN 424
            ...:.|..|.|||.                 ::.|..|...|   ||.|..::|...|..|.|:|
Zfish   323 VLVISGERGCGKSTLAAWCLQTFSEQNPDLPVIRHFCGTSTS---STDVRSLLRLCTAQLRKAHN 384

  Fly   425 LELLRVICQQISIIFNIPEGYLPKDASFDPLYINT-WFQNLLRRVE----DMGNDVLFLFIDDLH 484
                               |..|   .:|....|| .|:.|.|.|:    .:......|.||.:.
Zfish   385 -------------------GDSP---DWDESLENTSEFEYLHRAVQAFTAALNLRPCILLIDGID 427

  Fly   485 LLNP---LDCDIVTALSWLPTSLPWNVQIICSSTTPVEQLKFTPMQRDRFKSIEYQFDLNMGDYA 546
            ||..   |....|.:|.|||..||...::|.::|       ||.:..   ||...:.|:.:
Zfish   428 LLTETLGLSKQEVKSLQWLPAVLPPFCKMIITTT-------FTDLTH---KSFSCRTDVQI---- 478

  Fly   547 TKLKIPPQCIPGDVSFALYVEQQF-----------DQLERHYGRQA----VGDLASYITCSEYGL 596
              ||.||...| .|..::.::..|           .::.|.....|    ||  ....||.....
Zfish   479 --LKCPPFPDP-SVQLSILLKHLFLPSQEPPSVVLQRMVRKCRSPAFLALVG--TELRTCGVLRK 538

  Fly   597 SETELLELLMPTDDPESLIETKNGHFSFATFKKIHREM--------------------------- 634
            .|.| :|||....:.:|:.|        ...|.|||.:
Zfish   539 KEEE-MELLKEYAEADSVPE--------LWVKVIHRWVKDYSRSAPSEDVTSSKVTETHTSPSEG 594

  Fly   635 ------DLLLLLH--DKIMSGKVLI------QWRHNYCASVAKRRYMDVQRTRSLHCELANLFFP 685
                  |.|.|:|  ..:...:||:      .|.|      .:.:.::..|.||       ..:|
Zfish   595 LSGWVWDTLCLIHMSRALTEAQVLVLLEDLGYWGH------LRVQVLEWARLRS-------AIWP 646

  Fly   686 QDEDESTLENESNRSESKSVISLKDRDREKDSLS-AVSAVSAGRKSSSTHHNDDTSTFYNPIAAD 749
            ..:::::           .::.:|.:     ||| |::.:..|.:..:|:| ...:||:....:|
Zfish   647 WIQEKAS-----------GLLIIKQK-----SLSLAMNLLLNGTEGQNTYH-QILATFFQKSNSD 694

  Fly   750 VSYSMRHVEESWHHLMRSDDTTRFKQIAVCNFDFLL--AAVQTVSISYLRCLIEHVRCYILDRDI 812
            :|::.:..|..||.:    .|:.||::    .:||:  |.|:.:|.:..|  ..|     |..|:
Zfish   695 ISWAQKMEEIPWHFI----QTSSFKEL----HEFLINPATVEFLSSNLKR--YPH-----LSTDV 744

  Fly   813 ELIYYTI--RKSSDVL-------------TRDPMQLG------SQLISWLRPISEHD-------- 848
             :.|:|:  :|..|.:             |.||.:|.      |:::.::..:...:
Zfish   745 -IHYWTLLRKKGFDPVVSFQNLITQTYADTPDPSRLSRLSLFCSKVLLYMGEMRTTEEMLLQADQ 808

  Fly   849 --------DDDNSLLSMTVRSATAWCDGYAVPLLVPLTGWLPAPLPSQIRTMTVSGTGCIRAVWL 905
                    |.|:..|.:.|:...|       .|.|.:      .||..|......|....|:
Zfish   809 ILQKTVELDSDSMRLQLNVQHMMA-------ELYVQM------HLPKDIEMFCHKGLETARS--- 857

  Fly   906 APSKQHLILATSSGDVQQWHIMSNSLDHIFKGHTAAVTCLLVAPQSDSELLLTGSEDATVLVWHV 970
                                        :.:.|..:|...|:..|....|.:...|:..:.....
Zfish   858 ----------------------------LTEAHLDSVEVKLIVGQLLCRLCMALLEEGRLFAVPE 894

  Fly   971 GLRE-RRAHIKNAHTAPITGVAAGANNTLIISSSEDASIAITDLASGKLRH 1020
            ..|| |.|...:||..        |..|::|..      ||..|:.|:|::
Zfish   895 LFREIRSARYTSAHPC--------AEGTVMILK------AIHKLSFGELKN 931

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG30116	NP_725799.1	WD40	<897..1057	CDD:441893	21/125 (17%)
		WD40 repeat	901..937	CDD:293791	1/35 (3%)
		WD40 repeat	942..982	CDD:293791	9/40 (23%)
		WD40 repeat	988..1024	CDD:293791	8/33 (24%)
		WD40	991..1491	CDD:441893	8/30 (27%)
		WD40 repeat	1029..1064	CDD:293791
		WD40 repeat	1071..1106	CDD:293791
		WD40 repeat	1112..1147	CDD:293791
		WD40 repeat	1216..1252	CDD:293791
		WD40 repeat	1258..1294	CDD:293791
		WD40 repeat	1299..1335	CDD:293791
		WD40 repeat	1340..1374	CDD:293791
		WD40 repeat	1379..1415	CDD:293791
		WD40 repeat	1421..1458	CDD:293791
		WD40 repeat	1464..1488	CDD:293791
ttc41	NP_001429318.1	None