Protein Alignment Elk and hcn1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_477009.1
• Gene: Elk / 37047
• FlyBaseID: FBgn0011589
• Length: 1284
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_068072094.1
• Gene: hcn1 / 100334297
• ZFINID: ZDB-GENE-110520-1
• Length: 925
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 996
• Identity: 209/996 - (20%)
• Similarity: 395/996 - (39%)
• Gaps: 252/996 - (25%)

  Fly   186 GDTEAGEGNNLDVPAG---CNMGRRRSRAVLYQLSGHYKPEKGGVKTKLKLGNNFMHSTEAPFPE 247
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Zfish    42 GNSVGGKGDREEAMVGFDDIDAASRQYGFMQRQFGAMMQP--GVNKFSLRM-----------FGS 93

  Fly   248 YKTQSIKKSRL------ILPHYGVFKGIWDWVILVATFYVALMVPYNAAFAKADRQTK--VSDVI 304
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Zfish    94 QKAVEKEQERVQTAGYWIIHPYSDFRFYWDLIMLIMMMGNLIIIPVGITFFSEQTTTSWLVFNVA 158

  Fly   305 VEALFIVDILLNFRTTFVSRK-GEVVSNSKQIAINYLRGWFALDLLAALPFDHLYASDLYDGEDS 368
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Zfish   159 SDTIFLVDLVMNFRTGIVNEESSEIILDPKVIKMNYLKSWFVVDFLSSIPVDYIFLI-VEKGFDS 222

  Fly   369 HIH-------------LVKLTRLLRLARLLQKIDRYSQHTAMILTL---------LMFSFTLAAH 411
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Zfish   223 EVYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVVRIFNLIGMMLLLCH 287

  Fly   412 WLACIWYVIAVKEYEWFPESNIGWLQLLAERKNASVAILTTAETYSTALYFTFTSLTSVGFGNVS 476
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Zfish   288 WDGCLQFLVPLLQ-DFPPDC---WVSL-----NGMVND-SWGKQYSYALFKAMSHMLCIGYGARA 342

  Fly   477 ANTTAEKVFTIIMMLIGALMHAVVFGNVTAIIQRMYSRRSLYESKWRDLKDFVALHNMPKELKQR 541
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Zfish   343 PVSMSDLWITMLSMIVGATCYAMFVGHATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQYMSFHKLPADMRQK 407

  Fly   542 IEDYFQTSWSLSHGIDIYETLREFPEELRGD-VSMHLHREILQLPIFEAASQGCLKLLSLHIKTN 605
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Zfish   408 IHDYYEHRYQ-GKIFDEDSILNELNDPLKEEIVNFNCRKLVATMPLFANADPNFVTGMLSKLKFE 471

  Fly   606 FCAPGEYLIHKGDALNYIYYLCNGSMEVIKDDMVVAILGKGDLVGSDINVHLVATSN---GQMTA 667
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Zfish   472 VFQPNDYIIREGTVGKKMYFIQHGVASVI----------------TKFNKELKLTDGSYFGEICL 520

  Fly   668 TTNSAGQDVVVRSSSDIKALTYCDLKCIHMGGLVEVLRLYPEYQQQF-------ANDIQH----- 720
            .|..       |.::.::|.|||.|..:.:....|||..||..::.|       .:.|.|
Zfish   521 LTKG-------RRTASVRADTYCRLFSLSVDHFNEVLEEYPMMRRAFETVAIDRLDRIVHKIKPE 578

  Fly   721 -DLTC------------------NLREG-YENQDSDIGPSFPLPSISEDDE------NREEAEEG 759
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Zfish   579 DNLRCDPKTQRKKNSLLLQKFQKDLNAGVFNTQENEL-----LKQIIRQDREMVMMVDRKQSVTG 638

  Fly   760 GKGEKENGGGPPSGASPLHNISNSPLH---ATRSPLLGMGSPRNQRLHQRGRSL----------- 810
                  ....|.||    ::|.|||..   ||.:.:||     |.:|.|:...|
Zfish   639 ------MNSTPMSG----NSIINSPAQPPFATATAILG-----NNQLQQQAAPLSYSTSATITPS 688

  Fly   811 --------ITLRETNKRHRTLNAACSLDRGSFEEPEPLEEEQSSGG----------------KRP 851
                    :|....:..|..|:::      |...|.||  :|.:|.                :.|
Zfish   689 GRVPPSQGVTFSAPSVSHGNLSSS------SPNPPTPL--QQPAGAIMSPCSFTTSICSPPVQTP 745

  Fly   852 SLER-------LDSQVSTLHQDVAQLSAEVRNAISALQEMTFTSNAMTSHSSLKFPPARSIPNIS 909
            ...|       ..||:|.:.|.:.|.|                     |.:||..|||:..|  .
Zfish   746 IASRTFQYGSPTASQLSLVQQALPQQS---------------------SPASLPQPPAQQQP--Q 787

  Fly   910 GVAGTRSGV-----AVEHGLMGGVLAAAELAAMQRSSSHPPEVWGRDVQLPTSNTASSKAPSPVE 969
            |.:..||.|     |::.|.:...|  ..|:|.|.|..|...:..|      ::..|.::.:.::
Zfish   788 GASPQRSDVHKSAQALQSGSLSKDL--RHLSASQPSLPHETSLAAR------AHPTSGESLASIQ 844

  Fly   970 PKKTMTSRSSQTDFYRIDFPTFERFVLANPRLVLGLLGIEPAIKNEMDLLQQKQTLQISPLNTID 1034
            |....::...|.                 |..|| ..||...:...:.|.:|..:..:.|:.|..
Zfish   845 PPPMGSAAGIQA-----------------PGSVL-QSGIRTNVPQRVALFRQMSSGALPPVRTAP 891

  Fly  1035 ECVSPSDHNLASSKERLITSS 1055
            ......| :..|.:|..:.||
Zfish   892 SSAQHRD-STGSRRESAVLSS 911

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Elk	NP_477009.1	PAS_9	40..133	CDD:463873
		PLN03192	270..>650	CDD:215625	95/405 (23%)
		cNMP	586..716	CDD:197516	28/139 (20%)
hcn1	XP_068072094.1	Ion_trans_N	75..117	CDD:400630	9/54 (17%)
		PLN03192	110..>614	CDD:215625	122/538 (23%)
		CAP_ED	452..560	CDD:237999	27/130 (21%)
		PHA03247	<653..906	CDD:223021	60/315 (19%)