DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment unc-104 and kif1ab

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_611155.3 Gene:unc-104 / 36876 FlyBaseID:FBgn0267002 Length:1739 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_009296795.1 Gene:kif1ab / 566766 ZFINID:ZDB-GENE-070912-480 Length:1799 Species:Danio rerio


Alignment Length:1865 Identity:979/1865 - (52%)
Similarity:1254/1865 - (67%) Gaps:228/1865 - (12%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     2 SSVKVAVRVRPFNSREIARESKCIIEMAGATTAITNPKVPPNTSDSVKRFNFDYSYWSH-DHHDA 65
            :||||||||||||||||.::|||||:|:|.||.|.|||.|...    |.|||||||||| ...|.
Zfish     4 ASVKVAVRVRPFNSREIGKDSKCIIQMSGNTTTILNPKQPKEN----KSFNFDYSYWSHTTPEDV 64

  Fly    66 DFSTQSMVYKDIGEEMLQHSFDGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGRQEEQQEGIIPMICKDLFTRI 130
            :::.|..||:|||||||.|:|:||||||||||||||||||||||:||:.||||||::|:||||:|
Zfish    65 NYACQKQVYRDIGEEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEKDQEGIIPLLCEDLFTKI 129

  Fly   131 QDTETDDLKYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVEDLSKLAVTDYQDIHDL 195
            .|...:::.||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||.|.||.||
Zfish   130 NDNNDNNMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLMGPYVEDLSKLAVTSYNDIQDL 194

  Fly   196 IDEGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIFFTQRRHDLMTNLTTEKVSKISLVDLAGSERADSTGA 260
            :|.|||||||||||||||||||||||.|.|||::||..:..||||||||||||||||||||||||
Zfish   195 MDSGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFNIIFTQKQHDNDSENTTEKVSKISLVDLAGSERADSTGA 259

  Fly   261 KGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEVAS---KKKNTKKAD-FIPYRDSALTWLLRENLGGNSK 321
            |||||||||||||||||||||||||||:.|   |.|..||.: |||||||.|||||||||||||:
Zfish   260 KGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEMDSAPNKNKKKKKVESFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSR 324

  Fly   322 TAMIAAISPADINYDETLSTLRYADRAKQIVCKAVVNEDANAKLIRELKEEIQKLRDLLKAEGI- 385
            |||:||:|||||||||||||||||||||||.|.||:|||.|.:|:||||||:.:|:|||.|:|: 
Zfish   325 TAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIRCNAVINEDPNNRLVRELKEEVARLKDLLYAQGLG 389

  Fly   386 --------------EVQEEDE------LTKSTVIKSPTKS----RNRNGST------------TE 414
                          .:|..::      :|.:....||:.|    .:|.||.            :|
Zfish   390 DIIENLSNYKANISSIQAVNQRGDFSTVTNAMTGMSPSPSLSALTSRVGSISSLHDRIMFSPGSE 454

  Fly   415 MAVDQLQASEKLIAELNETWEEKLKRTEEIRVQREAVFAEMGVAVKEDGITVGVFSPKKTPHLVN 479
            .|:::|:.:||:||||||||||||:|||.||::|||:.||||||::|||.|||||||||||||||
Zfish   455 EAIERLKETEKIIAELNETWEEKLRRTEAIRMEREALLAEMGVAMREDGGTVGVFSPKKTPHLVN 519

  Fly   480 LNEDPNLSECLLYYIKEGLTRLGTHEANVPQDIQLSGSHILKEHCTFENKNS-----TVTLLPHK 539
            |||||.:|||||||||:|:|::|..:|:..|||.|||..|..|||.|.:..:     ||.|.|.:
Zfish   520 LNEDPLMSECLLYYIKDGITKVGREDASSRQDIVLSGHFIKDEHCIFTSTTNAIGEGTVVLEPCE 584

  Fly   540 DAIIYVNGRKLVEPEVLKTGSRVILGKNHVFRFTNPEQARELRDKIETENEAENEVEKTDTQQVD 604
            .|..||||:::.||.|||:|:|:|:||:|||||.:|||||:.|::....:        |..:.||
Zfish   585 GAETYVNGKRVTEPTVLKSGNRIIMGKSHVFRFNDPEQARQDRERTPCAD--------TPVEPVD 641

  Fly   605 WNFAQCELLEKQGIDLKAEMKKRLDNLEEQYKREKLQADQQFEEQRKTYEARIDALQKQVEEQSM 669
            |.|||.|||||||||:|.||.:||..||:||::|:.:|....|:||..||::::||||||.    
Zfish   642 WAFAQRELLEKQGIDMKQEMDQRLQELEDQYRKEREEASNLLEQQRLDYESKLEALQKQVN---- 702

  Fly   670 TMSMYSSYSPEDFHQEEDVYTNPMYESCWTAREAGLAAWAFRKWRYHQFTSLRDDLWGNAIFLKE 734
                 |.|.||...:||::..    |..||.||..||.|||||||::|||||||.||||||||||
Zfish   703 -----SRYYPETTEEEEELED----EVPWTKRETELALWAFRKWRFYQFTSLRDLLWGNAIFLKE 758

  Fly   735 ANAISVELKKKVQFQFTLLTDTLYSPLPPE-LASTVAPVHQEDEFGAPPVSKTLVAVEVTDTKNG 798
            ||||||||||||||||.||||||||||||: |..::|...::..|     .:|:|||||.|.|||
Zfish   759 ANAISVELKKKVQFQFVLLTDTLYSPLPPDLLPPSIAKDREKRLF-----PRTIVAVEVQDQKNG 818

  Fly   799 ATHHWSLEKLRYRLELMRQIYN--VESPPSSM---------------------------LFDTSG 834
            |||:|:|:|||.||:|||::|:  .|.|.:::                           :.:|..
Zfish   819 ATHYWTLDKLRQRLDLMREMYDRAAEVPSTAVEDCDHIMSGGDPFYDRFPWFRLVGRTPILNTCM 883

  Fly   835 MEALSG-WISPPSQHPGQQAQLLPLE---PPVESERGRLTLAN--LIPSRQRLELMREMYHNE-- 891
            .|.:|| .:||....|......|..|   ..||.|...|...:  :.......||.||...::  
Zfish   884 SERMSGLTLSPTLSDPDSDITELADERHYGKVEVEEEELEDLDDEIFVEDNGSELGREEEEDDDD 948

  Fly   892 --AEMSPTSPDYNVESLTGGDPFYDRFPWFRMVGRSFIYLSNLLYPVPLVHKVAIVNERGDVRGY 954
              .|..|...|       |.||||||:|.|.:|||:|:|||||||||||||:||||:|:|:|:|:
Zfish   949 GVGERCPGVSD-------GQDPFYDRWPLFSLVGRAFVYLSNLLYPVPLVHRVAIVSEKGEVKGF 1006

  Fly   955 LRIAVQPV-LDEESIDFNNGVKQS--ARLVFNEDDAKPKYRA---------LNEKDDVQRYIDNG 1007
            ||:|||.: .|||:.|:.:||:||  |::.| ||.|..|::.         .:..::..|.::..
Zfish  1007 LRVAVQAISADEEAPDYGSGVRQSGTAKISF-EDQAFEKFQTEACTSGMSQTHTSEEELRIVEGE 1070

  Fly  1008 GLDSKLE-ELEDVDSGRGIDSNSAS--------EC--HENSEEPGEHLQVGKEFTFRVTVLQATG 1061
            |.:|:|. ..::|::...:.|...|        ||  ....::..:||::|..||||||||||:.
Zfish  1071 GQNSELGLSADEVNNNTCLVSPDISDSPLKGVLECPLDVTQDKSLQHLKIGSNFTFRVTVLQASS 1135

  Fly  1062 IGAEYADIFCQFNFLHRHEEAFSTEPVKNSASGAPLGFYHVQNITVPVTKSFIEYLKTQPIMFKI 1126
            |.||||||||||||:|||:|||||||:||:..|.||||||||||||.|||||:||:|:|||:|::
Zfish  1136 ISAEYADIFCQFNFIHRHDEAFSTEPLKNTGRGPPLGFYHVQNITVEVTKSFVEYIKSQPIVFEV 1200

  Fly  1127 FGHYQTHPLHKDAKQDFVSRPPPRRMLPPSIPISQPVRSPKFGPLPCAPTSTVLAKHDVLVWFEI 1191
            |||||..|.....|....|..|.||..|..:|:|:||.:.|...|..:.......|:|::.:|||
Zfish  1201 FGHYQKQPFPPLCKDLISSLRPMRRQFPRVMPLSKPVPATKLSTLARSTAGPCHCKYDLMAFFEI 1265

  Fly  1192 CELAPNGEYVPSVVEHSDDLPCRGLFLLHQGIQRRIRITIVHEPTTEVKWKDINELVVGRIRNTP 1256
            |||..||:|:|:||:|...:||.|.|||||||||||.:||.||...:::||::.|||:|||||||
Zfish  1266 CELEANGDYIPAVVDHRGGMPCHGTFLLHQGIQRRITVTIAHETGNDIEWKEVKELVIGRIRNTP 1330

  Fly  1257 ESSDEQDEDACVLSLGLFPG--------EALEVPGDDRSFYRFEAAWDSSLHNSALLNRVSQGGE 1313
            | :||...|..:|||.:...        :.:.:..|.|:|||||||||||:|||.|||||:..||
Zfish  1331 E-ADETIIDPNILSLNILSSNYIRPTYDDRVSLGSDHRTFYRFEAAWDSSMHNSLLLNRVTPYGE 1394

  Fly  1314 TIYITLSAYLELENCARPAIITKDLSMVIYGRDAR-TGPRSLKHLFS-GQYRNPEANRLTGVYEL 1376
            .||||||||||:|||.:|.::|||..||.|.|||: ...||:::||| |.:|..|:|.:||||||
Zfish  1395 KIYITLSAYLEMENCTQPTVVTKDFCMVFYSRDAKLPASRSIRNLFSTGAFRPLESNCVTGVYEL 1459

  Fly  1377 ALRRASEAGSPGVQRRQRRVLDTSSTYVRGEENLHGWRPRGDSLIFDHQWELEKLTRLEEVGRMR 1441
            :|...::.||||:|||:|||||||..||||||||.|||||.||||.|||||||||:.|:||.:.|
Zfish  1460 SLCHLADIGSPGMQRRRRRVLDTSVAYVRGEENLAGWRPRSDSLILDHQWELEKLSLLQEVEKTR 1524

  Fly  1442 HLLLLRERLGMDTNPNPTTKTEKDVCNLAARAATSPVHMVIP------QSPQTPVKDPQQIIPER 1500
            |.|||||:|.........:...||:  |.:..|.||  |:.|      .||              
Zfish  1525 HYLLLREKLEASLLLGQDSFYGKDL--LDSPKANSP--MISPVMSLGLDSP-------------- 1571

  Fly  1501 EYNQREQDLMLKCLKLVQGRYTKSEANDTQTQSDVSPSDEGCADMTVSCISSNSMENNKFVIRRR 1565
              |:|:::|..||::|:...:.:..   :|..|.:|.|       .:|.||::       ::|..
Zfish  1572 --NERQRELAAKCVRLLMHTFNRQY---SQVSSSLSES-------KLSEISAS-------LLRDS 1617

  Fly  1566 LCSPDRADAPN----------------GWEAPAPATQPAL----PLR------LYVPELEEIRVS 1604
            :.||..:..|:                |.||.:.|:.|.|    |:.      .::|.::|||||
Zfish  1618 VTSPLSSLTPSSTCPSLLDGHYSTDLRGAEANSGASSPDLDPFSPIERKPRTCTFIPNIQEIRVS 1682

  Fly  1605 PVVARKGLLNVLEHGGSGWKKRWVIVRRPYVFIYRSEKDPVERAVLNLATAHVECSEDQAAMVKI 1669
            |:|::||.|:.||...|||.||:::||||||::||||:|.||||::||::|.||.|||...:::.
Zfish  1683 PIVSKKGYLHFLEPHTSGWVKRYIVVRRPYVYLYRSERDYVERAIINLSSAQVEYSEDHHTLMRA 1747

  Fly  1670 PNTFSVVTKHRGYLLQTLGDKEVHDWLYAINPLLAGQIKSRLARR 1714
            ||||:|.|:||..|||...|||:||||||.||||||.|:|:|:||
Zfish  1748 PNTFTVCTEHRNILLQATNDKEMHDWLYAFNPLLAGTIRSKLSRR 1792

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
unc-104NP_611155.3 KISc_KIF1A_KIF1B 2..358 CDD:276816 280/360 (78%)
Kinesin_assoc 355..498 CDD:465047 90/179 (50%)
FHA_KIF1 474..574 CDD:438757 59/104 (57%)
YhaN <575..>666 CDD:443752 44/90 (49%)
KIF1B 878..924 CDD:463574 17/49 (35%)
DUF3694 1199..1347 CDD:463599 86/155 (55%)
PH_KIFIA_KIFIB 1602..1704 CDD:269939 61/101 (60%)
kif1abXP_009296795.1 KISc_KIF1A_KIF1B 4..361 CDD:276816 280/360 (78%)
Kinesin_assoc 358..538 CDD:465047 90/179 (50%)
FHA 514..628 CDD:469597 64/113 (57%)
ERM_helical 647..>702 CDD:466641 30/54 (56%)
KIF1B 828..875 CDD:463574 10/46 (22%)
DUF3694 1273..1428 CDD:463599 86/155 (55%)
PH_KIFIA_KIFIB 1680..1782 CDD:269939 61/101 (60%)

Return to query results.
Submit another query.