DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment unc-104 and kif1b

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_611155.3 Gene:unc-104 / 36876 FlyBaseID:FBgn0267002 Length:1739 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_068072796.1 Gene:kif1b / 369190 ZFINID:ZDB-GENE-030820-1 Length:1927 Species:Danio rerio


Alignment Length:1983 Identity:1013/1983 - (51%)
Similarity:1265/1983 - (63%) Gaps:336/1983 - (16%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     2 SSVKVAVRVRPFNSREIARESKCIIEMAGATTAITNPKVPPNTSDSVKRFNFDYSYWSH-DHHDA 65
            :|||||||||||||||..:||||||:|.|.:|.|.|||.|...    |.|:|||||||| ...|.
Zfish     4 ASVKVAVRVRPFNSRETGKESKCIIQMQGNSTTILNPKNPKEP----KTFSFDYSYWSHTSPDDP 64

  Fly    66 DFSTQSMVYKDIGEEMLQHSFDGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGRQEEQQEGIIPMICKDLFTRI 130
            .|::|:.||.|||:|||||:|:||||||||||||||||||||||:|||.||||||.:|::||.:|
Zfish    65 SFASQNQVYNDIGKEMLQHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEEGQEGIIPQLCEELFEKI 129

  Fly   131 QDTETDDLKYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVEDLSKLAVTDYQDIHDL 195
            .|...:::.|||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||
Zfish   130 NDNNNEEISYSVEVAYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVEDLSKLAVTSYTDIADL 194

  Fly   196 IDEGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIFFTQRRHDLMTNLTTEKVSKISLVDLAGSERADSTGA 260
            :|.|||||||||||||||||||||||||.||||::|..|:|:|||||||||||||||||||||||
Zfish   195 MDAGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQRKYDSETDLSTEKVSKISLVDLAGSERADSTGA 259

  Fly   261 KGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEV---ASKKKNTKKADFIPYRDSALTWLLRENLGGNSKT 322
            ||||||||||||||||||||||||||||   .||.|..||.||||||||.|||||||||||||:|
Zfish   260 KGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEVDNCTSKSKKKKKTDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRT 324

  Fly   323 AMIAAISPADINYDETLSTLRYADRAKQIVCKAVVNEDANAKLIRELKEEIQKLRDLLKAEG--- 384
            ||:||:||||||:||||||||||||||||.|.||:|||.||||:||||:|:.:|::||:|:|   
Zfish   325 AMVAALSPADINFDETLSTLRYADRAKQIKCNAVINEDPNAKLVRELKDEVSRLKELLRAQGLGD 389

  Fly   385 ---IEVQEED----------------------------------------------ELTKSTVIK 400
               ||...:|                                              .|.....::
Zfish   390 ILDIEPMGDDCLGSGSKYLKDIHNNKHRYLLASENQRPGHFSTAPMGCLTASPSSGSLCSQAGLQ 454

  Fly   401 SPTKSRNRNGSTT--EMAVDQLQASEKLIAELNETWEEKLKRTEEIRVQREAVFAEMGVAVKEDG 463
            |.:..:.|..||.  |.|:::|:.|||:||||||||||||::||.||::|||:.||||||::|||
Zfish   455 SVSSIQERIMSTPGGEEAIERLKESEKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALLAEMGVAIREDG 519

  Fly   464 ITV------------------------------------------GVFSPKKTPHLVNLNEDPNL 486
            .|:                                          ||||||||||||||||||.:
Zfish   520 GTLGVFSPKKFGPDRPTSLSIEDFSVYSSNQLFVERPCEVYTDFNGVFSPKKTPHLVNLNEDPLM 584

  Fly   487 SECLLYYIKEGLTRLGTHEANVPQDIQLSGSHILKEHCTFENKNST-----VTLLPHKDAIIYVN 546
            |||||||||:|:||:|..:|...|||.|||:||.:|||.|.::.:.     |||.|.:.:..|||
Zfish   585 SECLLYYIKDGITRVGQADAERRQDIVLSGAHIKEEHCIFRSERNANGHVIVTLEPCEGSETYVN 649

  Fly   547 GRKLVEPEVLKTGSRVILGKNHVFRFTNPEQARELRDKIETENEAENEVEKTDTQQVDWNFAQCE 611
            |:::.....|::|:|:|:||||||||.:|||||..|:|..:   ||..||     .|||.|||.|
Zfish   650 GKRVNSAVQLRSGNRIIMGKNHVFRFNHPEQARAEREKTPS---AETPVE-----PVDWTFAQRE 706

  Fly   612 LLEKQGIDLKAEMKKRLDNLEEQYKREKLQADQQFEEQRKTYEARIDALQKQVEEQSMTMSMYSS 676
            ||||||||:|.||:|||..:|..||:||.:|||..|:||..||:::..||||||.:|:     ::
Zfish   707 LLEKQGIDMKQEMEKRLTEMEILYKKEKEEADQLLEQQRLVYESKLQELQKQVETRSL-----AA 766

  Fly   677 YSPEDFHQEEDVYTNPMYESCWTAREAGLAAWAFRKWRYHQFTSLRDDLWGNAIFLKEANAISVE 741
            .:|::..:||:....|     ||..:..||.||||||||||||||||.|||||::||||||||||
Zfish   767 ETPDEEEEEEEEDEVP-----WTQHKYELAQWAFRKWRYHQFTSLRDQLWGNAVYLKEANAISVE 826

  Fly   742 LKKKVQFQFTLLTDTLYSPLPPELASTVAPVHQEDEFGAPPVSKTLVAVEVTDTKNGATHHWSLE 806
            |||||||||.||||||||||||||    .|...|.|..|.|..:|:|||||.|.||||||:||||
Zfish   827 LKKKVQFQFVLLTDTLYSPLPPEL----LPPEPEKERDARPFPRTVVAVEVQDLKNGATHYWSLE 887

  Fly   807 KLRYRLELMRQIYNVESPPSSMLFDTSGMEALSG---------WI----SPPSQHPGQQAQLLPL 858
            ||:.||:.||::|:.....:|......|..||:|         |.    |.|..|.....:|...
Zfish   888 KLKQRLDQMREMYDRAGEMASSNQGDDGEGALTGSDPFYDRFHWFKLVGSSPIFHGCVNERLADR 952

  Fly   859 EPPVESERGRLTLANLIPSRQRLELMREMYHNEAEMSPTSPDYNVES-----LTGGDPFYDRFPW 918
            .|..........:..|...||  ..|.:...:||.:..||.|...|.     ..|.||||||.||
Zfish   953 TPSPTFSTTDSEITELADERQ--SEMEDFMDDEAFVDDTSSDAGTEEGSDIFSDGQDPFYDRSPW 1015

  Fly   919 FRMVGRSFIYLSNLLYPVPLVHKVAIVNERGDVRGYLRIAVQPV-LDEESIDFNNGVKQS--ARL 980
            |.:|||:|:|||||||||||||:||:|.|:|||||:||:.||.: .|||:.|:.:||:||  |::
Zfish  1016 FILVGRAFVYLSNLLYPVPLVHRVAVVTEKGDVRGFLRVGVQAIAADEEAPDYGSGVRQSGTAKI 1080

  Fly   981 VFNEDDAKPKYRALNEKDDVQRYIDNGGLDSKLEELEDVDSGRGIDSNSASECHENSEEP----- 1040
            .|:.:..|       :.|.....:...||  .||||..|: |:|    .:||....|||.     
Zfish  1081 SFDNEYFK-------KNDFTSVAMTRSGL--SLEELRIVE-GQG----QSSEVITPSEEMNRINE 1131

  Fly  1041 ----------------GEHLQVGKEFTFRVTVLQATGIGAEYADIFCQFNFLHRHEEAFSTEPVK 1089
                            .|||:||..||||||||||:||.||||||||||||||||:|||||||:|
Zfish  1132 MDLKLGNVDTKLGDGLAEHLEVGSIFTFRVTVLQASGIPAEYADIFCQFNFLHRHDEAFSTEPLK 1196

  Fly  1090 NSASGAPLGFYHVQNITVPVTKSFIEYLKTQPIMFKIFGHYQTHPLHKDAKQDFVS-RPPPRRML 1153
            |:..||||||||||||:|.||:|||||:||:||:|::|||||.||||... ||.|| ..|.|:..
Zfish  1197 NTGRGAPLGFYHVQNISVEVTESFIEYIKTKPIVFEVFGHYQQHPLHIHG-QDVVSPSQPSRKYY 1260

  Fly  1154 PPSIPISQPVRSPK----------------------------------------------FGPLP 1172
            ||.:|:|:|..:.|                                              |.|:|
Zfish  1261 PPPMPLSKPDHARKIELIRYLMSGYVHGQVLDTLSEHANALASTAVASLEEGAYELCHFPFLPIP 1325

  Fly  1173 CAPTSTV---------------------LAKHDVLVWFEICELAPNGEYVPSVVEHSDDLPCRGL 1216
            ..|...|                     ::|:|:|.||||.||.|.|||:|:||:|:..|||.|.
Zfish  1326 NCPVFRVPRHDVPATKLNTITKSNLGQCVSKYDLLAWFEISELEPTGEYIPAVVDHTGGLPCHGT 1390

  Fly  1217 FLLHQGIQRRIRITIVHEPTTEVKWKDINELVVGRIRNTPESSDEQDEDACVLSLGLFPGEALE- 1280
            :||||||||||.:|::||..:|:.|||:.|||||||||.|| .|:...|| ||||.:...:.|: 
Zfish  1391 YLLHQGIQRRITVTLIHEKGSELHWKDVRELVVGRIRNKPE-VDDSAADA-VLSLNIISAKNLKS 1453

  Fly  1281 --------VPGD-DRSFYRFEAAWDSSLHNSALLNRVSQGGETIYITLSAYLELENCARPAIITK 1336
                    :..| .|:||||||.||||||||.|||||:..||.||:||||||||::|.:||||||
Zfish  1454 SHNSSSLCIDSDISRTFYRFEAVWDSSLHNSLLLNRVTPYGEKIYMTLSAYLELDHCIQPAIITK 1518

  Fly  1337 DLSMVIYGRDAR-TGPRSLKHLF-SGQYRNPEANRLTGVYELALRRASEAGSPGVQRRQRRVLDT 1399
            |:.||.|.|||: :.||||::|| ||..:.|:.|::||||||:|.:.::.||||:|||:|:||||
Zfish  1519 DICMVFYSRDAKISPPRSLRNLFGSGYSKTPDCNKVTGVYELSLCKIADTGSPGMQRRRRKVLDT 1583

  Fly  1400 SSTYVRGEENLHGWRPRGDSLIFDHQWELEKLTRLEEVGRMRHLLLLRERLGMDTNPNPTTKTEK 1464
            |..||||||||.||||||||||.:|||||:|:.:|.||.:.||||||||:||  ..|.|.:.:|.
Zfish  1584 SVAYVRGEENLAGWRPRGDSLILEHQWELDKMEQLHEVEKTRHLLLLREKLG--ETPPPKSLSES 1646

  Fly  1465 DVCNLA------ARAATSPVHMVIPQSPQTPVK-------DPQQIIPEREYNQREQDLMLKCLKL 1516
            ...:|:      :.:.:|.:.....:|..||.:       |.:.::      .||::|..|||:|
Zfish  1647 LSPSLSSGTLSTSTSISSQISSTTFESAITPSESSGYDSTDIESLV------DREKELATKCLRL 1705

  Fly  1517 VQGRYTKSEANDTQTQ------SDVSPSDEGCADMTVSCISSNSMENNKFVIRRRLCSPDRADAP 1575
            :...: .||.|.....      ||:||...   |.:||..||.::..:.      .| |..:|:.
Zfish  1706 LTHTF-NSEYNQMCNSISDCKFSDISPMGR---DPSVSSFSSATLTPSS------TC-PSLSDSR 1759

  Fly  1576 NGWEAPAPATQPA---------LP---------------LRLYVPELEEIRVSPVVARKGLLNVL 1616
            .. ||.:.||.|:         :|               |.| ||.:||:|...||::||:||.:
Zfish  1760 TP-EANSRATSPSGSDYENFPMVPILETSYLARAGKHEFLNL-VPNIEEMRPGSVVSKKGILNFM 1822

  Fly  1617 EHGGSGWKKRWVIVRRPYVFIYRSEKDPVERAVLNLATAHVECSEDQAAMVKIPNTFSVVTKHRG 1681
            |...:.|.|.:|:|||||||||.::||||||.||||:||.||.||||.||:|.|:||::.|||||
Zfish  1823 EPRSNTWVKHFVVVRRPYVFIYNNDKDPVERGVLNLSTAQVEYSEDQQAMLKTPHTFAMCTKHRG 1887

  Fly  1682 YLLQTLGDKEVHDWLYAINPLLAGQIKSRLARR 1714
            .|||...||:::|||||.||||||.|:|:||||
Zfish  1888 ILLQANNDKDMNDWLYAFNPLLAGTIRSKLARR 1920

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
unc-104NP_611155.3 KISc_KIF1A_KIF1B 2..358 CDD:276816 281/359 (78%)
Kinesin_assoc 355..498 CDD:465047 89/238 (37%)
FHA_KIF1 474..574 CDD:438757 57/104 (55%)
YhaN <575..>666 CDD:443752 50/90 (56%)
KIF1B 878..924 CDD:463574 20/50 (40%)
DUF3694 1199..1347 CDD:463599 91/157 (58%)
PH_KIFIA_KIFIB 1602..1704 CDD:269939 62/101 (61%)
kif1bXP_068072796.1 KISc_KIF1A_KIF1B 4..360 CDD:276816 281/359 (78%)
Kinesin_assoc 357..596 CDD:465047 89/238 (37%)
FHA_KIF1B 571..680 CDD:438779 59/108 (55%)
GBP_C <680..754 CDD:293879 43/81 (53%)
KIF1B 889..937 CDD:463574 12/47 (26%)
KIF1B <999..1021 CDD:463574 11/21 (52%)
DUF3694 1373..1529 CDD:463599 91/157 (58%)
PH_KIFIA_KIFIB 1808..1910 CDD:269939 62/101 (61%)

Return to query results.
Submit another query.