DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment unc-104 and unc-104

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_611155.3 Gene:unc-104 / 36876 FlyBaseID:FBgn0267002 Length:1739 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001022041.2 Gene:unc-104 / 174144 WormBaseID:WBGene00006831 Length:1628 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:1781 Identity:902/1781 - (50%)
Similarity:1180/1781 - (66%) Gaps:196/1781 - (11%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MSSVKVAVRVRPFNSREIARESKCIIEMAGATTAITNPKV-PPNTSDSVKRFNFDYSYWSHDHHD 64
            ||||||||||||||.|||:..|||::::.|.||.|....: ..|.|     ||||:||||...:|
 Worm     1 MSSVKVAVRVRPFNQREISNTSKCVLQVNGNTTTINGHSINKENFS-----FNFDHSYWSFARND 60

  Fly    65 ADFSTQSMVYKDIGEEMLQHSFDGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGRQEEQQE-GIIPMICKDLFT 128
            ..|.||..||:::|.|||:|:|:|||||||||||||:||||||||:..:..| ||||.:|.|||.
 Worm    61 PHFITQKQVYEELGVEMLEHAFEGYNVCIFAYGQTGSGKSYTMMGKANDPDEMGIIPRLCNDLFA 125

  Fly   129 RIQDTETDDLKYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVEDLSKLAVTDYQDIH 193
            ||.:....|::|||||||||||||||:|||||.:.|||||||||||||||:||:|:||..|.||.
 Worm   126 RIDNNNDKDVQYSVEVSYMEIYCERVKDLLNPNSGGNLRVREHPLLGPYVDDLTKMAVCSYHDIC 190

  Fly   194 DLIDEGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIFFTQRRHDLMTNLTTEKVSKISLVDLAGSERADST 258
            :|:|||||||||||||||.|||||||||||..||:||...:||.|||.||||||||||||||:||
 Worm   191 NLMDEGNKARTVAATNMNSTSSRSHAVFTIVLTQKRHCADSNLDTEKHSKISLVDLAGSERANST 255

  Fly   259 GAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEVASKKKNTKKADFIPYRDSALTWLLRENLGGNSKTA 323
            ||:|.||||||||||||||||.|||.|||.::|||.:.|. .||||||.||||||||||||||||
 Worm   256 GAEGQRLKEGANINKSLTTLGLVISKLAEESTKKKKSNKG-VIPYRDSVLTWLLRENLGGNSKTA 319

  Fly   324 MIAAISPADINYDETLSTLRYADRAKQIVCKAVVNEDANAKLIRELKEEIQKLRDLLKAEGIEVQ 388
            |:||:||||||:||||||||||||||||||:||||||.||||||||.||:.|||.:||.:||:|.
 Worm   320 MLAALSPADINFDETLSTLRYADRAKQIVCQAVVNEDPNAKLIRELNEEVIKLRHILKDKGIDVT 384

  Fly   389 EEDELTKSTVIKSPTKSRNRNG----STTEMAVDQLQASEKLIAELNETWEEKLKRTEEIRVQRE 449
            :..|          |..:::.|    :.....:::||.||||:||:.:|||:||..|||||.|||
 Worm   385 DVQE----------TPGKHKKGPKLPAHVHEQLEKLQESEKLMAEIGKTWEQKLIHTEEIRKQRE 439

  Fly   450 AVFAEMGVAVKEDGITVGVFSPKKTPHLVNLNEDPNLSECLLYYIKEGLTRLGTHEANVPQDIQL 514
            ....:||:|..|||.|:|||||||.||||||||||.:||||:||:|||:|.:|..||....||.|
 Worm   440 EELRDMGLACAEDGTTLGVFSPKKLPHLVNLNEDPLMSECLIYYLKEGVTSVGRPEAEHRPDILL 504

  Fly   515 SGSHILKEHCTFENKNSTVTLLPHKDAIIYVNGRKLVEPEVLKTGSRVILGKNHVFRFTNPEQAR 579
            ||..||:.||.|.|::..|||....:|..|:||:::..|.||.||||||||::||||:.:|::||
 Worm   505 SGEAILELHCEFINEDGNVTLTMKPNASCYINGKQVTTPTVLHTGSRVILGEHHVFRYNDPQEAR 569

  Fly   580 ELRDKIETENEAENEVEKTDTQQVDWNFAQCELLEKQGIDLKAEMKKRLDNLEEQYKREKLQADQ 644
            :.|..:....|          |.:||.:||.|||:||||||||:|:|::..:|.||:|||::.:|
 Worm   570 QSRHNLAAIAE----------QPIDWKYAQQELLDKQGIDLKADMEKKMLEMESQYRREKVELEQ 624

  Fly   645 QFEEQRKTYEARIDALQKQVE---------------EQSMTMSMYSSYSPEDFHQEEDVYTNPMY 694
            :...|.:.||:.|:.|||||:               |:.:|.|:..  .||:..           
 Worm   625 KMYHQTREYESMIENLQKQVDLAQSYISGGGSIWEGERMLTSSLLE--FPEELK----------- 676

  Fly   695 ESCWTAREAGLAAWAFRKWRYHQFTSLRDDLWGNAIFLKEANAISVELKKKVQFQFTLLTDTLYS 759
               ||:.:..:...|..|||||||||:||||||||||:||||||||||||||||||.|||||:||
 Worm   677 ---WTSDQKRVVLKAAIKWRYHQFTSVRDDLWGNAIFVKEANAISVELKKKVQFQFALLTDTMYS 738

  Fly   760 PLPPELASTVAPVHQEDEFGAPPVSKTLVAVEVTDTKNGATHHWSLEKLRYRLELMRQIYNVESP 824
            ||||:|      :...::....|..||:||::|.|.||||||:||:|||:.|||.||..||.|..
 Worm   739 PLPPDL------LPPGEDLTLRPYPKTVVAIQVQDLKNGATHYWSIEKLKQRLEDMRIFYNSELS 797

  Fly   825 PSSMLFDTSGMEALSGWISPPSQHPGQQAQLLPLEPPVESERGRLTLANLIPSRQRLELMREMYH 889
            .:....|........||::..:::.                      |.|||.|||||.||:||.
 Worm   798 VAGTPVDVPYPPVAEGWLAALNRNS----------------------ARLIPDRQRLEAMRDMYE 840

  Fly   890 NEAEMSPTSPDYNVESLTGGDPFYDRFPWFRMVGRSFIYLSNLLYPVPLVHKVAIVNERGDVRGY 954
            .:|||||...|..:::|.|.|||||||||||||||:|:||:|||:.|||:||||:|||:|:|:||
 Worm   841 TDAEMSPADGDPMMDALMGTDPFYDRFPWFRMVGRAFVYLNNLLHNVPLIHKVAVVNEKGEVKGY 905

  Fly   955 LRIAVQPVLDEESIDFNNGVKQSARLVFNEDDAKPKYRALNEKDDVQRYIDNGGLDSKLEELEDV 1019
            |::|::||..:|.|:...||:|:|:|.|.::|.                            |:..
 Worm   906 LKVAIEPVQKDEVINQKKGVRQTAKLHFRKEDF----------------------------LKSH 942

  Fly  1020 DSGRGIDSNSASECHENSEEPGEHLQVGKEFTFRVTVLQATGIGAEYADIFCQFNFLHRHEEAFS 1084
            .:|...||::.:.        .||:|...||.|||.||||..:...|:|:||||||||||:||||
 Worm   943 KNGETSDSDALAF--------PEHMQEEVEFCFRVVVLQAIDVADTYSDVFCQFNFLHRHDEAFS 999

  Fly  1085 TEPVKNSASGAPLGFYHVQNITVPVTKSFIEYLKTQPIMFKIFGHYQ--THPLHKDAKQDFVSRP 1147
            |||:|||.|  ||.|.|.||:.:.::|:|:.||...||:|::|||:|  :...:.:.:...:.|.
 Worm  1000 TEPMKNSKS--PLTFEHTQNLHIKMSKTFLHYLHHFPIIFEVFGHFQPKSEQFNFERQNSALGRR 1062

  Fly  1148 PPRRML--PPSIPISQPVRSPKFGPLPCAP----TSTVLAKHDVLVWFEICELAPNGEYVPSVVE 1206
            ...::.  .||:.||.||:|.|..    ||    .::|.:|||:||||||||||.||||||::|:
 Worm  1063 LSTKLTFQQPSLVISTPVKSKKAN----APIQNNNASVKSKHDLLVWFEICELANNGEYVPTIVD 1123

  Fly  1207 HSDDLPCRGLFLLHQGIQRRIRITIVHEPTTEVKWKDINELVVGRIRNTPESSDEQDEDACVLSL 1271
            |:..||..|:|||||||||||:|||.|| ..|:||||..||||||||..||.:...|.|  ||||
 Worm  1124 HAQGLPTHGIFLLHQGIQRRIKITICHE-KGELKWKDCQELVVGRIRAGPEWAGGDDVD--VLSL 1185

  Fly  1272 GLFPGEALEVPGDDRSFYRFEAAWDSSLHNSALLNRVSQGGETIYITLSAYLELENCARPAIITK 1336
            |||||..:|...|||:|::||||||||||||.||||||..|:.||:|||||:||:.||:||::||
 Worm  1186 GLFPGTFMEFSMDDRTFFQFEAAWDSSLHNSPLLNRVSNYGDQIYMTLSAYMELDGCAQPAVVTK 1250

  Fly  1337 DLSMVIYGRDAR--TGPRSLKHLFSGQYRNPEANRLTGVYELALRRASEAGSPGVQRRQRRVLDT 1399
            ||.::||.||::  ...|..:.|..|..::||.||:.|||:|.|:..|::|:   .|||||||||
 Worm  1251 DLCLLIYARDSKISAASRFCRSLVGGISKSPEMNRVPGVYQLCLKDGSDSGA---IRRQRRVLDT 1312

  Fly  1400 SSTYVRGEENLHGWRPRGDSLIFDHQWELEKLTRLEEVGRMRHLLLLRERLGMDTNPNPTTKTEK 1464
            ||.||||||||..||||||||||:|||||||||||::|.|:|..|.||:||....|     |.| 
 Worm  1313 SSAYVRGEENLGQWRPRGDSLIFEHQWELEKLTRLQQVERVRLFLRLRDRLKGKKN-----KGE- 1371

  Fly  1465 DVCNLAARAATSPVHMVIPQSPQTPVKDPQQIIPER-EYNQREQDLMLKCLKLVQGRYTKSEAND 1528
                  ||...||.             ||...|||. :.:::::.::.|.|.|::.:...::...
 Worm  1372 ------ARTPVSPC-------------DPVCAIPESIKLDEKDKGIVGKVLGLIRRKIPMNKDPP 1417

  Fly  1529 TQTQSDVSPSDEGCADMTVSCISSNSM----ENNKFVIRRR-------LCSPDRADAPNGWEAPA 1582
            |..::. ..|||..::...|.:|..|:    .::..:.|::       ..:.|..|...|.:...
 Worm  1418 TGNKAQ-ELSDESGSNSITSPVSDKSLIKSSRSSDLLCRQKSKSDQNLASNDDIVDNLGGMKRSL 1481

  Fly  1583 PATQPALPLRLYVPELEEIRVSPVVARKGLLNVLEHGGSGWKKRWVIVRRPYVFIYRSEKDPVER 1647
            ..:: .|.|.:.|||:.|.||..||::||.:|.||....||.:|||||||||:.::|.::|.|.|
 Worm  1482 SGSR-ILQLNILVPEVLEERVGVVVSKKGYMNFLEEKTQGWTRRWVIVRRPYILLFRDDRDLVIR 1545

  Fly  1648 AVLNLATAHVECSEDQAAMVKIPNTFSVVTKHRGYLLQTLGDKEVHDWLYAINPLLAGQIKSRLA 1712
            .::|||.|.:|.||||.||||:||||||.|..||:|:|.:...|::|||||||||:|||:|..  
 Worm  1546 GIINLANARIEHSEDQQAMVKVPNTFSVCTNQRGFLMQMMPGDEMYDWLYAINPLMAGQMKLH-- 1608

  Fly  1713 RRTLEPASQTASQIQATNAANANSAS 1738
                  .:|..:.:::..::::.:||
 Worm  1609 ------GNQNGTTLKSPTSSSSIAAS 1628

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
unc-104NP_611155.3 KISc_KIF1A_KIF1B 2..358 CDD:276816 253/357 (71%)
Kinesin_assoc 355..498 CDD:465047 80/146 (55%)
FHA_KIF1 474..574 CDD:438757 56/99 (57%)
YhaN <575..>666 CDD:443752 39/105 (37%)
KIF1B 878..924 CDD:463574 30/45 (67%)
DUF3694 1199..1347 CDD:463599 95/147 (65%)
PH_KIFIA_KIFIB 1602..1704 CDD:269939 58/101 (57%)
unc-104NP_001022041.2 KISc_KIF1A_KIF1B 2..354 CDD:276816 250/353 (71%)
Kinesin_assoc 351..488 CDD:465047 75/140 (54%)
FHA_KIF1 464..564 CDD:438757 57/99 (58%)
Rcc_KIF21 595..652 CDD:425381 26/56 (46%)
KIF1B 829..875 CDD:463574 4/45 (9%)
DUF3694 1116..1260 CDD:463599 76/151 (50%)
PH_KIFIA_KIFIB 1500..1602 CDD:269939 20/113 (18%)

Return to query results.
Submit another query.