Protein Alignment CG8060 and Als2

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_611117.2
• Gene: CG8060 / 36824
• FlyBaseID: FBgn0034113
• Length: 1189
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_649347.1
• Gene: Als2 / 40410
• FlyBaseID: FBgn0037116
• Length: 1486
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1291
• Identity: 260/1291 - (20%)
• Similarity: 435/1291 - (33%)
• Gaps: 377/1291 - (29%)

  Fly    62 HMSASTARYEILEWLLNHGAYINGQDYESGSSPLHRALYYGSIDCAVLLLRYGAS---------- 116
            ||.....|.::::           .|:.|||..|...|..||:.....    |:.
  Fly    74 HMDLQLLRTDVVD-----------MDFCSGSQELFVVLTNGSVQRQAT----GSGRDVGHPHAWQ 123

  Fly   117 ------LELLDEDTRCPLQAICRKCDDDDLATDSQNDVLVWGSNKNYNLGIGNE--QNTNTPQAV 173
                  |||..|..|  ::.:|  |       .:|..|.|..|.:.|.:|...|  :....|:.:
  Fly   124 TLGFDPLELHAEGVR--IRRVC--C-------SAQGVVFVGASGETYVMGSCGEVFKAEQQPRHM 177

  Fly   174 DFFRKSNLWLEQVA-------LGAYHSLFCDKKGHLYAVGHGKGGRLGIGLENSLPAPKRVKVSS 231
            ..:.:....|:..|       |.|.::|..|..            :|.:......|..:|..|.|
  Fly   178 RLYEEGKELLDLAAGNEHFVMLVAPYNLADDAL------------QLSVASAKEEPEDERASVKS 230

  Fly   232 KLSGDSIQCISVSRQHSL----VLTHQSLVFACGLNTDHQLGVRDAAEQLTQFKEVVALRDKGAS 292
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  Fly   231 ISSGHSERSVAANTRHLLHQGYALLHTQL-FTFGASNNGLLGSGDHIRR----ANVMRLQKLDSM 290

  Fly   293 DLVRVIACDQHSIA--YGSRCVYVWGA-NQGQFGINSNTPSITVPTLIKLPAKTTIRFVEANNAA 354
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  Fly   291 GVCSIAAGLEHTVARTLDGR-LYHWGLNNHSQLG-----EDVSSPMEITITENTAALPIEQNSAL 349

  Fly   355 TVIYNEEKIITLCYADKTRYIK-TPNYEDLKSISVMGGNLKNSTKGSA--AALKLLMLTETNVVY 416
            .....:...:.|..:.:...:: .|....|:..|.....|.....|:|  ..|:|||.:....:
  Fly   350 EATCGDYHTLLLNASGQIHSLQPAPPMRHLQQSSTYAQTLLQLQLGAAWPRQLRLLMCSGGYTL- 413

  Fly   417 LWYENTQQFYR-CNFSPIRLHQIKKILYKCNQVMVLSEDGCVYRGKCNQIAL-PSSALQEKSRGS 479
               :|.:||.| .::....|....::|.|..|.:...|   :::   .|.|| |.|||..    .
  Fly   414 ---QNQRQFQRQYHYYLSHLQSQLQLLLKHRQAVQTLE---IWQ---RQSALEPLSALGP----L 465

  Fly   480 LDNWQDNDQNKTEI---------SREHVIRIEL-------------QRVPNIDRATYIFCD---- 518
            |.||:       .|         |.|...|.:.             :.:...|..|..:||
  Fly   466 LINWE-------RILCLLVATLHSLEGFYRADFVQPADLLFICHYKEYIDLFDGYTKAYCDVFSV 523

  Fly   519 EGFSSFAVL------------QESH-TKYFRKP-SLPRREHSFKKLLHETSDCDAVHDVVFHVDG 569
            .||....|.            :||: |:.|::| |:.:....|.:||..|......|.|.:
  Fly   524 NGFGEAVVAITGLSSPLAELNEESYVTRLFQQPFSIYQLFVQFMELLVRTQSEYGEHRVAW---- 584

  Fly   570 EKFAAHKFIIYSRAPGLRDLIRCYLDKDIYLNFDHLTGKMFELIL-------------------- 614
            .:||.|..|....|...:|.   :...|.........|:...:||
  Fly   585 SEFARHSCISQELAVNTKDF---WSSNDRNPRIVQFRGRHRRVILTSALVPLKLVTSGISRSSNS 646

  Fly   615 -------------NHIYS----SYWP-TEDDIDCIQQSLGPANPQQ----RTRTCEM---FLPHL 654
                         |.:||    :.|. ||.|      ||....|::    .||:.||   :|..|
  Fly   647 FILFSDFLCQVSGNSLYSYPLTTLWVWTEGD------SLRLTTPEKSFLVSTRSQEMRKVWLDQL 705

  Fly   655 EKFQLVELTKYVQSYVRDHQFPLPNARKL---FNRLYRSDHP----------------------E 694
            :...:..|.|.:.|       |:|:.|..   |:|    :||                      |
  Fly   706 QSSIIASLGKPLGS-------PVPSYRSTGYEFSR----EHPKFSRVKACGTWRKGVLHGNCYLE 759

  Fly   695 LYDVRIVC---KDGKVLGAHKCMLV-----------ARLEYFEMMFMHLWAERSSVTMEGVPAEY 745
            ..|..:.|   :.|.:.|..|.::.           .|.....:..||......|...||   .:
  Fly   760 YPDGSVYCGELQHGIIEGFGKMVIPTTGLYVGNFKGGRFHGHGVYEMHCKDSPESEVYEG---NF 821

  Fly   746 MEPVLD---------YLYSLDNEAFCKQGY--LETFLYNMITICDQY---FIESLQNVCESLILD 796
            .|.:..         |:|..:.:|..:.||  :|..:..     |:|   |.::.::...|.|.:
  Fly   822 CEGLFHGHGVMRNNRYIYVGEYQANARSGYGVIEDLVSG-----DKYMGMFADNKRSGIGSCITN 881

  Fly   797 KISIRKCGEMLEFA-----------AMYNCKILQKGCMDFICQNLSRVLCYRSIEQCDG------ 844
            :      |:..|.:           |::......:|.:..:..|........|.:.|.|
  Fly   882 R------GDYFEGSFSGDDLTGSGVAVFENDYYYEGELTLLGPNGRGEYYMPSGDACGGSGAMGT 940

  Fly   845 ----ETLKCLNDHYRKMFKRVFDYRQITPFSEAIEDELLLSFVDGCDVDLNYRMD--AESKLKQA 903
                :|.:.:.:   |||      .|::...:.:.       :...::.||.|..  ..|..:|.
  Fly   941 GEFDDTCELIGN---KMF------GQLSGTWDTVR-------IQAGELVLNRRFPKYPSSLGRQV 989

  Fly   904 AKHKQKDLRKQDARHQYEQQAISSMMRSLSISESTQ--GTEVPSSPQDSARSEDKNWSRVVDKKD 966
            ..|.:|   .:...:.:|.. :::...|.|.|...|  ||...||....:.::..|...|...|.
  Fly   990 VDHNRK---WRSLFNNFESD-LANCTASTSSSGGNQSAGTLRKSSKPTLSTAQIWNCIAVYMSKQ 1050

  Fly   967 QKRKLAETALKVNNTLKHEDPPTQELVPIERKPLKEQTPPPPSHETEPTTPLSK-----SYNLDF 1026
            :.|:..:.....||.|.             ..||.::|..|.:.....|:.|||     :..|||
  Fly  1051 RAREGTKPGNYFNNILL-------------SLPLPQKTSSPLAKARTTTSALSKLQTEAASALDF 1102

  Fly  1027 SSLTP---QSQK-LSQKQ--RKRLSS-----ESKSWRTNNPPL----VEQS---STPVAVPNAWG 1073
            ....|   |||: |:.|.  .:|..|     .:.|...:|..|    ::||   ||
  Fly  1103 LGFPPRRIQSQEALNSKPGGLQRADSLISMGHNTSRDLDNSSLASFQLDQSLMNST--------- 1158

  Fly  1074 VTTTPSGSFNDSFTSPTTGSSTDPTSFANMMRGHATSSTTPT----DQSQSFSRIL 1125
            |....|.:||:||:..:..::...:...|.:....||:|:.|    ||..||...|
  Fly  1159 VNGDESSTFNESFSKLSHNNNNSISKHMNNIDCSITSTTSTTSAVLDQVPSFGMAL 1214

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG8060	NP_611117.2	ANKYR	<51..141	CDD:440430	19/94 (20%)
		ANK repeat	56..87	CDD:293786	3/24 (13%)
		ANK repeat	89..121	CDD:293786	11/47 (23%)
		ATS1	140..>355	CDD:444065	50/230 (22%)
		BTB_POZ	543..643	CDD:453885	26/141 (18%)
		BTB2_POZ_IBtk	691..802	CDD:349611	26/160 (16%)
		BACK_IBtk	798..857	CDD:350575	9/79 (11%)
Als2	NP_649347.1	ATS1	<238..>367	CDD:444065	29/139 (21%)
		PH-like	616..715	CDD:473070	20/104 (19%)
		COG4642	<745..890	CDD:443680	26/158 (16%)
		PLN03185	835..>962	CDD:215619	24/146 (16%)
		VPS9	1373..1479	CDD:460489