Protein Alignment CG9068 and dnah2

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_611111.1
• Gene: CG9068 / 36817
• FlyBaseID: FBgn0034106
• Length: 1227
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_009301399.2
• Gene: dnah2 / 556023
• ZFINID: ZDB-GENE-130530-910
• Length: 4506
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1260
• Identity: 319/1260 - (25%)
• Similarity: 614/1260 - (48%)
• Gaps: 58/1260 - (4%)

  Fly     3 SSSAVEDEHLTDSDLTDDEERSVEPRQEEIRPETPKPSYSDEE--------LNQLVGYIQRMS-- 57
            |||::..:..:....:..:..|..|..:::.|:.|:.:...|:        ::::..|.:|:.
Zfish    12 SSSSMSKQSDSRKGHSKSKRISSTPAPDDMSPQAPEVAAEREKSVSEVTVAVDEVDSYKKRLREA 76

  Fly    58 -----VLSCLDHRDWQEGTLDIIRGWLLEVHEPLLTIYYDR-DALAACLGMPSMCVSDLSYFRRE 116
                 .||.:....|.|.....:..::.:....||.:|:|. ..|.....||:..|..:|||.|.
Zfish    77 FKQRLALSGISKESWTEENEQALDKFISDSSVRLLVVYHDPFTGLYVDYAMPAQVVEQMSYFIRA 141

  Fly   117 PNEIFSVEGFHDEINFGTLTSDVDGCLMELLDRLYVPFFRNYLEWNATVRNRFCSSMDRFLAFLS 181
            |:.:.:.|.|...:.||::.......|:.:::.::.|.......|..|.:|.:.:.:.|||..|:
Zfish   142 PDSMITEESFRSSVQFGSVRGGAIEGLLRMMNGVHTPQVTLSTTWPETSKNNYSAELHRFLTKLT 206

  Fly   182 GMHHQISGMSVMYVPFVIKELTAGPVD----RYLVGSLEGIALYWTTQIRTLLADDTLTVPHDLV 242
            ....::.|.:|:|:|  ::.|...|.:    :.||..||.:.::||.||:.:|:..:::...|.:
Zfish   207 DSRFKLLGSTVLYIP--LEALQHRPEEAVKNKNLVQRLEMVVIHWTRQIKAVLSAQSVSDIGDTL 269

  Fly   243 TVRDEFEFWEYRYEVLQGINDQLAHSDVQKVLLLLHNAQSVHMPQMDGLIERARKELHKSLSNIK 307
            ...:|..||:.|...|..|:.||....|:.:..:|....|.::|....|.::.::...::.||:.
Zfish   270 GPLEEISFWKSRCADLDSISTQLQKPGVRHIQEILQLYTSTYIPPFCKLAKQIQESSLQAQSNVT 334

  Fly   308 YLHLLIEPCSKIDAATSPADLTKLLPRIIHLIRFIWLNSEYYNTTRLIAALFRNLSNQIIRFCTK 372
            :|.||.|||.:: |...|.::...|..|::|||.||:||.|:||...|.||.|.:||:|||.|.:
Zfish   335 FLSLLKEPCEEL-AQLKPCEIAPKLAHILNLIRVIWVNSSYFNTRDRITALLRKISNEIIRLCCR 398

  Fly   373 QTKVEEILSGKPRFGIRICNVAIECCLTYRGIYDTISRDLAQKHTQMPWELDEGLIFNHIDAFVE 437
            :..:..|..|......:|.|..|:|||.::.:|...|: |..||:...|.||:..||..:|:|::
Zfish   399 EISLNRIFQGYAVSSKQILNDCIQCCLAWKELYLHTSQ-LHHKHSSQGWSLDQISIFALVDSFMQ 462

  Fly   438 RLNDVIDICESMIVFGRLDENGSIPKPVFGGTCGEELEKIAESVEVQFLDTLNKLQQNSQAYILN 502
            |..|:|:|||....|.|.::...:|.|.|.|..|.|:.:....:|..|..:|..||  |...||:
Zfish   463 RCKDLIEICECQQQFARWEDGERVPLPCFAGRLGSEVTQKLLYIEATFDKSLQVLQ--SVQDILD 525

  Fly   503 VHRADWYADVAGFRKNMQKLEETVQRLIFNVFQQVSNVEEMLEALQAMLFYSYRQRGTLRKTYLK 567
            |....|:.|.:.||..::.||..:|.||.:.|:.|:.|||.::.|.  :|.....|..:::|..:
Zfish   526 VRNPSWHEDYSRFRAKLKDLEVMMQNLITSTFEMVNCVEEGVQLLD--VFQHLSGREAIKRTIDR 588

  Fly   568 ETSKLWRMFSKE-------MDATSRKLLEEQSRESWLSKHVSIALGYRINLERLTWLRDRLKNSE 625
            :|..::.:|..|       |..||..:..:..|.:. ..|.:.||..|:  ||   ..:.|:.:.
Zfish   589 KTVDVYNLFHSELVEINLVMCRTSSLIPVQMPRYAG-QIHWTKALHSRV--ER---SMEVLRRAH 647

  Fly   626 WLPAVKESSPALAKFDALRHEFQKEIRLAYDDW---VAKCCGFSGDLCQRLDRYLVVRSKKFKGL 687
            :||.|:.:......:..|.....:::|..:.||   ::|.|..|      ||:.|::|.|...||
Zfish   648 FLPHVRSADEMHVIYVKLCQTLDEKVRRIFTDWSQSLSKECHSS------LDQPLMIRCKGKTGL 706

  Fly   688 LECNIDASVLELCEQAQHFERMGFAIPSTMKKLYERYDTIRSLYNGIIKLALSHNRILAVLSDRE 752
            |:.|.:.::|:|..:..:::|:.|.||..:.::|:|.:.:.:|...::.:...:|||:..|:..|
Zfish   707 LDINFNKNLLKLFNEIHYWDRLQFEIPHFVTEVYQRREELHNLRENVLLVVRDYNRIIKDLNADE 771

  Fly   753 RKLFRPLIQACDRQLAPGVFKITYGSEFN-EEFFEDGTEFIAEFQELVLIFKRANRGVARICEKI 816
            ..||...|:..|:::.||:.|:.:.::.. ..|..|......:.|.:|..:|.||...::.||:|
Zfish   772 LGLFSERIRFLDKKIQPGLSKLHWSTKGTPSAFINDCRVHANKVQLMVDEYKAANLATSKHCEQI 836

  Fly   817 CGTCLLHFAFSGSVDISVFQQQLSSRLSSSGDILRSYYSHVVELLSAFSGQFQSVDDEMSAEWIA 881
            ....|:|...........||:...:...|....|::.:..::::::...|.|.....|:...|.:
Zfish   837 SELLLVHLDGKTVYRDHEFQEDQQTHQHSQMLRLQNAHQDIIKIMARVYGTFHLDGPEVQQHWTS 901

  Fly   882 YVNDMDDMLASSLMTSARGSLNKLYEALHCDADMASAP------IIVVESDVKDGRIVFTPDMDA 940
            |:..:|.||..:...:.:.||.:|.:|::.|..::..|      ::..|:.....::.|:|....
Zfish   902 YMEKIDQMLEEAFRVNIKRSLQELSKAINGDGKISPNPLFRVEVVLTPETARSTAQVDFSPSPQK 966

  Fly   941 IGDMINGIVDSIRSMLDQFPRLGYKLKLPKKQQRQGFASVFREDQECSELMRSIQAEIGIQREEL 1005
            :..::|.|...:...:..|.||. .|...::.||:...|:..:|:|..::..:|.|.:......|
Zfish   967 LAHIVNSISSQLIKTISGFKRLP-DLLTRQQSQRKPIHSIIEQDEEICKIQGAIAAGMVTNASYL 1030

  Fly  1006 AKYESEWNKNRVLWQTTEEEFRQRLMSKSRTAGVFEGGIEHYSALADDVIFEDAITNVYFILINQ 1070
            ..|...|:|:|.:|:..::.|.||....:.|...|:..|..|:.:|::|..|:.:.:|.|:|::.
Zfish  1031 QTYLKTWDKHREIWEIEKDSFIQRYQRLNPTVTSFDADIARYTEVANNVQKEETLLSVQFVLLDC 1095

  Fly  1071 NALKSTMLDWIEKWQALNIKMLLDHGSNLMGAVYRYMRRNERNVMKVPRTIRETVAAKQLFEKLL 1135
            :.||.::|....:||:...::|....|:.:..::.:::.|...:.:.|:|:.:...:.:|.|.|.
Zfish  1096 SPLKFSLLQHCNEWQSKFTQLLSLMASSKLKELHSFLQENAVRLSQPPQTLTDLGESLKLLETLQ 1160

  Fly  1136 KDVPVKQSAFTPMLELFVLLHKYQVKLSEETFEQVMGLETAWLHYLQVLEEADEMLDNEDSEAKL 1200
            .|:...:|...|:.|.:.:|.||:|.:.....|.:..|...|:.:.||:.::|.||.......|.
Zfish  1161 ADLNKIESQIPPIHEQYAILTKYEVAVDPAVLELLEALNAEWVWFQQVVIDSDIMLKKHKDTMKS 1225

  Fly  1201 LLAKHGEKFKLILKDFLEDFYSKLP 1225
            .|....|:|:...:.||:.|.|..|
Zfish  1226 GLILSSEEFQKKTQTFLQSFSSNGP 1250

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG9068	NP_611111.1	DHC_N1	212..784	CDD:462457	169/582 (29%)
dnah2	XP_009301399.2	None