Protein Alignment CG9068 and Dhc98D

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_611111.1
• Gene: CG9068 / 36817
• FlyBaseID: FBgn0034106
• Length: 1227
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_524541.3
• Gene: Dhc98D / 43379
• FlyBaseID: FBgn0013813
• Length: 5080
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1333
• Identity: 238/1333 - (17%)
• Similarity: 452/1333 - (33%)
• Gaps: 396/1333 - (29%)

  Fly   191 SVMYVPFVIKELTAGPVDRYLVGSLEGIALYWTTQIRTLLADDTLT-VPHDLVTVRDEFEFWEYR 254
            :::.||...|.|..  |..|....||.:...|...::..:  .||| ...|..|...|..:| ::
  Fly   503 AIIRVPVDPKRLDL--VITYTQQQLEEVVDGWIKYLKKTM--KTLTDAKLDDFTPMAEHRYW-HK 562

  Fly   255 YEV-LQGINDQLAHSDVQKVLLLLHNAQSVHMPQMDGLIERARKELHKSLSNIKYLHLLIEPCSK 318
            .|| |.|..:||....|..||..|.:.:|..:.:...::|:.......:..|..||..:|:...|
  Fly   563 MEVELYGTLEQLKTEFVVAVLQRLTDDKSPVLDEWQAVVEKTEARFKLAKENSDYLGTIIDYLEK 627

  Fly   319 IDAATSPADLTKLLPRIIHLIRFIWLNSEYYNTTRLIAALFRNLSNQIIRFCTKQTKVEEILSGK 383
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  Fly   628 VRSYESFKMVVLQIPNIMVGLRHIWTMSSHYCRDPEMQVLLCQISNVFVQ------KVKSIINFE 686

  Fly   384 PRFGIRICNVAIECCLTYRGIYDTISR------------DLAQKHTQ-----MPWELDEGLIFNH 431
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  Fly   687 NIF---------KYSATY--TYETATNCANLLRCWKQAYKLSRQHIEDSGAGSRWEFDRVALFNE 740

  Fly   432 ID--------------AFVE-------RLNDVI---DICESMI--VFGRLD-------------- 456
            ::              .||:       ||...|   .|.::::  |:..||
  Fly   741 VNHIHRVAVDIAYVGRVFVQYENLFGHRLKACIADPSIVDNLMRKVYRMLDDLIKSVDYDMFRPG 805

  Fly   457 --ENGSIPKPVFGGTCGEELEKIAESVEVQFLDTLNKLQQNSQAYI--LNVH-RADWYADVAGFR 516
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  Fly   806 NWENWEYSLELFNKRL-DNVENEAKNVIDQSINSLLSSEKGLDLVVNAMNIDTRATLQEFVATKH 869

  Fly   517 KNMQKLEETVQRLIFNVFQQVSNVEEMLEALQA-------------------MLFYSYRQRGTLR 562
            :|:.:...|....:..||.::.....|.:...|                   :.|........::
  Fly   870 ENLLRFFVTEINAVERVFTKLKKSPPMAKHQPAKISAIFWARLLGKKLKTSVLAFKRVEDEPAIK 934

  Fly   563 KTYLKETS------KLWRMFSKE--------------MDATSRK-----LLEEQSRESWLSKHV- 601
            .::||.:|      .:..||..|              ::.|:|.     .:.::|..|::|:.|
  Fly   935 NSFLKRSSFKQYFELMTVMFQFEKVLFENFIQNATYLVNTTNRSNVLRIRICKESTMSYISEAVQ 999

  Fly   602 SIALGYRINLERLTWLRDR----LKNSEWLPAVKESSPALAKFDALRHEFQKE------------ 650
            ::....|..|:..:   ||    :|:|..:|...|:..|.:..|:...|...|
  Fly  1000 TLKAKPRPELQMTS---DRRVTPVKSSNLMPVQSEAFSAYSVADSAGTEISSESENEGLLVGDTS 1061

  Fly   651 ------------IRLAYDDWVA-----------KCCGF---------------------SGDLCQ 671
                        :.:|...|:.           :|..|                     :.:|.|
  Fly  1062 QKKLMCRINRLTVLVAMIMWMVSNTRKANIQLQECTAFIKMVKDKKPKDVTAMDRHCVRTCELLQ 1126

  Fly   672 RLD-RYLVVRSKKFKG---LLE------CNIDASVLELCEQAQHFERMGFAIPSTMKKLYERYDT 726
            |.: :||:...::..|   |:|      .|:...|.::..:||.||.:||.:|:.::....:.|.
  Fly  1127 RAESQYLLPIWRELVGEKTLIEYDMDFVVNLKRDVFDVLFEAQQFEHLGFTLPAVLRTAIMKKDL 1191

  Fly   727 IRSLYNGIIKLALSHNRILAVLSDRERKLFRPLIQACDRQLAPGVFKITYGSEFNEEFFEDGTEF 791
            :...|..:.::...:..|:..||..|....|..|...:..:..||.:.|:.| ||
  Fly  1192 LFKDYERMTEVVDRYRSIINNLSMSEVIFLRGHIYDTELFIQMGVGRYTWTS-FN---------- 1245

  Fly   792 IAEFQELVLIFKRANRGVARICEKICGTCLLHFAFSGSVDISVFQQQLSSRLSSSGDILRSYY-- 854
                             :.:.|::|  ...|....|....|:..:..|.||:    |:::|:.
  Fly  1246 -----------------IGKFCDQI--NSQLRKLTSIVSQINFIRLDLRSRI----DMIKSFNLF 1287

  Fly   855 ----SHVVELLSAFSGQ------------FQSVDDEMSAEWIAYVNDMDDMLASSLMTSARGS-- 901
                ...||..|..||:            |:||    :.|.|...:...|:.|......|.||
  Fly  1288 NLDDELKVEDTSRSSGESYLQDRKNPSQRFKSV----TGETITMFSVEKDVPADEKAEQACGSGI 1348

  Fly   902 --------------------LNKLYEAL----------------------------------HCD 912
                                :.|||::|                                  .|.
  Fly  1349 YPCQGYFELLEASRNRKAAQMKKLYDSLGPVLVKLESLVLGTFSGRSDRMKTYYEYWEGETFKCI 1413

  Fly   913 ADM-------------ASAPIIVVESDVKDGRIVFTPDMDAIGDMINGIVDSIR---SMLDQFPR 961
            .||             ::.|:..|.:.:....||..|   ::.::.|.||.:.:   |.|..|.|
  Fly  1414 VDMTYQNLKCYINRLLSNKPMFEVNAVLLMSEIVLEP---SVQELQNTIVTATKDYISRLRIFTR 1475

  Fly   962 --LGYKLKLPKKQQRQGFASVFREDQECSELMRSIQAEIGIQ------REELAKYESEWNKNRVL 1018
              .|..:..|..:..:.|...:...::..::...:...|.|.      ..|...:.|::.|...|
  Fly  1476 WMTGTCIACPLVEMGKQFKYNYTYYEDVIQIRSIVDLVINIHDLASRVANEARGFVSQFRKYFNL 1540

  Fly  1019 WQTTEEEFRQRLMSKSRTAGVFEGGIEHYSALADDVIFEDAITNVYFILINQNALKSTMLDWIEK 1083
            |...:....|:.:.|..|....:.....||::.:.:.......::..:.||...|.:::....:.
  Fly  1541 WAFEKSFICQKFLEKQVTLIEIDEKFTFYSSIVETLANTRKFQDIKCVRINLEPLLASITQHAQD 1605

  Fly  1084 WQALNIKMLLDHGSNLMGAVYRYMRRNERNVMKVPRTIRETVAAKQLFEKLLKDVPVKQSA---- 1144
            |.....:.||.|.::.|.|:...::....|:.|..|.:.:       |:.::..:...||:
  Fly  1606 WCTTLGEELLRHVNDNMRAMRNEVKTLSLNLNKTTRELED-------FKLVMTTIGTVQSSTLTN 1663

  Fly  1145 ---FTPMLELFVLLHKYQVKLSEETFEQVMGLETAW-------LHYLQVLE------------EA 1187
               ...|.|.|.:|.::::....|.......||..|       |:..:.|:            |.
  Fly  1664 EQKIHEMQETFTILSEHKIMFPYEDMLMAHHLEKRWKRLFLSALYRYEKLQPIKQKFADMTSVEI 1728

  Fly  1188 DEMLDNEDSEAKLLLAKHGEKFKLILKDFLEDF 1220
            ||..|:                   |.:|::|:
  Fly  1729 DEFCDD-------------------LAEFIKDY 1742

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG9068	NP_611111.1	DHC_N1	212..784	CDD:462457	141/750 (19%)
Dhc98D	NP_524541.3	DHC_N1	523..>968	CDD:462457	88/465 (19%)
		DHC_N2	1795..2196	CDD:462462
		DYN1	1999..4719	CDD:227570
		AAA_6	2338..2664	CDD:463697
		Dynein_C	4778..5076	CDD:465677