Protein Alignment CG9068 and CG3339

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_611111.1
• Gene: CG9068 / 36817
• FlyBaseID: FBgn0034106
• Length: 1227
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001036762.2
• Gene: CG3339 / 43295
• FlyBaseID: FBgn0039510
• Length: 4842
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1521
• Identity: 284/1521 - (18%)
• Similarity: 528/1521 - (34%)
• Gaps: 429/1521 - (28%)

  Fly    18 TDDEE----RSVEPRQEEIRPETPKPSYSDEELNQLVGY---IQRM------SVLSCLDHR---- 65
            :.|||    .|...||...|      .|||..|.::..|   ..|:      .:::|.|.|
  Fly     9 SSDEEGLPAGSTSGRQRVQR------DYSDARLERVAAYTTTTMRLKPDKWTKMMACDDLRRIVV 67

  Fly    66 DWQEG-------TL----DII-RGWLLEVHEPL-----------LTIYYDRDALAACLGMPSMCV 107
            :||.|       ||    |:: |..|.:::.|.           ..:..:.:|:|......|..|
  Fly    68 EWQHGHRRVLVMTLSPGGDLVPRSCLSDLYLPYSVQSARGSIPSAMLPAEDEAMATVTAAVSAVV 132

  Fly   108 S--------------------------DLSYF-RREPNE-IFSVEGFHDEINFG---------TL 135
            |                          ..:|| ||..:: ..:...|.:.:.:|         |:
  Fly   133 SATPGALLIPLPPASSSFTTLDGVPRGKCAYFVRRNTSDGPLTASNFAESVLYGDFPVHSKIETM 197

  Fly   136 TSDVDGCLMELLDRLYVPFFRNYLEWNATVRNRF---CSSMDRFLAFLSGMHHQISGMSVMYVPF 197
            :...|..|..||::.       ..:|.|.||...   ...:...|..:.|..:..:.:|::..|.
  Fly   198 SLLFDDVLQPLLEQA-------QSQWPAIVRKDLQARIKEVRNTLTEIKGKTNNRTILSLLVSPT 255

  Fly   198 VIKELTA-----------GPVDRYLVGSLEGIALYWTTQIRTL---------LADDTLTVPHD-- 240
            :::|:.|           .|..|.|   ||.:.:.||||:..:         |...|.:..|.
  Fly   256 IVEEVFAHVSQGHLRPALDPKFRNL---LEEMFINWTTQMHDIVLERSECQPLGSTTQSAGHQPK 317

  Fly   241 ---LVTV-RDEFEFWEYRYEVLQGINDQLAHSDVQKVLLLLHNAQSVHMPQMDGLIERARKELHK 301
               ||:: ..|..||..|...||.|.:||..|..:.:..:|...:||:...    ...|.::|..
  Fly   318 YITLVSLPAQEIGFWTNRKLNLQNIYEQLRESTHKTLAQILERIESVYYEP----YATAFRKLVA 378

  Fly   302 SLSNIKYLHLLIEPCSKIDAATSPADLTK---LLPRIIHLIRFIWLNSEYYNTTRLIAALFRNLS 363
            :....:.:.|.::|..:..||.:....:.   |:..::|::..:|.|:.||.:|:.::.|.|.:.
  Fly   379 AWLEAQDVSLWLQPLLRQTAAFNSVQFSNGHDLVAPLVHIVHLVWSNARYYRSTQRMSVLLRCIC 443

  Fly   364 NQIIRFCTKQTKVEEILSGKPRFGIRICNVAI-------ECCLTYRGIY--------------DT 407
            |.::....:..:::.:..|....|:...|..|       :..|.|:..|              ..
  Fly   444 NMLVHRAAEDLELQLLFQGDADEGLLKINRTIAVLELFKQRMLDYKERYAGSQVLLPALSEGAAA 508

  Fly   408 ISRDLAQKHTQMPWELDEGLIFNH-IDAFVERLNDVIDICESMIVFGRLDENGSIPKPVFGGTCG 471
            ::...:....|..|......:|.. :|.|..:|.::..:.|:.:.|.:|:      |...||..|
  Fly   509 VASSPSPDDQQQLWRFCHEDVFGQTLDGFSLQLLELRQVFEAAVQFQQLE------KLEVGGLRG 567

  Fly   472 ----EELEKIAESVEVQFLDTLNKLQQNSQAYILNVHRADWYADVAG----FRK-------NMQK 521
                |.:.:|....:|.|       :|.|...|      |..|.||.    ||:       .||.
  Fly   568 KILTERVREIFGEFKVLF-------EQWSNVDI------DLTATVASKWKCFRREQTLFFSRMQL 619

  Fly   522 LEETVQRLIFNVFQQVSNVEEMLEALQAMLFYSYRQRGTLRKTYLKETSKLWRMFSKEM----DA 582
            ||:.:..::...|:|..:...:|..  .::|.|..||..:|....:....:..::..||    |:
  Fly   620 LEQKLATVLLQAFEQCHSWMHLLRL--TLMFGSLLQREAVRPELARVLPHILFIYDTEMEQLEDS 682

  Fly   583 TSRKLLEEQSR-----------------ESWLSKHVSIALGYRINLERLTWLRDRL--KNSE--- 625
            ....||..:.|                 ..||.:|:|..  .....:.|:.|.::|  :.||
  Fly   683 VGEVLLGYEIRGLAALPLANNFPPIANAMMWLEQHISRC--DEFGAKELSQLVEQLLKEKSELQT 745

  Fly   626 ----WLPAVKESSPALAKFDALRHEFQKEIRLAYDDWVAKCCGFSGDLCQRLDRYLVVRSKKFKG 686
                |...:...:....|...|    |.:|.:::.:.|.|.      :.|.||..::.||:.. .
  Fly   746 LPIQWNSLLSRRNILTTKLSNL----QMKIWISWHECVDKL------IIQGLDESVLSRSQDL-S 799

  Fly   687 LLECNIDASVLELCEQAQH---FERMG------FAIPSTMKKLYERYDTIRSLYNGIIKLALSHN 742
            .|..|....:..|.::.::   .:..|      |.:|..:..||...|........:||:...:|
  Fly   800 QLHLNFSQVLFTLLKETKYLLALQATGSLSGDLFQLPEPLLTLYGHRDAYWERRIRLIKIGEFYN 864

  Fly   743 RILA-VLSDRERKLFRPLIQACDRQLAPGVFKITYGSEFNEE----FFEDGTEFIAEFQE----- 797
            .|.: ..:..|.:|.|..:.:.|..:.....::|: ..:|:|    .||...:..|..|:
  Fly   865 GIRSGECAAAELQLIRNDLASIDEHVEVACQQLTW-RNYNDELVAGIFEQSRDLFARLQQSHGNL 928

  Fly   798 --LVLIFKRANRGVARICEKICGTCLLHFAFSGSVDISVFQQQLSSRLSSSGD------------ 848
              ::...:|.:|.... ...:.|..||        |:...|.::..||....:
  Fly   929 DAILASMRRWSREPLH-QRSLYGRNLL--------DLRHQQDRVRLRLLQCDETKMLLNRLLIAN 984

  Fly   849 --ILRSYYSHVVELLS------AFSGQFQSVDDEMSAEWIAYVNDMDDMLASSLMTSARGSLNKL 905
              :..:|.|...:|.|      .|..:|   .:|...::..|:..:|:::...:..:.|.||..|
  Fly   985 FCLFFNYESQEFQLYSRDLSVQEFIREF---PEEQRRQYNKYLASVDELICREVREAMRISLEYL 1046

  Fly   906 YEAL-----------------HCDADMA----------------------------SAPIIVVES 925
            |:.:                 .|.|.||                            .||:..|:.
  Fly  1047 YKEMTATATATTTPTAPPVDPGCSAGMARLVLQQITTPQATSTAGAGASGAPPTANDAPLFEVKL 1111

  Fly   926 DVKDGRIVFTPDMDA-----IGDMINGIVDSIRSMLDQFPRL------------------GYKLK 967
            ::.:..|.|:|..||     ...::..::..|:...|..||:                  .|:.:
  Fly  1112 ELTETEIRFSPAFDASVENNFQQIVEQLLLDIKQTCDCMPRIVADNAPSEDDEDDDTATVDYEQE 1176

  Fly   968 L---PKK----------------QQRQG-------------FASVFREDQECSE-----LMRSIQ 995
            |   |::                :|.||             .|..:.:..||:.     |.|:|:
  Fly  1177 LRWEPREDRAQELQERKKKDLELEQEQGDPKPQAVQFNLLAAAKAYSQKMECTADGLEMLERAIR 1241

  Fly   996 AEIGIQREELAKYESEWNKNRVLWQTTEEEFRQRLMSKSR------TAG------VFEGGIEHYS 1048
            ..:.......:.|.:::.....||.....|.....|..:|      :||      .|:..||:|:
  Fly  1242 DALADTVAAASAYAAKFQAYAFLWTQQSSEVLAACMQTAREQTHHVSAGGYAIMETFKKEIENYN 1306

  Fly  1049 ALADDVIFEDAITNVY----FILINQNALKSTMLDWIEKWQALNIKMLLDHGSNLMGAVYRYMRR 1109
            .:.|.:   |...|..    ::.::...||..:|:...||..:..|.||.:....:..:..::.|
  Fly  1307 EVHDAI---DQCENRECINGWLALDIKPLKYGLLNLACKWSHMCKKWLLRYVQGTLKELNAFIAR 1368

  Fly  1110 NERNVMKVPRTIRETVAAKQLFEKLLKDV----------PVKQSAFTPMLELFVLLHKYQVKLSE 1164
            ....:        :...|:|.|..||:.:          |...:.|.|:.|:..||..|.|:...
  Fly  1369 GFETL--------QLHIARQDFATLLRVLAIMSEIREREPYADNVFKPLKEIMGLLKTYNVEFEP 1425

  Fly  1165 ETFEQVMGLETAW---LHYLQVLEEA 1187
            :....:..|...|   .|...|.:||
  Fly  1426 QLLRGIEQLPQQWQQLKHSSTVKQEA 1451

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG9068	NP_611111.1	DHC_N1	212..784	CDD:462457	132/670 (20%)
CG3339	NP_001036762.2	DHC_N1	279..903	CDD:462457	131/665 (20%)
		DHC_N2	1532..1943	CDD:462462
		DYN1	1759..4514	CDD:227570
		AAA_6	2095..2421	CDD:463697
		MT	3419..3759	CDD:463699
		Dynein_C	4545..4840	CDD:465677