Protein Alignment CG9068 and Dnah2

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_611111.1
• Gene: CG9068 / 36817
• FlyBaseID: FBgn0034106
• Length: 1227
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001094146.1
• Gene: Dnah2 / 303242
• RGDID: 1565087
• Length: 4508
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 1254
• Identity: 329/1254 - (26%)
• Similarity: 607/1254 - (48%)
• Gaps: 69/1254 - (5%)

  Fly     7 VEDEHLTDSDLTDDEERSVEPRQEEI-----RPETPKPSYSDEELNQLVGYIQRMSVLSCLDHRD 66
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  Rat    34 VEKE---TSQLPIIPEPEYEPMKEESEQDLEEPEEPKEPDLSTDVKPI--FLSR-AMLTGLADST 92

  Fly    67 WQEGTLDIIRGWLLEVHEPLLTIYYDR-DALAACLGMPSMCVSDLSYFRREPNEIFSVEGFHDEI 130
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  Rat    93 WTAEHDAVLEHFAQDPSVPVLTIFVDPVFGLKLELGMPVQTQNQIVYFIRQAPVPITPENFEETV 157

  Fly   131 NFGTLTSDVDGCLMELLDRLYVP-FFRNYLEWNATVRNRFCSSMDRFLAFLSGMHHQISGMSVMY 194
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  Rat   158 QYGTVRGAYIPALLRLLSGVYVPQIFMN-KSWPESIRNHFVSHLHRFLASLTDTRYKLEGHTVLY 221

  Fly   195 VPFVIKELTAGPV----DRYLVGSLEGIALYWTTQIRTLL-ADDTLTVPHDLVTVRDEFEFWEYR 254
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  Rat   222 IP--AEAITMDPAVVIKDKELVQRLETSMIHWTRQIKEVLSAQESVDTGENLGPL-EEIEFWNNR 283

  Fly   255 YEVLQGINDQLAHSDVQKVLLLLHNAQSVHMPQMDGLIERARKELHKSLSNIKYLHLLIEPCSKI 319
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  Rat   284 CMDLSGISKQLVKQGVKHIESILLLAKSSYLAPFRKLAQQIQDGSRQAQSNLTFLSILREPYQEL 348

  Fly   320 DAATSPADLTKLLPRIIHLIRFIWLNSEYYNTTRLIAALFRNLSNQIIRFCTKQTKVEEILSGKP 384
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  Rat   349 -AFMKPKDISDKLPKLISLIRIIWVNSPHYNTRERLTGLFRKMSNEIIRLCCHSVSLDRIFEGYV 412

  Fly   385 RFGIRICNVAIECCLTYRGIYDTISRDLAQKHTQMP---WELDEGLIFNHIDAFVERLNDVIDIC 446
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  Rat   413 SSSKEDLQGCISCCHAWKEHY----LRAVQMHTQFSNRGWVLDQTSIFAQVDAFVQRCKDLIEVC 473

  Fly   447 ESMIVFGRLDENGSIPKPVFGGTCGEELEKIAESVEVQFLDTLNKLQQNSQAY---ILNVHRADW 508
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  Rat   474 DCQYHFARWLDGTQGPLPCFFGAQGPQITRNLLEIE----DIFHKNLQTLRAVRGGILDVKNTSW 534

  Fly   509 YADVAGFRKNMQKLEETVQRLIFNVFQQVSNVEEMLEALQAMLFYSYRQRGTLRKTYLKETSKLW 573
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  Rat   535 HEDYNKFRAGIKDLEVMTQNLITSAFELVRDVEHGVLLLDT--FHRLANREAIMRTYEKKAVDLY 597

  Fly   574 RMFSKEMDATSRKLLEE-QSRESWLSKHVSIALGYRINLERLTWLRDRLKNSEWLPAVKESSPAL 637
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  Rat   598 MLFNSELALVNRELNKKWPYLEPYMAQYSGQAHWVRILRRRIDRVMNCLSGAHFLPHIGTGEETV 662

  Fly   638 AKFDALRHEFQKEIRLAYDDWVAKCCGFSGDLCQRLDRYLVVRSKKFKGLLECNIDASVLELCEQ 702
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  Rat   663 HTYQQMVQAIDELVRKTFQEWTAT---LDKDCIRRLDMPLLRISQEKAGMLDVNFDKTLLILFVE 724

  Fly   703 AQHFERMGFAIPSTMKKLYERYDTIRSLYNGIIKLALSHNRILAVLSDRERKLFRPLIQACDRQL 767
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  Rat   725 IDYWERLLFETPHYVMNVADRAEDLRILRENLLLVARDYNRIIAMLSPDEQALFKERIRFLDKKI 789

  Fly   768 APGVFKITYGSEFNEEFFEDGTE---FIAEFQELVLIFKRANRGVARICEKICGTCLLHFAFSGS 829
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  Rat   790 HPGLKKLNWALKGASAFFI--TECRIHASKVQMIVNDFKASTLTIGWKAQEMSELLLVH--ITGK 850

  Fly   830 V---DISVFQQQLSSRLSSSGDILRSYYSHVVELLSAFSGQFQSVDDEMSAEWIAYVNDMDDMLA 891
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  Rat   851 QVYRDLEFEEAQREHRMAVQQKLV-NLHQDVINILTNSFEVFKNDGPEIQQQWLLYTIRLDHMME 914

  Fly   892 SSLMTSARGSLNKLYEALHCDADMASAP----IIVVESDVKDG--RIVFTPDMDAIGDMINGIVD 950
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  Rat   915 DALRLNVKWSLLELSKAINGDGKTSPNPLFRVLVILQSDVQGGGAQVEFSPTLQTLASVVNDIGS 979

  Fly   951 SIRSMLDQFPRLGYKLKLPKKQQRQGFASVFREDQECSELMRSIQAEI--GIQREE--LAKYESE 1011
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  Rat   980 HLFSTISVFRHLP-DILTKRKMTREPIHVVVERDED----IRKIQAQISSGMTNNASLLQNYLKT 1039

  Fly  1012 WNKNRVLWQTTEEEFRQRLMSKSRTAGVFEGGIEHYSALADDVIFEDAITNVYFILINQNALKST 1076
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  Rat  1040 WDMYREIWEINKDSFIRRYQRLNPPVSSFDADIARYTEVANNVQKEETVLNIQFVMLDCSHLKFS 1104

  Fly  1077 MLDWIEKWQALNIKMLLDHGSNLMGAVYRYMRRNERNVMKVPRTIRETVAAKQLFEKLLKDVPVK 1141
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  Rat  1105 LVQHCNEWQNKFTTLLKEMAAGRLMDLHTYLKDNAEKISRPPQTLEELGVSLQLMDTLQHDLPNL 1169

  Fly  1142 QSAFTPMLELFVLLHKYQVKLSEETFEQVMGLETAWLHYLQVLEEADEMLDNEDSEAKLLLAKHG 1206
            ::...|:.|.|.:|.||:|.:.:...|.:..|...||.:.|:|.::::||.....:.|..|....
  Rat  1170 ETQIPPIHEQFTILEKYEVPVPDTVLEMLESLNGEWLTFQQILLDSEQMLKKHKEKFKTGLIHAA 1234

  Fly  1207 EKFKLILKDFLEDFYSKLP 1225
            :.||....:.||||..|.|
  Rat  1235 DDFKKKAHNLLEDFELKGP 1253

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG9068	NP_611111.1	DHC_N1	212..784	CDD:462457	163/579 (28%)
Dnah2	NP_001094146.1	DHC_N1	241..798	CDD:462457	163/571 (29%)
		DHC_N2	1301..1709	CDD:462462
		DYN1	1368..4189	CDD:227570
		AAA_6	1846..2172	CDD:463697
		Dynein_C	4204..4504	CDD:465677