Protein Alignment CG9068 and Dnah17

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_611111.1
• Gene: CG9068 / 36817
• FlyBaseID: FBgn0034106
• Length: 1227
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_038943440.1
• Gene: Dnah17 / 287845
• RGDID: 1563805
• Length: 4459
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 1268
• Identity: 272/1268 - (21%)
• Similarity: 512/1268 - (40%)
• Gaps: 201/1268 - (15%)

  Fly    81 EVHEPLLTIYYDR-------------DALAACLGMPSMCVSDLSYFRREPNEIFSVEGFHDEINF 132
            |.:..|.|.::|:             ..:..|||.|....:...||.|...|..:.:.:...:.:
  Rat    31 EENMALFTEFFDKTENPVLVMTLNPAGIIIPCLGFPESLKTKGVYFIRTKPENITKDNYKTRLIY 95

  Fly   133 GTLT-SDVDGCLMELLDRLYVPFFRNYLE----WNATVRNRFCSSMDRFLAFLSGMHHQISGMSV 192
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  Rat    96 GDISPTPVDQLIAVVEEVLYSLLNQN--ENMDGWPRVVSEDIVKQVHRLKNEMFVMGGKIKGKTL 158

  Fly   193 MYVPFVIKELTA---------GPVDRYLVGSLEGIALYWTTQIRTLLADDT----LTVPHDLVTV 244
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  Rat   159 LPIPEHLGSLDGTLESMERIPSSLDNSLLHSIETIIIDWSHQIRDVLSKDSAQALLDGLHPLPRV 223

  Fly   245 RDEFEFWEYRYEVLQGINDQLAHSDVQKVLLLLHNAQSVHMPQMDGL---IERARKELHKSLSNI 306
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  Rat   224 --EFEFWDARLMNLQCIHEQLNRPKVNKIVEILEKAKSCYWPALQNVYMNVTQGLKEANDIVLYL 286

  Fly   307 KYLHLLIEPCSKIDAATSPADLTKLLPRIIHLIRFIWLNSEYYNTTRLIAALFRNLSNQIIRFCT 371
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  Rat   287 KPLRILLEEMEQADFTVLPSFIVKVLSTIC----FIWATSEHYNTPSRVIVILREFSNQIIEMTR 347

  Fly   372 K-----------QTKVEEILSG-KPRFGI--RICNVAIECCLTYRGIYDTISRDLAQKHTQMPWE 422
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  Rat   348 TYLSPEEVLKGLQGEIEEVLGGISQSVGVLKELFHAYDFCCANMKLFF--------KDRPPVPWE 404

  Fly   423 LDEGLIFNHIDAFVERLNDVIDICESMIVFGRLD--ENGSIPKPVFGGTCGEELEKIAESVEVQF 485
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  Rat   405 FPSSLAFSRMNAFFHRVQTIEDLYKTAIEFLKLEKIELGGVRGNILGNLVTQIYDEVFELVKVFA 469

  Fly   486 LDTLNKLQQNSQAYILNVHRADWYADVAGFRKNMQKLEETVQRLIFNVFQQVSNVEEMLEALQAM 550
            ....:.|.....::      .|.|.|   |...:|.|:..:..:....|...:.:|...:.|
  Rat   470 ECKYDPLDPGDSSF------DDDYND---FETKIQDLDRRLATIFCQAFDDCNCIESSAKLL--- 522

  Fly   551 LFYSYRQRGTL-RKTYLKET----SKLWRMFSKEMDATSRKLL-------EEQSRESWLSKHVSI 603
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  Rat   523 ----YMCGGLLERPLILVEVVPRYSVMLEMFNTELD--NAKLMYDAQMAASEDGQIPPIHKNMPP 581

  Fly   604 ALGYRINLERLTW---LRDRLKNS-EWLPAVKESSPALAKFDA--LRHEFQKEIRL-------AY 655
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  Rat   582 VAG------QLKWSLELQERLEVSMKYLKHI--DHPVMSSVEAKLVYDKYDEMIGLLKGYREKKY 638

  Fly   656 DDWVAKCCGFSGDLCQRLDRYLVVRSKKFKGLLECNIDASVLELCEQAQH--FERMGFAIPSTMK 718
            ..||.   |...|....|.:.|:.|. .|..|::.|...:::.:..:.::  |::.. .|||:.:
  Rat   639 QQWVE---GVDQDCHFNLGQPLIQRD-PFSSLIQVNFSKALVAVLREVKYLNFQQQK-EIPSSAE 698

  Fly   719 KLYERYDTIRSLYNGIIKLALSHNRILAVLSDRERKLFRPLIQACDRQLAPGVFKITYGSEFNEE 783
            ||:...:..|.....:..:...:|.|...:.:.|..|.:..::..|.:|......:.:..|...|
  Rat   699 KLFSENEIFRKFVGNLELIVGWYNEIKTTVMEVEFPLIKSELEEIDVKLMSAETTLFWNGENVME 763

  Fly   784 FFEDGTEFIAEFQELVLIFKRANRGVARICEKICGTCLLHFAFS---GSVDISVFQQQLSSR--- 842
            :.::..|.:...|..:...|:...|:.:..::.....|.....:   ..:|:......|:.|
  Rat   764 YIQEMREILHNLQNRIQKTKQNIEGITQAMQEWSANPLFERKDNKKEALLDLDGRVANLNKRYAA 828

  Fly   843 LSSSGDILRSYYSHVVELLSAFSGQFQSVDDEMSAEWIAYVNDMDDMLASSLMTSARGSLNKLYE 907
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  Rat   829 VKDAGVRIQAMVTENAELFKA---------DTTSQPWKDYVNYIDAMVLDEFDRFIRKSLNYLMD 884

  Fly   908 ALHCDADMASAPIIVVESDVKDGRIVFTP-----DMDAIGDMINGIVDSIRSMLDQFPRLGYKLK 967
            .:..|.::  ||:..:..::.:..:.|.|     |.|:...:|.|:::.:.::....|||. |.:
  Rat   885 NMTMDENI--APLFEIRMELDEDGLTFNPTLEMGDEDSFLSLIEGLINDLYNVARLIPRLA-KGR 946

  Fly   968 LPKKQQRQGFASVFREDQECSELMRSIQAEIGIQR--EELAKYESEWNKNRVLWQTTEEEFRQRL 1030
            :..|...:....:....:|.|.|:      ||..:  ||   |:..:.:...||....:||.:..
  Rat   947 INYKSDLEDITDLIEMREELSSLV------IGAMKVAEE---YQDSFERYSYLWVDDLQEFMKNF 1002

  Fly  1031 M--------------------SKSRTAGVFEGGIEHYSALADDVI-FEDAITNVY--FILINQNA 1072
            :                    ....|...|:..|:.|..|.::|. .|:  |.|:  ::..:...
  Rat  1003 LIFGHAPTPEELDTKIDDTIPKTQPTLAQFQQQIDSYEKLYEEVSRCEN--TKVFHGWLQCDCRP 1065

  Fly  1073 LKSTMLDWIEKWQALNIKMLLDHGSNLMGAVYRYMRRNERNVMKVPRTIRETVAAKQLFEKLLKD 1137
            .|..:|:.|::|..|..:.|.||..|.:..:..:|... |..:|.|....:.....::...|:|
  Rat  1066 FKQALLNTIKRWSLLFKRYLSDHVINSLADLESFMGVT-RTGLKKPLKEGDYDGLVEVMGHLMK- 1128

  Fly  1138 VPVKQ------SAFTPMLELFVLLHKYQVKLSEETFEQVMGLETAWLH----YLQVLEEADEMLD 1192
              ||:      |.|.|:.:...||..|..::.|||:.::..|...|.:    .:||.:....:..
  Rat  1129 --VKERQVATDSMFEPLKQTIELLKSYGEEMPEETYLKLQELPEQWTNTKKLAIQVKQNVAPLQA 1191

  Fly  1193 NEDSEAKLLLAKHGEKFKLILKDFLEDFYSKLP 1225
            ||.:    :|.:..::|:|...:|.|.|....|
  Rat  1192 NEVN----ILRRKCQQFELKQHEFREKFRRDAP 1220

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG9068	NP_611111.1	DHC_N1	212..784	CDD:462457	143/621 (23%)
Dnah17	XP_038943440.1	DHC_N1	187..764	CDD:462457	143/621 (23%)
		DHC_N2	1266..1672	CDD:462462
		DYN1	1493..4124	CDD:227570
		AAA_6	1806..2132	CDD:463697
		MT	3040..3383	CDD:463699
		Dynein_C	4162..4457	CDD:465677