Protein Alignment CG9068 and dnah9

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_611111.1
• Gene: CG9068 / 36817
• FlyBaseID: FBgn0034106
• Length: 1227
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001353479.1
• Gene: dnah9 / 266676
• ZFINID: ZDB-GENE-020925-1
• Length: 4464
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1252
• Identity: 254/1252 - (20%)
• Similarity: 493/1252 - (39%)
• Gaps: 205/1252 - (16%)

  Fly    32 IRPETPKPSYSDEELNQLVGYIQRMSVLSCLDHRDWQEGTLDIIRGWLLEVHEPLLTIYYDRDAL 96
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Zfish    26 VKPERWERCVSAEE--------QRRVIQEFLDQSE----------------HSTLSVSVNSAGQL 66

  Fly    97 AACLGMPSMCVSDLSYFRREPNEIFSVEGFHDEINFGTLTSDV--------DGC------LMELL 147
            ...||:.:...|...:|.:...              |.||:|.        |.|      ...|:
Zfish    67 VPALGLSAAVKSKAVFFVKRGK--------------GALTADKMKTQLFSGDMCYSPLEQFSVLV 117

  Fly   148 DRLYVPF---FRNYLEWNATVRN---RFCSSMDRFLAFLSGMHHQISGMSVMYVPFVIKELTA-- 204
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Zfish   118 DKVVEPVLSNLNNQRDFPKVVSQDLMRHIHALQNNVFVTAG---QIKGKTHLPVPLGFKQFEQCS 179

  Fly   205 -------GPVDRYLVGSLEGIALYWTTQIRTLLADDTL--------TVPHDLVTVRDEFEFWEYR 254
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Zfish   180 QQLDKRFHVVDKSLIHSMETVVIDWSHQVYKVLKKDSSEPLLEGRNPTPH------AEIQFWRNR 238

  Fly   255 YEVLQGINDQLAHSDVQKVLLLLHNAQSVHMPQMDGLIERARKELHKSLSNIKYLHLLIEPCSKI 319
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Zfish   239 LADLQGIQQQLQSSKVLTLAELLLAVDSSYYPAFAKMIQDV-MEAHNESKNIT---TFLKPLERL 299

  Fly   320 DAATSPADLTKL---LPRIIHLIRFIWLNSEYYNTTRLIAALFRNLSNQIIRFCTKQTKVEEILS 381
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Zfish   300 IEDLENADFTELKAKIPPLMHTVCLIWANCRYYSKPARVIVLLQEICNLLIQQARSFLNPDDILK 364

  Fly   382 GKPRFGIRICNVAIECCLTYRGIYDTISRDLA--QKHTQ--MPWELDEGLIFNHIDAFVERLNDV 442
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Zfish   365 GDVLESLLRVQAAVDLLTHFKNTYEDRRANLSHYQKNEDPVKPWDFSPLMVFVGLDHFMKRLRTI 429

  Fly   443 IDICESMIVFGRLDENGSIPKPVFGGTCGEELEKIAESVEVQFLDTLNKLQQNSQAY-ILNVHRA 506
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Zfish   430 ETVLLTVMDMMRLE------KIEFGGIQGKSLSQIVQRLHEDFLQTYKSFSE--KPYDCLDVNNM 486

  Fly   507 DWYADVAGFRKNMQKLEETVQRLIFNVFQQVSNVEEMLEAL--------QAMLFYSYRQR-GTLR 562
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Zfish   487 EFESDFAEFQLTVDDTNRRLGAIFCNAFDDASGLEHSFKVLDMFGRLLEQPLIAAEAQARYPILI 551

  Fly   563 KTYLKETSKLWRMFSKEMDATSRKLLEEQSRESWLSKHVSIALGYRINLERLTWLRDRLK----- 622
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Zfish   552 KLFDKQLEDCKTIFKKQMQ------MEETRGYSPVSKNMPAVSG---GLKFVQELQERIQTLYNN 607

  Fly   623 ----NSEWLPAVKESSPALAKFDALRHEFQKEIRLAYDDW---VAKCCGFSGDLCQRLDRYLVVR 680
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Zfish   608 FRFINHPCMESV-DAKEMMQKYDELMRQLKQYSSKLYDIWTSSVAEKSQFN------LNKPLISR 665

  Fly   681 SKKFKGLLECNIDASVLELCEQAQHFE-RMGFAIPSTMKKLYERYDTIRSLYNGIIKLALS---H 741
            ..:.: ||..|....::.:..:.::.| |....||....::|...:.   |:..:..|.|:   :
Zfish   666 EPRSR-LLSVNFSPQLVSVLREVKYLEARQAEIIPDAAAEIYSSREL---LWQYVANLELTTGWY 726

  Fly   742 NRILAVLSDRERKLFRPLIQACDRQLAPGVFKITYGSEFNEEFFEDGTEFIAEFQELVLIFKRAN 806
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Zfish   727 NKIISSVLDVEMPLVQGQLTDIDNKLKGAQENLCWISEGIWEYIQDVREAVSDLEQRL---RRTK 788

  Fly   807 RGVARICEKICGTCL-LHFAFSGSVDISVFQQQLSSRLSSSGDILRSYYSHVVELLSAFSGQFQS 870
            ..|..:...:..... ||....|..::.:..::.|.|:..:...:||..:.:..||......|::
Zfish   789 DNVEEMQSLMKSWATPLHDRKEGKKEMLLNLEERSERVERTYSHIRSSGARIHLLLQENLHLFKA 853

  Fly   871 VDDEMSAEWIAYVNDMDDMLASSLMTSARGSLNKLYEALHCDADMASAPIIVVESDVKDGRIVFT 935
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Zfish   854 --DPSSPQWKIYVDYVDEMVIDGFFNAIESTLKFFME--NTDADAGLEPLFEAQLRLQVPDLVFQ 914

  Fly   936 PDM-----DAIGDMINGIVDSIRSMLDQFPRLGYKLKLPKKQ-QRQGFASVFREDQECSELMRSI 994
            |.:     |::.:::.|::..:.......|||......|..| ..:....:.:..|...:.::.|
Zfish   915 PSLELRSSDSLHELVEGLLRDVFKTSTLVPRLAKHSGFPDYQDDMEDMEELVQTRQHVMQRVKRI 979

  Fly   995 QAEIGIQREELAKY-------ESEWNKNRVLW------QTTEEEFRQRLMSKSRTAGVFEGGIEH 1046
            ..:....|..|.:|       ..|:.:..:|:      |..||.....:.....|...|...::.
Zfish   980 MMKCCEYRNSLERYAYLYVDDRKEFMRQFLLYGHVLTSQEIEEHAEHGVPESPPTLERFRQQVDS 1044

  Fly  1047 YSALADD-------VIFEDAITNVYFILINQNALKSTMLDWIEKWQALNIKMLLDHGSNLMGAVY 1104
            |..|.::       ::||      .::.::..|.||.:|:.::||..:..:.|:||.:|.:..:.
Zfish  1045 YERLYEELQRMEPVMVFE------RWMRVDARAFKSALLNTVKKWSLMFKQHLIDHVTNSLSDLE 1103

  Fly  1105 RYMRRNERNV-MKVP----RTIRETVAAKQLFEKLLKDVPVKQSA----FTPMLELFVLLHKYQV 1160
            .::|..|..: .||.    |.:.|.:.       .|..|..:||:    |.|:.:...||..|:.
Zfish  1104 EFIRLTEAGLGQKVEEGDYRGLVEIMG-------FLMAVKERQSSTDEMFEPLQQTIDLLKTYEQ 1161

  Fly  1161 KLSEETFEQVMGLETAW 1177
            :|.:..::|:..|...|
Zfish  1162 ELPDVVYKQLEVLPEKW 1178

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG9068	NP_611111.1	DHC_N1	212..784	CDD:462457	133/612 (22%)
dnah9	NP_001353479.1	DHC_N1	194..769	CDD:462457	133/612 (22%)
		DHC_N2	1272..1678	CDD:462462
		DYN1	1499..4129	CDD:227570
		AAA_6	1812..2138	CDD:463697
		MT	3047..3390	CDD:463699
		Dynein_C	4167..4462	CDD:465677