Protein Alignment CG9068 and Dnah11

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_611111.1
• Gene: CG9068 / 36817
• FlyBaseID: FBgn0034106
• Length: 1227
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_038934019.1
• Gene: Dnah11 / 117253
• RGDID: 621088
• Length: 4514
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 1373
• Identity: 278/1373 - (20%)
• Similarity: 505/1373 - (36%)
• Gaps: 285/1373 - (20%)

  Fly     3 SSSAVEDEHLTDSDLTDDEERSVEPRQEEIRPETPKPSYSDEELNQLVGYIQRM--SVLSCLDHR 65
            |.|..|||        :|||.....|.:....: |:..:....|.|.:|:.:..  ..|...|||
  Rat    13 SPSEQEDE--------EDEEAEAARRAQRFAVD-PRVRFLGGRLQQALGFPEETWGEYLESEDHR 68

  Fly    66 DWQEGTLDIIRGWLLEVHEPLLTIY-YDRDALAACLGMPSMCVSDLSYFRREPNEIFSVEGFHDE 129
            .        :.|..||...|...:: .....|:|...:|......|.||.::.........|...
  Rat    69 Q--------VLGDFLESSGPASLVFSVAPGLLSASPEIPRDVKHKLVYFAKKMTGSTGESDFSQT 125

  Fly   130 INFGTLTSDVDGCLMELLDRLYVPFF---RNYLEWNATVRNRFCSSMDRFLAFLSGMHH----QI 187
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  Rat   126 VLFGEIPRSLFTHVTAFLDEILVPILSNKNNHESWSCFI----SQDVEHHTEIMKNKMHIFRGKM 186

  Fly   188 SGMSVMYVPFVIKEL-------TAGPV--DRYLVGSLEGIALYWTTQIRTLLADDT----LTVPH 239
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  Rat   187 SRRTHLPIPTIAENIDLDQHYSVTRPQSDERRILHAIESVVIKWSHQIQEIIEKDSAQPLLSGLH 251

  Fly   240 DLVTVRDEFEFWEYRYEVLQGINDQLAHSDVQKVLLLLHNAQSVHMPQMDG--------LIERAR 296
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  Rat   252 P--TPETELDFWTMRHDNLKCIYHQLQAPIVLKMVKILRTRQSSYLPALKGIFTTVENALLEARD 314

  Fly   297 KELHKSLSNIKYLHLLIEPCSKIDAATSPADLTK---LLPRIIHLIRFIWLNSEYYNTTRLIAAL 358
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  Rat   315 VELH------------LRPLRKHIQGLQEADFPQTGILIAPLIHTICLIWSHSKFYNSPARVIVL 367

  Fly   359 FRNLSNQIIRFCTKQTKVEEILSGKPRFGIRICNVAIECCLTYRGIYDTISRDLAQKHT----QM 419
            .:...|..|.........|::|.|:....:....|||.....::..:....|.|....|    |.
  Rat   368 LQEFCNLFIDQARAYLSPEDLLKGEIEDALEKVQVAIGVLRMFQNSFFKYRRGLTSYFTGDTEQR 432

  Fly   420 PWELDEGLIFNHIDAFVERLNDVIDICESMIVFGRLDENGSIPKPVFGGTCGEELEKIAESVEVQ 484
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  Rat   433 PWDFQSHLVFSRFNKFLDRLVKIEDMFVTILEFEKLE------RLEFGGSKGAVLNAQIHSMKEE 491

  Fly   485 FLDTLNKLQQNSQAYILNVHRAD---WYADVAGFRKNMQKLEETVQRLIFNVFQQVSNVEEMLEA 546
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  Rat   492 FIECCNVFRQS----IYDPSDCDSMEFESDYFQFKSKTLDFDRRLGTLLCEGLSNCSGLESAFKL 552

  Fly   547 LQAMLFYSYRQRGTLRKTYLKETSKLWRMFSKEMDATSRKLLEEQSRE-----SWLSKHVSIALG 606
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  Rat   553 L--TIFGNFLEKPVVMEIFSPHYSTLLNMFNAELDMCKR-LYDEHMKQIEHGHEILNKNMPFTSG 614

  Fly   607 ----YRINLERLTWLRDRLKNSEWL-PAVKESSPALAKF---DALRHEFQKEIRLAYDDW---VA 660
                .|:.||||........:..:| |...:.:....|:   ..|..:|:..|   |.:|   |.
  Rat   615 NIKWARMLLERLQMFWSNFTSLHYLFPDSPDEAAVCQKYAEMTTLLDQFESRI---YSEWRRNVD 676

  Fly   661 KCCGFSGDLCQRLDRYLVVRSKKFKGLLECNIDASVLELCEQAQHFERMGFA-IPSTMKKLYERY 724
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  Rat   677 KTCEF--NLNQPL-----VKFSPINGLLSVNFDPKLVAVLREVKYLLMLKKSNIPDSALGIFQKK 734

  Fly   725 DTIRSLYNGIIKLALSHNRILAVLSDRERKLFRPLIQACDRQLAPGVFKITYGSEFNEEFFEDGT 789
            :.|......:..|...:|::...|.:.|..|....:.|.|.||......:|:..:|
  Rat   735 NIILKHIGNLELLVQGYNKLKQTLLEVEYPLIEKELGAIDEQLRVAATWLTWQDDF--------- 790

  Fly   790 EFIAEFQELVLIFKRANRGVARICEKICGTCLLHFAFSGSVDISVFQQQLSS------------- 841
                     .:..::.....|.:..::..|         ..::...||.:.:
  Rat   791 ---------WVYMEKVQVATAELERRVSQT---------QSNVQTIQQTMQAWAEWPLLPRRETR 837

  Fly   842 -----RLSSSGDILRSYYSHVVE-------LLSAFSGQFQSVDDEMSAEWIAYVNDMDDMLASSL 894
                 .|...||:....|..:.|       |:......|::  |.....|..||..:||::....
  Rat   838 REAALTLDDKGDLFAKKYKLIREDGYKIHNLVEENRKLFRA--DPSLDSWKIYVEFIDDIVVEGF 900

  Fly   895 MTSARGSLNKLYEALHCDADMASAPIIVVESDVKDGRIVFTPDMD-AIGDMINGIVDSIRSML-- 956
            ..:....|:  :...:.:..:..||....:..:....|||.|.:: ..||   |..:.:.:||
  Rat   901 FQTILHDLD--FFLRNTEKQLKPAPFFQAQMLLMPPEIVFKPPLEREAGD---GFYNLVEAMLCG 960

  Fly   957 -----DQFPRLGYKLKLPKKQQRQ----GFASVFREDQECSELMRSIQAEIGIQREELAKYESEW 1012
                 .|..|:...|.:|..|...    |.|.|   .||....:..:..::...|..|..|...|
  Rat   961 SFKVSAQMGRVAAHLDIPDYQNDMDNMLGLAEV---RQEIMNRVADVIDKVLEFRSSLETYSYLW 1022

  Fly  1013 NKNRVLWQTTEEEFRQRLM------------------SKSRTAGVFEGGIEHYSALADDVI-FED 1058
            ..:||      |..||.|:                  .:|.|...|:..|:.|.||...:. |:|
  Rat  1023 VDDRV------EILRQFLLYGHAVPSEEIDAPAGEDILQSPTLEQFKEQIDIYEALYVQMSKFDD 1081

  Fly  1059 -AITNVYFILINQNALKSTMLDWIEKW----QALNIKMLLDHGSNLMGAVYRYMRRNERNVMKVP 1118
             .:.|.:| .|:....|.:||:.|:||    |...::.::|..|.|.|    ::::....:.:.|
  Rat  1082 FRVFNSWF-KIDMRPFKLSMLNVIKKWSWMFQEHLLRFVVDSLSELQG----FIKQTNAGLQRQP 1141

  Fly  1119 R---------------TIRETV-AAKQLFEKLLKDVPVKQSAFTPMLELFVLLHKYQVKLSEETF 1167
            .               .:|... |..:|||              |:.|..:||..|..|:.|:.:
  Rat  1142 HEGDHDGLVDIMGHLLAVRSRQRATDELFE--------------PLKETIMLLESYGQKMPEQVY 1192

  Fly  1168 EQVMGLETAW----------LHYLQVLEEADEMLDNEDSEAKLLLAKHGEKFKLILKD-----FL 1217
            .|:..|...|          .|.:..|:.|         |..||      :.|.||.|     |.
  Rat  1193 AQLEELPERWETTKKIAAVVRHEVSPLQNA---------EVTLL------RKKCILFDEKQAEFR 1242

  Fly  1218 EDFYSKLP 1225
            |.|.|..|
  Rat  1243 ERFRSYAP 1250

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG9068	NP_611111.1	DHC_N1	212..784	CDD:462457	134/610 (22%)
Dnah11	XP_038934019.1	DHC_N1	220..791	CDD:462457	134/625 (21%)
		DHC_N2	1296..1722	CDD:462462
		DYN1	1550..4164	CDD:227570
		AAA_6	1862..2188	CDD:463697
		MT	3095..3439	CDD:463699
		Dynein_C	4217..4512	CDD:465677