Protein Alignment CG9068 and dnah11

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_611111.1
• Gene: CG9068 / 36817
• FlyBaseID: FBgn0034106
• Length: 1227
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_031759446.1
• Gene: dnah11 / 100494270
• XenbaseID: XB-GENE-950720
• Length: 4472
• Species: Xenopus tropicalis
• Alignment Length: 1301
• Identity: 260/1301 - (19%)
• Similarity: 496/1301 - (38%)
• Gaps: 260/1301 - (19%)

  Fly    19 DDEERSVEPRQEEIRPETPKPSYSDEELNQLVGYIQRMSVLSCLDHRDW-----QEGTLDIIRGW 78
            :|||..|.|..|::|.             |.:|  .|:..:..:....|     .|....|||.:
 Frog     5 EDEEAPVPPFWEDVRV-------------QFMG--DRIQQMMKIKTDKWIKFVEDETNEKIIRDF 54

  Fly    79 L-LEVHEPLLTIYYDRDALAACLGMPSMCVSDLSYFRREPNEIFSVEGFHDEINFGTLTSDVDGC 142
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 Frog    55 FELGDHVTLVFSIGPNGILTASKEITMNTKSKTVYIRKKKPANIGMENYKTDLMFGELACASINQ 119

  Fly   143 LMELLDRLYVPFF---RNYLEWNATVRNRFCS-SMDRFLAFLSGMHH----QISGMSVMYVPFV- 198
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 Frog   120 TSALVEEVLVPILSNKKNHLSW-----PQFTSLDMDQHVEYMKNKMHVIQGLISGKTHLPIPTVA 179

  Fly   199 --------IKELTAGPVDRYLVGSLEGIALYWTTQIRTLLADDTLTV--------PHDLVTVRDE 247
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 Frog   180 TITEQNLNVTSNKENHVQRAALHAFESILIKWSYQIVEVLERDSSQPLLQGLDPGPH------AE 238

  Fly   248 FEFWEYRYEVLQGINDQLAHSDVQKVLLLLHNAQSVHMPQMDGLIERARK--------ELHKSLS 304
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 Frog   239 LKFWKERRDNLTCIYEQLQAPAVQKMASILQDTESAYYPTFTNIVCEVKKALIEAEDIDLH--LS 301

  Fly   305 NIK-YLHLLIEPCSKIDAATSPADLTKLLPRIIHLIRFIWLNSEYYNTTRLIAALFRNLSNQIIR 368
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 Frog   302 TLRNHIKLLEE--------TDFPQIYILLPPLLHTICLIWAHSKCYNIPARVIVLLQEFCNLLIE 358

  Fly   369 FCTKQTKVEEILSGKPRFGIRICNVAIECCLTYRGIYDTISRDLAQKHTQ----MPWELDEGLIF 429
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 Frog   359 QAKTYLSPEDLFKAEPEESLEHVQAALKVLQSFKHAFFTHRASLQTYYTDRTQFKAWDFRSEMVF 423

  Fly   430 NHIDAFVERLNDVIDICESMIVFGRLDENGSIPKPVFGGTCGEELEKIAESVEVQFLD------- 487
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 Frog   424 AKFDRFLERLLKIEDIFVIMLEFQKLE------KLEFGGKKGKALNEKIFNLNEEFQDNSKVFKE 482

  Fly   488 -TLNKLQQNSQAYILNVHRADWYADVAGFRKNMQKLEETVQRLIFNVFQQVSNVEEMLEALQAM- 550
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 Frog   483 STLDPTDRNNKEF------EQEYSD---FKAKVLDCDTRIASLLSEAFNDSSGLESAFKLLAICG 538

  Fly   551 LFYSYRQRGTLRKTYLKETSKLWRMFSKEMDATSRKLLEEQSRESWLSKHVSIALGYRIN----- 610
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 Frog   539 LFL---ERSVILDIFSPNYFTLLQMYDKELDRC--KLLYD--------AHVKQLENYAVHRNMPA 590

  Fly   611 ----LERLTWLRDRLK----NSEWLPAVKESSPALAKFDALRHEFQKEIRL----------AYDD 657
                |:....::||::    |..::..:...||..:..      :||.:.:          .|:.
 Frog   591 VAGTLKFTREIKDRIQISWSNFRFIHHLSMESPEASSV------YQKYMEMMTLLDQYEDSVYEK 649

  Fly   658 WVAKC---CGFSGDLCQRLDRYLVVRSKKFKGLLECNIDASVLELCEQAQHFERMGFA-IPSTMK 718
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 Frog   650 WTSKVDEECEFN------LDRPLLVRNND-DGLLSVNFDPKLIAVLREVRYLQKQSQADIPKEAL 707

  Fly   719 KLYERYDTIRSLYNGIIKLALSHNRILAVLSDRERKLFRPLIQACDRQLAPGVFKITYGSEFNEE 783
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 Frog   708 AIFDKREMLHKYIASLDQLVFWYNKLKRTVLEVEYPLIKDDLKNIDEQLRESEERYTWKD----- 767

  Fly   784 FFEDGTEFIAEFQELVL-IFKRANRGVARI--CEKICGTCLLHFAFSGSVDISVFQQQLSSRLSS 845
              ::..::|.:.:.:|. :.||.......|  .::|.......:.||...:    :::....|..
 Frog   768 --DNCWDYIVKVKSVVQDLEKRVQTSKDNIITMQQIMKVWAEQWLFSRKDN----RKETLINLDD 826

  Fly   846 SGDILRSYYSHV--------------VELLSAFSGQFQSVDDEMSAEWIAYVNDMDDMLASSLMT 896
            ..:|:...|..:              :|||.|..|    :|     .|..||..:|.::...|..
 Frog   827 KNEIVNKKYQTIQEDSVKIQSLAMENMELLKATPG----LD-----SWKMYVEYIDTIVTDGLYN 882

  Fly   897 SARGSLNKLYEALHCDADMASAPIIVVESDVKDGRIVFTP-----DMDAIGDMINGIVDSIRSML 956
            :...||....|  :.|..:..||:...:..:....|:|.|     |.|.:.|::..::..|..|.
 Frog   883 TILHSLTFFME--NTDVRLKPAPLFEAQMILASTEIIFKPSLQKEDGDGLYDLVEEMLSDIFKMS 945

  Fly   957 DQFPRLGYKLKLPKKQQRQGFASVFREDQECSELMRSIQAEIGIQRE-----ELAKYESEWNKNR 1016
            .|..|:...|:...          ::.|.:....:.:|:.|| ::|.     ::..|.|.::...
 Frog   946 GQVKRIAKHLETDN----------YQNDMDDMTDLAAIRQEI-MERVTGVIIKVTDYRSTYDSYS 999

  Fly  1017 VLWQTTEEEFRQRLMSKSRTAGVFEGGI---EHYSALADDVIFE------------DAITNVYFI 1066
            .||....:||.::.:        ..|.:   :...|.|||.:.|            |...|:|.:
 Frog  1000 YLWTDDRQEFMRQFL--------LYGHVLTSDEIEAHADDGVPETPPTIDQFKEQIDIFENLYVL 1056

  Fly  1067 L--------------INQNALKSTMLDWIEKWQALNIKMLLDHGSNLMGAVYRYMRRNERNVMKV 1117
            :              ::....|:::|..|:||..:..:.|:....:.:..:..:::  |.|.:.:
 Frog  1057 MSSSDDTKVFERWFRVDIKPFKTSLLVIIKKWSWMFKEHLVRFVIDSLAELEEFIK--EANAILL 1119

  Fly  1118 PRTIRETVAAKQLFEKLLKDVPVKQSA----FTPMLELFVLLHKYQVKLSEETFEQVMGLETAWL 1178
            .:......:|.....:||..|..:|.|    |.|:.:...||..|..||.::.:.|:..|...|.
 Frog  1120 KKVPEGDYSALVAVMELLLAVRDRQMATDELFEPLKQTISLLESYGQKLPDQIYVQLEELPEKWN 1184

  Fly  1179 H 1179
            |
 Frog  1185 H 1185

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG9068	NP_611111.1	DHC_N1	212..784	CDD:462457	131/628 (21%)
dnah11	XP_031759446.1	DHC_N1	201..773	CDD:462457	131/635 (21%)
		DYN1	1276..4128	CDD:227570
		DHC_N2	1277..1684	CDD:462462
		AAA_6	1818..2144	CDD:463697
		AAA_8	2780..3039	CDD:463701
		MT	3052..3396	CDD:463699
		Dynein_C	4175..4470	CDD:465677