Protein Alignment CG9068 and dync2h1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_611111.1
• Gene: CG9068 / 36817
• FlyBaseID: FBgn0034106
• Length: 1227
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001410228.1
• Gene: dync2h1 / 100332402
• ZFINID: ZDB-GENE-100217-1
• Length: 4299
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1285
• Identity: 226/1285 - (17%)
• Similarity: 427/1285 - (33%)
• Gaps: 432/1285 - (33%)

  Fly    90 YYDRDALAACLGMPSMCVSDLSYFRREPNE-IFSVEGFHDEINFGTLTSDVDGCLMELLDRLYVP 153
            |:..|..|:.    |.| ..|..|..:.|| :.||....:|:.|.....::||      |...:.
Zfish    20 YFSLDTAASL----SSC-RPLDNFLDDGNEFLLSVTRQSEELQFSNKLENMDG------DGRVLV 73

  Fly   154 FFRNYLEWNATVRNRFC----SSMDRFLAFLSGMHHQIS----GMSVMYVPFVIKELTAGPVDRY 210
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Zfish    74 FFKPHP----------CVVSEENLQRCILVSSMLESPISTLYQALRQVYSPVLLQD------DKW 122

  Fly   211 LVGSLEGIALYWTTQIRTLLAD------------DT----------LTVPHDLVTVRDEFEFWEY 253
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Zfish   123 --------SQSFDSKLQSLLSDLEIGLGSVLRHSDTKGSGKRSNSEMDV-SNIMTPLDEFSFW-- 176

  Fly   254 RYEVLQGINDQLAHSDV----QKVLLLLHNAQSVHMPQMDGLIERARKELHKSLSNIKYLHLLIE 314
                          :||    ||   .....::.|..::...||:....| .|.|.::.|.|:..
Zfish   177 --------------ADVSRSGQK---SSERDRATHFCELFTTIEKDYSNL-DSFSLVEVLDLIEN 223

  Fly   315 PCSKIDAATSPADLTKLLPRIIHLIRFIWLNSEY--YNTTRLIAALFRNLSNQIIRFCTKQTK-- 375
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Zfish   224 TREAVDD--------------------VWKQNEHTPYPETRMI-RLMDVIGGALGRFVQRKLSDL 267

  Fly   376 ---------VEEILSGKPRFGIRICNVAIECCLTYRGIYDTISRDLAQKHTQMPW----ELDEGL 427
                     |.|.|.|    |:.:|...:..|       :.::..:.:::....|    ...:||
Zfish   268 RLWEDPYFTVREGLKG----GVAVCEQWVAAC-------EHLTGQVWKRYAPHQWTGEKHRPQGL 321

  Fly   428 IFNHIDAFVERLNDVI---DICESMIVFGRLDENGSIPKPVFGGTCGEELEKIAESVEVQFLDTL 489
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Zfish   322 -----HSLAQRLEEVVQVRSVCEKL---QRLLSGGK--------------QQISAARVYQPFTGL 364

  Fly   490 NKLQQNSQAYILNVHRADWYADVAGFRKNMQKLEETVQRLIFNVFQQVSNVEEMLEALQAMLFYS 554
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Zfish   365 NPIHYNPYTEPL------WRAAVSQF-----------DRLIAPAEQEAA---------------- 396

  Fly   555 YRQRGTLRKTYLKET----SKLWRMFSKEMDATSRKLLEEQ---SRESWLSKHVSIALGYRINLE 612
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Zfish   397 ----GKL-KTFIIDAQDSPQQLLQVFQKHRDLIKRATISKELQPERETLLTRLLDYNKGLRADFE 456

  Fly   613 ------------------------RLTWLR-------DRLKNSEWLPAVKESSPALAKF-DALRH 645
                                    .:.|:|       |.||.::.|.:.......|.:| |.|:.
Zfish   457 SRCHGTPGEKTGPLAGRNLPEVVNNIVWVRQLLLKVEDSLKMADALLSDLSGFQPLLRFSDDLQE 521

  Fly   646 EFQKEIRLAYDDWVAKCCG-----FSGDLCQRLDRYLVVRSKKFKGLLECNIDASVLELCEQAQH 705
            :.:...:..::||......     .||...|..:|  |:......|.|:......::.|..:.:.
Zfish   522 QLRSYEQEQFEDWTRDLLSGLSDPKSGISLQASNR--VMELDHMDGKLKIQYSDRLVSLLREVRQ 584

  Fly   706 FERMGFAIPSTMKKLYERYDTIRSLYNGII---KLALSHNRILAVLSDRERKLF---RPLIQACD 764
            ...:||.||:   |:.:..:|....|...|   ::|..:|.|       ::::.   ||::..|
Zfish   585 LSALGFTIPA---KIQQAANTAEKFYRQAIILKQVAHFYNTI-------DQQMIPSQRPMMLGC- 638

  Fly   765 RQLA-PGVFKITYGSEFNEE------FFEDGTE---FIAEFQELVLIFKRANRGVAR----ICEK 815
             .|| ..|.|....|:..:|      .:|:..|   :|::.|.........||.:.:    ..:|
Zfish   639 -ALAFEQVIKQNPRSQSRDEGGKLQMTWENPKELEQYISKLQSAAERLSTENRKLRKWHTDFTDK 702

  Fly   816 ICGTCLLHFAFSGSVDISVFQQQ--------------LSSRLSSSGDI--LRSYYSHVVELLSAF 864
            :.|..        .||:...||:              |.|:...:||:  .|.:::|  :|..|.
Zfish   703 VVGLM--------GVDLLRQQQRWKDGLQDLRAGFATLESQGFGAGDMRAWRQHWNH--QLYKAL 757

  Fly   865 SGQFQSVDDEMSAEWIAYVNDMDDMLASSLMTSARGSLNKLYEALHCDADMASAPIIVVESDVKD 929
            ..|:|     :..|                      :|||            :.|.|.::...|.
Zfish   758 EHQYQ-----VGLE----------------------ALNK------------NLPEINIDLVFKQ 783

  Fly   930 GRIVFTPDMDAIGDMINGIVDSIRSMLDQFPRLGYKLKLP-----KKQQRQGFASVFREDQ---- 985
            ||:.|.|..:.:.......:....|:.:||..:....:.|     .::...||.::|.:.:
Zfish   784 GRLQFRPAFEEVRAKYYREMKRFISIPNQFKGVSETGEEPIFTRMIERNASGFLTIFSKAEHLFS 848

  Fly   986 ECSELMRSI-------QAEIGIQREELAKYESEWNKNRVLWQTTEEEFRQRLMSKSRTAGVFEGG 1043
            ..|.|:...       |.::.:..|:......:|.:|....:...:| .:||.|..:.
Zfish   849 RLSHLLDKFKDWVVVGQVDVEVLVEKHLHSVQDWERNFKALKAKGKE-AERLPSSEKV------- 905

  Fly  1044 IEHYSALADDVIFEDAITNVYFILINQNALKSTMLDWIEKWQALNIKMLLDHGSNLMGAVYRYMR 1108
                          |.||      :|...::.::.|.|::               |..|:...:|
Zfish   906 --------------DCIT------VNCEPVRVSVDDLIQR---------------LFDALLASLR 935

  Fly  1109 RNERNVMKV---------------PRTIRETVAAKQLFEKLLKDVPVKQSAFTPMLELFVLLHKY 1158
            |:.:..::|               |.:|.|...|.....:|....|.....|....|...||.
Zfish   936 RSIQGHIQVIDSFVNGAMETLSLRPESIDEIGEANAKHSQLQTQKPEVLPQFQQAEEKNRLLR-- 998

  Fly  1159 QVKLSEETFEQVMGLETAW--------LHYLQVLEEADEMLDNEDSEAKL 1200
              .::....:.:..|...|        .|.|.:.|:.:.|..|.:|..::
Zfish   999 --SVAGGGLDTISSLRAKWDKFELMMESHQLMIREQVEVMKGNVESRVQV 1046

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG9068	NP_611111.1	DHC_N1	212..784	CDD:462457	121/674 (18%)
dync2h1	NP_001410228.1	DHC_N1	<231..648	CDD:462457	93/502 (19%)
		DHC_N2	1118..1518	CDD:462462
		DYN1	1321..4008	CDD:227570
		AAA_6	1647..1980	CDD:463697
		Dynein_C	4003..4296	CDD:465677