DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ITGA9 and Itga9

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_002198.2 Gene:ITGA9 / 3680 HGNCID:6145 Length:1035 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001406931.1 Gene:Itga9 / 685004 RGDID:1311191 Length:1036 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1036 Identity:934/1036 - (90%)
Similarity:980/1036 - (94%) Gaps:1/1036 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MGGPAAP-RGAGRLRALLLALVVAGIPAGAYNLDPQRPVHFQGPADSFFGYAVLEHFHDNTRWVL 64
            ||||||. .|||.|||||||||.||:||||||:|.||||.||||..|||||||||||||||||||
  Rat     1 MGGPAAKGTGAGGLRALLLALVAAGVPAGAYNIDAQRPVRFQGPPGSFFGYAVLEHFHDNTRWVL 65

Human    65 VGAPKADSKYSPSVKSPGAVFKCRVHTNPDRRCTELDMARGKNRGTSCGKTCREDRDDEWMGVSL 129
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.:|||.|||||||.|||||||||||
  Rat    66 VGAPKADSKYSTSVKSPGAVFKCRVHTNPDRRCTELDMARERNRGESCGKTCRGDRDDEWMGVSL 130

Human   130 ARQPKADGRVLACAHRWKNIYYEADHILPHGFCYIIPSNLQAKGRTLIPCYEEYKKKYGEEHGSC 194
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||:||||||||||.|||||||||||||||||||
  Rat   131 ARQPKADGRVLACAHRWKNIYYETDHILPHGFCYLIPSNLQAKGRMLIPCYEEYKKKYGEEHGSC 195

Human   195 QAGIAGFFTEELVVMGAPGSFYWAGTIKVLNLTDNTYLKLNDEVIMNRRYTYLGYAVTAGHFSHP 259
            |||||||||||||:||||||||||||:||||||||||.||||:.|||||||||||||||||||||
  Rat   196 QAGIAGFFTEELVIMGAPGSFYWAGTLKVLNLTDNTYFKLNDDAIMNRRYTYLGYAVTAGHFSHP 260

Human   260 STIDVVGGAPQDKGIGKVYIFRADRRSGTLIKIFQASGKKMGSYFGSSLCAVDLNGDGLSDLLVG 324
            |..|||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
  Rat   261 SVTDVVGGAPQDEGIGKVYIFRADRRSGTLIKIFQASGKKMGSYFGSSLCAVDLNMDGLSDLLVG 325

Human   325 APMFSEIRDEGQVTVYINRGNGALEEQLALTGDGAYNAHFGESIASLDDLDNDGFPDVAIGAPKE 389
            ||||||||||||||||:|:|:|.|||||.||||.|||||||||||||.|||:|||||||:|||.|
  Rat   326 APMFSEIRDEGQVTVYLNQGHGVLEEQLTLTGDAAYNAHFGESIASLGDLDDDGFPDVAVGAPME 390

Human   390 DDFAGAVYIYHGDAGGIVPQYSMKLSGQKINPVLRMFGQSISGGIDMDGNGYPDVTVGAFMSDSV 454
            |||||.||||||||.||||||||||||:||||:|:|||||||||||||||||||||||||:||||
  Rat   391 DDFAGTVYIYHGDAQGIVPQYSMKLSGRKINPILQMFGQSISGGIDMDGNGYPDVTVGAFLSDSV 455

Human   455 VLLRARPVITVDVSIFLPGSINITAPQCHDGQQPVNCLNVTTCFSFHGKHVPGEIGLNYVLMADV 519
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||:|||||||||.|.|||
  Rat   456 VLLRARPVITVDVSIFLPGSINITAPQCHDGQQPVNCLNVTVCFRFHGKNVPGEIGLNYNLTADV 520

Human   520 AKKEKGQMPRVYFVLLGETMGQVTEKLQLTYMEETCRHYVAHVKRRVQDVISPIVFEAAYSLSEH 584
            |:|||||:|||||||||||.|||:|:||||:|:|.|.|||||||||||||||||||||||||.||
  Rat   521 AQKEKGQLPRVYFVLLGETAGQVSERLQLTHMDEVCHHYVAHVKRRVQDVISPIVFEAAYSLGEH 585

Human   585 VTGEEERELPPLTPVLRWKKGQKIAQKNQTVFERNCRSEDCAADLQLQGKLLLSSMDEKTLYLAL 649
            |.|||:||||.|||||||||||:||||||||||||||||||||||||:|||||||:||||.:|||
  Rat   586 VIGEEDRELPDLTPVLRWKKGQRIAQKNQTVFERNCRSEDCAADLQLRGKLLLSSVDEKTTHLAL 650

Human   650 GAVKNISLNISISNLGDDAYDANVSFNVSRELFFINMWQKEEMGISCELLESDFLKCSVGFPFMR 714
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   651 GAVKNISLNISISNLGDDAYDANVSFNVSRELFFINMWQKEEMGISCELLESDFLKCSVGFPFMR 715

Human   715 SKSKYEFSVIFDTSHLSGEEEVLSFIVTAQSGNTERSESLHDNTLVLMVPLMHEVDTSITGIMSP 779
            |||||||||||||||||||||:|||||||||||.||||:||||||.|.:||:||||||||||:||
  Rat   716 SKSKYEFSVIFDTSHLSGEEEILSFIVTAQSGNMERSEALHDNTLTLTIPLVHEVDTSITGIVSP 780

Human   780 TSFVYGESVDAANFIQLDDLECHFQPINITLQVYNTGPSTLPGSSVSISFPNRLSSGGAEMFHVQ 844
            |||||||||||:|||||||.||||||:||||||||.|||||||||||||||:|||.||||||.||
  Rat   781 TSFVYGESVDASNFIQLDDQECHFQPVNITLQVYNMGPSTLPGSSVSISFPSRLSPGGAEMFQVQ 845

Human   845 EMVVGQEKGNCSFQKNPTPCIIPQEQENIFHTIFAFFTKSGRKVLDCEKPGISCLTAHCNFSALA 909
            :|||.|||||||.|:||||||||||||||||||||||:|||||||||||.|..|||.|||.|||.
  Rat   846 DMVVSQEKGNCSLQRNPTPCIIPQEQENIFHTIFAFFSKSGRKVLDCEKTGSFCLTLHCNLSALP 910

Human   910 KEESRTIDIYMLLNTEILKKDSSSVIQFMSRAKVKVDPALRVVEIAHGNPEEVTVVFEALHNLEP 974
            |||||.||:||||||||||||||||||||:||||||:|||||||||:|||||..|||||||||||
  Rat   911 KEESRAIDLYMLLNTEILKKDSSSVIQFMARAKVKVEPALRVVEIANGNPEETLVVFEALHNLEP 975

Human   975 RGYVVGWIIAISLLVGILIFLLLAVLLWKMGFFRRRYKEIIEAEKNRKENEDSWDWVQKNQ 1035
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||::||||||||
  Rat   976 RGYVVGWIIAISLLVGILIFLLLAVLLWKMGFFRRRYKEIIEAEKNRKENEEAWDWVQKNQ 1036

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ITGA9NP_002198.2 FG-GAP 1. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00803 35..96 56/60 (93%)
Int_alpha 44..101 CDD:214549 53/56 (95%)
FG-GAP 2. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00803 111..174 59/62 (95%)
FG-GAP 3. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00803 182..232 47/49 (96%)
FG-GAP 4. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00803 233..289 50/55 (91%)
Int_alpha 244..294 CDD:214549 46/49 (94%)
FG-GAP 5. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00803 290..349 53/58 (91%)
Int_alpha 300..347 CDD:214549 42/46 (91%)
FG-GAP 6. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00803 351..408 48/56 (86%)
Int_alpha 361..414 CDD:214549 46/52 (88%)
FG-GAP 7. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00803 411..474 58/62 (94%)
Int_alpha 425..>466 CDD:214549 39/40 (98%)
Integrin_alpha2 460..903 CDD:462478 395/442 (89%)
GFFKR motif 1005..1009 3/3 (100%)
Itga9NP_001406931.1 Int_alpha 45..102 CDD:214549 53/56 (95%)
Int_alpha 245..295 CDD:214549 46/49 (94%)
Int_alpha 301..347 CDD:214549 42/45 (93%)
Int_alpha 362..415 CDD:214549 46/52 (88%)
Int_alpha 425..>467 CDD:214549 39/41 (95%)
Integrin_alpha2 461..904 CDD:462478 395/442 (89%)

Return to query results.
Submit another query.