DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Ptp52F and Ptprd

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_611093.2 Gene:Ptp52F / 36790 FlyBaseID:FBgn0034085 Length:1433 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_063144608.1 Gene:Ptprd / 313278 RGDID:1561090 Length:1938 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1450 Identity:329/1450 - (22%)
Similarity:546/1450 - (37%) Gaps:368/1450 - (25%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   129 PKTTVTSVV--ATANTIKVTWQTNDRACVESFGITAKATDYTKSFQLLNDKSSQTF--VNLSACL 189
            ||...|.||  :||.:|.:||.:.:...|..:.|..|..:..:.::.::..::..:  ..||...
  Rat   330 PKPPGTPVVTESTATSITLTWDSGNPEPVSYYIIQHKPKNSEEPYKEIDGIATTRYSVAGLSPYS 394

  Fly   190 THTITLDTRNN-----ASVVVDTDATDVDTQYAEPGDLVMNVTNLASGITMITWGDPSEKN-CIS 248
            .:...:...||     ||..|.|. |......:.|.|:...:  |:|...::.|.:|.|.| .|.
  Rat   395 DYEFRVVAVNNIGRGPASEPVLTQ-TSEQAPSSAPRDVQARM--LSSTTILVQWKEPEEPNGQIQ 456

  Fly   249 NY-----------VFKWQRNDCGTDQNQDTT-----------------TDVPSTETTNEIDYVTT 285
            .|           |..|.:::..  .:|.||                 |.:.....:::|..:|.
  Rat   457 GYRVYYTMDPTQHVNNWMKHNVA--DSQITTIGNLVPQKTYSVKVLAFTSIGDGPLSSDIQVITQ 519

  Fly   286 T-----PMETTPDTPSD-EVKCEWTD-----------VSSDGKLRE-----------YLLTDLQG 322
            |     |:....:..|: .:...||.           |..||...|           |.|..|:.
  Rat   520 TGVPGQPLNFKAEPESETSILLSWTPPRSDTIASYELVYRDGDQGEEQRITIEPGTSYRLQGLKP 584

  Fly   323 CDLYTFQVFINENSTAKASQTFTSAEKLVSA-VYEPSPTAYPTQLHWT----------WFSP--Q 374
            ..||.|::      :|::.|...::...:|| ..:..|:|.|..:..|          |..|  :
  Rat   585 NSLYYFRL------SARSPQGLGASTAEISARTMQSKPSAPPQDISCTSPSSTSILVSWQPPPVE 643

  Fly   375 NHPKCVANYSV---TLTGPIQRSENKTMNVITEETFAIFDDLDPCGIYLVEIVPNQLNGSAGTKY 436
            .....:..||:   .:.|...| .::.:.:.::.|..:.:.|:....|.:.:..:...|......
  Rat   644 KQNGIITEYSLKYAAVDGEDYR-PHEILGIPSDTTKYLLEQLEKWTEYRITVTAHTDVGPGPESL 707

  Fly   437 QEQSTVGEDQPSVIQDPV-VEA-EAYSMEVSWKTP----EYADLCIDGYRL-------------- 481
            .......||.||.....| ||| .|.:::|||::|    ::..  |.||::              
  Rat   708 SVLIRTDEDVPSGPPRKVEVEAVNATAVKVSWRSPVPNKQHGQ--IRGYQVHYVKMENGEPKGQP 770

  Fly   482 ---------SGWMEDDKLVEVEALSITTQNTTVVFDKNLLACQVYIIQIIPYTKENLDGQLRQVG 537
                     :.|..||          .|::..::  ..|.....|.:.:..||.:....:.:...
  Rat   771 MLKDVMLADAQWEFDD----------ATEHDMII--SGLQPETSYSLTVTAYTTKGDGARSKPKL 823

  Fly   538 VETKAA-------IVDYTKVKLEMKNAGSEFIDLIAFNADYNNSCPTIFALFTCNATTQVRNPYA 595
            |.|..|       ::::|    :|..|      ||.::...:...|                   
  Rat   824 VSTTGAVPGRPRLVINHT----QMNTA------LIQWHPPVDTFGP------------------- 859

  Fly   596 ERYVEGHSKQGFNASLSPLSPY-----------------ATYVCKVILYNVAGPSEPVV---DAD 640
               ::|:..:.....:.||:..                 |:|:.::...|..|..|.:|   ...
  Rat   860 ---LQGYRLKFGRKDMEPLTTLEFSEKEDHFTATDIHKGASYIFRLSARNKVGFGEEMVKEISVP 921

  Fly   641 MHTTTYFPEQPESVMLEKSTVSSLLFNWQPPTYT--NGPIKYYQAFLMRHEASYFVPADCAIVEQ 703
            ....|.||:...|   |.:|.:|:..:||||...  ||.|..| ..|.|......:|.:..||..
  Rat   922 EEVPTGFPQNLHS---EGTTSTSVQISWQPPVLAERNGVITKY-TLLYRDINVPLLPMEHLIVPA 982

  Fly   704 DTKSETKGDPSVNFTGLAPAVRYMMQVAAQNDFGMGVYTEPVIGITLPAVSDSVTQLTVLTQGPV 768
            ||        |:..|||.....|.::|.|....|.|.|:..|...|||     |.|........|
  Rat   983 DT--------SMTLTGLKSDTTYDVKVRAHTSKGPGPYSPSVQFRTLP-----VDQAVFAKNFHV 1034

  Fly   769 NNNAVYEANVTITWKVPCKSNGDIEYFQLAFNG----------TRN---NFAPVSFERRVELDTG 820
              .||.:.:|.::|::|...|..:.:..|..:|          |:.   |..|......|..:.|
  Rat  1035 --KAVMKTSVLLSWEIPENYNSAMPFKILYDDGKMVEEVDGRATQKLIVNLKPEKSYSFVLTNRG 1097

  Fly   821 NKQGRMSYTET--------EMQPQF----DYTVEVSVKNRDVEQLSSSVPG-------------- 859
            |..|.:.:..|        ..:|.|    :....::|:..|| ..:.::.|              
  Rat  1098 NSAGGLQHRVTAKTAPDVLRTKPAFIGKTNLDGMITVQLPDV-PANENIKGYYIIIVPLKKSRGK 1161

  Fly   860 ---SWQSPAGLPTIPSDELIKQM---RANVEETSNPTKTAIVRLPADIMTS--ASGDIKWMALMI 916
               .|:||   ..:..|||:|::   |.::...........:....|::.:  ..||.|......
  Rat  1162 FIKPWESP---DEMELDELLKEISRKRRSIRYGREVELKPYIAAHFDVLPTEFTLGDDKHYGGFT 1223

  Fly   917 SQKNCAGVPHLKYDVSSDWPKVLSYQEAGADGTGDCSLEYQTTEERWHPEPVQRQRRDGEVTSDE 981
            :::..:|..::.:.::     |:.:.|         |..|.|:.   :.:||.....|.:..:||
  Rat  1224 NKQLQSGQEYVFFVLA-----VMDHAE---------SKMYATSP---YSDPVVSMDLDPQPITDE 1271

  Fly   982 E------------------IVFTIGLDKC--------SEVQKTYC-NGPLLPD---TDYNVVVRL 1016
            |                  ||..|.|.|.        ||.:|:.. |...:|.   ||...:.||
  Rat  1272 EEGLIWVVGPVLAVVFIICIVIAILLYKSKPDRKRAESESRKSSLPNSKEVPSHHPTDPVELRRL 1336

  Fly  1017 -FTASGYSDAAV---LNFKTKAAIKVTLILVSVCSCLLLAFVLGLTVLWVRKRLAWKRDSGQGIE 1077
             |...|..|:..   |:|.:.|:.....||                            :....||
  Rat  1337 NFQTPGSDDSGYPGNLHFSSMASHPPIPIL----------------------------ELADHIE 1373

  Fly  1078 DPFGNVIAKNFAIFYTEVAKPEKLAREFKEITVVALELSYSASELGCHKNRYADIFPYDKNRVIL 1142
            ....|...| |:..|..:...::...|            :|..|:...|||||::..||.:||:|
  Rat  1374 RLKANDNLK-FSQEYESIDPGQQFTWE------------HSNLEVNKPKNRYANVIAYDHSRVLL 1425

  Fly  1143 DI--DAEGSDYINASFIDGHTRKKEYIATQGPKPESVMDFWRMILQYNVRVIVQVTQFREGNTIK 1205
            ..  ...||||:||::|||:.::..||||||..||:..||||||.:.....:|.:|:..|.:.:|
  Rat  1426 SAIEGIPGSDYVNANYIDGYRKQNAYIATQGSLPETFGDFWRMIWEQRSATVVMMTKLEERSRVK 1490

  Fly  1206 CHEYYP---YNVRGLTVTIKSKEVLELYDRTELTVVHDKYGLKEK--VIHYYFKKWPDHGVPEDP 1265
            |.:|:|   ....|| |.:...:.:||......|....|.|..||  |..:.|..||||||||.|
  Rat  1491 CDQYWPSRGTETHGL-VQVTLLDTVELATYCVRTFALYKNGSSEKREVRQFQFTAWPDHGVPEHP 1554

  Fly  1266 MHLIMFVKKVKAEKRPSYSPIVVHCSAGVGRTGTFIGLDLIMQRLKSESKINIFETVKKLRFQRM 1330
            ...:.|:::||....|...|:||||||||||||.||.:|.:::|:|.|..::|:..|..:|.||.
  Rat  1555 TPFLAFLRRVKTCNPPDAGPMVVHCSAGVGRTGCFIVIDAMLERIKHEKTVDIYGHVTLMRAQRN 1619

  Fly  1331 KMVQTQQQYTFLYACTYELV 1350
            .||||:.||.|::....|.|
  Rat  1620 YMVQTEDQYIFIHDALLEAV 1639

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Ptp52FNP_611093.2 FN3 648..749 CDD:238020 31/102 (30%)
PTPc 1100..1345 CDD:214550 99/251 (39%)
PtprdXP_063144608.1 None

Return to query results.
Submit another query.