DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ATPCL and aclyb

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_523755.2 Gene:ATPCL / 36760 FlyBaseID:FBgn0020236 Length:1112 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_001334195.4 Gene:aclyb / 794259 ZFINID:ZDB-GENE-090909-2 Length:1111 Species:Danio rerio


Alignment Length:1117 Identity:743/1117 - (66%)
Similarity:891/1117 - (79%) Gaps:18/1117 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MSAKAITEASGKDILNRHLNTHGAGAATCRFSTVNSTTD--WSKLAVDHPWLLTTPLVCKPDQLI 63
            ||.|||:|.:||::|.:::.|  ......|||.|..|||  |..:.||||||||..||.||||||
Zfish     1 MSVKAISERTGKELLYKYICT--TAVVRNRFSCVTVTTDTNWDCITVDHPWLLTERLVVKPDQLI 63

  Fly    64 KRRGKLGLIGVKKNFEQVKQWIGERLNKDQKIGNAVGKLRNFIIEPFVPHTDAEEMYVCIYSHRA 128
            ||||||||:.|....|.|::|:...|..:..:|||.|.|:.|:|||||||...||.|||||:.|.
Zfish    64 KRRGKLGLVAVDLKLESVQEWLKSHLMTEITVGNAKGVLKKFLIEPFVPHIQEEEFYVCIYASRE 128

  Fly   129 ADTILFYHQGGVDIGDVDAKAVKLDVPVNSSLSLADVKSKLLKEVKDAGTKERIAKFVSALYTTY 193
            ...:||:|:|||:|||||.||.:|.:.::..|....|..:||..|.| ..||.:|.|:..|:..|
Zfish   129 GSHVLFHHEGGVEIGDVDNKAQRLTLGIDEKLMEEIVTQQLLVHVPD-DKKEVLASFIVGLFNLY 192

  Fly   194 VDLYFTYLEINPLVVTADNLYILDLAAKLDSTADFICRPKWGEIDYPPPFGRDAYPEEAYIADLD 258
            .|||||||||||||||.|.:|:||:|||:||.|::||:||||::::||||||:||||||||||||
Zfish   193 EDLYFTYLEINPLVVTKDGVYVLDMAAKIDSAAEYICKPKWGDVEFPPPFGREAYPEEAYIADLD 257

  Fly   259 AKSGASLKLTILNRNGRIWTMVAGGGASVIYSDTICDLGGASELANYGEYSGAPSEQQTYEYAKT 323
            :|||||||||:||.:||||||||||||||:||||||||||..||||||||||:|||||.|:||||
Zfish   258 SKSGASLKLTVLNPSGRIWTMVAGGGASVVYSDTICDLGGVDELANYGEYSGSPSEQQMYDYAKT 322

  Fly   324 ILNLMTSSPKHPDGKVLITGGGIANFTNVAATFQGIITALREFQPKLVEHNVSIFVRRAGPNYQE 388
            ||.|||.. ||.||||||.||.|||||||||||:||:.|::::|..|.||.|:|||||.||||||
Zfish   323 ILLLMTRE-KHSDGKVLIIGGSIANFTNVAATFKGIVRAIKDYQEPLKEHEVTIFVRRGGPNYQE 386

  Fly   389 GLRKMRDFGSTLGIPLHVFGPETHMTAICGMALGKRPIPQTASVEFSTANFLL-PGGQQAQADLK 452
            |||.|.:.|.|.|||:||||.|||||||.|||||.||||....|...||:||| .....|...:.
Zfish   387 GLRVMGEVGKTTGIPIHVFGTETHMTAIVGMALGHRPIPNQPPVAAHTASFLLNSSASAATPPIT 451

  Fly   453 AASDASE--ALGSGSALSPTAAKPIKLPPISADEADSAGISGAQRNGSSLNRK---FFSNTTKAI 512
            ..:..||  ......|::||..    .||:.:....|  .||.....:::..|   .||..||.|
Zfish   452 RNTSLSEHNTCSVTDAITPTTG----APPVVSTHCHS--WSGKVMLNAAVKAKPTTLFSRQTKVI 510

  Fly   513 VWGMQQRAVQSMLDFDFICRRDEPSVVAMVYPFTGDHKQKYYWGHKEILIPVYKKMSDAIHKHKE 577
            |.|:|.:|||.|||||::|.||||||||||||:|||||||:||||||||:.|||.|:||:.||.:
Zfish   511 VCGIQTQAVQGMLDFDYVCSRDEPSVVAMVYPYTGDHKQKFYWGHKEILLSVYKNMADAMKKHPD 575

  Fly   578 VDVMVNFASMRSAYESTLEVLEFPQIRTVAIIAEGIPENMTRKLIIEADKKGVAIIGPATVGGVK 642
            |||::||||:|||::||:|.|::|||||:|||||||||.:|||||..||:|||.|||||||||:|
Zfish   576 VDVLINFASLRSAFDSTMETLQYPQIRTIAIIAEGIPEALTRKLIKTADEKGVTIIGPATVGGIK 640

  Fly   643 PGCFKIGNTGGMLDNILHSKLYRPGSVAYVSRSGGMSNELNNIISKATDGVIEGIAIGGDRYPGS 707
            |||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||..||||.||:||||||:|||
Zfish   641 PGCFKIGNTGGMLDNILASKLYRPGSVAYVSSSGGMSNELNNIISHTTDGVYEGVAIGGDRFPGS 705

  Fly   708 TFMDHILRYQADPETKLIVLLGEVGGTEEYDVCAALKDGRITKPLVAWCIGTCASMFTSEVQFGH 772
            |||||:||||..|..|:||:|||:||||||::|..:.||.||||:|.|||||||::.:|||||||
Zfish   706 TFMDHVLRYQDTPGIKMIVVLGEIGGTEEYNICQGITDGLITKPIVCWCIGTCATLLSSEVQFGH 770

  Fly   773 AGSCANSDRETATAKNKGLRDAGAYVPDSFDTLGELIHHVYGELVKTGRVVPKEEVPPPTVPMDY 837
            ||:||....|||.|||:.||:|||:||:|||.||::|..||.:||..|.:||::|||||||||||
Zfish   771 AGACATQVLETAVAKNQALREAGAFVPNSFDELGDVIKFVYDDLVTNGIIVPEQEVPPPTVPMDY 835

  Fly   838 SWARELGLIRKPASFMTSICDERGQELIYAGMPISEVLSKDVGIGGVISLLWFQRCLPSYVCKFF 902
            ||||||||||||||||||||||||||:|||||||:||..:::|:|||:.||||||.||.|.|:|.
Zfish   836 SWARELGLIRKPASFMTSICDERGQEVIYAGMPITEVFKEEMGVGGVLGLLWFQRRLPRYACQFI 900

  Fly   903 EMCLMVTADHGPAVSGAHNTIVCARAGKDLVSSVVSGLLTIGDRFGGALDGSARQFSEAYDTNLH 967
            |||||||||||||||||||||||||||||||||:.|||||||||||||||.:|:|||:|:|:.|.
Zfish   901 EMCLMVTADHGPAVSGAHNTIVCARAGKDLVSSLTSGLLTIGDRFGGALDAAAKQFSKAFDSGLL 965

  Fly   968 PMEFVNKMRKEGKLILGIGHRVKSINNPDVRVKIIKEFVLENFPACPLLKYALEVEKITTNKKPN 1032
            ||||||||:|:|.||:|||||||||||||:||:|:|:||.::||:..||.||||||||||:||||
Zfish   966 PMEFVNKMKKDGVLIMGIGHRVKSINNPDMRVQILKDFVKQHFPSTQLLDYALEVEKITTSKKPN 1030

  Fly  1033 LILNVDGVIATAFVDMLRNSGSFTSEEAQEYINVGAINSLFVLGRSIGFIGHYMDQKRLKQGLYR 1097
            ||||:||.|..||||:||..|.||.:||.|::::|.:|.:|||||||||||||:|||||||||||
Zfish  1031 LILNIDGFIGVAFVDLLRTCGGFTRDEADEFVDIGTLNGIFVLGRSIGFIGHYLDQKRLKQGLYR 1095

  Fly  1098 HPWDDISYVIPE 1109
            |||||||||:||
Zfish  1096 HPWDDISYVLPE 1107

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ATPCLNP_523755.2 PLN02235 1..421 CDD:177879 265/421 (63%)
PLN02522 503..1106 CDD:178137 450/605 (74%)
aclybXP_001334195.4 PLN02235 1..419 CDD:177879 265/421 (63%)
PLN02522 501..1104 CDD:178137 449/602 (75%)

Return to query results.
Submit another query.