Protein Alignment ItgaPS4 and itga6a

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_611025.2
• Gene: ItgaPS4 / 36693
• FlyBaseID: FBgn0034005
• Length: 1069
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_005167466.2
• Gene: itga6a / 503893
• ZFINID: ZDB-GENE-050309-23
• Length: 1092
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1183
• Identity: 269/1183 - (22%)
• Similarity: 476/1183 - (40%)
• Gaps: 278/1183 - (23%)

  Fly    17 NAYNISPYPNSVLNFPELEGNRRSSYFGFSLVI------REKSI-MVAAPRANSSLEAQRNISEP 74
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Zfish    24 SAFNLD--TQNVLR----KSGQPGSLFGFSIALHRQLQPHDKTILLIGAPKARALSNQGANVT-- 80

  Fly    75 GVIFRCYFES-GNNCSPYNIDTKGNYKGMPNDGLLTAKNKDFRWLGGAMD----GGTRDSDKFLV 134
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Zfish    81 GGLYSCDITTHPNDCSRVDFD---------NDVDVRVENKENQWMGVTVQSQGPGG-----KIVT 131

  Fly   135 CAPRFYSI---NNENDYNN--GMCYWLS-DTPKNIDSTEVMEKWPLRIEKKQVLKLADTNLIPYY 193
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Zfish   132 CAHRYQRLLFPNTPQEARDITGRCYMLSQDLSIDNQSDEDGGNW----------KFCDGRTRGHE 186

  Fly   194 SMG--ELGLSAHVSDDNSKLLMGAPGIDQWKGSVHLKQEVPSIKT----SSGRQRRGMNTNRKCN 252
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Zfish   187 RFGACQQGLAATFTKDYHYVIFGAPGAYNWKGIVRIEQKNNTLLEMGLFDDGPYEVG-DENRLDP 250

  Fly   253 ECNPEPKNFGQEEFSYFGYAVSSGYFDSSNLSTVLYVATAPRGNNQFGEAYIFDIYEDSIYKY-- 315
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Zfish   251 NLVPVPAN------SYLGFSLDSGH-SITEKGKLIIVSGAPRANH--SGAVVFLRKEGELSSMLT 306

  Fly   316 --HEFRGNHFGEYFGYSVLAEDLNGDGKTDVIISAPLYALRNSYDDGAIYVFINKGSFTFEERII 378
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Zfish   307 PEHILEGPGLASSFGYDVAVVDLNGDGWQDVVVGAPQFFQRDEEVGGAVYVYINKAGRWRDVTPV 371

  Fly   379 RSPAGSGGRFGTTLSRIGDINKDGYNDVAVGAPFA--GNGSVFIYLGSENGLRDPPSQCLDAPSQ 441
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Zfish   372 RLNGTKDSMFGLSVENIGDVNLDSFEDIAVGAPYADSGFGSVYIYHGSADGISTKPAQILEG--- 433

  Fly   442 QPSKYGSYMFGHGLSRGSDIDGNGFNDFAIGAPNAEAVYLYRAYPVVKIHAIIKPKLQNVNPEEE 506
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Zfish   434 --KQHNTKMFGYSLAGNMDLDHNSYPDLAVGS-LSDTVFIYRSKNVISIKKDIKVTPKEIDLTKK 495

  Fly   507 RVNITVCYRLSSKSDSKAK-ALMEQELVIRIDIDT---KSKIKL---AVF------DEEHGSQMS 558
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Zfish   496 TCGNSICLTVEACFSYRANPATYNPKITISCTFEAEWYRRKLGLPSRVVFLDKTEIDQDFQSTGI 560

  Fly   559 FKAKAFHEEICSEFQIEMD----KRAKFTPIALEMQYELSKKIPNSGDFCEDCAVVDPAEP-KFV 618
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Zfish   561 LELRGQNKKACYKTKLRLQDGIRDKLRAIPIEVSVAIQSAKRGKRQSSLPQLVPILDSTVPNKTL 625

  Fly   619 TEYITFNTGCATD-VCVADLKIS---CI--------------NASSTLVLGTTAVLRLTYNITN- 664
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Zfish   626 TEVNFLKEGCGTDNICQSNLNLQYRFCYRESKQDIFPPLPLENGVPVISLSDQKDIALEVTVRNR 690

  Fly   665 NGEFAYHPKF------SVTNSAGLSLAQVPGNCKVNEAVMVCDLNHGQRMA--------KGDTD- 714
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Zfish   691 NGDDAHEAKLVSHFDDSLSYSGFRSL-------RTNDKHVICAANQNGSLADCELGNPFKRDSEV 748

  Fly   715 -------SLTISFDVRQLRGRSLEIQAEVLSARDESNPENNK-------LTNVLSLREKADIYVS 765
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Zfish   749 TFYIILSTGKISLETKEV---EIDLQLETTSSQEGLSKVKAKAKVVIELLLSVQGVAKPSQVYFG 810

  Fly   766 GVQTNDHVVLKES------PYTAEVVNYYE-IKSHGPSTLENLTVSLYIPVAYKTPDSTNVKHIV 823
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Zfish   811 GEVKGMSAMKKEEEVGSLIEYEFRVINLGKPLKSFG-------TASLNI----QWPKESSV---- 860

  Fly   824 TSSPKIQSKYAHKIMPINFIDQNNALANNFAIDHDQSTLLFSATPQHE----------NVGNLSG 878
                   .|:...:|.||..|..                |.:.:|:.|          ::.....
Zfish   861 -------GKWLLYLMKINTRDLQ----------------LVTCSPEREINPLKLREDSSIRKKRE 902

  Fly   879 IVEQNPS----ISLLNEDLPVNNTLVLNCQDTNVTLCVPVEIRLENGLQ------LKPEELMNMT 933
            :.|:.||    |||..:.   ....:|:|  :....||.::..|: ||.      || ..|.|.|
Zfish   903 LEERRPSEGNKISLFTDK---RKHKILSC--SGDARCVEIKCPLQ-GLDSTAVIVLK-SRLWNST 960

  Fly   934 VSFTVNLKDADDIWEYFVIQTDLKVHKIGDPTLSSFTIEKKIESNVICKHAEIAI---------- 988
            .        .:|...|..:...:|         :|.:::...: |::.|:.|..:
Zfish   961 F--------LEDFASYNYLDIIVK---------ASISLDVSAK-NIVLKNPETQVRLTVFPETTA 1007

  Fly   989 --------WKIIVSVIVGILVFSAATYALYKRGFFKRAIKDDLKQLIRDSFEDGI-----IRTEM 1040
                    |.|:|:|:.|||:.:.....|:|.|||||:           .:||.:     :|...
Zfish  1008 TPFGGVPWWIILVAVLAGILMLALLVLLLWKCGFFKRS-----------KYEDSVPKYHAVRIRK 1061

  Fly  1041 EENAQSQGDADLD 1053
            |......|...||
Zfish  1062 ETRLLKDGKVMLD 1074

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
ItgaPS4	NP_611025.2	FG-GAP_3	335..408	CDD:433275	27/72 (38%)
		Int_alpha	384..434	CDD:214549	24/51 (47%)
		Int_alpha	447..>492	CDD:214549	15/44 (34%)
		Integrin_alpha2	486..808	CDD:462478	69/394 (18%)
itga6a	XP_005167466.2	None