DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ItgaPS4 and ItgaPS5

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_611025.2 Gene:ItgaPS4 / 36693 FlyBaseID:FBgn0034005 Length:1069 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_611808.2 Gene:ItgaPS5 / 37732 FlyBaseID:FBgn0034880 Length:1018 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1075 Identity:505/1075 - (46%)
Similarity:693/1075 - (64%) Gaps:108/1075 - (10%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MFCLLVIVLLALQSEINAYNISPYPNSVLNFPELEGNR----RSSYFGFSLVIREKSIMVAAPRA 61
            |..||.::.|||:.:.||.|.||.||.|::.|:....|    ||||||:|||||..||.|.||||
  Fly     1 MHRLLFLIFLALKYQSNAMNFSPLPNRVIDAPKHLKTRMIQVRSSYFGYSLVIRPTSIFVGAPRA 65

  Fly    62 NSSLEAQRNISEPGVIFRCYFESGNNCSPYNIDTKGNYKGMPNDGLLTAKNKDFRWLGGAMDGGT 126
            .|:||:|.:|:|.|.::||...|| :||.|.:          ||.|    ||.|:||||:|||||
  Fly    66 QSTLESQGSINETGAVYRCPLASG-SCSHYVL----------NDKL----NKQFQWLGGSMDGGT 115

  Fly   127 RDSDKFLVCAPRFYSINNENDYN--NGMCYWLSDTPKNIDSTEVMEKWPLRIEKKQVLKLADTNL 189
            :|:||.|||||||:...|:| |.  .|:|||:.||        |.:..||.       .:...:|
  Fly   116 KDTDKLLVCAPRFFVPKNKN-YGQMRGICYWVRDT--------VADTPPLS-------DVRTISL 164

  Fly   190 IP----YYSMGELGLSAHVSDDNSKLLMGAPGIDQWKGS--VHLKQEVPSIKTSSGRQRRGMNTN 248
            ||    .:.|.||||||||:||||..|:||||:..||||  ||..:::.:         :|....
  Fly   165 IPSQAEEHFMLELGLSAHVTDDNSGFLIGAPGVRSWKGSVLVHRGEDLAA---------QGSYAV 220

  Fly   249 RKCNECNPEPKNFGQEEFSYFGYAVSSGYFDSSNLSTVLYVATAPRGNNQFGEAYIFDIYEDSIY 313
            :..:..     ::.:..|:|.|||:|||||.|:|.:::|||.|||......|:|||||:..:.:.
  Fly   221 KMLDSW-----DWVKNHFTYVGYALSSGYFSSNNRTSLLYVTTAPSSVLNTGKAYIFDVVGEIVR 280

  Fly   314 KYHEFRGNHFGEYFGYSVLAEDLNGDGKTDVIISAPLYALRNSYDDGAIYVFINKGSFTFEERII 378
            |.|.|.|...||||||||:||||||||.|||::||||.||.:|||.||||||||||.|.||::||
  Fly   281 KLHVFHGEQLGEYFGYSVVAEDLNGDGLTDVVVSAPLNALGDSYDVGAIYVFINKGLFKFEKKII 345

  Fly   379 RSPAGSGGRFGTTLSRIGDINKDGYNDVAVGAPFAGNGSVFIYLGSENGLRDPPSQCLDAPSQQP 443
            |.|..||.|||::||::||||.|||||:||||||||||:|||:||||:||||.|||.|||||::|
  Fly   346 RLPLSSGARFGSSLSKVGDINHDGYNDLAVGAPFAGNGAVFIFLGSEHGLRDEPSQRLDAPSREP 410

  Fly   444 SKYGSYMFGHGLSRGSDIDGNGFNDFAIGAPNAEAVYLYRAYPVVKIHAIIKPKLQNVNPEEERV 508
            ..||::|||.|||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.::.:.:.:.||:|.:
  Fly   411 GPYGAHMFGQGLSRGSDIDGNGFNDLAIGAPGAEAVYLYRAYPVVKIHATVRSESRAIRPEQETI 475

  Fly   509 NITVCYRLSSKSDSKAKALMEQELVIRIDIDTKSKIKLAVFDEEHGSQMSFKAKAFHEEICSEFQ 573
            .:|.||||  ::.|||:.:.:|||..|:.||  ..::...|.....:::||:|:|.....|..|.
  Fly   476 TVTACYRL--ETTSKARQMQQQELTFRMTID--ELLQRVSFAPMRTNEVSFQAQAGLSGSCRNFS 536

  Fly   574 IEMDKRAK-FTPIALEMQYELSKKIPNSGD-FCEDCAVVDPAEPKFVTEYITFNTGCATDVCVAD 636
            :.:..... ||||.||:.|||:||||:|.: |||.||||||.|||:.|..::|.||||..|||:|
  Fly   537 VGVHYTGGIFTPIDLELHYELAKKIPHSHEAFCESCAVVDPLEPKYATGTLSFMTGCAAHVCVSD 601

  Fly   637 LKISCINASSTLVLGTTAVLRLTYNITNNGEFAYHPKFSVTNSAGLSLAQVPGNCKVNEAVMVCD 701
            |::|..:.:|:.:.|:..||..:|.|||:||.||..:|:||:||.|..|:|||||:|...||:||
  Fly   602 LQLSSKDVNSSFIFGSLEVLSFSYEITNSGEPAYVAQFNVTSSARLPFAKVPGNCRVRHEVMLCD 666

  Fly   702 LNHGQRMAKGDTDSLTISFDVRQLRGRSLEIQAEVLSARDESNPENNKLTNVLSLREKADIYVSG 766
            ||.|:.:|:||::||||.|||.||.|:||.|:|.|.||..:.||::|.::..:||||.|:|..||
  Fly   667 LNGGRALARGDSESLTIIFDVTQLSGQSLTIEAAVSSAGMDQNPKDNTMSTTISLREYAEIDASG 731

  Fly   767 VQTNDHVVLKESPYTAEVVNYYEIKSHGPSTLENLTVSLYIPVAYKTPDSTNVKHIVT-SSPKIQ 830
            ...:.|:.|||.||:|||.|.||.||||||.::.|||.:.:|:||....|..:|.|.. ||.::|
  Fly   732 GPIDGHIALKEYPYSAEVNNSYEFKSHGPSIIDELTVYVDVPIAYTVTGSAGIKSIFNISSLQMQ 796

  Fly   831 SKYAHKIMPINFIDQNNALANNFAID--------------HDQSTLLFSATPQHENVGNLSGIVE 881
            :.:..:::||...||.|.||..:.::              .||..::...        |:|.|  
  Fly   797 ATHGSELVPIKLYDQTNTLAKEYPLEDSSRRANRKRRELQQDQYAIMPDV--------NISDI-- 851

  Fly   882 QNPSISLLNEDLPVNNTLVLNCQDTNVTLCVPVEIRLENGLQLKPEELMNMTVSFTVNLKDADDI 946
                  |..|:||.|.||||:|...|.|:||..::|    :|||||:.:::.:||.|:|.|..:.
  Fly   852 ------LTKENLPANRTLVLDCLRGNWTICVRSQMR----VQLKPEQPIDLRISFKVDLNDFVNT 906

  Fly   947 WEYFVIQTDLKVHKIGDPTLSSFTIEKKIESNVICKHAE--IAIWKIIVSVIVGILVFSAATYAL 1009
            ::|.||.|::::.|.||.|  |..:::.::.|||..::|  :.||.||:|:|.|.|:..|.||.|
  Fly   907 FDYLVIFTNVEMFKEGDST--SIALKRNLKPNVIFNYSETPLPIWYIILSLIAGHLLLGAMTYIL 969

  Fly  1010 YKRGFFKRAIKDDLKQLIRDSFEDGIIRTEMEENA 1044
            ||..||||..|::||:|:.:.      |:|.:|.|
  Fly   970 YKLRFFKRGKKEELKRLLEEH------RSETKEPA 998

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ItgaPS4NP_611025.2 FG-GAP_3 335..408 CDD:433275 51/72 (71%)
Int_alpha 384..434 CDD:214549 38/49 (78%)
Int_alpha 447..>492 CDD:214549 39/44 (89%)
Integrin_alpha2 486..808 CDD:462478 153/323 (47%)
ItgaPS5NP_611808.2 FG-GAP 294..332 CDD:460357 29/37 (78%)
Int_alpha 351..403 CDD:214549 40/51 (78%)
Int_alpha 417..463 CDD:214549 40/45 (89%)
Integrin_alpha2 453..837 CDD:462478 169/387 (44%)

Return to query results.
Submit another query.