Protein Alignment SMC2 and glu

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_610995.1
• Gene: SMC2 / 36653
• FlyBaseID: FBgn0027783
• Length: 1179
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_723996.1
• Gene: glu / 35001
• FlyBaseID: FBgn0015391
• Length: 1409
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1311
• Identity: 306/1311 - (23%)
• Similarity: 552/1311 - (42%)
• Gaps: 277/1311 - (21%)

  Fly     1 MYVKKLVLDGFKSYGRRTEIEGFDPEFTAITGLNGSGKSNILDSICFVLGISNLQNVRASALQDL 65
            :.:.|:|...||||....|:..|...||||.|.|||||||::||:.||.| .....:|...:..|
  Fly    87 LIISKIVNRNFKSYAGEVELGPFHQSFTAIIGPNGSGKSNVIDSMMFVFG-CRANRIRCKRVSTL 150

  Fly    66 VYKNGQ-AGITKATVTIVFDNTNPAQCPQGYEKCRE-----ISVTRQVVVGGKNKFLINGKLVQN 124
            ::.:.. ..:...:|.:.|...    ..:|...|.:     |.:.|..:....:.:.||.|..|.
  Fly   151 IHSSSSYPNLRSCSVAVHFKQI----VDKGDGTCEDVPDSSIVIERTAMSDNSSYYQINDKRAQL 211

  Fly   125 KKVQDFFCSIQLNVNNPNFLIMQGKIQQVLNMKPK-------EVLSMVEEAAGTSQY-------- 174
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  Fly   212 KDVAKLLKKHHVDLEHNRFLILQGEVESIAMMKPKGQTENETGMLEYLEDIVGTQRYIRPLQQIN 276

  Fly   175 ---------KTKRDATKTLIE-----------------KKETKVRETKVLLDEEVLP-KLVKLRQ 212
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  Fly   277 QRVDQLTDDRTEKHNRCKLAEREMKDLEQPFNEAVDYLKKENELVRTKSFHIQKIISIKKSKLEQ 341

  Fly   213 ERSAYQEYQKICRDIDFLIRIHISAKYLKQCETLKTVEANEHKIEDRIANCKATHAKNLAEVESI 277
                |.:..:.|                  .|.|||.:.....::...|..:....|   |:|..
  Fly   342 ----YTQEHEAC------------------AEELKTHDEGTAALKQSRAEKETIIRK---EIEEY 381

  Fly   278 ENSVKEMQQQIDAEMGGSIKNLETQLSAKRALEATATGSLKAAQGTIQQDEKKIRMASKNIEDDE 342
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  Fly   382 EALVKK-REQIK-------KRLVTVESAYTEIQST-------------------------MENTN 413

  Fly   343 RALAKKEADMAKVQGEFESLKEADARDSKAYEDAQKKLEAVS-QGLSTNENGEAS---------- 396
            :...|.:|.:.|.:.|.|.|.:...::.:..||..||||::. ..::.||..|..
  Fly   414 KQRKKDKAQIEKNEKELEDLHKLPEKNQREIEDCNKKLESLEVSKVTLNEELEKQQAELTKTTAP 478

  Fly   397 ------TLQEQLIVAKEQFSEAQTTIKTSEIELRHTRGVLKQRE----GETQTNDAAYVKDKKLH 451
                  .|.::|:..||:.:.|:..::..|.:|:    :|||.|    .:.:|..::|.:.:|..
  Fly   479 LTEKRLKLSDELVGLKEKVNTAKGEVQVFESQLK----ILKQAETTESRKYETLKSSYEQSQKSL 539

  Fly   452 DQLVVEIKNLERQLQSLDYE----GGHFEKLKQRRNDLHMRKRDLKRELDRCNASRYDLQYQDPE 512
            ::.|..:..|:..:..:..|    ....:|:.:...:|.|:...|:.|::..::.....:..:..
  Fly   540 EEKVTRVDELKESIPRMKTEIASKSAEVDKMVKEERNLSMQCNKLRTEINERSSVMQAQRSNNKV 604

  Fly   513 PNFDRR-----KVRGLVGKLFQVK--DMQNSMALVQTAGGSLYSYVTDDDVTSKKILQRGNLQR- 569
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  Fly   605 LDFLMRMKMEGKIPGILGRLGDLGGIDAKYDIA-ISTACGRLDNIVTDNYETASAAI--GALKEY 666

  Fly   570 ---RVTLIPINKIQSGSLNRNVVEYAQNKVGA-ENVQWAMSLIDY-DRYYEPVMKFCFGGTLICK 629
               |.|.|.::||:......|      :::.. |||.....|:.. |........|....||:|.
  Fly   667 NVGRATFITLDKIEHHRREAN------SRINTPENVPRLYDLVKVEDDRVRTAFYFALRNTLVCD 725

  Fly   630 DLIVAKQISYDPRINCRSVTLEGDVVDPHGTVSGGAAPKGANVLEELHAIKQIEKEYREID-SEI 693
            ||....:|:|. |...|.|||.|::::..||:|||    |:..:......:...|.....| |:|
  Fly   726 DLEQGTRIAYG-RERYRVVTLRGEMIEMTGTMSGG----GSRPIRGKMGTQVRTKTAESADSSQI 785

  Fly   694 AQ---VEKQIASIENQALAFNKMKENLDLRQHELTMCENRLAQTTFQQNQAEIEEMRERVKTLEQ 755
            :|   .:.||.:.|.|| ..|..:|.....:.|:...:|.|     |:::||.:.:...:.:|||
  Fly   786 SQKALEDMQIQAEELQA-RVNYCQEQQGSLEREIQTLKNGL-----QRDEAEYKRLAVSITSLEQ 844

  Fly   756 QIIDSREKQKTSQAKIVDIEAKLADAKGYRERELNAATNEIKVTKQRAEKSRANWKKREQEFETL 820
            |:..:.::.:..:.:::   .|..|.:..:|||     .:|:..||..|:::...:....:.|.:
  Fly   845 QMASNLKQCEAQRQRML---KKTTDERAVKERE-----EQIEAAKQELEQAQFAEQAVSSQIEEI 901

  Fly   821 QLEITELQ-KSIETAKKQHQEMIDNLEKFKAELDALKVNSSSAASEVTE-------LEQAIKEQK 877
            |.:...|: :|::..:.:.:::...:||..|.:.:|.|..::|...:|:       |.:.||..:
  Fly   902 QNQYDTLRNESVKPVEAKIKKVNSQIEKLAANVRSLNVGLATADRNITKITGNNNNLRENIKAAE 966

  Fly   878 DKLRDQNKEMRNQLVKKEKMLKENQEIEL-----------------EVKKKENEQ--KKISSDAK 923
            :||:..|::......|||::.||.:|.|.                 |:.|:||::  ::|..|.|
  Fly   967 EKLKSLNEDRNKAKEKKEELEKEIEESEASIEGAKSQSSDIKKEIDEITKEENKRNIERIEIDTK 1031

  Fly   924 --EAKKRMEALEAKYP-W-----------IPEEKNCFGMKNTRYDYSKEDPHEAGNKLAKMQEKK 974
              .|..:|..::...| |           ||.|..    .........|:..|| ..|..:|.|:
  Fly  1032 LQAAAGKMNKVKNDIPGWQAQLAPLKLNEIPGETE----PQAPLKELNEEELEA-ETLEALQYKQ 1091

  Fly   975 DKMERTL-----NMNAIMVLDREEENFKETERRRNIVAMDKEKIKKIIVKMDEEEQDQLNKAA-- 1032
            ..:|..|     |::.|          ||...:| :|.:|:.::.:.|.....|.:|:..:..
  Fly  1092 TMLEEDLKTKKPNLSCI----------KEFNEKR-LVYLDRVRVLEDITSKRNEMRDKYEEVRKR 1145

  Fly  1033 --TEVNTNFSGI-------FSSLLPGAEAKLNPVHTNGCLTGLEIKVGFNGI----------WKE 1078
              .|....||.|       :..:..|.:|:|..|.:....|        .|:          ||
  Fly  1146 RYKEFMDGFSIITRKLKEMYQMITLGGDAELELVDSMDPFT--------EGVNFTVRPPKKSWK- 1201

  Fly  1079 SLGELSGGQKSLVALSLVLAMLKFSPAPLYILDEVDAALDMSHTQNIGSMLKQHFTNSQFLIVSL 1143
            .:..||||:|:|.:|:||.|:..:.|:|||.:||:|||||..:...:|..:|:...|:||:||||
  Fly  1202 YISNLSGGEKTLSSLALVFALHYYKPSPLYFMDEIDAALDFKNVSIVGHYIKERTKNAQFIIVSL 1266

  Fly  1144 KDGLFNHANVL 1154
            :..:|..||.|
  Fly  1267 RVNMFELANFL 1277

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
SMC2	NP_610995.1	SMC_N	2..1162	CDD:481474	306/1310 (23%)
glu	NP_723996.1	SMC_N	89..1287	CDD:426784	306/1309 (23%)