Protein Alignment Mdr50 and mdlB

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_523740.3
• Gene: Mdr50 / 36582
• FlyBaseID: FBgn0010241
• Length: 1313
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_414983.1
• Gene: mdlB / 945088
• ECOCYCID: EG11622
• Length: 593
• Species: Escherichia coli
• Alignment Length: 565
• Identity: 158/565 - (27%)
• Similarity: 271/565 - (47%)
• Gaps: 75/565 - (13%)

  Fly   780 DQYVRENSNQYSLYFLIAGIVVGIATF------LQIYFFGIAGERLTERLRGLMFEAMLRQEVAW 838
            |..|.:|:....:...:|...||:..|      .|...|..|...:.::||..:.:|.|||.::.
E. coli    51 DNMVAKNNLPLKVVAGLAAAYVGLQLFAAGLHYAQSLLFNRAAVGVVQQLRTDVMDAALRQPLSE 115

  Fly   839 FDDKANGTGSLCARLSGDAAAVQGATGQRIGTIVQSISTLALGIALSMYYEWSLGLVALAFTPFI 903
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E. coli   116 FDTQP--VGQVISRVTNDTEVIRDLYVTVVATVLRSAALVGAMLVAMFSLDWRMALVAIMIFPVV 178

  Fly   904 LIAFYMQ-----------RTLMAKENMGSAKTMENCTKLAVEVVSNIRTVASLGRE--EMFHQNY 955
            |:...:.           |..:|..|.|..:.:.     .:.|:...|..|..|..  |....:|
E. coli   179 LVVMVIYQRYSTPIVRRVRAYLADINDGFNEIIN-----GMSVIQQFRQQARFGERMGEASRSHY 238

  Fly   956 IG----------MLIPAVEISKRNTHFRGLVYGLARSLMFFAYAACMYYGTWCVIHRGILFGDVF 1010
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E. coli   239 MARMQTLRLDGFLLRPLLSL------FSSLI--LCGLLMLFGFSAS---GT---IEVGVLYAFIS 289

  Fly  1011 ---KVSQALIMGTASIANALAFAPNMQKGVSAAKTIFTFL---RRQPSIVDRPGVSRDPWHSEGY 1069
               ::::.||..|...|       .:|:.|.|.:.:|..:   |:|....|||..|       |.
E. coli   290 YLGRLNEPLIELTTQQA-------MLQQAVVAGERVFELMDGPRQQYGNDDRPLQS-------GT 340

  Fly  1070 VRFDKVKFSYPTRSEIQVLKGLELAVSKGQKIALVGPSGCGKSTCIQLIQRFYDVDEGATLIDEC 1134
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E. coli   341 IEVDNVSFAY--RDDNLVLKNINLSVPSRNFVALVGHTGSGKSTLASLLMGYYPLTEGEIRLDGR 403

  Fly  1135 DVRNVSMTNLRNQLGIVSQEPILFDRTIRENISYGDNARNVTDQEIISACKKSNIHEFIANLPLG 1199
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E. coli   404 PLSSLSHSALRQGVAMVQQDPVVLADTFLANVTLG---RDISEERVWQALETVQLAELARSMSDG 465

  Fly  1200 YDTRMGEKGAQLSGGQKQRIAIARALIRNPKIMLLDEATSALDAESEKVVQDALDAASEGRTTIS 1264
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E. coli   466 IYTPLGEQGNNLSVGQKQLLALARVLVETPQILILDEATASIDSGTEQAIQHALAAVREHTTLVV 530

  Fly  1265 IAHRLSTVVHSDVIFVFENGLVCEAGDHKQLLANRGLYYTLYKLQ 1309
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E. coli   531 IAHRLSTIVDADTILVLHRGQAVEQGTHQQLLAAQGRYWQMYQLQ 575

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Mdr50	NP_523740.3	PTZ00265	69..1308	CDD:240339	156/562 (28%)
mdlB	NP_414983.1	PRK10790	1..592	CDD:182733	158/565 (28%)