Protein Alignment Sox15 and pan

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_523739.2
• Gene: Sox15 / 36575
• FlyBaseID: FBgn0005613
• Length: 784
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_726528.2
• Gene: pan / 43769
• FlyBaseID: FBgn0085432
• Length: 1192
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 804
• Identity: 166/804 - (20%)
• Similarity: 268/804 - (33%)
• Gaps: 246/804 - (30%)

  Fly    13 LLTNYNSKKYPHVSRT-----PEYSHSTGSDYPEHGGYLTDGRLMHESNSD------AGIYHVRQ 66
            ::.|||.:.......|     ||:  ||....|..|           |||.      :||:.:.|
  Fly   523 IVFNYNRESSAESIVTDPLLVPEF--STAPSTPSTG-----------SNSGCSTGMVSGIFGLSQ 574

  Fly    67 GSEHSSPSLHSPAIQSSGY---------ENEHLNE-------AVLAAHSHSHSPMPMVSSAYVGG 115
            .......:.|...:.::.:         :||..|:       ..|...:.||.....:||
  Fly   575 NRRKQRLARHIETLTTNSFKSNAIRGNVDNEITNQLKTSPSIRALPTENVSHLITKTLSS----- 634

  Fly   116 GTASGSLINSNIPLLGGGGNSVLNKFLSHPHAGMVGGGTGQMEDCTSHSPIEAASMWSYDYKGDL 180
              |:.||....:        |:.|.|.....|  :.|..|.|:  |...|:..|   .||.
  Fly   635 --ANASLTAQEL--------SITNLFKERLCA--LQGNAGSMK--TEIFPMIDA---PYDL---- 678

  Fly   181 CAPNCGYLERHKPLPADLKYRPGGTQSKSAKES-------RIRRPMNAFMVWAKIERKKLADENP 238
               :.|...:|..|.|.   .....||..:||:       .|::|:||||::.|..|.|:..|..
  Fly   679 ---SIGSKTKHMNLEAK---HTSNAQSNESKETTNDKKKPHIKKPLNAFMLYMKEMRAKVVAECT 737

  Fly   239 DLHNADLSKMLGKKWRSLTPQDRRPYVEEAERLRVIHMTEHP------NYKYRPRRRKQSKLRAM 297
            ...:|.::::||::|..|:.:::..|.|:|.:.|.:||..:|      ||.|..:::|:.|.|:.
  Fly   738 LKESAAINQILGRRWHELSREEQSKYYEKARQERQLHMELYPGWSARDNYGYVSKKKKRKKDRST 802

  Fly   298 QPGGKEQSESSPNPGTGGSKSNPKLATPPLATASSSYTTP-TDESTC----NSTNQNHGQSTPGG 357
            ...|          |....|...:..    ....|.:..| ..:..|    .:.|.| |.:..|.
  Fly   803 TDSG----------GNNMKKCRARFG----LDQQSQWCKPCRRKKKCIRYMEALNGN-GPAEDGS 852

  Fly   358 LYEQPLKPTYSPSSVDCY---------SNADSTEQIESLAANCPPALLNESSPTGGGYDNSLLLK 413
            .:::. ....|....|.|         .:||.|.:||...:..    ||:|.|:.|....   |.
  Fly   853 CFDEH-GSQLSDDDEDDYDDDKLGGSCGSADETNKIEDEDSES----LNQSMPSPGCLSG---LS 909

  Fly   414 KLTKPSPSRAAKSRQEKLAKSEEKNKGSQSQGQSQQGIYAATYPLAPTSVAVVAARGMYVTCNNR 478
            .|..||.:.:       ||.....|..|.:.         ..:|.:..::.:|.|
  Fly   910 SLQSPSTTMS-------LASPLNMNANSATN---------VIFPASSNALLIVGA---------- 948

  Fly   479 GLLDHGHSVKGTFYPPVSVSEDDNSTSMRNSISALQQHCNVVTSTPSSSGGT--MPTSEMSSYTV 541
                                  |..|:        ||...:|:::.||||.|  :.|:..:|.||
  Fly   949 ----------------------DQPTA--------QQRPTLVSTSGSSSGSTSSISTTPNTSSTV 983

  Fly   542 S----MADNCGNLRLSMNELSGNEYLPSANAYGMQYEDFLRYQSNDMDYSTSAVEHKETTSDSAS 602
            |    |...|.........:.||                 |:....|..|...|    :||.|.|
  Fly   984 SPVTCMTGPCLGSSQERAMMLGN-----------------RFSHLGMGLSPPVV----STSTSKS 1027

  Fly   603 GQKCLKYPDTNQNYDDYEAEAYSNAMLPATAASYYTQLPYPPTS---LAAFPLQLAVPF------ 658
             :...|...|..|...:...:..|..|..::        .|.||   :.|.|..:..|.
  Fly  1028 -EPFFKPHPTVCNNPIFALPSIGNCSLNISS--------MPNTSRNPIGANPRDINNPLSINQLT 1083

  Fly   659 --------------QQTTSGAYGAQPIQSGYLHYGNYGGYEGMAQSQPQNQAPVHHQQASHSAPP 709
                          :..|..|:.|..|    :.:....||.........|...:|||..:.:..|
  Fly  1084 KRREYKNVELIEASESKTIVAHAATSI----IQHVAVNGYHANHSLLNSNLGHLHHQLNNRTENP 1144

  Fly   710 SLSVPPNQTV--TSNSAAISMQQH 731
            :.|   .||:  .||.:..|.:.|
  Fly  1145 NRS---EQTMLSVSNHSVNSSECH 1165

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Sox15	NP_523739.2	HMG-box_SoxF	214..289	CDD:438841	25/80 (31%)
		PHA03273	305..>391	CDD:223031	17/99 (17%)
pan	NP_726528.2	HMG-box_TCF7-like	713..791	CDD:438812	25/77 (32%)