DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment pea and Dhx8

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_610928.1 Gene:pea / 36561 FlyBaseID:FBgn0086895 Length:1242 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_006247348.1 Gene:Dhx8 / 287727 RGDID:1310723 Length:1242 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1265 Identity:888/1265 - (70%)
Similarity:1017/1265 - (80%) Gaps:67/1265 - (5%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     2 DELQKLEYLSLVSKICTELDNHLGINDKDLAEFIIDLENKNRTYDTFRKALLDNGAEFPDSLVQN 66
            :||.||||||||||:||||||||||||||||||:|.|..||.|:|||:.:|:.|||||.|||:.|
  Rat    20 EELAKLEYLSLVSKVCTELDNHLGINDKDLAEFVISLAEKNTTFDTFKASLVKNGAEFTDSLISN 84

  Fly    67 LQRIINLMRPSRPGGASQEKTVGDKKEDKKSQLLKMFPGLALPNDTYSKKEESDDDEKVKAKPEK 131
            |.|:|..|||......|::..|..|.|  |.:|.::||.|..|::...:....::|.||.     
  Rat    85 LLRLIQTMRPPAKPSTSKDPVVKPKTE--KEKLKELFPVLCQPDNPSVRTMLDEEDVKVA----- 142

  Fly   132 HSETHKKTDMSDVDAAMMELEALAPGEGATLVRPHKEVSSRDRHKRRSRDRDTKRRSRSREDRHS 196
                        || .:.|||||.|.......:...|...|.:.|:|||.||   |.|.| ||..
  Rat   143 ------------VD-VLKELEALMPSAAGQEKQRDTEHRDRTKKKKRSRSRD---RDRDR-DRDR 190

  Fly   197 DRRRSRSRDKERRR-RSRSRDNRRRSRSREDRDRDRDRRHKSSSSRDH---HER-----RRRSRS 252
            ||.|.|.|||:|.| |.|.||..|      |||||..|||: |.||.|   .||     |.||||
  Rat   191 DRDRDRDRDKDRERDRDRERDRER------DRDRDHKRRHR-SRSRSHSRTRERAKGKSRYRSRS 248

  Fly   253 RS----TERRDRR-------DRSRDCSEKMPPPSAAMTDDPEAGKIYSGKIANIVPFGCFVQLFG 306
            ||    .:|:||.       ||.||.....|||     ::|..|.||:||:.:|:.|||||||.|
  Rat   249 RSQSPFKDRKDREKYGERNLDRWRDKHVDRPPP-----EEPAIGDIYNGKVTSIMQFGCFVQLEG 308

  Fly   307 LRKRWEGLVHISQLRAEGRVTDVTEVVTRNQTVKVKVMSITGQKVSLSMKEVDQDSGKDLNP--- 368
            ||||||||||||:||.||||.:|.:||::.|.|||||:|.||.|.|||||:|||::|:||||   
  Rat   309 LRKRWEGLVHISELRREGRVANVADVVSKGQRVKVKVLSFTGTKTSLSMKDVDQETGEDLNPNRR 373

  Fly   369 LSHAPEDDESLRDRNPDGPFSSSTSMLNLQGNGMEGDEHESRKRVTRISSPERWEIKQMISSGVL 433
            .:...|.:|....||||.|    |.:..:....:|.|..| |||:||||.||:|||||||::.||
  Rat   374 RNLVGETNEETSMRNPDRP----THLSLVSAPEVEDDSLE-RKRLTRISDPEKWEIKQMIAANVL 433

  Fly   434 DRSEMPDFDEETGLLPK--DEDDEADIEIEIVEEEPPFLSGHGRALHDLSPVRIVKNPDGSLAQA 496
            .:.|.||||||||:|||  ||:|| |:|||:||||||||.||.:...|:||::|||||||||:||
  Rat   434 SKEEFPDFDEETGILPKVDDEEDE-DLEIELVEEEPPFLRGHTKQSMDMSPIKIVKNPDGSLSQA 497

  Fly   497 AMMQSALSKERREQKMLQREQEIEAMPTSLNKNWIDPLPEDESRSLAANMRGMAAAPPEVPEWKK 561
            |||||||:|||||.|..|||.|::::|..|||:|:||||:.|.|.:||||||:...|.::|||||
  Rat   498 AMMQSALAKERRELKQAQREAEMDSIPMGLNKHWVDPLPDAEGRQIAANMRGIGMMPNDIPEWKK 562

  Fly   562 HVIGGKKSSFGKKTDLTLVEQRQSLPIYKLRDDLIKAVTDNQILIVIGETGSGKTTQITQYLGEC 626
            |..||.|:|:||||.::::|||:|||||||::.|::||.|||||||||||||||||||||||.|.
  Rat   563 HAFGGNKASYGKKTQMSILEQRESLPIYKLKEQLVQAVHDNQILIVIGETGSGKTTQITQYLAEA 627

  Fly   627 GFTARGKIGCTQPRRVAAMSVAKRVAEEYGCRLGQEVGYTIRFEDCTSPETIIKYMTDGMLLREC 691
            |:|:|||||||||||||||||||||:||:||.|||||||||||||||||||:|||||||||||||
  Rat   628 GYTSRGKIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEFGCCLGQEVGYTIRFEDCTSPETVIKYMTDGMLLREC 692

  Fly   692 LMEAELKSYSVIMLDEAHERTIHTDVLFGLLKTAVQKRPELKLIVTSATLDAVKFSQYFFKAPIF 756
            |::.:|..|::|||||||||||||||||||||..||||.::||||||||||||||||||::||||
  Rat   693 LIDPDLTQYAIIMLDEAHERTIHTDVLFGLLKKTVQKRQDMKLIVTSATLDAVKFSQYFYEAPIF 757

  Fly   757 TIPGRTFPVEVLYTKEPETDYLDASLITVMQIHLREPPGDILLFLTGQEEIDTACEILYERMKSL 821
            ||||||:|||:|||||||||||||||||||||||.|||||||:||||||||||||||||||||||
  Rat   758 TIPGRTYPVEILYTKEPETDYLDASLITVMQIHLTEPPGDILVFLTGQEEIDTACEILYERMKSL 822

  Fly   822 GPDVPELIILPVYSALPSEMQTRIFDPAPAGSRKVVIATNIAETSLTIDGIFYVVDPGFVKQKVY 886
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||:|||||||||||||
  Rat   823 GPDVPELIILPVYSALPSEMQTRIFDPAPPGSRKVVIATNIAETSLTIDGIYYVVDPGFVKQKVY 887

  Fly   887 NSKTGMDSLVVTPISQAAAKQRAGRAGRTGPGKTYRLYTERAYRDEMLPTPVPEIQRTNLATTVL 951
            |||||:|.|||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||.|.||||||||||:|||
  Rat   888 NSKTGIDQLVVTPISQAQAKQRAGRAGRTGPGKCYRLYTERAYRDEMLTTNVPEIQRTNLASTVL 952

  Fly   952 QLKTMGINDLLHFDFMDAPPVESLVMALEQLHSLSALDDEGLLTRLGRRMAEFPLEPNLSKMLIM 1016
            .||.|||||||.||||||||:|:|:.|:|||::|.||||||||||||||||||||||.|.|||||
  Rat   953 SLKAMGINDLLSFDFMDAPPMETLITAMEQLYTLGALDDEGLLTRLGRRMAEFPLEPMLCKMLIM 1017

  Fly  1017 SVALQCSDEILTIVSMLSVQNVFYRPKDKQALADQKKAKFNQAEGDHLTLLAVYNSWKNNKFSNA 1081
            ||.|.||:|:||||||||||||||||||||||||||||||:|.|||||||||||||||||||||.
  Rat  1018 SVHLGCSEEMLTIVSMLSVQNVFYRPKDKQALADQKKAKFHQTEGDHLTLLAVYNSWKNNKFSNP 1082

  Fly  1082 WCYENFVQIRTLKRSQDVRKQLLGIMDRHKLDVVSAGKNSVRIQKAICSGFFRNAAKKDPQEGYR 1146
            ||||||:|.|:|:|:||:|||:|||||||||||||.||::||:||||||||||||||||||||||
  Rat  1083 WCYENFIQARSLRRAQDIRKQMLGIMDRHKLDVVSCGKSTVRVQKAICSGFFRNAAKKDPQEGYR 1147

  Fly  1147 TLVDSQVVYIHPSSALFNRQPEWVIYHELVQTTKEYMREVTTIDPKWLVEFAPSFFRFSDPTKLS 1211
            ||:|.|||||||||||||||||||:|||||.||||||||||||||:|||||||:||:.|||||||
  Rat  1148 TLIDQQVVYIHPSSALFNRQPEWVVYHELVLTTKEYMREVTTIDPRWLVEFAPAFFKVSDPTKLS 1212

  Fly  1212 KFKKNQRLEPLYNKYEEPNAWRISRVRRRR 1241
            |.||.||||||||:|||||||||||..|||
  Rat  1213 KQKKQQRLEPLYNRYEEPNAWRISRAFRRR 1242

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
peaNP_610928.1 S1_DHX8_helicase 285..363 CDD:240189 53/77 (69%)
HrpA 573..1221 CDD:224557 558/647 (86%)
Dhx8XP_006247348.1 S1_DHX8_helicase 287..365 CDD:240189 53/77 (69%)
DEXDc 583..768 CDD:214692 153/184 (83%)
DEXDc 604..742 CDD:238005 116/137 (85%)
HELICc 767..924 CDD:238034 147/156 (94%)
HA2 986..1068 CDD:214852 72/81 (89%)
OB_NTP_bind 1102..1201 CDD:285018 88/98 (90%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C166339560
Domainoid 1 1.000 616 1.000 Domainoid score I175
eggNOG 1 0.900 - - E1_COG1643
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 1 1.050 1700 1.000 Inparanoid score I70
OMA 1 1.010 - - QHG53574
OrthoDB 1 1.010 - - D354219at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000059
OrthoInspector 1 1.000 - - oto96503
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100085
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR18934
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X141
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1413.810

Return to query results.
Submit another query.