DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment pea and mog-5

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_610928.1 Gene:pea / 36561 FlyBaseID:FBgn0086895 Length:1242 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_495019.1 Gene:mog-5 / 173920 WormBaseID:WBGene00003393 Length:1200 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:1279 Identity:774/1279 - (60%)
Similarity:956/1279 - (74%) Gaps:127/1279 - (9%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     4 LQKLEYLSLVSKICTELDNHLGINDKDLAEFIIDLENKNRTYDTFRKALLDNGA--EFPDSLVQN 66
            :.:||:||||||:.:|::||.|:.:||:|||:|.|..:|.|:|..:|||...|.  :|.|||...
 Worm     1 MDQLEHLSLVSKVLSEVENHFGVVEKDVAEFVIHLAQENPTFDKLKKALDSQGLGDQFDDSLTAT 65

  Fly    67 LQRIINLM----RPSRPGGASQE--------KTVGDKKEDKKSQLLKMFPGLALPNDTYSKKEES 119
            :.||:..|    :.::.||.|:|        ..:.|.||:.|::|    |.||:.| |..:||::
 Worm    66 ILRIVQSMTAVKKKNKKGGDSKEDIKDSHKITLISDAKEEIKARL----PALAMAN-TAKEKEDN 125

  Fly   120 DDD-----EKVKAKPEKHSETHKKTDMSDVDAAMMELEALAPGEGATLVRPHKEVSSRDRHKRRS 179
            :||     ||::.:.|......|::|                             |.|:|.:.||
 Worm   126 EDDLMAQLEKMEGRYESEKRLQKESD-----------------------------SKRNRSRSRS 161

  Fly   180 RDRDTKRRSRSREDRHSDRRRSRSRDKERRRRSRSRDNRRRSRSREDRDRDRDRRHKSSSSRDHH 244
            |.||.|            ||||||.|::||||||||:: ||.|.|.||||||||....       
 Worm   162 RSRDRK------------RRRSRSGDRDRRRRSRSRED-RRDRDRRDRDRDRDRGRGD------- 206

  Fly   245 ERRRRSRSRSTERRDRRDRSRDCSEKMPPPSAAMTDDPEAGKIYSGKIANIVPFGCFVQLFGLRK 309
               ||...|..:||||||..          .|..::..|.||||.|::.:|..||.|:.|.|.|:
 Worm   207 ---RRGDDRQRDRRDRRDDG----------GARKSEVAEIGKIYDGRVNSIQSFGAFITLEGFRQ 258

  Fly   310 RWEGLVHISQLRAEGRVTDVTEVVTRNQTVKVKVMSITGQKVSLSMKEVDQDSGKDLNPLSHAPE 374
            :.||||||||:|.| ||..|.:|:.|.:.|||||..|...|:|||||||||:||:||||..    
 Worm   259 KQEGLVHISQIRNE-RVQTVADVLKRGENVKVKVNKIENGKISLSMKEVDQNSGEDLNPRE---- 318

  Fly   375 DDESLRDRNPDG-------PFSSSTSMLNLQGNGMEGDEHES----RKRVTRISSPERWEIKQMI 428
                 .|.|||.       |.:|::|.:|.:.:|:......|    :.|| |||:|||||::||.
 Worm   319 -----TDLNPDAIGVRPRTPPASTSSWMNPEASGVGQGPSTSIGGGKARV-RISTPERWELRQMQ 377

  Fly   429 SSGVLDRSEMPDFDEETGLLPK--DEDDEADIEIEIVEEEPPFLSGHGRALHDLSPVRIVKNPDG 491
            .:|||..::|||||||.|:|..  ||.|..|||||:||:||.||.|:|:...::.||::||||||
 Worm   378 GAGVLTATDMPDFDEEMGVLRNYDDESDGEDIEIELVEDEPDFLRGYGKGGAEIEPVKVVKNPDG 442

  Fly   492 SLAQAAMMQSALSKERREQKM-LQREQEIEAMP-TSLNKNWIDPL--------PEDESRSLAANM 546
            ||||||:||.||||||:|.|: .|||::::... .|.|...:||:        ..|||:.....|
 Worm   443 SLAQAALMQGALSKERKETKIQAQRERDMDTQKGFSSNARILDPMSGNQSTAWSADESKDRNNKM 507

  Fly   547 RGMAAAPPEVPEWKKHVIGGKKSSFGKKTDLTLVEQRQSLPIYKLRDDLIKAVTDNQILIVIGET 611
            :       |:|||.|||..|.|:::|::|:|::||||:||||:.|:.:|::|:.|||||:|:|||
 Worm   508 K-------EMPEWLKHVTAGGKATYGRRTNLSMVEQRESLPIFALKKNLMEAMIDNQILVVVGET 565

  Fly   612 GSGKTTQITQYLGECGFTARGKIGCTQPRRVAAMSVAKRVAEEYGCRLGQEVGYTIRFEDCTSPE 676
            |||||||:|||..|.|...|||||||||||||||||||||||||||:||.:||||||||||||.:
 Worm   566 GSGKTTQMTQYAIEAGLGRRGKIGCTQPRRVAAMSVAKRVAEEYGCKLGTDVGYTIRFEDCTSQD 630

  Fly   677 TIIKYMTDGMLLRECLMEAELKSYSVIMLDEAHERTIHTDVLFGLLKTAVQKRPELKLIVTSATL 741
            ||||||||||||||||::.:|..||:|||||||||||||||||||||.|.:||||||||:|||||
 Worm   631 TIIKYMTDGMLLRECLIDPDLSGYSLIMLDEAHERTIHTDVLFGLLKAAARKRPELKLIITSATL 695

  Fly   742 DAVKFSQYFFKAPIFTIPGRTFPVEVLYTKEPETDYLDASLITVMQIHLREPPGDILLFLTGQEE 806
            |:||||:||.:||||||||||||||:|||:|||:|||:|:.||||||||.|||||:|:|||||||
 Worm   696 DSVKFSEYFLEAPIFTIPGRTFPVEILYTREPESDYLEAAHITVMQIHLTEPPGDVLVFLTGQEE 760

  Fly   807 IDTACEILYERMKSLGPDVPELIILPVYSALPSEMQTRIFDPAPAGSRKVVIATNIAETSLTIDG 871
            |||:||:|||||||:|||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||
 Worm   761 IDTSCEVLYERMKSMGPDVPELIILPVYGALPSEMQTRIFDPAPAGKRKVVIATNIAETSLTIDG 825

  Fly   872 IFYVVDPGFVKQKVYNSKTGMDSLVVTPISQAAAKQRAGRAGRTGPGKTYRLYTERAYRDEMLPT 936
            |||||||||||||:||.|:||||||||||||||||||:||||||||||.||||||||:|||||||
 Worm   826 IFYVVDPGFVKQKIYNPKSGMDSLVVTPISQAAAKQRSGRAGRTGPGKCYRLYTERAFRDEMLPT 890

  Fly   937 PVPEIQRTNLATTVLQLKTMGINDLLHFDFMDAPPVESLVMALEQLHSLSALDDEGLLTRLGRRM 1001
            |||||||||||:|:||||.||||:|:.||||||||::|::.||..||:|||||.:||||:|||||
 Worm   891 PVPEIQRTNLASTLLQLKAMGINNLIDFDFMDAPPLDSMITALNTLHTLSALDGDGLLTKLGRRM 955

  Fly  1002 AEFPLEPNLSKMLIMSVALQCSDEILTIVSMLSVQNVFYRPKDKQALADQKKAKFNQAEGDHLTL 1066
            |||||||:|||:|||||.|.||:|:||||:||:|||:|||||:||..||||||||:|.|||||||
 Worm   956 AEFPLEPSLSKLLIMSVDLGCSEEVLTIVAMLNVQNIFYRPKEKQDHADQKKAKFHQPEGDHLTL 1020

  Fly  1067 LAVYNSWKNNKFSNAWCYENFVQIRTLKRSQDVRKQLLGIMDRHKLDVVSAGKNSVRIQKAICSG 1131
            |||||||||:.||..||:|||:|:|::||:||:|||||||||||||.:||.|::..|:|||||||
 Worm  1021 LAVYNSWKNHHFSQPWCFENFIQVRSMKRAQDIRKQLLGIMDRHKLLMVSCGRDVSRVQKAICSG 1085

  Fly  1132 FFRNAAKKDPQEGYRTLVDSQVVYIHPSSALFNRQPEWVIYHELVQTTKEYMREVTTIDPKWLVE 1196
            |||||||:|||||||||.|.|.||||||||.|.:|||||:|||||.||||||||||.||||||||
 Worm  1086 FFRNAAKRDPQEGYRTLTDGQNVYIHPSSACFQQQPEWVVYHELVMTTKEYMREVTAIDPKWLVE 1150

  Fly  1197 FAPSFFRFSDPTKLSKFKKNQRLEPLYNKYEEPNAWRISRVRRR 1240
            ||||||:..|.||||.||:||:::||::||.:.|||||:||::|
 Worm  1151 FAPSFFKIGDSTKLSTFKRNQKIDPLFDKYADANAWRITRVKKR 1194

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
peaNP_610928.1 GH2-like_DHX8 7..74 CDD:409668 32/68 (47%)
S1_DHX8_helicase 285..363 CDD:240189 43/77 (56%)
HrpA 578..>1203 CDD:441249 503/624 (81%)
mog-5NP_495019.1 GH2-like_DHX8 4..73 CDD:409668 32/68 (47%)
S1_DHX8_helicase 234..311 CDD:240189 43/77 (56%)
HrpA 538..>1157 CDD:441249 499/618 (81%)

Return to query results.
Submit another query.