DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment pea and DHX8

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_610928.1 Gene:pea / 36561 FlyBaseID:FBgn0086895 Length:1242 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_004932.1 Gene:DHX8 / 1659 HGNCID:2749 Length:1220 Species:Homo sapiens


Alignment Length:1256 Identity:880/1256 - (70%)
Similarity:1010/1256 - (80%) Gaps:71/1256 - (5%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     2 DELQKLEYLSLVSKICTELDNHLGINDKDLAEFIIDLENKNRTYDTFRKALLDNGAEFPDSLVQN 66
            :||.||||||||||:||||||||||||||||||:|.|..||.|:|||:.:|:.|||||.|||:.|
Human    20 EELAKLEYLSLVSKVCTELDNHLGINDKDLAEFVISLAEKNTTFDTFKASLVKNGAEFTDSLISN 84

  Fly    67 LQRIINLMRPSRPGGASQEKTVGDKKEDKKSQLLKMFPGLALPNDTYSKKEESDDDEKVKAKPEK 131
            |.|:|..|||......|::..|..|.|  |.:|.::||.|..|::...:....:||.||.     
Human    85 LLRLIQTMRPPAKPSTSKDPVVKPKTE--KEKLKELFPVLCQPDNPSVRTMLDEDDVKVA----- 142

  Fly   132 HSETHKKTDMSDVDAAMMELEALAPGEGATLVRPHKEVSSRDRHKRRSRDRDTKRRSRSREDRHS 196
                        || .:.|||||.|.......:...|...|.:.|:|||.||..|      ||..
Human   143 ------------VD-VLKELEALMPSAAGQEKQRDAEHRDRTKKKKRSRSRDRNR------DRDR 188

  Fly   197 DRRRSRSRDKERRRRSRSRDNRRRSRSREDRDRDRDRRHKSSSSRDHHERRRRSRSRS----TER 257
            ||.|:|.||.:||.|||||.   |||:||        |:|..|       |.||||||    .:|
Human   189 DRERNRDRDHKRRHRSRSRS---RSRTRE--------RNKVKS-------RYRSRSRSQSPPKDR 235

  Fly   258 RDR-------RDRSRDCSEKMPPPSAAMTDDPEAGKIYSGKIANIVPFGCFVQLFGLRKRWEGLV 315
            :||       .||.||.....|||     ::|..|.||:||:.:|:.|||||||.||||||||||
Human   236 KDRDKYGERNLDRWRDKHVDRPPP-----EEPTIGDIYNGKVTSIMQFGCFVQLEGLRKRWEGLV 295

  Fly   316 HISQLRAEGRVTDVTEVVTRNQTVKVKVMSITGQKVSLSMKEVDQDSGKDLNP---LSHAPEDDE 377
            |||:||.||||.:|.:||::.|.|||||:|.||.|.|||||:|||::|:||||   .:...|.:|
Human   296 HISELRREGRVANVADVVSKGQRVKVKVLSFTGTKTSLSMKDVDQETGEDLNPNRRRNLVGETNE 360

  Fly   378 SLRDRNPDGPFSSSTSMLNLQGNGMEGDEHESRKRVTRISSPERWEIKQMISSGVLDRSEMPDFD 442
            ....||||.|    |.:..:....:|.|..| |||:||||.||:|||||||::.||.:.|.||||
Human   361 ETSMRNPDRP----THLSLVSAPEVEDDSLE-RKRLTRISDPEKWEIKQMIAANVLSKEEFPDFD 420

  Fly   443 EETGLLPK--DEDDEADIEIEIVEEEPPFLSGHGRALHDLSPVRIVKNPDGSLAQAAMMQSALSK 505
            ||||:|||  ||:|| |:|||:||||||||.||.:...|:||::|||||||||:|||||||||:|
Human   421 EETGILPKVDDEEDE-DLEIELVEEEPPFLRGHTKQSMDMSPIKIVKNPDGSLSQAAMMQSALAK 484

  Fly   506 ERREQKMLQREQEIEAMPTSLNKNWIDPLPEDESRSLAANMRGMAAAPPEVPEWKKHVIGGKKSS 570
            ||||.|..|||.|::::|..|||:|:||||:.|.|.:||||||:...|.::||||||..||.|:|
Human   485 ERRELKQAQREAEMDSIPMGLNKHWVDPLPDAEGRQIAANMRGIGMMPNDIPEWKKHAFGGNKAS 549

  Fly   571 FGKKTDLTLVEQRQSLPIYKLRDDLIKAVTDNQILIVIGETGSGKTTQITQYLGECGFTARGKIG 635
            :||||.::::|||:|||||||::.|::||.|||||||||||||||||||||||.|.|:|:|||||
Human   550 YGKKTQMSILEQRESLPIYKLKEQLVQAVHDNQILIVIGETGSGKTTQITQYLAEAGYTSRGKIG 614

  Fly   636 CTQPRRVAAMSVAKRVAEEYGCRLGQEVGYTIRFEDCTSPETIIKYMTDGMLLRECLMEAELKSY 700
            ||||||||||||||||:||:||.|||||||||||||||||||:||||||||||||||::.:|..|
Human   615 CTQPRRVAAMSVAKRVSEEFGCCLGQEVGYTIRFEDCTSPETVIKYMTDGMLLRECLIDPDLTQY 679

  Fly   701 SVIMLDEAHERTIHTDVLFGLLKTAVQKRPELKLIVTSATLDAVKFSQYFFKAPIFTIPGRTFPV 765
            ::|||||||||||||||||||||..||||.::||||||||||||||||||::||||||||||:||
Human   680 AIIMLDEAHERTIHTDVLFGLLKKTVQKRQDMKLIVTSATLDAVKFSQYFYEAPIFTIPGRTYPV 744

  Fly   766 EVLYTKEPETDYLDASLITVMQIHLREPPGDILLFLTGQEEIDTACEILYERMKSLGPDVPELII 830
            |:|||||||||||||||||||||||.|||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||
Human   745 EILYTKEPETDYLDASLITVMQIHLTEPPGDILVFLTGQEEIDTACEILYERMKSLGPDVPELII 809

  Fly   831 LPVYSALPSEMQTRIFDPAPAGSRKVVIATNIAETSLTIDGIFYVVDPGFVKQKVYNSKTGMDSL 895
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||:|.|
Human   810 LPVYSALPSEMQTRIFDPAPPGSRKVVIATNIAETSLTIDGIYYVVDPGFVKQKVYNSKTGIDQL 874

  Fly   896 VVTPISQAAAKQRAGRAGRTGPGKTYRLYTERAYRDEMLPTPVPEIQRTNLATTVLQLKTMGIND 960
            ||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||.|.||||||||||:|||.||.|||||
Human   875 VVTPISQAQAKQRAGRAGRTGPGKCYRLYTERAYRDEMLTTNVPEIQRTNLASTVLSLKAMGIND 939

  Fly   961 LLHFDFMDAPPVESLVMALEQLHSLSALDDEGLLTRLGRRMAEFPLEPNLSKMLIMSVALQCSDE 1025
            ||.||||||||:|:|:.|:|||::|.||||||||||||||||||||||.|.|||||||.|.||:|
Human   940 LLSFDFMDAPPMETLITAMEQLYTLGALDDEGLLTRLGRRMAEFPLEPMLCKMLIMSVHLGCSEE 1004

  Fly  1026 ILTIVSMLSVQNVFYRPKDKQALADQKKAKFNQAEGDHLTLLAVYNSWKNNKFSNAWCYENFVQI 1090
            :||||||||||||||||||||||||||||||:|.|||||||||||||||||||||.||||||:|.
Human  1005 MLTIVSMLSVQNVFYRPKDKQALADQKKAKFHQTEGDHLTLLAVYNSWKNNKFSNPWCYENFIQA 1069

  Fly  1091 RTLKRSQDVRKQLLGIMDRHKLDVVSAGKNSVRIQKAICSGFFRNAAKKDPQEGYRTLVDSQVVY 1155
            |:|:|:||:|||:|||||||||||||.||::||:||||||||||||||||||||||||:|.||||
Human  1070 RSLRRAQDIRKQMLGIMDRHKLDVVSCGKSTVRVQKAICSGFFRNAAKKDPQEGYRTLIDQQVVY 1134

  Fly  1156 IHPSSALFNRQPEWVIYHELVQTTKEYMREVTTIDPKWLVEFAPSFFRFSDPTKLSKFKKNQRLE 1220
            |||||||||||||||:|||||.||||||||||||||:|||||||:||:.||||||||.||.||||
Human  1135 IHPSSALFNRQPEWVVYHELVLTTKEYMREVTTIDPRWLVEFAPAFFKVSDPTKLSKQKKQQRLE 1199

  Fly  1221 PLYNKYEEPNAWRISRVRRRR 1241
            ||||:|||||||||||..|||
Human  1200 PLYNRYEEPNAWRISRAFRRR 1220

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
peaNP_610928.1 GH2-like_DHX8 7..74 CDD:409668 48/66 (73%)
S1_DHX8_helicase 285..363 CDD:240189 53/77 (69%)
HrpA 578..>1203 CDD:441249 541/624 (87%)
DHX8NP_004932.1 GH2-like_DHX8 25..92 CDD:409668 48/66 (73%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 153..266 51/141 (36%)
S1_DHX8_helicase 265..343 CDD:240189 53/77 (69%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 337..372 15/38 (39%)
HrpA 556..>1187 CDD:441249 544/630 (86%)
DEAH box 685..688 2/2 (100%)

Return to query results.
Submit another query.