DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment AGO1 and AGO1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_725341.1 Gene:AGO1 / 36544 FlyBaseID:FBgn0262739 Length:984 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_061517419.1 Gene:AGO1 / 1280922 VectorBaseID:AGAMI1_003573 Length:955 Species:Anopheles gambiae


Alignment Length:989 Identity:878/989 - (88%)
Similarity:912/989 - (92%) Gaps:39/989 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MSTERELAPGGPAQLHPHTLPLTFPD----LQMTSTVGIIGKVY-ESQWTPSPTRPQSPSQAQTS 60
            |||||||.||...|||    ||::.|    :|:...  |:||.: ||.||.||.||.||||:|||
Mosquito     1 MSTERELTPGTTQQLH----PLSYSDMATHIQLNGV--IMGKSFNESPWTSSPPRPPSPSQSQTS 59

  Fly    61 FDTLTSPPAPGSSVNPTAVTSPSAQNVAAGGATVAGAAATAAQVASALGATTGSVTPAIATATPA 125
            ||||:.||| |::||||.|                 |..|..|.|.|||         :..|||.
Mosquito    60 FDTLSPPPA-GATVNPTTV-----------------ATTTGTQGAQALG---------VVPATPP 97

  Fly   126 TQPDMPVFTCPRRPNLGREGRPIVLRANHFQVTMPRGYVHHYDINIQPDKCPRKVNREIIETMVH 190
            ..||:||||||||||||||||||||||||||:|||||:|||||||||||||||||||||||||||
Mosquito    98 APPDLPVFTCPRRPNLGREGRPIVLRANHFQITMPRGFVHHYDINIQPDKCPRKVNREIIETMVH 162

  Fly   191 AYSKIFGVLKPVFDGRNNLYTRDPLPIGNERLELEVTLPGEGKDRIFRVTIKWQAQVSLFNLEEA 255
            ||||:||.|||||||||||||||.|||||:|:|||||||||||||:|||||||.|||||||||||
Mosquito   163 AYSKMFGALKPVFDGRNNLYTRDLLPIGNDRVELEVTLPGEGKDRVFRVTIKWVAQVSLFNLEEA 227

  Fly   256 LEGRTRQIPYDAILALDVVMRHLPSMTYTPVGRSFFSSPEGYYHPLGGGREVWFGFHQSVRPSQW 320
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||
Mosquito   228 LEGRTRQIPYDAILALDVVMRHLPSMTYTPVGRSFFSSPDGYYHPLGGGREVWFGFHQSVRPSQW 292

  Fly   321 KMMLNIDVSATAFYKAQPVIDFMCEVLDIRDINEQRKPLTDSQRVKFTKEIKGLKIEITHCGQMR 385
            ||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Mosquito   293 KMMLNIDVSATAFYKAQPVIEFMCEVLDIRDINEQRKPLTDSQRVKFTKEIKGLKIEITHCGTMR 357

  Fly   386 RKYRVCNVTRRPAQMQSFPLQLENGQTVECTVAKYFLDKYRMKLRYPHLPCLQVGQEHKHTYLPL 450
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||
Mosquito   358 RKYRVCNVTRRPAQMQSFPLQLENGQTVECTVAKYFLDKYKMKLRYPHLPCLQVGQEHKHTYLPL 422

  Fly   451 EVCNIVAGQRCIKKLTDMQTSTMIKATARSAPDREREINNLVKRADFNNDSYVQEFGLTISNSMM 515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||:|||||||||||:||
Mosquito   423 EVCNIVAGQRCIKKLTDMQTSTMIKATARSAPDREREINNLVRRADFNNDAYVQEFGLTISNNMM 487

  Fly   516 EVRGRVLPPPKLQYGGRVSTGLTGQQLFPPQNKVSLASPNQGVWDMRGKQFFTGVEIRIWAIACF 580
            |||||||||||||||||||: ::||.|..||||||||.||||||||||||||||||||:||||||
Mosquito   488 EVRGRVLPPPKLQYGGRVSS-MSGQLLSGPQNKVSLALPNQGVWDMRGKQFFTGVEIRVWAIACF 551

  Fly   581 APQRTVREDALRNFTQQLQKISNDAGMPIIGQPCFCKYATGPDQVEPMFRYLKITFPGLQLVVVV 645
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..|||||||
Mosquito   552 APQRTVREDALRNFTQQLQKISNDAGMPIIGQPCFCKYATGPDQVEPMFRYLKSTFSHLQLVVVV 616

  Fly   646 LPGKTPVYAEVKRVGDTVLGMATQCVQAKNVNKTSPQTLSNLCLKINVKLGGINSILVPSIRPKV 710
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mosquito   617 LPGKTPVYAEVKRVGDTVLGMATQCVQAKNVNKTSPQTLSNLCLKINVKLGGINSILVPSIRPKV 681

  Fly   711 FNEPVIFLGADVTHPPAGDNKKPSIAAVVGSMDAHPSRYAATVRVQQHRQEIIQELSSMVRELLI 775
            |:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mosquito   682 FDEPVIFLGADVTHPPAGDNKKPSIAAVVGSMDAHPSRYAATVRVQQHRQEIIQELSSMVRELLI 746

  Fly   776 MFYKSTGGYKPHRIILYRDGVSEGQFPHVLQHELTAIREACIKLEPEYRPGITFIVVQKRHHTRL 840
            ||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||.:|:||||||||||||||||
Mosquito   747 MFYKSTGGFKPHRIILYRDGVSEGQFPHVLQHELTAIREACIKLEADYKPGITFIVVQKRHHTRL 811

  Fly   841 FCAEKKEQSGKSGNIPAGTTVDVGITHPTEFDFYLCSHQGIQGTSRPSHYHVLWDDNHFDSDELQ 905
            |||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||
Mosquito   812 FCADKKEQSGKSGNIPAGTTVDVGITHPTEFDFYLCSHQGIQGTSRPSHYHVLWDDNHFESDELQ 876

  Fly   906 CLTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYAHLVAFRARYHLVEKEHDSGEGSHQSGCSEDRTPGAMARA 970
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mosquito   877 CLTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYAHLVAFRARYHLVEKEHDSGEGSHQSGCSEDRTPGAMARA 941

  Fly   971 ITVHADTKKVMYFA 984
            ||||||||||||||
Mosquito   942 ITVHADTKKVMYFA 955

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
AGO1NP_725341.1 ArgoN 146..275 CDD:465134 119/128 (93%)
ArgoL1 285..335 CDD:462567 48/49 (98%)
PAZ_argonaute_like 336..456 CDD:239212 116/119 (97%)
Piwi_ago-like 502..942 CDD:240015 419/439 (95%)
AGO1XP_061517419.1 None

Return to query results.
Submit another query.