Protein Alignment shot and kst

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_725339.1
• Gene: shot / 36542
• FlyBaseID: FBgn0013733
• Length: 8805
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001097492.2
• Gene: kst / 38418
• FlyBaseID: FBgn0004167
• Length: 4337
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 5053
• Identity: 1002/5053 - (19%)
• Similarity: 1833/5053 - (36%)
• Gaps: 1412/5053 - (27%)

  Fly  4373 TCRNGII---NRREGVFRE-----------PGSNSFVPLGEALSLGLIVDIENAGFGLYELLSMG 4423
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  Fly    53 TQRDGIIKFENERIKTLQEERLHIQKKTFTKWMNSFLIKAKMEVEDLFTDLAD-GIKLLKLLEI- 115

  Fly  4424 FYETSTRKVLHPVTNRKLNLNEACVEDVVSLSSSLVKHHETGKYLRLANAIKEQLVDDSRGCYNL 4488
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  Fly   277 DAEDIDSAR-----PDEKSILTYVASYYH----TFARMKNEQKSGKRIANIVGQL--------MD 324

  Fly  4637 KPREMSLEEAIRYNI---IDPKTALVRDFDSFKFLPYSV-AVERGLVDTTK-RTLVDP------- 4689
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  Fly   325 ADRKKMQYEGLTTNLLSWIRQKTLELEQRD----LPNSLEGIQRELLAFKEYRTIEKPPKYKERS 385

  Fly  4690 --KALYFAFDPTLIVYVREPVTFDQAAESKCLDLQTGLLTYVPASVPGSATAAPASDDSANDSLT 4752
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  Fly   386 EIEALYFTIN-TLLKALNQP-------------------PYNP---------------------- 408

  Fly  4753 VIETPKVYTLKEAASAGVVDPDSALVKDLAKA-KLVRLPE-----AFRKGLMDANKANVLNTQTS 4811
                                .|..||.|:.|| :::...|     |.|..|:...|...||.:..
  Fly   409 --------------------QDGQLVNDIEKAWQILEYAEHHREVALRDELLRQEKLEQLNYKFE 453

  Fly  4812 KLCTLQEAYESGLICTPKRSFGLLEAITFNLYNPTNGCLVDPFQMHPDIIRRRKFTLAEAIGSGL 4876
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  Fly   454 KKSVLREGY-------------LKEMIQ---------VLSD-----PRYLRQVDATLKK------ 485

  Fly  4877 VDPSSTVVRDPSTGVIVPLTAAISSGLIDATEGRLTDANEPKNNIDLVKAAEKGLLLPAEQRQAV 4941
                               ..|||:.::...| |..|.......:|......|
  Fly   486 -------------------HEAISADILARVE-RFNDLTAMAEELDRENYHGK------------ 518

  Fly  4942 FEKFNMCEENVNDLLKWVTTVEQKISSVGGPREKIDELRNQINALKQIKDEIES----QQR---- 4998
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  Fly   519 -ERVRRREQEV--MAKW----RQLLELLENQRLNLSQMSNLMNLLREIASTTEAVRELQQQFASE 576

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  Fly   577 DVGPHLLGVEELLQAHSLQELQVNTYGETLKRFNRQALPYKSSEHKDAALLAQRLADLEEAYSEL 641

  Fly  5048 LRRLEAGRDELTKLRSELDVFSDWLQVARRTLEDKERSLSDLTRLPSQADSVREFVSDVIGHQAD 5112
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  Fly   642 LRRSAARRARLEEARNFHHFMEDY--------DNEESWLVDKQRICKTGITAK-----------D 687

  Fly  5113 LRFITMAAQK---FVDESKEFLAILNDFRTSLPERLPHVEPLSSAESPIRQEVSLVSAQY---KD 5171
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  Fly   688 LRAVLSLQQKHKALEDEIK--------------SRKPKSGQMSTAGK------RLIGEQHPRSSE 732

  Fly  5172 LLNRVNALQDRVSGLGG----RQREYQDALD---------KANEWLRSVHPRVSRIISEPIAGDP 5223
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  Fly   733 IQSRIDSLAEHWQALEALVELRRRQLEDAAEAYQFYTDANEAESWL---NEKIALVNSRDYGNDE 794

  Fly  5224 KGVQDQMNEAKALHNELLS-SGRLVDNAQQALDNLLRSLGGQLSPMEINQLELPIADLKN----N 5283
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  Fly   795 PSAQALLQRHRDLQGELNAYSGDILNLNQQA-DKLIKA---GICTLELSAAEPELPEVEQEEWVN 855

  Fly  5284 YQQL----------LDNLGEHCKTLDKTLV---------QSQGVQ-------------------- 5309
            ..:|          ::.| ||.|..:..::         :.||::
  Fly   856 ETRLVPKEVWEDEWVEKL-EHKKVTETKMLPHVKSLFPFEGQGMKMDKGEVMLLKSKTNDDWWCV 919

  Fly  5310 ---DALDSLV--GWVNQAEDKFKMNLRPASLI---KERLQEQIREHKVLLADLQSHQASIDSVQV 5366
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  Fly   920 RKDNGVEGFVPANYVREVEP------RPVACIVPKAEKVKSLQKVKKTILVRQVVPVKRIKPVSV 978

  Fly  5367 SAKHLLASASNARI----AKKVESNLNDVTVKFEKLYEKANKRGEFLDDVYNRLSRYLDEISTVE 5427
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  Fly   979 APKPLVQRRTSTQSINENADSVEKRQQRINQTYDELQEMAQKRHALLEDSIH-LFGFYRECDDFE 1042

  Fly  5428 QRMASLQEALDSRETSLLSTEELARRMNELSRDKDQLAPQFEDCVRSGKDLISLRDVTDTGVLRD 5492
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  Fly  1043 KWMKEKERMIKSDEGE--GVDNAKRKFEKFITDLSAASKRVEE-IDGAVDTFRRQGHSQLDKIIA 1104

  Fly  5493 RIKALESQWRNINISIDERAKLSKQKAEQQLAYEGLK---------DQVLSWLASTEARVNG--L 5546
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  Fly  1105 RQRQIHQIWQRLN----------NAKAQREKSLEGASSVELFNRTCDEAKVWMSEKMLQLDTAVI 1159

  Fly  5547 PPVAIDLDRIKQQHDELKPICKDYRDYAPTIDKINDIGAQYDALIRPESPARKRSTY--SPIKRT 5609
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  Fly  5610 SPLRRMSGDARSPSPTKGGILSPLSTGSSGFGSRRSSQDGFQLSELSPVQQQLSEINNRYGLIGV 5674
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  Fly  1201 YPAEKDNVNAR----------------------QQEVQDMWQ-----QVQQRGSDLRNR------ 1232

  Fly  5675 RLNDRQHELDNLNEELRKQYEN--LKGLAQFLERIQRQLPKESVSNKDEAERCIKQARKILE--- 5734
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  Fly  1233 -----------IESEVGQQVFNNSAKVLLAWIDSVKDQL------NADESARDVETANNLLKKHN 1280

  Fly  5735 DMYEKQSLLDTTKAQVKDILRRKSD--------VPGAEQLRQENDSI------QEKW-------- 5777
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  Fly  1281 DLGDDIRAHDTEFVEVIQLGKQLSDGKPNMAETVAVIERLKAEQDAIHRGWAEKQKWLLQCVDLQ 1345

  Fly  5778 ------KNLNDICKNRIAFSEKLRDFLDTHGNLKSWLDSKERMLTVLGPISSDPRMVQSQVQQVQ 5836
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  Fly  1346 MFNREADKIDATTKSHEAFLE--------YNNLGASLDEVEAIL-----------------KRHL 1385

  Fly  5837 VLREEFRTQQPQLKHFQELGHDVV--DHLAGTPDAQAVEIKLKDILGKWDDLVGKLDDRANSLGG 5899
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  Fly  1386 DFEKSLMAQDKILKGFSDNADKLISNDHY----DSKYIGDRRNQVLGKRKAVKDRAFERKRLLQA 1446

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  Fly  1447 SKDFHK-FAAEADDLKVWLQ------DKTRIAGD--ENYRDLSNLPRKLQKHQAFERELRANEGQ 1502

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  Fly  6077 D------RQQDRGVKRDLDRIQQQWEKLRREAVDRHTRLQTCMEHCKKYSQTSETFLAWL--RTA 6133
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  Fly  6134 EDKLADLTPGVLSKAKLETRLRDLQTFRSEVWKHSGEFENTKGLGETFLSSCDIDKEPIKAELQD 6198
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  Fly  1801 -----------KLLTKHKTIELELDTYSGIVTEM--------GHSCAAMVAANHPDSKVLAAKQQ 1846

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  Fly  2117 TALKIQHDAIYGEIEAREDKFRYLNELS---DSMVQTGHYAAADVEEKCAAMLDERQKLHAAWNK 2178

  Fly  6668 DKI---SPLELW--------LDNTERSVKAMELIPTD----EEKIQQRIREHDRLHDEILGKKPD 6717
            .||   ..::|:        :||...|.:| .|..:|    .|.:|.:||:||           :
  Fly  2179 KKIMLEQKIDLFCFLRDAKQIDNLSSSQQA-ALSSSDFGQTVEDVQNKIRKHD-----------E 2231

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            ...:| |...|.       |:    :.:||:...:..|....||:.:...| ......:|.:...
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            ..:::..|::..|..:..|      |...|.:.:|:...:|||  :|.     |||:..:|  ::
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            ..:..|..:|:   |.||  |:....|:|..          |..:|:.|   ::|....|.:.|.
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  Fly  7296 ATKKRGSSLDDILSVAEPFWKQLNSVMKTLKDLEETLSCQEPPAAQPQDIKKQQVALQE------ 7354
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  Fly  2925 TKKDKLQQAYD-ALAFN-------------------------------RSVDEFNNWMDEVE--- 2954

  Fly  7473 VEVEALNRQAVELTERTSPEQAASIREPLSVVNRRWEALLRGMVERQKQLEHALLHLGQFQHALN 7537
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  Fly  2955 ----------LQLSSEDYGKDLAAV---------------SNLLKKHERLEADVAHHGEL----- 2989

  Fly  7538 ELLVWINKTDSTLDQLKPIPGDPQLLEVELAKLKVLANDIQAHQNSVDTLNDAGRQLIETEKGSV 7602
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  Fly  2990 ------------ADQLK--QKDEQFFQAE----HFLRHEIH-------------------ERATV 3017

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  Fly  3018 -------SIRRYNT----LHEPLGIRRENLEDSL-SLQQFLRDAEDELQWLAEKQLVAG-SQDLG 3069

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                |:...::...:.:|    ||....|.::.:..:||:.| |.|..  :|..||:....|:::
  Fly  3070 ----TSLLSVQGLQKKHNSLEAELTSQEPLIQALLQRGQQMI-RDNHF--ASEQLQYKSELLQKQ 3127

  Fly  7729 WDAVVSRASDKKIKLEIALKEATEFHDTLQAFVEWLTQAEKLLSNAEPVSRVLETIQAQMEEHKV 7793
            ...:...|:.::::|..|: |:..|:........|:.:...:||::: ..|...::|...::.:|
  Fly  3128 LVQLRDLAAIRRLRLLDAV-ESQLFYVEANEADAWMREKRPVLSSSD-YGRDEVSVQGHQKKLEV 3190

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            ||::::..:.::..:.|..|.|   .:|....  |..||  ..|...:|.::..|.||...|...
  Fly  3191 LQRELTAFKPSIEKVAKLATGLIERNHFDSSN--IAEKN--AQVGQEYEDLLRLAKERESRLGEC 3251

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            .|           :.:||:|||::.:.:.::  .|||    ::.:.:::.|...:.....|.|.:
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            :..:..:..|..|::........:..|     :::..::|.:..|.....::||..:.|
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            .....:..:.||.|  ||....|.::|...|.|..:|.    .||:|    |:.||       |:
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            .. :::.:.::|.|.|.::.....|....|.:|.:...|.|. |.|..|:|..|.   .||..:|
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            |.:.|..|:..|:...|           :...:::.|.: .|..:|: ||||      :::.|.|
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                    :.|.           |:||...|..      :|.|..|.|...||........|.
  Fly  3726 --------FGDD-----------NEHLALQKSSSSGMFGDRLRRGSADANVKRAESMKVQPKQAK 3771

  Fly  8375 --------RLTDLFRKMDKDNNGMIPRDVFIDGILNTKFDTSGLEMKA----------------V 8415
                    |....|||..|.....:| .|.|.|.|..|........||                |
  Fly  3772 RTPSFTTRRRAQSFRKNQKGEGFDLP-PVEIQGSLERKHGLQSGGKKAPVRSWKQFHTVLCGQLV 3835

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            ....|.|     |:.:...|..|            |:.::|               .|...|.::
  Fly  3836 CFFKDEN-----DFLQQKTATAPVNILGAKCERADDYTKKKYVFRLKLPDGSEFLFEAPSLDILN 3895

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  Fly  3947 PDSQRRTS---GAQVL--DGTATPQMAFL-QRQMQQQQQQQQSQPSSPTGGFDQKPPIPPRGAAP 4005

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  Fly  4071 TTMPPVGGQHQHPQNSHSHQNQHQAQVQQRINAFNAAASQQHQPDYFNNNTARQQPQRIPSGRID 4135

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  Fly  4136 STRKFIEMEAHNNNGGTSSSPKRSTINYSSSGASSNGNGNVKIGSGNSSTTTITTSTTTHQVTSS 4200

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  Fly  4201 SRTVWHLTSSPTSSTKSSSTGGSGEPSHAISNPSYMGLHLNNNNDSIGIGLGGWGNTRFESNRPV 4265

  Fly  8765 SSTPSGMQTPR-------KSSAEPTFSSTMRRTSRGTTPTEKREPFRL 8805
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  Fly  4266 SLQPDSISFSRVSAESSSESEAQSISSVSGVKGSKGTKEERRSGMFRI 4313

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
shot	NP_725339.1	SAC6	204..>420	CDD:227401
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		PLEC	<1498..1526	CDD:197605
		Plectin	1949..1980	CDD:459901
		DUF5585	2860..>3198	CDD:465521
		SMC_prok_B	<4936..>5564	CDD:274008	129/737 (18%)
		SPEC	5304..5513	CDD:238103	39/240 (16%)
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kst	NP_001097492.2	CH_beta_spectrin_rpt1	61..176	CDD:409042	32/150 (21%)
		CH_beta_spectrin_rpt2	196..302	CDD:409043	21/114 (18%)
		SPEC	450..640	CDD:238103	45/261 (17%)
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		SPEC	3465..3680	CDD:238103	57/233 (24%)
		PH_beta_spectrin	3801..3904	CDD:269975	18/107 (17%)