Protein Alignment stj and cacna2d2a

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001246303.1
• Gene: stj / 36526
• FlyBaseID: FBgn0261041
• Length: 1271
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001013521.4
• Gene: cacna2d2a / 541376
• ZFINID: ZDB-GENE-050320-71
• Length: 1109
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1291
• Identity: 326/1291 - (25%)
• Similarity: 558/1291 - (43%)
• Gaps: 287/1291 - (22%)

  Fly    36 NYNLVHSWADKLGMELFHLGDFITRRKEVQESFKDAK----VVSRNGASIVDSMAKEIEMMMDLK 96
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Zfish    37 HYTMMH-WAGRIEKELEKVLQLVTGGQQMRAIYNDKRNQFDVVRNTPKQLVEKVAGDIAKLLNRK 100

  Fly    97 VSAVRRIMDTAENTALSH--QNDMADKMFSYYSAKEMLEPGDPVPPIPTPAPDMDKDIGEPLIYV 159
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Zfish   101 RKALERLAREAEDIQREHSWQDAIKENDIQYYDAK-------------ADSDVMDDDDGENLL-D 151

  Fly   160 QPKVVVLE--PRPEFHNTPVNFSVSSVHVPVNVFDRAPDVIKAIQWSENLDQIFRDNYKNDPTLS 222
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Zfish   152 NPNSLSLEFVDDPNFKN-KVNYSYTAVQIPTDIYKGSPTILNELNWTQSLERVFIENSREDPSLR 215

  Fly   223 WQFFGSSTGFMRQFPASKWRKDVPVDLYDCRLRSWYMEAATSPKDIVILMDGSGSMLGQRLDIAK 287
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Zfish   216 WQVFGSTTGVTRYYPATKWKAPNKIDLYDVRRRPWYIQGASSPKDMVIIVDVSGSVSGLTLKLMK 280

  Fly   288 HVVNTILDTLGTNDFVNIFTFDKEVSPVVPCFEDTLIQANLGNIRELKEGIELFRPKSIANYTAA 352
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Zfish   281 TSVIEMLDTLSDDDYVNVARFNEKAYAVVPCF-TTLVQANIKNKKIFKEAVMNMQAKGTTDYKTG 344

  Fly   353 LTKAF-ELLEETKLSSRGAQCNQAIMIIGDGAPENNREVFELHNWRDPPYKPVRVFTYLIGKEVA 416
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Zfish   345 FQFAFDQLLNDT--SAPRANCNKMIMMFTDGGEDRAQDIFEKYNW---PNRTVRVFTFSVGQH-- 402

  Fly   417 NWD--DIRWMACENQGYYVHLSDTAEVREMVLNYIPVMARPLVL-GRHDHPVIWSQVYADIEDTK 478
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Zfish   403 NYDVTPLQWIACFNKGYYFEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGERAKQVQWTNVYQDALGLG 467

  Fly   479 LSDYLWDINQCEYQKADVLEYWQVHDRMLEPSEMHRRKYRRMKETWNQPVDSNVYQFMTTVSMPI 543
            |                                                        :.|.:||:
Zfish   468 L--------------------------------------------------------VITGTMPV 476

  Fly   544 YDRRENALINLTTDINPAAKINLQVTRIANILGVAGTDVPINEIKKLLSPFTLGVNGYAFIVTNN 608
            :        |||.|.:  .|.| |:     :|||.|.|:.:||||:|...:.||.|||.|.:..|
Zfish   477 F--------NLTADRD--TKQN-QL-----MLGVMGVDIALNEIKELTPRYKLGANGYTFAIDPN 525

  Fly   609 GYVLFHPDFRPIFQGYILKPAYNSVDMIEVELLDDDRPARDFNPVLMTIRDSIINQSTGSKWM-- 671
            ||||.||:.:|        ...|..:.:.::.||.:.|.|:..    .||..:|:...|.:.:
Zfish   526 GYVLLHPNLQP--------KIINFREPVTLDFLDAELPDRNKE----EIRRQMIDGRGGQRKIKT 578

  Fly   672 LVKNHFDEMKRVARVKRQYYWTAIKKTPFTLVISYPEQYGVSHMDIRADQEIHRISIKGTNLRSV 736
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Zfish   579 LVKS-VDE-RYIDESQRTYIWSPVEGTDYSLGLVLP-SYSENHIRANLSDQILQVQY-GSDFKDF 639

  Fly   737 FSGKRWKIHPDWLFCKHSNRTFKTPEIELLYFLERMSEPGWRWPGSRSAMPPEHAAAMFSNNSST 801
            .|     :.|:         ||::                   .|.....|.|:...:..:|::|
Zfish   640 ES-----LLPN---------TFES-------------------EGHVFIAPREYCKDLELSNNNT 671

  Fly   802 G---RYPSINEK---ESYYCDRQLMQALVFDARVTGWFSNNTSFNSKDDKGTSASSPIAVLMGLL 860
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Zfish   672 EFLLNFIALMEKVTPDSKQCDNFLLHNLILD---TG-----------------------IIKQLV 710

  Fly   861 PR----NEFKQRFGVTVAFLATHSGLTRWHEFHSNAAEESGVGETFSQNNTRAIDEIWYKRAVDQ 921
            .|    |:. ..:|....|.||..|:||  .|.:.||      ||: :.::...:..:|:|::|
Zfish   711 DRVWKINDL-NTYGFLAVFAATDGGITR--VFPNKAA------ETW-EEDSEPFNASYYRRSLD- 764

  Fly   922 HFVREESFVYSVPFDAGE------SNSEILVTASHAVFHNEGGKTAPAAVVGFQFQHSALYKLFH 980
                .:.:::..|:....      .|..|.:..|.||....|.:....||||.:....|....|.
Zfish   765 ----NKGYIFRAPYRTANDDIINPENDTIGILVSTAVDITMGSRNLKPAVVGVKLDLEAWTDKFK 825

  Fly   981 NITGN----------------ACAV------DDKDCYILDNNGYVIISTRV---HETGRFFGEVN 1020
            .:..|                .|.:      ||..||::|:.|::|:|.:.   ::.|.||.||:
Zfish   826 ILASNHTDSNRLSSQTCGPTSGCEMDCEANSDDLLCYLIDDGGFLIMSNQKDHWYKIGMFFSEVD 890

  Fly  1021 GAIMKRLLEENVYRQVTVYDYQAVCFESKNDNNASS---MLLSPLFHLLRVGKWLLHTALWYIVQ 1082
            ..:...|...:.||:...:|||:||....:.|..::   :.:..:..:|.|. ||...|.|.::|
Zfish   891 PTLFYALYNNSFYRRKQSFDYQSVCDPVPSSNTGAAPRGVFVPTIADMLNVA-WLTSAAAWSLLQ 954

  Fly  1083 LLQWAPGVSSHYADMYGDSNDTEPPPPEPHPDHHARNGNGHGKKDDDHWLRYLTLHRTRLKPCDM 1147
            .:.:.....|.:..   |..|.|                |...|:..........:.:.:.
Zfish   955 QMLYGFAYQSWFMT---DEVDAE----------------GFEYKETSCVTVQTQFYFSNIS---- 996

  Fly  1148 KRDLYTLFNEKDNVVYNMTAHACERPFVVLPIPFSNLILLVIDQL-CPRDGSVVLTVNPQPIDYH 1211
              ..|.:..:.||         |.|......|..:||:.:|.::| |  :...:..::....:|
Zfish   997 --SSYNILQDCDN---------CSRLIHAKRINNTNLLFVVAERLSC--NSCEIEKLSQVETEY- 1047

  Fly  1212 LSVNDSLACYKQAREFNRMRPHSCISRHANESGIKLCGKACSVYANLGLLLLCHIL 1267
               .::.||...|....|....||......|: ...||:..|...:|..|||..:|
Zfish  1048 ---KETKACETIAAPRYRKGTTSCFDYSVLEN-TSDCGRGHSFRPSLYTLLLLQLL 1099

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
stj	NP_001246303.1	VWA_N	107..241	CDD:462464	43/137 (31%)
		vWA_VGCC_like	253..439	CDD:238740	75/188 (40%)
		dCache_1	<528..624	CDD:460673	34/95 (36%)
		PDC2_MCP_like	586..708	CDD:350337	37/123 (30%)
		VGCC_alpha2	870..>1084	CDD:462488	59/247 (24%)
cacna2d2a	NP_001013521.4	None