Protein Alignment Mdr49 and pgp-8

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_523724.2
• Gene: Mdr49 / 36428
• FlyBaseID: FBgn0004512
• Length: 1302
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_509811.2
• Gene: pgp-8 / 181277
• WormBaseID: WBGene00004002
• Length: 1243
• Species: Caenorhabditis elegans
• Alignment Length: 1293
• Identity: 432/1293 - (33%)
• Similarity: 688/1293 - (53%)
• Gaps: 102/1293 - (7%)

  Fly    34 LFRYSTRCERFLLVVSLLVATAASAFIPYFMIIYGEFTSLLVDRTVGVGTSS--PA---FALPMF 93
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 Worm    28 VWQCTSKWEKFLFVIGVVSAICTGLTQPFMSYTFGEVSQAFVRITAAVNNASLDPSDLEKAYEMF 92

  Fly    94 GGGQQLTNASKEENNQAIIDDATAFGIGSLVGSVAMFLLITLAIDLANRIALNQIDRIRKLFLEA 158
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 Worm    93 ---------HADMNNVVI-----HFG---LVGCAFMFFGF-IQFSLFKYIGDNTTYRLRHKFILR 139

  Fly   159 MLRQDIAWYDTSSGSNFASKMTEDLDKLKEGIGEKIVIVVFLIMTFVIGIVSAFVYGWKLTLVVL 223
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 Worm   140 LLKKDAKYFDTISTGYLSTVLNDNLERFREAFNEKIAFIICFSTDFAIGTALAFYTSW-----TL 199

  Fly   224 SCVPFIIAATSVVARLQGSLA-----EKELKSYSDAANVVEEVFSGIRTVFAFSGQEKEKERFGK 283
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 Worm   200 ASYGSVFAFGIVISGLLNSTSMMKSNEKQSMHYSNAGAIAFQALCSFKTVISLNGQTQELEKYSA 264

  Fly   284 LLIPAENTGRKKGLYSGMGNALSWLIIYLCMAL---AIWYGVTLILDERDLPDRVYTPAVLVIVL 345
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 Worm   265 ELKEGEKFGSRRAFFLATSRGLSH---FFCNALNGTILYVGADLIYNKT-------MNTVAIVTL 319

  Fly   346 F-AVIMGAQNLGFASPHVEAIAVATAAGQTLFNIIDRPSQVDPMDEKGNRPENT------AGHIR 403
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 Worm   320 FHYMLFSAFSLGEAFLHISYLLNAINSATPIFDVL---TSDDDMIENNQDNEQTDSNKTIQGMLS 381

  Fly   404 FEGIRFRYPARPDVEILKGLTVDVLPGQTVAFVGASGCGKSTLIQLMQRFYDPEAGSVKLDGRDL 468
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 Worm   382 FNNVKFAYPSRPDVDILRGISFDVKQGECIALVGASGSGKSTIVQLLLHFYNIQSGTIKIGDSHL 446

  Fly   469 RTLNVGWLRSQIGVVGQEPVLFATTIGENIRYGRPSATQADIEKAARAANCHDFITRLPKGYDTQ 533
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 Worm   447 HDINLKQLRNAIGVVSQEPVLFNTTIEENIRFGNPNATSSEIYEALRKANAYDFVCNIKDGLKTI 511

  Fly   534 VGEKGAQISGGQKQRIAIARALVRQPQVLLLDEATSALDPTSEKRVQSALELASQGPTTLVVAHR 598
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 Worm   512 VGERGAQLSGGQKQRIAIARVLVKNPAILLLDEATSALDSASERAVQLALKKASEGRTTIIIAHR 576

  Fly   599 LSTITNADKIVFLKDGVVAEQGTHEELMERRGLYCELV--SITQRKEATEADEGAVAGRPLQKS- 660
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 Worm   577 LSTIRHCDKIMVMSNGKIAEVGSHEELISMDREYSNLVRAQFFDSQSVEEDINGQGAEEVIQKTP 641

  Fly   661 QNLSDEETDDDEEDEEEDEEPELQTSGSSRDSGFRASTRRKRRSQRRKKKKDKEVVSKVSFTQLM 725
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 Worm   642 PNLNDGEPLE-----------ELLKETSS----------------------DIEIKSNI--WEVL 671

  Fly   726 KLNSPEWRFIVVGGIASVMHGATFPLWG-LFFGDFFGILSDGDDDVVRAEVLKISMIFVGIGLMA 789
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 Worm   672 RECRPDAFLLSMAVIGSAIQGCNFPILSQIIVQTYKAYAMDGENILTYGHFW--AAMFLVLGVIR 734

  Fly   790 GLGNMLQTYMFTTAGVKMTTRLRKRAFGTIIGQDIAYFDDERNSVGALCSRLASDCSNVQGATGA 854
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 Worm   735 PITLYCQFFFFGKVSEKLSTRLRIKSFQHLLSLPCAFYDDPKHSPTRLVNRLNTDPSNIKAAVDA 799

  Fly   855 RVGTMLQAVATLVVGMVVGFVFSWQQTLLTLVTLPLVCLSVYLEGRFIMKSAQKAKASIEEASQV 919
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 Worm   800 RLGSLLMSMVSFSLAILIACYYSWKLTLQVVLFFPVLYYAKFLYKKTTTISIKEDSVAFENSNKI 864

  Fly   920 AVEAITNIRTVNGLCLERQVLDQYVQQIDRVDIACRRKVRFRGLVFALGQAAPFLAYGISMYYGG 984
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 Worm   865 AIEVLDNMKTVKALNMEARVINLVMEYLAVLKTSYPRRSVVMGLANGFSAGCSQIVYAISFKFGT 929

  Fly   985 ILVAEERMNYEDIIKVAEALIFGSWMLGQALAYAPNVNDAILSAGRLMDLFKRTSTQPNPPQSPY 1049
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 Worm   930 YLILQKEVIPMDMYLSLITLSYTSNMAGSAISYMPDFRKAIHSAGLIFNLFTYPATMPFNSDTGS 994

  Fly  1050 NTVEKSEGDIVYENVGFEYPTRKGTPILQGLNLTIKKSTTVALVGPSGSGKSTCVQLLLRYYDPV 1114
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 Worm   995 RSITK--GEVNGENVKFHYHQRPDYTVLDSVNLKVEAGKTLAIVGPSGSGKSTIISLLEMFYRAD 1057

  Fly  1115 SGSVNLSGVPSTEFPLDTLRSKLGLVSQEPVLFDRTIAENIAYGNNFRDDVSMQEIIEAAKKSNI 1179
            .|.:.:.........||.|||.||||||.||||:.:|.:||.||  ...::|..||..|.:.:|.
 Worm  1058 QGFIKIDNDNVENINLDHLRSNLGLVSQGPVLFNCSIRDNILYG--LTRNISQTEIENALQIANA 1120

  Fly  1180 HNFISALPQGYDTRLG-KTSQLSGGQKQRIAIARALVRNPKILILDEATSALDLESEKVVQQALD 1243
            .||:..||||.||.:| :.:||||||||||||.||::||||:|:|||||||||.||||:||.|||
 Worm  1121 FNFVFQLPQGLDTIVGDRGAQLSGGQKQRIAITRAILRNPKLLLLDEATSALDTESEKIVQNALD 1185

  Fly  1244 EARSGRTCLTIAHRLTTVRNADLICVLKRGVVVEHGTHDELMALNKIYANLYLMQQVS 1301
            .|....:.:.:||||:|:.|||.|.||:.|.|||.|||::|:|:...|..|...|:.|
 Worm  1186 TASERLSTIVVAHRLSTIINADSIAVLRNGKVVEQGTHNQLLAVKGDYWRLVQHQKSS 1243

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Mdr49	NP_523724.2	MdlB	44..643	CDD:440747	218/620 (35%)
		MdlB	720..1299	CDD:440747	195/580 (34%)
pgp-8	NP_509811.2	MdlB	37..618	CDD:440747	218/616 (35%)
		MdlB	667..1240	CDD:440747	195/580 (34%)