Protein Alignment Mdr49 and pgp-1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_523724.2
• Gene: Mdr49 / 36428
• FlyBaseID: FBgn0004512
• Length: 1302
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_502413.1
• Gene: pgp-1 / 178215
• WormBaseID: WBGene00003995
• Length: 1321
• Species: Caenorhabditis elegans
• Alignment Length: 1307
• Identity: 463/1307 - (35%)
• Similarity: 727/1307 - (55%)
• Gaps: 47/1307 - (3%)

  Fly     5 EESRLPQAGDFQLKEGSVVDATRKYSYFDLFRYSTRCERFLLVVSLLVATAASAFIPYFMIIYGE 69
            |...:...|:.::...:..:...|.|...|:||:|..|:.||.:..|||....|.:|...|:.|:
 Worm    36 EGDNIDSNGEIKITRDAKEEVVNKVSIPQLYRYTTTLEKLLLFIGTLVAVITGAGLPLMSILQGK 100

  Fly    70 FTSLLVDRTVGVGTSSPAFALPMFGGGQQLTNASKEENNQAIIDDATAFGIGS-LVGSVAMFLLI 133
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 Worm   101 VSQAFINEQIVINNNGSTF-LPT---GQNYTKTDFEHDVMNVVWSYAAMTVGMWAAGQITVTCYL 161

  Fly   134 TLAIDLANRIALNQIDRIRKLFLEAMLRQDIAWYDTSSGSNFASKMTEDLDKLKEGIGEKIVIVV 198
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 Worm   162 YVAEQMNN--------RLRREFVKSILRQEISWFDTNHSGTLATKLFDNLERVKEGTGDKIGMAF 218

  Fly   199 FLIMTFVIGIVSAFVYGWKLTLVVLSCVPFIIAATSVVARLQGSLAEKELKSYSDAANVVEEVFS 263
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 Worm   219 QYLSQFITGFIVAFTHSWQLTLVMLAVTPIQALCGFAIAKSMSTFAIRETLRYAKAGKVVEETIS 283

  Fly   264 GIRTVFAFSGQEKEKERFGKLLIPAENTGRKKGLYSGMGNALSWLIIYLCMALAIWYGVTLILD- 327
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 Worm   284 SIRTVVSLNGLRYELERYSTAVEEAKKAGVLKGLFLGISFGAMQASNFISFALAFYIGVGWVHDG 348

  Fly   328 ERDLPDRVYTPAVLVIVLFAVIMGAQNLGFASPHVEAIAVATAAGQTLFNIIDRPSQVDPMDEKG 392
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 Worm   349 SLNFGDMLTT-------FSSVMMGSMALGLAGPQLAVLGTAQGAASGIYEVLDRKPVIDSSSKAG 406

  Fly   393 NRPENTAGHIRFEGIRFRYPARPDVEILKGLTVDVLPGQTVAFVGASGCGKSTLIQLMQRFYDPE 457
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 Worm   407 RKDMKIKGDITVENVHFTYPSRPDVPILRGMNLRVNAGQTVALVGSSGCGKSTIISLLLRYYDVL 471

  Fly   458 AGSVKLDGRDLRTLNVGWLRSQIGVVGQEPVLFATTIGENIRYGRPSATQADIEKAARAANCHDF 522
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 Worm   472 KGKITIDGVDVRDINLEFLRKNVAVVSQEPALFNCTIEENISLGKEGITREEMVAACKMANAEKF 536

  Fly   523 ITRLPKGYDTQVGEKGAQISGGQKQRIAIARALVRQPQVLLLDEATSALDPTSEKRVQSALELAS 587
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 Worm   537 IKTLPNGYNTLVGDRGTQLSGGQKQRIAIARALVRNPKILLLDEATSALDAESEGIVQQALDKAA 601

  Fly   588 QGPTTLVVAHRLSTITNADKIVFLKDGVVAEQGTHEELMERRGLYCELVSITQRKEATEADEGAV 652
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 Worm   602 KGRTTIIIAHRLSTIRNADLIISCKNGQVVEVGDHRALMAQQGLYYDLVT---AQTFTDAVDSAA 663

  Fly   653 AG---RPLQKSQNLSDEETDDDEEDEEEDEEPELQTSG-SSRDSGFRASTRRKRRSQ----RRKK 709
            .|   |....::..|:.|....:..|.:|....:::|. .|..:|.....:.:|..:    |.|:
 Worm   664 EGKFSRENSVARQTSEHEGLSRQASEMDDIMNRVRSSTIGSITNGPVIDEKEERIGKDALSRLKQ 728

  Fly   710 KKDKEVVSKVSFTQLMKLNSPEWRFIVVGGIASVMHGATFPLWGLFFGDFFGILSDGDDDVVRAE 774
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 Worm   729 ELEENNAQKTNLFEILYHARPHALSLFIGMSTATIGGFIYPTYSVFFTSFMNVFAGNPADFL-SQ 792

  Fly   775 VLKISMIFVGIGLMAGLGNMLQTYMFTTAGVKMTTRLRKRAFGTIIGQDIAYFDDERNSVGALCS 839
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 Worm   793 GHFWALMFLVLAAAQGICSFLMTFFMGIASESLTRDLRNKLFRNVLSQHIGFFDSPQNASGKIST 857

  Fly   840 RLASDCSNVQGATGARVGTMLQAVATLVVGMVVGFVFSWQQTLLTLVTLPLVCLSVYLEGRFIMK 904
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 Worm   858 RLATDVPNLRTAIDFRFSTVITTLVSMVAGIGLAFFYGWQMALLIIAILPIVAFGQYLRGRRFTG 922

  Fly   905 SAQKAKASIEEASQVAVEAITNIRTVNGLCLERQVLDQYVQQIDRVDIACRRKVRFRGLVFALGQ 969
            ...|:.:...::.::|:|||.|:|||..|..|....:.:.:::|.......::...:||.:....
 Worm   923 KNVKSASEFADSGKIAIEAIENVRTVQALAREDTFYENFCEKLDIPHKEAIKEAFIQGLSYGCAS 987

  Fly   970 AAPFL----AY--GISMYYGGILVAEERMNYEDIIKVAEALIFGSWMLGQALAYAPNVNDAILSA 1028
            :..:|    ||  |:::    |:.....|....:::|..|:...:..||.|.:|.|....|..:.
 Worm   988 SVLYLLNTCAYRMGLAL----IITDPPTMQPMRVLRVMYAITISTSTLGFATSYFPEYAKATFAG 1048

  Fly  1029 GRLMDLFKRTSTQPNPPQSPYNTVEKSEGDIVYENVGFEYPTRKGTPILQGLNLTIKKSTTVALV 1093
            |.:..:.::.|...:  .|.....:|..|.::::||.|.||.|....||:||:.:::...|:|||
 Worm  1049 GIIFGMLRKISKIDS--LSLAGEKKKLYGKVIFKNVRFAYPERPEIEILKGLSFSVEPGQTLALV 1111

  Fly  1094 GPSGSGKSTCVQLLLRYYDPVSGSVNLSGVPSTEFPLDTLRSKLGLVSQEPVLFDRTIAENIAYG 1158
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 Worm  1112 GPSGCGKSTVVALLERFYDTLGGEIFIDGSEIKTLNPEHTRSQIAIVSQEPTLFDCSIAENIIYG 1176

  Fly  1159 NNFRDDVSMQEIIEAAKKSNIHNFISALPQGYDTRLG-KTSQLSGGQKQRIAIARALVRNPKILI 1222
            .: ...|:|.::.|||:.:||||||:.||:|::||:| :.:|||||||||||||||||||||||:
 Worm  1177 LD-PSSVTMAQVEEAARLANIHNFIAELPEGFETRVGDRGTQLSGGQKQRIAIARALVRNPKILL 1240

  Fly  1223 LDEATSALDLESEKVVQQALDEARSGRTCLTIAHRLTTVRNADLICVLKRGVVVEHGTHDELMAL 1287
            |||||||||.|||||||:|||.||.||||:.|||||.||.|||.|.|:..|.::|.|||.:||:.
 Worm  1241 LDEATSALDTESEKVVQEALDRAREGRTCIVIAHRLNTVMNADCIAVVSNGTIIEKGTHTQLMSE 1305

  Fly  1288 NKIYANL 1294
            ...|..|
 Worm  1306 KGAYYKL 1312

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Mdr49	NP_523724.2	MdlB	44..643	CDD:440747	227/600 (38%)
		MdlB	720..1299	CDD:440747	211/582 (36%)
pgp-1	NP_502413.1	MdlB	131..653	CDD:440747	212/539 (39%)
		MdlB	733..1319	CDD:440747	212/588 (36%)