DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment garz and GBF1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_610761.2 Gene:garz / 36337 FlyBaseID:FBgn0264560 Length:1983 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_006718110.1 Gene:GBF1 / 8729 HGNCID:4181 Length:1893 Species:Homo sapiens


Alignment Length:1974 Identity:843/1974 - (42%)
Similarity:1151/1974 - (58%) Gaps:285/1974 - (14%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     8 IYVVRGEMATLMTAMRRGTRWNATAYVDDENDSLLKLFIDLKHELNRIEDLRQIEPQVFLAPFLE 72
            ||:::||:..::.|::|..||:....:|:|.|.||..|..||..||.|.:|.:|||.|||.||||
Human     6 IYIIQGEINIVVGAIKRNARWSTHTPLDEERDPLLHSFGHLKEVLNSITELSEIEPNVFLRPFLE 70

  Fly    73 VIRTADATGPLTSLALASVNKLLSYGLIDPTSPNLADIVERIADAVTHARFMGTDQSSDGVTFMR 137
            |||:.|.|||:|.|||.||||.|||.|||||....|:.:|.:|||||||||:|||.:||.|..|:
Human    71 VIRSEDTTGPITGLALTSVNKFLSYALIDPTHEGTAEGMENMADAVTHARFVGTDPASDEVVLMK 135

  Fly   138 VIEVLHTLIRSPEGAAVSNVSMCEVMLSCFKISFEPRLSELLRRSAEKSLKDMVLLFFMRLPQFA 202
            :::||.||:.:|.||.::|.|:||:|.|||:|.||.|||||||:|||.:|.|||.|.|.|||||.
Human   136 ILQVLRTLLLTPVGAHLTNESVCEIMQSCFRICFEMRLSELLRKSAEHTLVDMVQLLFTRLPQFK 200

  Fly   203 EER-----------SDTMLQK-RFTIGDAASGATQ-------EKLKRKTVA----------QAQT 238
            ||.           |..:|.| ..:.|:......|       :.||.|..|          :.:.
Human   201 EEPKNYVGTNMKKISPCLLNKLELSSGEQTKALNQLERVLLFKNLKLKMRAGGMSDSSKWKKQKR 265

  Fly   239 APR---------KSSAVEEPPQTPQSANLT-------VPGHL-----KAPILATTPASPAG---- 278
            :||         ..|.:..|..|..|:|||       ||..:     :|.....:|::.:|    
Human   266 SPRPPRHMTKVTPGSELPTPNGTTLSSNLTGGMPFIDVPTPISSASSEAASAVVSPSTDSGLEFS 330

  Fly   279 -------NILDMQGKITQTPTTTASTGEDETTVPETPVIQVEST----------ESEP-LLDGET 325
                   ::.|::...:...:|....|..|..|||.|.:|.|.|          ||.| :|:..|
Human   331 SQTTSKEDLTDLEQPGSPGYSTATEPGSSELGVPEQPDLQQEGTHVEKSQSASVESIPEVLEECT 395

  Fly   326 GEAT-STLAEANSSEYINSVGVRFTQQSTDHDVTSLSPYGLPFIQELFRFLIILCNPLDKQNSDS 389
            ..|. |..|..:..:|:|..||||| ||:..:.|:|.|||||.|:|||||||.|.||.|:.||:.
Human   396 SPADHSDSASVHDMDYVNPRGVRFT-QSSQKEGTALVPYGLPCIRELFRFLISLTNPHDRHNSEV 459

  Fly   390 MMHTGLSLLTVAFEVAADNIGKYEGLLELVKDDLCRNLISLLSSERLSIFAADLQLCFLLFESLR 454
            |:|.||.|||||.|.|.  :.:.:.||.|:||::||:|..|||.|||:::||.|::|||||||:|
Human   460 MIHMGLHLLTVALESAP--VAQCQTLLGLIKDEMCRHLFQLLSIERLNLYAASLRVCFLLFESMR 522

  Fly   455 GHLKFQLEAYLRKLSEIIASDNPKTPYEMRELALDNLLQLWRIPGFVTELYINYDCDLYCTDMFE 519
            .|||||:|.|::||.|||..:|||.||||:|:||:.::||||||.||||||||||||.||:::||
Human   523 EHLKFQMEMYIKKLMEIITVENPKMPYEMKEMALEAIVQLWRIPSFVTELYINYDCDYYCSNLFE 587

  Fly   520 SLTNLLSKYTLSATNAVYSTHIISMDTLLSVIDSIERNCAAS-KNSSNNRESLPEAAPA---TGG 580
            .||.||||.....:..:|:||::|:|.||:||||.|.:|.|. .||...:|....|.|:   ..|
Human   588 ELTKLLSKNAFPVSGQLYTTHLLSLDALLTVIDSTEAHCQAKVLNSLTQQEKKETARPSCEIVDG 652

  Fly   581 SRHSRHNSGLEGIVIDSGNSVAAEEKVENIASFINA----SSHRLRLQSGGEGVGITSE------ 635
            :|.:.:.           ...|::.|...:||.|..    ...||..:.|..|.....|      
Human   653 TREASNT-----------ERTASDGKAVGMASDIPGLHLPGGGRLPPEHGKSGCSDLEEAVDSGA 706

  Fly   636 -------------------QLAKVKQKKRLLSQGTERFNQRPEKGIQYLQEHGILNAELDPMQVA 681
                               :|.::|.||:||..|||:|||:|:||||:|||.|:|...:|..:||
Human   707 DKKFARKPPRFSCLLPDPRELIEIKNKKKLLITGTEQFNQKPKKGIQFLQEKGLLTIPMDNTEVA 771

  Fly   682 LFLRENPGLDKKMIGEYISKKKNVDSKILINFVDSFDFTGLRVDQALRLYLETFRLPGEAPLIFL 746
            .:|||||.||||||||::|.:||:|  :|.:||.:|.|.|||:|:|||||||.||||||||:|..
Human   772 QWLRENPRLDKKMIGEFVSDRKNID--LLESFVSTFSFQGLRLDEALRLYLEAFRLPGEAPVIQR 834

  Fly   747 VLEHFSDHWHKQNQDPFANVDAAFRLAYAIIMLNMDQHNSNAKRLNVPMTLEDFTKNLRGLNGGE 811
            :||.|::.|...|..||||.||.|.||||:||||.||||.|.::.|.|||||:|.|||:|:|||:
Human   835 LLEAFTERWMNCNGSPFANSDACFSLAYAVIMLNTDQHNHNVRKQNAPMTLEEFRKNLKGVNGGK 899

  Fly   812 DFDQEMLAQVFNAIKNEEIVMPAEQTGLVRENYQWKVLLRRGDTHDGHFHYVHDASYDVEIFNIV 876
            ||:|::|..:::||||||||||.||||||||||.|.|||.||.|.:|.|..|..||||:::|.:.
Human   900 DFEQDILEDMYHAIKNEEIVMPEEQTGLVRENYVWNVLLHRGATPEGIFLRVPTASYDLDLFTMT 964

  Fly   877 WGASLSALSFMFDKS-TETGYQRTLAGFSKSAAISAHYNLHSDFDALVLTLCKFTTLLSSVEQHE 940
            ||.:::|||::|||| .||..|:.::||.|.|.|||||.|...||.|:::|||||.|.|...::.
Human   965 WGPTIAALSYVFDKSLEETIIQKAISGFRKCAMISAHYGLSDVFDNLIISLCKFTALSSESIENL 1029

  Fly   941 PAPANNETQQAVNFGLNGKAQAAMRTVFLLVHDYGDCLRESWKHILDLYLQLFRLKLLPKSLIEV 1005
            |:.          ||.|.||..|.:|||.|.|.:||.|||.||:|::..|||||.:||||::|||
Human  1030 PSV----------FGSNPKAHIAAKTVFHLAHRHGDILREGWKNIMEAMLQLFRAQLLPKAMIEV 1084

  Fly  1006 EDFCEANGKAMLILEK-PREKQESGLFSSLYSFIS--------SEGQREPTYEEQDFIKLGRKCI 1061
            |||.:.|||..|..|: |..:.|    |::.||:|        ....|.|:.|.|:..::..:||
Human  1085 EDFVDPNGKISLQREETPSNRGE----STVLSFVSWLTLSGPEQSSVRGPSTENQEAKRVALECI 1145

  Fly  1062 KECQLDQMLQESKFVQLESLQELLKCVLALLKAPQGHKSIGLPYAEDQTVFWMEFLVKIVVHNRD 1126
            |:|..::|:.||||:||||||||:|.::::....:       .|.|:...|.:|.|::||:.|||
Human  1146 KQCDPEKMITESKFLQLESLQELMKALVSVTPDEE-------TYDEEDAAFCLEMLLRIVLENRD 1203

  Fly  1127 RMIPLWPAVRDQMYLLLMGSASCGYDYLLNRCIVAVLKLAIYLMRNEELCPIVLQSLKMLLMLKP 1191
            |:..:|..|||.:|.|.:.:..  :.:|:.|.:|.:|:|||.|:|.||:...||.||::||::||
Human  1204 RVGCVWQTVRDHLYHLCVQAQD--FCFLVERAVVGLLRLAIRLLRREEISAQVLLSLRILLLMKP 1266

  Fly  1192 ALLLRISKQISIGIYELLKTSAQNIHSEQDWQIIFNLLECVGAGAVPPNYDDAQLPLPPNGSAKS 1256
            ::|.|:|.|::.|::|||||:|.||||..||..:|.||||:|:|..||    |.|    ..:|::
Human  1267 SVLSRVSHQVAYGLHELLKTNAANIHSGDDWATLFTLLECIGSGVKPP----AAL----QATARA 1323

  Fly  1257 DGAISGEEDATAVP---------ERGYTSDSEITKASAAPAVSSPSA-------ENWILVNNKDS 1305
            |...:|.:..:.:|         :||||||||:......|.....||       ..|::|...|.
Human  1324 DAPDAGAQSDSELPSYHQNDVSLDRGYTSDSEVYTDHGRPGKIHRSATDADVVNSGWLVVGKDDV 1388

  Fly  1306 ELTTASRPQSPPSLSAPPVNTLVYNCQL---LDHAPF---ALFKCWDSLAFIVRSVAHITPYNFE 1364
            :       .|.|..|.|..:.|:....|   ||..|.   :|.||.:||:||||..|||||.|||
Human  1389 D-------NSKPGPSRPGPSPLINQYSLTVGLDLGPHDTKSLLKCVESLSFIVRDAAHITPDNFE 1446

  Fly  1365 ACVRCIRIFVEACRDGGIRQRRKLESAAKQKSS----KKRSE-----RKPGMASSASSSNLTLLT 1420
            .||:.:||||||..:||.:.:.|...:.|..|.    ||:|:     |:|..:|..:|      .
Human  1447 LCVKTLRIFVEASLNGGCKSQEKRGKSHKYDSKGNRFKKKSKEGSMLRRPRTSSQHAS------R 1505

  Fly  1421 GDPSDNQINGNAAEQEDLAQRYEQLSIQ----LLDLMYTLYTRTAQIFRWWAEE-------GCTV 1474
            |..||:.      |.|.:...|..:|:|    |||||:||:||.|.|:..||||       |..:
Human  1506 GGQSDDD------EDEGVPASYHTVSLQVSQDLLDLMHTLHTRAASIYSSWAEEQRHLETGGQKI 1564

  Fly  1475 -PQSAALWSPGWCPLLQGIARLAMDRRREVRTHAISCLQQRALLVHDLQTLSGTEWCSCFHQVLF 1538
             ..|..||:..|||||||||.|..|.||:||..|::.| ||||||||||.|...||.|||::|||
Human  1565 EADSRTLWAHCWCPLLQGIACLCCDARRQVRMQALTYL-QRALLVHDLQKLDALEWESCFNKVLF 1628

  Fly  1539 PLLNELLPESNAAGQLDAALLEESRIRTATIMSKVFLQHLTTLIELGNAFNELWLDILDYIERFM 1603
            |||.:||...:.|   |...:||:|:|.:|::||||||||:.|:.| :.|..|||.|||:::::|
Human  1629 PLLTKLLENISPA---DVGGMEETRMRASTLLSKVFLQHLSPLLSL-STFAALWLTILDFMDKYM 1689

  Fly  1604 KVG-SDTLSEQMQEILKNMLLVMHSVRVFHNQD--GSLQQALWELTWRRIGEFLPNLKEELFHDE 1665
            ..| ||.|||.:.|.||||||||.:..:||:.|  |....||||:||.||..|||:|::|||   
Human  1690 HAGSSDLLSEAIPESLKNMLLVMDTAEIFHSADARGGGPSALWEITWERIDCFLPHLRDELF--- 1751

  Fly  1666 GKRAQTLTNPAPQAAVAAAPQQQLPAVTILPRQTQVSNELVVSA--------PTPPAATPLLGS- 1721
              :...:.:|.|.     .||.|.|.         .|..|..:|        |.||.....||: 
Human  1752 --KQTVIQDPMPM-----EPQGQKPL---------ASAHLTSAAGDTRTPGHPPPPEIPSELGAC 1800

  Fly  1722 ---PVESPRRSIILQP--PMADVLQQPPSFVFAQPIIVPP--QPPAVTDP--------IPPSTLL 1771
               ..||||.:....|  |:|    ..||.:...|...||  |||.:..|        :||.| |
Human  1801 DFEKPESPRAASSSSPGSPVA----SSPSRLSPTPDGPPPLAQPPLILQPLASPLQVGVPPMT-L 1860

  Fly  1772 PDLVN----EATAAAVQATTTSPT 1791
            |.::|    |||:......|..||
Human  1861 PIILNPALIEATSPVPLLATPRPT 1884

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
garzNP_610761.2 PLN03076 <395..>986 CDD:215560 310/624 (50%)
Sec7 643..830 CDD:460178 113/186 (61%)
GBF1XP_006718110.1 PLN03076 <463..>1212 CDD:215560 372/784 (47%)
Sec7 733..918 CDD:460178 113/186 (61%)
PHA03247 <1828..1891 CDD:223021 19/58 (33%)

Return to query results.
Submit another query.