DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment garz and gbf1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_610761.2 Gene:garz / 36337 FlyBaseID:FBgn0264560 Length:1983 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_009305378.2 Gene:gbf1 / 566350 ZFINID:ZDB-GENE-081107-54 Length:1862 Species:Danio rerio


Alignment Length:1918 Identity:837/1918 - (43%)
Similarity:1140/1918 - (59%) Gaps:219/1918 - (11%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     8 IYVVRGEMATLMTAMRRGTRWNATAYVDDENDSLLKLFIDLKHELNRIEDLRQIEPQVFLAPFLE 72
            ||:|:||::.::.|::|.:||:....:|:|.|:||..|..||..||.|:||..:||.|||.||||
Zfish     6 IYIVQGEISVVVAAIKRNSRWSTHTPLDEEQDTLLNSFRLLKERLNNIKDLSDVEPNVFLRPFLE 70

  Fly    73 VIRTADATGPLTSLALASVNKLLSYGLIDPTSPNLADIVERIADAVTHARFMGTDQSSDGVTFMR 137
            |:|:.|.|||:|.|||.||||.|||||||......|:.:|.:|||||||||:|||.:||.|..|:
Zfish    71 VVRSEDTTGPITGLALTSVNKFLSYGLIDANHEGAAECIENMADAVTHARFVGTDPASDEVVLMK 135

  Fly   138 VIEVLHTLIRSPEGAAVSNVSMCEVMLSCFKISFEPRLSELLRRSAEKSLKDMVLLFFMRLPQFA 202
            :::||.||:.:|.||.::|.|:||:|.|||:|.||.|||||||:|||.:|.|||.|.|.|||||.
Zfish   136 ILQVLRTLLLTPVGAHLTNESVCEIMQSCFRICFEMRLSELLRKSAEHTLVDMVQLLFSRLPQFK 200

  Fly   203 EERSD---TMLQKRFTI--------GDAASGATQEKLKRKTVAQAQTAP----RKSSAVEEPPQT 252
            ||...   |.::|.:.|        ....:|...|..|.|...::...|    |..|...:|.|:
Zfish   201 EEAKSYVGTNMKKAYNILWKNKRVQLKMRAGGMSESSKWKKQKRSPRPPRHMVRSPSGQMDPAQS 265

  Fly   253 PQSAN----------------LTVPGHLKAPILATTPASPAGNILDMQGKIT-QTPTTTASTGED 300
            ....|                .|.||...|....::|.:.:|  ||...|.| :...|.......
Zfish   266 STLTNNLSGGVPFIEQHSGGSSTFPGSDSAASSISSPTTDSG--LDTGSKTTSKEDLTDLDQNSS 328

  Fly   301 ETTVPETPV-----------------IQVESTESEPLLDGETGEATSTLAEANSS------EYIN 342
            ..|.|.||.                 .|..|.||.|    |..|....||:.:.|      :|:|
Zfish   329 TATTPITPSAEPGRLESQSESRGVERAQSASVESIP----EVLEDRDLLADQSDSASIHDMDYVN 389

  Fly   343 SVGVRFTQQSTDHDVTSLSPYGLPFIQELFRFLIILCNPLDKQNSDSMMHTGLSLLTVAFEVAAD 407
            ..||||| |||..:..:|.|||||.::|||||||.|.||.|:.|||.|||.||.||.||.|.|  
Zfish   390 PRGVRFT-QSTQKEGAALIPYGLPCLRELFRFLISLTNPHDRHNSDVMMHMGLQLLNVALEAA-- 451

  Fly   408 NIGKYEGLLELVKDDLCRNLISLLSSERLSIFAADLQLCFLLFESLRGHLKFQLEAYLRKLSEII 472
            :|..|:.||.||||:|||:||.||..:|::::.|.:::|||||||:|.|||||||.||:||.:||
Zfish   452 HIAPYQSLLGLVKDELCRHLIQLLGVDRMNLYTASIRVCFLLFESMREHLKFQLEMYLKKLMDII 516

  Fly   473 ASDNPKTPYEMRELALDNLLQLWRIPGFVTELYINYDCDLYCTDMFESLTNLLSKYTLSATNAVY 537
            .|:|||.||||:|:||:.::||||||.||||||||||||.||:::||.||.||||.....:..:|
Zfish   517 TSENPKMPYEMKEMALEAIVQLWRIPSFVTELYINYDCDFYCSNLFEDLTKLLSKNAFPVSGQLY 581

  Fly   538 STHIISMDTLLSVIDSIERNCAASKNSSNNRESLPEA-------------APATGGSRHSRHNSG 589
            :||::|::.||:||||.|.:|.|...:|..::...|:             :||..|..|...| |
Zfish   582 TTHLLSLEALLTVIDSTEAHCQAKVLNSATQQEQSESTTVGDSSVSTITDSPAETGKPHPSSN-G 645

  Fly   590 LEGIVID--------SGNSVAA--------EEKVENIASFINASSHRLRLQSGGEGVGITSEQLA 638
            ...:|.:        ||:.:|.        :|:.:.....|:...||.      ......|::|.
Zfish   646 QNSVVSETRASCPPTSGHLMAEKMRLGRQDQEETDTGEKKISKKPHRF------SSYLPDSQELL 704

  Fly   639 KVKQKKRLLSQGTERFNQRPEKGIQYLQEHGILNAELDPMQVALFLRENPGLDKKMIGEYISKKK 703
            ::|.||:||..|||:|||:|:||||.|||.|:|::.:|..:||.:|||||.||||||||:||.::
Zfish   705 EIKNKKKLLITGTEQFNQKPKKGIQTLQEKGLLSSPMDNNEVAQWLRENPRLDKKMIGEFISDRR 769

  Fly   704 NVDSKILINFVDSFDFTGLRVDQALRLYLETFRLPGEAPLIFLVLEHFSDHWHKQNQDPFANVDA 768
            |.|  :|.:||::|.|.|||:|:|||||||.||||||||:|..:||.|:|:|||.|.:||...||
Zfish   770 NTD--LLDSFVNTFTFQGLRIDEALRLYLEAFRLPGEAPVIHRLLETFTDNWHKVNGNPFQTNDA 832

  Fly   769 AFRLAYAIIMLNMDQHNSNAKRLNVPMTLEDFTKNLRGLNGGEDFDQEMLAQVFNAIKNEEIVMP 833
            .|.||||:||||.||||.|.::.|:|||||.|.|||:|:|||.||||:||..::|||||||||||
Zfish   833 GFALAYAVIMLNTDQHNHNVRKQNIPMTLEQFKKNLKGVNGGNDFDQDMLEDIYNAIKNEEIVMP 897

  Fly   834 AEQTGLVRENYQWKVLLRRGDTHDGHFHYVHDASYDVEIFNIVWGASLSALSFMFDKS-TETGYQ 897
            .||||||:|||.|.|||.||.:.:|.|.:|.|.|||.::|::.||.:::|||::|||| .:|..:
Zfish   898 DEQTGLVKENYVWSVLLHRGASAEGMFLHVPDGSYDRDLFSMTWGPTIAALSYVFDKSLDDTIIE 962

  Fly   898 RTLAGFSKSAAISAHYNLHSDFDALVLTLCKFTTLLSSVEQHEPAPANNETQQAVNFGLNGKAQA 962
            :.:|||.|.|.|||||.....||.|:::|||||||.|...::.|..          ||.|.|||.
Zfish   963 KAIAGFRKCAMISAHYGFSDVFDNLIISLCKFTTLSSESVENLPTV----------FGSNRKAQV 1017

  Fly   963 AMRTVFLLVHDYGDCLRESWKHILDLYLQLFRLKLLPKSLIEVEDFCEANGKAMLILEK-PREKQ 1026
            |.:|||.|.|.:||.||:.||:|:|..|||||.:||||:::|||||.:.|.|..|..|: |..:.
Zfish  1018 AAKTVFSLAHRHGDILRDGWKNIMDSMLQLFRAELLPKTMVEVEDFLDPNEKISLQREETPSNRG 1082

  Fly  1027 ESGL--FSSLYSFISSEGQREPTYEEQDFIKLGRKCIKECQLDQMLQESKFVQLESLQELLKCVL 1089
            ||.:  |.|..:.....|.|.|:.|.|:..:....|||:|..:::..||||:||||||||:|.::
Zfish  1083 ESAVLSFVSWLTLSEQSGLRGPSTENQEAKQAALLCIKQCDPEKLNTESKFLQLESLQELMKALI 1147

  Fly  1090 ALLKAPQGHKSIGLPYAEDQTVFWMEFLVKIVVHNRDRMIPLWPAVRDQMY-LLLMGSASCGYDY 1153
            ::....:       .|.|:...|.:|.|::|::.||||:..:|..|||.:| |.:..:.||   :
Zfish  1148 SVTPDEE-------TYDEEDAAFCLEMLLRIILENRDRVSCVWQTVRDHLYQLCVHANESC---F 1202

  Fly  1154 LLNRCIVAVLKLAIYLMRNEELCPIVLQSLKMLLMLKPALLLRISKQISIGIYELLKTSAQNIHS 1218
            |:.|.:|.:|:|||.|:|.|::...||.||::|||:||.:|.|:|::::.|::|||||:|.||||
Zfish  1203 LVERAVVGLLRLAIRLLRREDIGSQVLLSLRLLLMMKPHVLSRVSREVAYGLHELLKTNAANIHS 1267

  Fly  1219 EQDWQIIFNLLECVGAGAVPPNYDDAQLPL----PPNGS-AKSDGAISGEEDATAVPERGYTSDS 1278
            ..||..:|:||||:|||..||    |.|..    |.|.: |:||..:|....:....:|||||||
Zfish  1268 TDDWYTLFSLLECIGAGIKPP----AALQFANTNPDNDTGAQSDSELSSYHQSEVSLDRGYTSDS 1328

  Fly  1279 EITK---ASAAPAVSSPSAENWILVNNKD-----SELTTASRPQSPPSLSAPPVNTLVYNCQLLD 1335
            ||..   .|..|..::.....|::|...|     :.:||.|:|.:.|.::...: ||..:..|  
Zfish  1329 EIYNEHGKSRIPRSATDVDVGWLVVGKDDLDGSKAAVTTPSKPMNHPLVNQYSL-TLGQDMGL-- 1390

  Fly  1336 HAPFALFKCWDSLAFIVRSVAHITPYNFEACVRCIRIFVEACRDGGIRQRRKLES---AAKQKSS 1397
            |...:|.||.|||:||||..||:||.|||.||:.||:||||..:||.|...|.:|   .:|....
Zfish  1391 HDTKSLIKCVDSLSFIVRDAAHVTPENFELCVKAIRVFVEASLNGGYRTHEKKKSHKYDSKSSRL 1455

  Fly  1398 KKRSERKPGMASSASSSNLTLLTGDPSDNQINGNAAEQEDLAQRYE----QLSIQLLDLMYTLYT 1458
            :|:...|.| ||..:.::........||::      |:|.:...|.    |:|:.|||||:||:|
Zfish  1456 RKKPREKEG-ASRRTKASSQRPARSHSDDE------EEEGVPASYHTVSFQVSLDLLDLMHTLHT 1513

  Fly  1459 RTAQIFRWWAEE-------GCTV-PQSAALWSPGWCPLLQGIARLAMDRRREVRTHAISCLQQRA 1515
            |.|.|:..||||       |..: ..|..||:..|||||||:|.|..|.||:||..|::.| |||
Zfish  1514 RAAGIYSSWAEEQRHLEDAGKKIEADSQTLWTSCWCPLLQGMAWLCCDARRQVRMQALTYL-QRA 1577

  Fly  1516 LLVHDLQTLSGTEWCSCFHQVLFPLLNELLPESNAAGQLDAALLEESRIRTATIMSKVFLQHLTT 1580
            |||||||||...||.|||::||||||.:||...:.|   |...:||:|:|..|::||||||||:.
Zfish  1578 LLVHDLQTLDAVEWESCFNKVLFPLLTKLLENISPA---DVGGMEETRMRACTLLSKVFLQHLSP 1639

  Fly  1581 LIELGNAFNELWLDILDYIERFMKVG-SDTLSEQMQEILKNMLLVMHSVRVFHNQDGSLQQA-LW 1643
            |:.| ..|..|||.|||:::::|..| ||.|.|.:.|.||||||||.:..:||:.|.....: ||
Zfish  1640 LLSL-PTFAALWLTILDFMDKYMHAGSSDLLLEAIPESLKNMLLVMDTAGIFHSADSRTGYSDLW 1703

  Fly  1644 ELTWRRIGEFLPNLKEELFHDE--------------------GKRAQTLTNPAPQAAVAAAPQ-- 1686
            |:||.||..|||.||||||...                    ...|.|:..|:|..|..|.|.  
Zfish  1704 EITWERIVCFLPRLKEELFKQAVIPEPVCNVPVEPVPPPVAVPPAAPTVPAPSPVPAAPAEPNIP 1768

  Fly  1687 ------QQLPAVTILPRQTQVSNELVVSAPTPPAATPLLGSPVESP----RRSIILQPPMADVLQ 1741
                  |.:|..:....:|..|:.  |...|||..||...||.|||    :..:||| |:|..||
Zfish  1769 SRPSSPQDMPTPSANGDRTDRSSP--VPPSTPPLPTPAKKSPPESPPPLSQSPLILQ-PLASPLQ 1830

  Fly  1742 --QPPSFVFAQPIIVPPQPPAVTDPIPPSTLLP 1772
              .||   ...|||:.|.....|.|:|   |||
Zfish  1831 VGVPP---MTLPIILNPALIEATSPVP---LLP 1857

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
garzNP_610761.2 PLN03076 <395..>986 CDD:215560 311/620 (50%)
Sec7 643..830 CDD:460178 117/186 (63%)
gbf1XP_009305378.2 None

Return to query results.
Submit another query.