DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Prp8 and PRP8

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_610735.1 Gene:Prp8 / 36304 FlyBaseID:FBgn0033688 Length:2396 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_012035.1 Gene:PRP8 / 856570 SGDID:S000001208 Length:2413 Species:Saccharomyces cerevisiae


Alignment Length:2387 Identity:1460/2387 - (61%)
Similarity:1827/2387 - (76%) Gaps:48/2387 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    41 NQIQQIPPPGAPLPPAGGHTNG-----IPIPVGGQGPGLGQIPTP-----------KPDILTEEK 89
            |:...:|||  |.||:....|.     ..:|.....|||.::.|.           |.||..:..
Yeast    44 NEDTFLPPP--PPPPSNFEINAEEIVDFTLPPPPPPPGLDELETKAEKKVELHGKRKLDIGKDTF 106

  Fly    90 LQEKALKWQHLQSKRFAEKRKFGFVDTQKEDMPPEHIRKIIRDHGDMTSRKYRHDKRVYLGALKY 154
            :..|:.|    ::|:..:|.|...:.|.|.:|||||:||||..|.||.|:.|..||:.:||||||
Yeast   107 VTRKSRK----RAKKMTKKAKRSNLYTPKAEMPPEHLRKIINTHSDMASKMYNTDKKAFLGALKY 167

  Fly   155 MPHAVLKLLENMPMPWEQIRDVQVLYHITGAITFVNEIPWVIEPVYIAQWGTMWIMMRREKRDRR 219
            :|||:||||||||.||||.::|:||||.:||||||||.|.||||||.|||...||.||||||||.
Yeast   168 LPHAILKLLENMPHPWEQAKEVKVLYHTSGAITFVNETPRVIEPVYTAQWSATWIAMRREKRDRT 232

  Fly   220 HFKRMRFPPFDDEEPPLDYADNVLDVEPLEAIQIELDNDEDNAVYKWFYDHRPL-VDTQFVNGTT 283
            ||||||||||||:||||.|..::.::|||:.|.:.||:.:|..|..|.||.||| .|::.||||:
Yeast   233 HFKRMRFPPFDDDEPPLSYEQHIENIEPLDPINLPLDSQDDEYVKDWLYDSRPLEEDSKKVNGTS 297

  Fly   284 YRKWNLSLPQLATLYRLANQLLTDLVDNNFFYLFDPKSFFTAKALNMAIPGGPKFEPLIKDHNVG 348
            |:||:..||:::.||||:..|..::.|.|::||||.||||..||||.|||||||||||.....  
Yeast   298 YKKWSFDLPEMSNLYRLSTPLRDEVTDKNYYYLFDKKSFFNGKALNNAIPGGPKFEPLYPREE-- 360

  Fly   349 DEDWNEFNDINKVIIRQPIRTEYRIAFPYLYNNMPHFVHLSWYHTP-NVVYIKTEDPDLPAFYFD 412
            :||:||||.|::||.|.|||:||::|||:|||:.|..|.:.||:.| :.:....|:.|.||.:||
Yeast   361 EEDYNEFNSIDRVIFRVPIRSEYKVAFPHLYNSRPRSVRIPWYNNPVSCIIQNDEEYDTPALFFD 425

  Fly   413 PLINPISH-RNANSKIQEPLPDDDEDFTLPDDVQPFL-QDTPLYTDNTANGIALLWAPRPFNMRS 475
            |.:|||.| .:.||.:......::.|||||:|..|.| ::..|...||.:.::|..:|.|||...
Yeast   426 PSLNPIPHFIDNNSSLNVSNTKENGDFTLPEDFAPLLAEEEELILPNTKDAMSLYHSPFPFNRTK 490

  Fly   476 GRSRRAIDVPLVKCWYKEHCPPGHPVKVRVSYQKLLKYYVLNALKHRKPKPQKKRYLFRSFKATK 540
            |:..||.||.|.|.|:.:|....:||||:||||||||.||||.|....|....|..|.:|.|.||
Yeast   491 GKMVRAQDVALAKKWFLQHPDEEYPVKVKVSYQKLLKNYVLNELHPTLPTNHNKTKLLKSLKNTK 555

  Fly   541 FFQTTTLDWVEAGLQVCRQGYNMLNLLIHRKNLNYLHLDYNFNLKPVKTLTTKERKKSRFGNAFH 605
            :||.||:||||||||:||||:||||||||||.|.||||||||||||.||||||||||||.||:||
Yeast   556 YFQQTTIDWVEAGLQLCRQGHNMLNLLIHRKGLTYLHLDYNFNLKPTKTLTTKERKKSRLGNSFH 620

  Fly   606 LCREILRLTKLIIDSHVQYRLNNVDAFQLADGLQYIFAHVGQLTGMYRYKYKLMRQIRMCKDLKH 670
            |.||:|::.|||:|:|||:||.||||||||||:.||..|:|||||:||||||:|.|||.||||||
Yeast   621 LMRELLKMMKLIVDTHVQFRLGNVDAFQLADGIHYILNHIGQLTGIYRYKYKVMHQIRACKDLKH 685

  Fly   671 LIYYRFNTGPVGKGPGCGFWAPGWRVWLFFMRGITPLLERWLGNLLSRQFEGRHSKGVAKTVTKQ 735
            :|||:||.. :|||||||||.|.|||||.|:||..|||||::|||::|||||| |..:.||.|||
Yeast   686 IIYYKFNKN-LGKGPGCGFWQPAWRVWLNFLRGTIPLLERYIGNLITRQFEGR-SNEIVKTTTKQ 748

  Fly   736 RVESHFDLELRASVMHDIVDMMPEGIKQNKARTILQHLSEAWRCWKANIPWKVPGLPIPIENMIL 800
            |:::::|||||.|||.||::||||.|:|.||||||||||||||||||||||.|||:|.||:.:|.
Yeast   749 RLDAYYDLELRNSVMDDILEMMPESIRQKKARTILQHLSEAWRCWKANIPWDVPGMPAPIKKIIE 813

  Fly   801 RYVKMKADWWTNTAHYNRERIRRGATVDKTVCKKNLGRLTRLYLKAEQERQHNYLKDGPYISPEE 865
            ||:|.|||.|.:.||||||||:|||.|:||:.||||||||||::|.|||||....|:||.|:|||
Yeast   814 RYIKSKADAWVSAAHYNRERIKRGAHVEKTMVKKNLGRLTRLWIKNEQERQRQIQKNGPEITPEE 878

  Fly   866 AVAIYTTTVHWLESRRFAPIPFPPLSYKHDTKLLILALERLKEAYSVKSRLNQSQREELGLIEQA 930
            |..|::..|.|||||.|:|||||||:||:|||:|:||||.||:.|:.|.|||.|:||||.|||:|
Yeast   879 ATTIFSVMVEWLESRSFSPIPFPPLTYKNDTKILVLALEDLKDVYASKVRLNASEREELALIEEA 943

  Fly   931 YDNPHEALSRIKRHLLTQRAFKEVGIEFMDLYSHLIPVYEVEPLEKITDAYLDQYLWYEADKRRL 995
            |||||:.|:|||::|||||.||.|.|..|:.|.::.|||.|:|||||||||||||||||||:|:|
Yeast   944 YDNPHDTLNRIKKYLLTQRVFKPVDITMMENYQNISPVYSVDPLEKITDAYLDQYLWYEADQRKL 1008

  Fly   996 FPPWIKPSDTEPPPLLAYKWCQGINNLQDVWDVGEGECNVLLESRFEKLYEKIDLTLLNRLLRLI 1060
            ||.||||||:|.||||.|||.||||||.::|||..|:..||||:...::.||||.||||||||||
Yeast  1009 FPNWIKPSDSEIPPLLVYKWTQGINNLSEIWDVSRGQSAVLLETTLGEMAEKIDFTLLNRLLRLI 1073

  Fly  1061 VDHNIADYMTAKNNVVINYKDMNHTNSYGIIRGLQFSSFITQYYGLVLDLLVLGLHRSSEMAGPP 1125
            ||.|||||:|||||||||:|||:|.|.||:||||:|:|||.||||||:|||:||..|::::|||.
Yeast  1074 VDPNIADYITAKNNVVINFKDMSHVNKYGLIRGLKFASFIFQYYGLVIDLLLLGQERATDLAGPA 1138

  Fly  1126 QMPNDFLTFQDTVTETAHPIRLYCRYVDRIHLFFRFSAEEARDLIQRYLTEHPDPNNENIVGYNN 1190
            ..||:|:.|:....|.|||||||.||:|||::.|.|..:|..:|...||.|:||||.||.:||||
Yeast  1139 NNPNEFMQFKSKEVEKAHPIRLYTRYLDRIYMLFHFEEDEGEELTDEYLAENPDPNFENSIGYNN 1203

  Fly  1191 KKCWPRDARMRLMKHDVNLGRAVFWDIKNRLPRSVTTIGWESTFVSVYSKDNPNLLFNMSGFECR 1255
            :||||:|:||||::.||||||||||:|::|:|.|:|:|.||:.|||||||:||||||:|.|||.|
Yeast  1204 RKCWPKDSRMRLIRQDVNLGRAVFWEIQSRVPTSLTSIKWENAFVSVYSKNNPNLLFSMCGFEVR 1268

  Fly  1256 ILPKCRTQNEEFTHRDGVWNLQNEITKERTAQCFLRVDDESLGRFHNRVRQILMASGSTTFTKIV 1320
            |||:.|.: |..::.:|||:|.:|.||:|||:.:|:|.:|.:.:|.:|:|.||||||||||||:.
Yeast  1269 ILPRQRME-EVVSNDEGVWDLVDERTKQRTAKAYLKVSEEEIKKFDSRIRGILMASGSTTFTKVA 1332

  Fly  1321 NKWNTALIGLMTYFREAVVNTQELLDLLVKCENKIQTRIKIGLNSKMPSRFPPVVFYTPKELGGL 1385
            .||||:||.|.||||||:|.|:.|||:|||.|.:||.|:|:|||||||:||||.|||||||||||
Yeast  1333 AKWNTSLISLFTYFREAIVATEPLLDILVKGETRIQNRVKLGLNSKMPTRFPPAVFYTPKELGGL 1397

  Fly  1386 GMLSMGHVLIPQSDLRWSKQTDVGITHFRSGMSHDEDQLIPNLYRYIQPWESEFIDSQRVWAEYA 1450
            ||:|..|:|||.|||.||||||.||||||:||:|::::|||.::|||..||:||:||||||||||
Yeast  1398 GMISASHILIPASDLSWSKQTDTGITHFRAGMTHEDEKLIPTIFRYITTWENEFLDSQRVWAEYA 1462

  Fly  1451 LKRQEANAQNRRLTLEDLEDSWDRGIPRINTLFQKDRHTLAYDKGWRIRTEFKQYQVLKQNPFWW 1515
            .|||||..|||||..|:||.|||||||||:||||:||||||||:|.|||.|||||.:.:.:||||
Yeast  1463 TKRQEAIQQNRRLAFEELEGSWDRGIPRISTLFQRDRHTLAYDRGHRIRREFKQYSLERNSPFWW 1527

  Fly  1516 THQRHDGKLWNLNNYRTDMIQALGGVEGILEHTLFKGTYFPTWEGLFWEKASGFEESMKYKKLTN 1580
            |:..|||||||||.||||:||||||:|.||||||||||.|.:|||||||||||||:||::||||:
Yeast  1528 TNSHHDGKLWNLNAYRTDVIQALGGIETILEHTLFKGTGFNSWEGLFWEKASGFEDSMQFKKLTH 1592

  Fly  1581 AQRSGLNQIPNRRFTLWWSPTINRANVYVGFQVQLDLTGIFMHGKIPTLKISLIQIFRAHLWQKI 1645
            |||:||:||||||||||||||||||||||||.|||||||||:|||||||||||||||||||||||
Yeast  1593 AQRTGLSQIPNRRFTLWWSPTINRANVYVGFLVQLDLTGIFLHGKIPTLKISLIQIFRAHLWQKI 1657

  Fly  1646 HESIVMDLCQVFDQELDALEIETVQKETIHPRKSYKMNSSCADILLFPAYKWNVSRPSLLADTKD 1710
            |||||.|:||:.|.|||.|:||:|.|||:|||||||||||.|||.:...::|.||:||||.:|.|
Yeast  1658 HESIVFDICQILDGELDVLQIESVTKETVHPRKSYKMNSSAADITMESVHEWEVSKPSLLHETND 1722

  Fly  1711 TMDNTTTQKYWLDIQLRWGDYDSHDVERYARAKFLDYTTDNMSIYPSPTGVLIAIDLAYNLHSAY 1775
            :.....|.|.|.|:|||:|||||||:.||.|||||||||||:|:|||||||:|.||||||::.||
Yeast  1723 SFKGLITNKMWFDVQLRYGDYDSHDISRYVRAKFLDYTTDNVSMYPSPTGVMIGIDLAYNMYDAY 1787

  Fly  1776 GNWFPGCKTLIQQAMAKIMKANPALYVLRERIRKALQLYSSEPTEPYLSSQNYGELFSNQIIWFV 1840
            ||||.|.|.|||.:|..|||||||||||||||||.||:|.|...||:|:|.||.|||:|.|..||
Yeast  1788 GNWFNGLKPLIQNSMRTIMKANPALYVLRERIRKGLQIYQSSVQEPFLNSSNYAELFNNDIKLFV 1852

  Fly  1841 DDTNVYRVTIHKTFEGNLTTKPINGAIFIFNPRTGQLFLKIIHTSVWAGQKRLGQLAKWKTAEEV 1905
            |||||||||:|||||||:.||.|||.||..||:||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Yeast  1853 DDTNVYRVTVHKTFEGNVATKAINGCIFTLNPKTGHLFLKIIHTSVWAGQKRLSQLAKWKTAEEV 1917

  Fly  1906 AALIRSLPVEEQPKQIIVTRKGMLDPLEVHLLDFPNIVIKGSELQLPFQACLKVEKFGDLILKAT 1970
            :||:||||.||||||||||||.||||||||:||||||.|:.:||:|||.|.:.::|..|:::|||
Yeast  1918 SALVRSLPKEEQPKQIIVTRKAMLDPLEVHMLDFPNIAIRPTELRLPFSAAMSIDKLSDVVMKAT 1982

  Fly  1971 EPQMVLFNLYDDWLKTISSYTAFSRLILILRALHVNTERTKIILKPDKTTITEAHHIWPTLTDEE 2035
            ||||||||:|||||..||||||||||.|:||||..|.|..|:||..|.|...:::|:||:.|||:
Yeast  1983 EPQMVLFNIYDDWLDRISSYTAFSRLTLLLRALKTNEESAKMILLSDPTITIKSYHLWPSFTDEQ 2047

  Fly  2036 WIKVEVQLKDLILADYGKKNNVNVASLTQSEIRDIILGMEISAPSAQRQQIAEI-----EKQTKE 2095
            ||.:|.|::||||.:||:|.|||:::|||:||:|||||..|.|||.:||::||:     |||..|
Yeast  2048 WITIESQMRDLILTEYGRKYNVNISALTQTEIKDIILGQNIKAPSVKRQKMAELEAARSEKQNDE 2112

  Fly  2096 Q--NQLTATTTRTTNKHGDEIITSTTSNYETQTFSSKTEWRVRAISATNLHLRTNHIYVSSDDIK 2158
            :  ...|...|:|.|..|:||:...:::||:||||||.|||..||:.|.|:||..:||||:||..
Yeast  2113 EAAGASTVMKTKTINAQGEEIVVVASADYESQTFSSKNEWRKSAIANTLLYLRLKNIYVSADDFV 2177

  Fly  2159 ETGYTYILPKNILKKFVTISDLRAQIAGYLYGVSPPDNPQVKEIRCIVMPPQWGTHQTINLPNTL 2223
            |....|:||||:||||:.|||::.|:|.::||:|..|:|:||||:.:|:.||.|...::.:.| :
Yeast  2178 EEQNVYVLPKNLLKKFIEISDVKIQVAAFIYGMSAKDHPKVKEIKTVVLVPQLGHVGSVQISN-I 2241

  Fly  2224 PTHQYLKD---MEPLGWIHTQPNELPQLSPQDITTHAKIMQENSNWDGEKTIVITCSFTPGSCSL 2285
            |....|.|   :|.|||||||..||..::..::.||:|:..:..    ...|.|:...||||.||
Yeast  2242 PDIGDLPDTEGLELLGWIHTQTEELKFMAASEVATHSKLFADKK----RDCIDISIFSTPGSVSL 2302

  Fly  2286 TAYKLTPSGFEWGSKNTDKGN-NPKGYLPSHYERVQMLLSNKFLGFFMVPAQSSWNYNFMGVRHD 2349
            :||.||..|::||.:|.|..| ..:|:.|:.....|:|||::..|.|::|:.:.|||.|||...:
Yeast  2303 SAYNLTDEGYQWGEENKDIMNVLSEGFEPTFSTHAQLLLSDRITGNFIIPSGNVWNYTFMGTAFN 2367

  Fly  2350 PNMKYELQLANPKEFYHELHRTSHFLLFSNLEDGGDGAGADREDVYA 2396
            ....|..:...|.|||:|:||..|||.||.|. |.:...|::.||::
Yeast  2368 QEGDYNFKYGIPLEFYNEMHRPVHFLQFSELA-GDEELEAEQIDVFS 2413

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Prp8NP_610735.1 PRP8 64..2396 CDD:227505 1452/2357 (62%)
PRP8NP_012035.1 PRP8 82..2413 CDD:227505 1448/2345 (62%)

Return to query results.
Submit another query.